Desulfoscipio gibsoniae: Desgi_3859
Help
Entry
Desgi_3859 CDS
T02657
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain protein
Organism
dgi
Desulfoscipio gibsoniae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGL03169
UniProt:
R4KKI1
LinkDB
All DBs
Position
complement(3901974..3909524)
Genome browser
AA seq
2516 aa
AA seq
DB search
MNVDPFRLAQQGSSQENHIMKTTNLYKGAVAFPLFLVSMDSQDDLQVSVVASYQSNVKNM
VENSNREFESSTLGLGWSMEVPRIIVKNRLVKESFDSSFYLVAEGGVYPLYRLGAEGDAI
SFYSVEHPYWKFYYFNASKESRWEIHKENGTVWVYGGDDSAIETRIHWDNWVGAASSNGG
EAFPVGWSLTSVKSFAGNSIAYTYEKEEAQIGDCSYTRAIRLIKVVSTFGETAEIVYKDK
EAFECVWPHSSKGSKNPYQFNCENKFIDSIQVKNREGQLLYVQQLGYDFYDIFQKGQLYK
KRFLTSATQVCYKDANMVSVPSMKFEYETNRQNPNPGALLQVTYPYGQKYRYSYKNDTLP
AGSPKVEFTKPGAEYTASVYHALNYTVVLFQNQNTNIVRVYTWNVAWQSYEDRDIAKETI
EDVQIHLGSDFFVMSYKMVNQGTYCYRLYKNNSLRQGEWTNEKVIQLNEGSRPAFTCSGT
FFAVKPKSQNTLIVYQFNYLTNTWKRQDLPVEGFDAQAISGGENFILGAFYRDNAKSMRL
QSFYIDANHQWKNGYLQDIPLEVNWQLTSWNTVWSVGACQAAATFVAMKSQDTVTSKIVL
LRWEELFRLKEIEVFTTEQKLGTKNPILTAITSDSIVGLAENIFRYSPGRWNKTSLLQVK
QGAAYAYAYGTDLALAVEQVDNQQRFVAMRFDPYTNQWTSSGVPVSSVLPGDEPIYRPGV
LGDYAVLGRGLFTRQPDESWKLIYTLPDRTDGSSIALSSGFLMYQLQNSRDTYAVFFRNN
EFYKQVKVDNQTFFSKDDTFPNVGLYSFTTYTGDKMATARTITLHKIVNRDYSLKIDINY
LNQVTLDTGFDEQSFYLSYKLSNAMFSGEVPQYSRVKVNQAAQTGEYGSTEYIYFNGLNP
SNPEAVYPPNSEFCNARDYYSFFAGQLYCTTLFDDQGNMTNRDVNYLKAIDTNGFCILPH
KVVQEIYLKPYSEDASGEWLCVSEEIETEYETVFGQKKKVTKINTNHKGEQTRISQNFKY
AWEVYPEFKKRNYVSAVVSTTKRNDTKNLVLEATAKEWVQDGFGNWGESNTYAYTGKEDP
NFQFNGSQKGWLKTNEVTSRLKNGSIVSQRALDGTVTTIIYDRLQGYPVAHFKNAGPGEV
FYCGFESYEQNDLWSPVDKTVEKNLMFETGEFYGGNRCCWLNKGCGITFSIKSGSGKYMI
SCALKTSGSVEGSGVYFGDTFVPLEDTQNHWKIFYKVVDLGSVPGKVDIRIVPANSSGKI
LVDALFVTPMLCDAEAYVYNSFMLTIGKHRNRRDGSYVLHDVIQRPIMELTDAQNPLKAS
VFYNTGNGVNQNTVKGPDFTLTAEFPNGGQFTDFNRGDDYLKYWAVTEKGLQMRENTGTN
YVFMFGTKLNTCQDISLSARGLKLHRNLDSWELHIGGTLIETVKMNEKADSDYTLIQFGE
RFTFLCNGAVLFSNKTGKSDPQPIKIESNNKLQLNYLMYAPEPAVKITYQDYVGKTLQDQ
SITEDGVLTMMPVYSPLGQASVLTKAVEAKNELWGYRSGFITDFNWDTGQLKGEAAEAYP
EDGGFPYSRTKTTISPKPLPKELRQPGPVLSQHPVTMDYFTNLNQIFGGNINLPGGQYFV
NLVKDGDGLSTYTVKDKLDNKLADWKVSEKDGTQNLTTYEYDDFGHQVLIKYPNYYDSNL
SPSEREKFVSRIRYDFFGRIVERTDVDTGTTRLAYNSQGKLRFTQDAAGSKHGYYVYQMF
DDRGNLTEIGSCSGVWDEAVLQEKADDPAFRPENSQWARKNYYDGTGDNRNLLGRLWKTL
TYNGSEDHIVEEEFDYDSDGNMIMRKQKVLGQENVLTAVYDRKGNPVKQQADNKEEMSYV
YNTQGQLKEVYSGGKCIAAYTYNPSGKLSTETFLPGEPNQLLRNYSYNSADWLCSIKDPF
FDQQISYYDTDDKAIYSGKIKAVSNKFLNSKAGPGFLKEYRMEYDYDGLGRLLSAVNSMG
NKFSLSASNQLAYDNNSNMRKENEQEMGYQSGSNMLVSRGADSFQYNEFGSVTKAKGLTL
QYDKALQYVSSLVSETKQINTQFLYGGDGRKVAEVSQDMIKTNVHNVKGNLFVQTEQKTG
KRSCCLAGVGGVFSLVENGKSYYLVKDYQSSVRGIYDGRGLCASYNYQIFGEYLGHVYEE
PQAKGLISFGFTGQLRDKDTGLYQMHSRWYDPTVGRFYSIDPDRQYASPYIYGGSDWVNY
MDPDGGWSWGVFAAITGGILLVVAGAVLTVASAGIASPLGAGLVMFGGTFLLGAGIGSVF
YGISSAIKGEFDYKDWLITAGLAGAFASLTALSGMAIPAGFTMFGMSAAATNIVLEVGIG
VVIGGADGVITNGCLNLVHGKSFTENWVQSMVIGAVIGGVSSAVFGLVGAGRNLKTLHTN
GENHNVHIGLAGPKTQKLRHSMIAQDGGNWSDIWPGRGFGNPPRGVPFHGRNVDTVTIPR
VPRNLVYNTGSNVFDLMTNNCTTYTTRTLATADLYAPLWARTPSTLYYWGKLVVLF
NT seq
7551 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaacgttgatccgtttcgtttagcacagcaaggcagttcccaagagaaccatattatg
aaaaccactaatttgtacaagggtgccgtagcctttcctctgttcttagtgtctatggat
tcccaggatgaccttcaggttagtgttgtagcctcctaccagagcaatgtgaaaaatatg
gtggaaaacagcaacagggaatttgaaagctctaccctggggcttggatggagtatggag
gttccccgcatcattgtaaagaacaggctcgtaaaagaaagctttgactcctccttttat
ttggttgccgaaggcggggtttatcccttgtaccggttgggagcagagggagacgccata
agcttttattccgtagaacacccttactggaaattctactattttaatgcctcaaaggaa
agccggtgggaaatacacaaggaaaacggcactgtctgggtctatgggggcgatgattcc
gccattgagacccgaatccattgggataactgggtgggtgctgcttcctccaacggaggg
gaagcttttcccgtaggctggagcctgacaagcgtgaaaagctttgccggaaacagtatt
gcctacacttatgagaaggaagaagcccaaatcggcgactgctcctatacccgggccata
cgtcttattaaagtagttagtactttcggagagacagcagaaatcgtatataaggataag
gaagcttttgagtgtgtctggccccattcctccaaaggcagcaaaaacccttaccagttc
aactgtgaaaataaattcattgacagcattcaagttaaaaacagggaaggacagctatta
tatgtccagcagctgggatatgatttttatgatatctttcaaaaagggcagctttataaa
aaacgttttctcacctctgcaactcaagtctgctataaagacgcaaacatggtctccgtg
ccttccatgaaattcgaatatgaaaccaaccggcagaatccaaatcccggcgcacttctt
caggtcacctacccttacggtcaaaaataccggtattcatataaaaatgacactttgccg
gccggcagtccgaaagtagagtttacaaaacccggcgccgaatacacagcctcggtttat
cacgccttgaattatactgtggtactattccagaaccaaaatacgaatattgtccgggta
tacacctggaatgttgcatggcagagttacgaggatagggatattgccaaagagacaata
gaagatgtgcagatccatttaggctcggactttttcgtcatgtcctacaaaatggtcaac
cagggaacctattgctaccggctgtataaaaacaattctttaagacaaggggaatggacc
aacgaaaaagtgattcagcttaatgagggatccagaccggcctttacgtgttcagggaca
ttttttgctgttaagccaaaaagtcaaaatacacttattgtttaccaattcaattacctg
accaatacatggaagcgccaggatctgccggtggagggctttgacgcgcaggccatatcc
gggggtgaaaattttatcctgggggctttctacagagataatgcaaaatctatgcgcctg
cagtccttctatattgatgccaaccaccaatggaaaaacggatatttacaggatatacca
ctggaagtcaactggcagctcacttcatggaataccgtatggtctgtgggagcatgccag
gcagcggctacctttgtggccatgaagagccaggacacggtaaccagcaaaatagtcctg
ctgcgctgggaggagctgttccgtttaaaggaaatcgaggtatttactacggaacaaaag
ttgggcaccaaaaatcctattttaacagctataaccagcgacagtatcgtggggcttgcc
gaaaacatcttccgctactctcccgggcgctggaacaaaacctcattgctgcaggtaaaa
caaggggcggcctatgcctacgcttatggaaccgaccttgccctggcagtggaacaggtt
gacaaccagcagagatttgttgctatgcgatttgacccctacaccaatcaatggacttca
tccggtgttcctgtcagcagtgtactgcccggagatgagcccatctatcgtcctggtgta
ctgggtgattatgcagtcttgggacgcggtctctttacccggcagcctgacgaaagctgg
aagctgatctacacattaccggaccgtacagacggcagcagtatagccttgagcagcggt
tttttaatgtaccagcttcagaacagcagagacacttatgctgtatttttcagaaacaat
gaattctacaagcaggtgaaggtggataaccagacatttttctcaaaggatgataccttt
ccaaacgtgggcctgtattcttttactacctacacgggtgacaagatggccacagcccgg
acaataaccctgcacaaaatcgtgaacagagattattctctaaaaattgatataaactac
ctgaatcaggttaccttggataccggctttgatgagcagagcttttatttgagttacaag
ctcagtaatgcaatgttttcaggggaagtcccccaatactcccgcgtaaaggtgaaccag
gctgcccaaaccggggaatacggctcaacggagtacatctatttcaacggtttaaatccc
tcaaaccccgaagcggtgtatcctcccaattcggaattttgcaacgcccgcgattattac
agttttttcgccgggcagctctattgcacgaccctgtttgatgaccaggggaacatgaca
aaccgtgatgtcaattacctgaaggccatagataccaacggcttttgcattttgccccat
aaagttgtgcaggagatatatctgaagccctattctgaggatgcaagcggtgaatggctt
tgtgtcagtgaggaaatcgaaacggaatatgagactgtttttggccagaagaaaaaagtt
accaaaatcaacaccaaccataagggagagcagacccgtatctcccagaattttaagtat
gcctgggaagtgtatccggaattcaagaaacggaattatgtgtccgctgtggtttccacc
acaaagcgaaacgataccaaaaaccttgtgctggaggctacagccaaggaatgggtccag
gatggatttggcaattggggtgagagcaatacctatgcatatacaggaaaagaggatccc
aatttccaatttaacggatcccaaaaaggatggctgaaaaccaatgaagttaccagccgc
ctgaaaaacggcagtattgtttcccaaagagccttggatggtacggttactaccattatt
tatgaccgcctgcaaggctatcctgtggcccactttaaaaatgccggccccggtgaagtg
ttctactgcggttttgaatcctatgagcaaaacgatctatggagtccggtagataaaacc
gtggagaagaatctcatgtttgagaccggagagttctatggcgggaaccgctgttgctgg
ttgaacaaaggctgcggtattaccttttcaattaaaagcggcagtggaaaatacatgatt
tcctgtgcgttgaagacctcaggcagcgtggagggttccggcgtttatttcggggatacc
tttgtgcctcttgaagatacacaaaaccattggaaaattttttacaaagtcgttgacctt
ggaagtgtacccggaaaagtagatatccgaatcgtcccggccaatagcagcgggaagatc
ctggtggatgcgctgtttgtgactccaatgctgtgtgatgccgaagcctatgtttacaat
agtttcatgctcaccatcggaaagcaccgcaacaggcgggatggcagttatgttctgcat
gatgtgatccaacgcccgatcatggagcttacggatgcccagaaccctctaaaagccagt
gtgttttataacaccggtaatggagtcaatcaaaataccgtaaaagggccggactttacg
ctgacggcggaatttcccaacgggggtcagtttactgatttcaatcgcggcgatgattat
ttgaaatattgggccgttaccgaaaagggtctccaaatgcgggaaaataccggcacaaac
tatgtgttcatgtttggaacaaagctgaatacctgccaggatatcagcttatccgccagg
gggcttaagcttcatcgcaacttggacagctgggagcttcacatcgggggcacattgatc
gagacggtcaaaatgaacgaaaaagcggattcggattatactctgatacagtttggagag
agatttacttttctgtgcaacggggccgtgctcttcagcaacaagaccgggaaaagtgat
ccacagcccatcaaaatagaaagcaataataagcttcagctcaactatctgatgtatgcc
ccggaacctgccgtaaagataacttaccaggattatgttggtaaaactctgcaggaccag
agtataactgaggatggtgtactgacaatgatgccggtatattctcctcttgggcaagcc
tcagtcctgacaaaggctgtggaagccaaaaatgaattgtggggctatcgcagtggtttc
ataaccgattttaattgggatacaggacagttgaagggggaagcggccgaagcctatccg
gaggacgggggtttcccctacagtagaacgaaaaccacaatttcacccaagcccctgccc
aaagaattaaggcaacccggtccggttttatcacagcatccggtgacaatggactatttc
accaacttgaatcagatttttggcgggaacataaatctgccgggaggccagtattttgta
aatctggtgaaagacggggatggtctcagtacttataccgttaaggacaagctggataat
aaactggctgactggaaggtttccgaaaaagacggtactcagaaccttacaacctatgaa
tatgacgacttcggccatcaggttcttattaagtatcccaactactatgactcaaacctt
agtccaagcgagcgtgaaaagtttgtaagccggatccgttacgacttctttggacgaatc
gtggaacggacggatgtggatacaggcacgaccaggctcgcatataacagtcagggcaaa
ctgcgtttcacccaggatgccgcgggaagtaagcacggttactatgtgtaccagatgttc
gatgacagggggaaccttacggaaatcggaagctgcagcggcgtatgggatgaggctgtg
ctgcaggaaaaggccgatgatcctgctttccgtcctgagaacagccagtgggcacggaaa
aactattatgacggaactggtgataatagaaacctgctgggcaggctttggaaaactctt
acttataacggcagcgaggaccatattgtcgaagaagaattcgactatgattccgacggc
aatatgattatgcgcaagcaaaaggtcttgggacaggagaatgttttgacggcggtgtac
gaccgcaaggggaaccccgtgaaacagcaggcagataacaaagaggaaatgagctatgtt
tataatacccaggggcagctaaaggaagtgtactccgggggaaaatgcatagcggcatac
acctataatccgtccggaaagctgagtacggaaaccttcctgcccggtgagcccaatcag
cttctgcggaattattcctataacagtgcagattggctttgttctatcaaggatccattt
tttgaccagcagatcagctattatgacactgacgataaagccatttattcaggcaagata
aaagctgtaagcaacaaattcttaaattccaaggccggtcccggctttttaaaagaatac
cgcatggaatatgactacgatggactggggcggctgttgtctgctgtcaattcaatgggg
aataagttcagcttaagtgcttcaaatcaattggcctatgacaataacagcaatatgcgc
aaagaaaatgaacaggaaatgggttatcaaagcggcagtaatatgctggtttcccgaggc
gccgacagttttcaatataacgaatttggaagcgtcaccaaggccaaggggcttactttg
caatatgataaagctctgcagtatgtatcctccctggtttcggaaaccaaacaaatcaat
acacagtttttatatggaggtgatggccgaaaggtagcagaggtgtcacaggacatgata
aaaactaatgtccataacgtgaaggggaacttatttgttcaaacggagcaaaagacaggg
aagcgctcttgctgcctggcaggtgtcggcggcgtattttccctggtggagaatggtaaa
tcctactatttggttaaggattaccagtcctctgtaagggggatatacgacggtcgaggt
ttgtgtgcttcttacaattaccagatttttggcgagtatttgggtcatgtctacgaagaa
ccacaggcaaaaggattgatcagctttggatttaccgggcaattgcgggataaggacacc
ggtttgtatcaaatgcattccaggtggtatgacccaacggtgggaaggttttattccatc
gatcccgacaggcagtatgccagcccttacatttatggcggctccgactgggtcaactat
atggaccctgacggcggttggtcgtggggtgtttttgcggcaatcacaggaggtatttta
cttgttgttgcgggtgcggtccttacggttgcttccgcaggtattgcctctcccctggga
gccggacttgttatgttcggcggcacctttttattgggtgcagggatcggcagtgtcttt
tatggtataagctctgctataaaaggtgagtttgactataaggattggctcatcactgcc
ggtctggcgggagcctttgccagtctaacagctttgtccggtatggcaatacctgcaggc
tttacaatgtttggtatgagcgccgccgccaccaatattgtcctggaagttgggataggc
gttgtgatcggtggtgccgacggagtaataacaaacggctgcttaaatctcgtccacgga
aagagttttacagaaaactgggtccaaagcatggtaatcggtgctgttataggcggtgtc
tcttcagccgtattcgggctggtaggtgccggacgcaatttgaaaactcttcataccaat
ggggaaaaccataacgtgcatataggcttggccggccccaaaacacagaaactgaggcat
tccatgattgcccaggacggaggtaattggtctgatatttggccggggcggggatttgga
aatcctcctcgtggggtaccattccacggtcgcaatgttgacacggtcaccattccaaga
gtgcccaggaatttggtttataataccggctctaatgtctttgaccttatgactaataac
tgtactacctataccaccagaactttggcgacagcggatctttatgcacccctgtgggca
aggactcccagtaccctgtattactggggaaaattagtagttcttttctag
DBGET
integrated database retrieval system
