Dendronephthya gigantea (soft corals): 114535798
Help
Entry
114535798 CDS
T06112
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R-like
KO
K13161
heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R
Organism
dgt
Dendronephthya gigantea (soft corals)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dgt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
dgt03041
]
114535798
Spliceosome [BR:
dgt03041
]
Complex C
Other components
hnRNP proteins
114535798
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
hnRNP_Q_AcD
RRM_7
RRM_5
RRM_PARP14_3
RRM_3
RRM_occluded
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114535798
NCBI-ProteinID:
XP_028412928
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
674 aa
AA seq
DB search
MEKFRGRVLPESVTVKLDNLCALGQLVLADLDERAFDALKELNEDGALAVLEQFANSDLS
HVQNKSAFLCGIMKTHREKKRQEQMGPQDLYAEIQEQQPVQTGEGGPNEEKIRELLERTG
YSLDITMGQRKFGGPPPGWEGPPPPTGTTGCCQVFVGKVPRDMFEDELIPPFEKYGRIYD
FRLMMDPHTGQNKGYAFCTFADRESAQSACKGLDNTEIRKNRRLGVCISIANDRLFVGSI
PKTKTKQDILDEFRQHTDNLKDVIVYISAEDKYKNRGFAFLEYDTHKAAALARRRLMSGR
VKVWGHIVPSVDWADPLEEPDTETMAKVRVVHVRNVSPNTSEESLKSAFSEHGEVERVKK
LKSYAFINFKERESAVKAIEEMNGKTIDGLVIEVSLAKPPQNREKRHGQSGFGALNAPGR
DQGGDMGRGRGRGMGRGGPRGRGRGGPRGGGYGGGYNEGYGGGYGDGYGGGYGGGYNEGY
DDGSGYGGGYGGDGYGGGYDDSYGGSYGGGYGGGYDDSYGGGYDDGYGGSDYSSGYGGGY
GGRGRGGSQRGRGGPGTPRGGPRGRGGPGTPRGGPPGRGGRGGPGGPGRGGPGGRGSRGG
PRGGPRGAGPQQAKRKFEGDGAGTVSYPEPKRRFNQAGSQPIAQQPLEQNNQSYGGGYDQ
SNQWYQDSSYQQWS
NT seq
2025 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagaagtttcgaggcagagtgttgcccgaatctgtcacagttaagcttgataaccta
tgcgcattaggtcagcttgttttggcagatctcgatgagagagcttttgacgcactgaaa
gaattgaatgaagacggcgctctcgcggtcttagaacagttcgcaaatagcgatctatcg
catgtacaaaacaagagtgcctttctttgtggaatcatgaaaacacatcgtgagaaaaag
cgtcaggagcaaatgggtcctcaagatttatatgcggaaatacaagaacagcaaccagta
cagactggcgaaggggggccgaatgaggagaaaattcgtgaactgctagaaagaactggc
tatagtttggatataaccatgggacagagaaagtttggaggtccacctcccggctgggag
ggccctcctccaccgacaggaactacgggctgctgtcaagtgtttgttggcaaagtacct
cgtgacatgtttgaagatgaactcatcccaccttttgagaaatatggtcggatatatgat
tttcggctgatgatggatcctcataccggccaaaacaagggctatgctttctgcaccttc
gctgatcgtgaatctgcccagagtgcgtgcaaaggattagataacactgaaatcagaaag
aaccgtcgtcttggtgtgtgtatatcaattgccaacgatagattgttcgttggttccatt
ccaaaaaccaagactaaacaggacatattggatgaattccgtcaacacacagacaacttg
aaggatgtgatcgtgtatatatccgctgaagacaaatacaagaatcgtggtttcgctttc
cttgagtatgacacccacaaagctgcagcccttgccagacgtcgactgatgagtggacgg
gtaaaagtttggggacatattgttccttctgttgactgggctgatccacttgaggaacct
gatacagaaacaatggccaaggttcgtgttgttcatgttcgcaatgtttctcccaacaca
agcgaagaaagtctgaagagtgcttttagcgaacatggtgaagttgaaagagtcaaaaag
ctgaagagttatgcatttatcaacttcaaagaacgagagtctgctgtgaaagctattgaa
gaaatgaatggtaaaacaatagacggacttgttattgaagtatccttggctaaaccacca
cagaacagagaaaaacgtcatggacagtcgggctttggtgctttaaatgctcctgggaga
gatcaaggtggtgatatgggtagaggtcgtggtcgtgggatgggtcgaggaggacctaga
ggtcgtggtcgtggaggtcctagaggaggtggttatggtggtggatataatgaaggatat
ggtggtggttatggtgatgggtatggaggaggttatggtggtggatataacgaaggatat
gatgatggaagtggatatggtggaggatatggtggtgatggttatggtggtggatatgat
gatagttatggtggtagttatggaggtggttatggtggagggtatgatgatagttatggt
ggtggatatgatgatggttatggtggtagtgattatagttcaggatatggaggtggttat
ggtggacgaggtcgtggtgggtctcagagaggtcgaggtggaccaggtacacctaggggt
ggtcctcgtggtcgtggaggaccaggtactcctagaggtggtcctcctggacgaggtgga
agaggaggtccaggtggtccaggccgtggtggtcctggaggacgtggaagcagaggtggt
ccaaggggaggtccgcgaggtgctggtccgcaacaagcaaagcgaaaatttgaaggagat
ggagctggaaccgttagctatcctgaaccaaaaagacgtttcaaccaagctggttctcaa
ccaattgctcagcagcctctggagcagaataaccaaagttatggtggtggatatgaccag
agcaaccaatggtaccaagactcatcataccaacaatggagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
