Debaryomyces hansenii: DEHA2G15994g
Help
Entry
DEHA2G15994g CDS
T01026
Name
(RefSeq) DEHA2G15994p
KO
K06672
cohesin loading factor subunit SCC2
Organism
dha
Debaryomyces hansenii
Pathway
dha04111
Cell cycle - yeast
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dha00001
]
09140 Cellular Processes
09143 Cell growth and death
04111 Cell cycle - yeast
DEHA2G15994g
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
dha03036
]
DEHA2G15994g
Chromosome and associated proteins [BR:
dha03036
]
Eukaryotic type
Sister chromatid cohesion proteins
Adherin complex
DEHA2G15994g
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nipped-B_C
Cohesin_HEAT
SCD
TOR1L1_N
Cnd1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8999223
NCBI-ProteinID:
XP_002770649
UniProt:
B5RUT8
LinkDB
All DBs
Position
G:1323536..1328371
Genome browser
AA seq
1611 aa
AA seq
DB search
MTNDKLHPTDLREGLGTVPLLHLIPKQDLAPLVSFNAVDTEPNDIEEMEINSTSVANKMR
SAMNGNPEYFSKVIDYLAEDFRSFEDRELDDITFKKPIIAKNSSTDRRKKPEILPFEKRL
FEEMSEVDDSCVEDKTIISNTLQIDKSELSIQDDYDANTVFSIQQHNEKFNQKFELQKKK
MAKQNVFAIPIHFPDDHSAGQSKHLLDNTEATPAQQAKRFQKTYLERDQLKTRACEELIE
IINNIGLVDEDINNDKYFSSIGESKLLTTETLIFILDRLLRISNDHVIDQVSLEYLIRIE
KLCIRSISEGVSTNWNELIELSDVNTLQEFMKNYDCVRKLFESALNGTISAKVILSILDS
RRNNKQLFLDEYFKSIIDLIYLLVQDVIIPFASKTIPDIQIVNVLRGFCLGLITDVCSIK
SMVSIHIEKDEVDEYLLTRLEYLSIIIVFAESNIKERVSIVGVSNFDNLRVCSCKVLTCI
FKHHLDQRQFILNEVLSNFDKLPTHKVAARRFKLNRGGNIQLTTVLLLNLLQSFDISKYS
SDANEARQANSDDKYKSLVENKRRMIMENVSLSLEEVTKTSNDIATFLMNKLYNNPDNQQ
KLSLELLLEDLLAVVILPEWPSAEILLISIFKALLFVIQSGTYSSLIETSALELSGMIGA
KIFELKQACTGVHQLNVNSSNEDILFYSGCFIDSLEYVQLQSMKNTNYITAFRLLIMKFI
CRIKVIIQDNDRGNTENQLAALNSDNDNSSQLATVRNDANLLYDRLLGILADDSINLNQT
LKSNMDASSISSYIQILLTQELLDLFDNFLNVMVNTLDSTKVKSKTKAIRTLSSLIDIDP
TLLVSSKIQESVSKRLLDSSPLVRDAVIDLISRFMSSKPEVIDQFHRPICDRLNDDSIQV
RKRVIKLSKEMYLKTDKVSIKSQISMKILRRLDDEDDIMASIAKSYLLELWFTSLADEIR
SMDMGQISEATAKRADVIMEITSIGGRTTAYFETFLTEYVLCNPDPKVISTVKLIIDKTL
DRIIDCVNTKSQTQVEKALMLISTFVKCDGKLMTQDQLVSLQPYLVDEKNSGEAVCFYSL
QILKYVLPCFPALRPGFVDAAETYLLRRLTKFNVKELHEAMPCVWRLCYMNKDTVKLANA
SISCMKLIKPFFDLSKKDEKIGFNTKLHRLLHLLGCFGTYCKLEKHRDIYLKARIGLKEN
ETVISVITKFLLFFCGSNFSSQIKKIAIKNIISICSTHPKLFMSEAILKVLDREFDDVDV
DIKRTIIQGFMDFLKNEDNNSKKLNGVQTKSSTEIKLDVAVFHGDAKSYVNDGICAGIIQ
RYLEKILEFCLQESDELAVLPVQFVQLVIKLGFANPKICIPYIIALESTTNPHIRHIAFE
LHTELFEKHESLTDSSYLEGLKLAVAFRKRTSNNIYQEKFFINNLYSIVNGNYSSRKKLI
LSLAKVFNINLGFTKLEDNTFQRDTIIYTAFNIAAIHFASLEEVLIFVYNINRVISREGL
DLSDKILKETNPNSPNTQPTSYKRNLCVNAQTLTALISFRNHLVATHAITGVQIENYKPN
RTELELRQPPKLVNEIPLSIETEGLNSVLKNSENFGPIYTRFFQAIHEFTE
NT seq
4836 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgaatgataagttgcatccgactgatttgagagaaggtctaggtactgttcctcta
cttcacctaattcctaagcaagacttggctccattggtatcgttcaatgcggtcgataca
gaacccaatgatattgaggagatggaaatcaattcaacgtctgtcgccaataaaatgaga
tctgcaatgaatggcaatcctgaatattttagtaaagttatcgactatttagcggaagac
ttccgttcttttgaggaccgtgagttagatgatatcaccttcaagaaaccaattattgca
aagaattctctgacagataggcgaaagaagcctgaaattttgccatttgaaaagaggtta
ttcgaagagatgagtgaagttgacgattcttgtgttgaggacaaaactataattctgaat
acactacaaatagataaatcagagctttcgattcaagatgattacgatgcaaatactgtt
ttttctattcaacagcataatgagaaatttaaccaaaaattcgaacttcaaaagaaaaaa
atggctaaacaaaatgtattcgctatacctattcactttccagatgatcattcagctggt
caaagtaaacacttgttggacaacacagaagcaactccggcgcaacaggcgaaacggttc
caaaagacgtacttagaacgagaccaactcaaaactagagcttgtgaagaattgatagaa
ataattaataatatcggtttagttgatgaagatattaataatgacaaatatttctctagt
ataggtgaaagcaaactattaaccactgaaacgctaatattcattttagaccgtttattg
agaattctgaatgatcatgttattgaccaagtgagccttgaatacttgattagaattgaa
aagctttgcattagatctatatccgagggtgtcctgactaactggaatgaattgatcgaa
ctttctgacgtcaatactcttcaagaattcatgaaaaattacgattgtgtacgaaaacta
ttcgagctggccttgaatgggactatttcagctaaagttattttgctgatacttgacagt
agaaggaataataagcaattatttttggatgaatatttcaagtcaatcatagatttaatt
tacttattagttcaagatgtaattattccctttgcgagcaaaacgatacctgatattcaa
atagtaaatgttttaagaggtttttgtttggggctaattactgatgtctgctcaattaaa
agcatggtatcaatccatattgaaaaagatgaagttgatgaatatttattgacgagactt
gagtacttatccattattatagtgtttgcagagtcgaatattaaagagagagtgtcaata
gttggtgtaagtaattttgataacttgagagtttgttcatgtaaggtccttacatgtatt
tttaagcatcatttagaccaaaggcagtttattttaaacgaagtcctatcaaatttcgat
aagctacctacccataaagttgcagctcgacgtttcaaattgaatagaggtggaaatatt
caactcacaactgtcttgttattgaatttgttgcaaagctttgacatatctaaatattcg
ctggatgcgaatgaagccagacaagcaaattctgatgacaaatataagtcgcttgtggaa
aacaaaagaagaatgattatggagaatgtatctttgtcactcgaagaagttaccaaaaca
tctaatgatattgctacatttttgatgaataagttatataacaaccctgataatcagcaa
aaactatcacttgaactacttttagaagatctacttgctgttgttattttacctgaatgg
ccatctgctgaaattttgctaatatcaatatttaaggcgttgttatttgttatacaatca
ggaacatattcttccttaattgaaacttctgcgttagaactatctggaatgattggtgct
aagatttttgaattgaaacaagcatgcactggtgtccatcagttaaacgttaactcctcc
aacgaagatatccttttttattctgggtgttttatagattcgcttgagtacgtgcaattg
caatccatgaaaaatactaattatattacagctttcaggcttttgatcatgaaattcatt
tgtcggatcaaagtcattattcaagataatgatcgtggtaatacagaaaatcaattagct
gctttgaattctgacaatgataattcatcccaactcgctacagttaggaatgatgccaat
ttattatatgatcgccttttaggtattctagctgatgacagtattaatcttaaccaaacc
ttgaaatcaaatatggacgccctgtctatatcgtcatatatacaaatattattaacccaa
gaattgctagatcttttcgataattttcttaatgtcatggtgaataccttagatagtaca
aaagtcaaatcgaaaactaaagcaataaggaccttgtcgtcattgattgatattgatcca
acattattagtttcatctaagattcaagagtctgtttctaaaagattattggattcctct
cccttggttagagatgcagttatagatttgattagtagatttatgctgtccaagccagaa
gtcattgatcaattccataggcccatatgcgatcgtttgaatgatgatagtattcaagta
cgaaagcgtgtaattaaactttcaaaggaaatgtatttgaaaactgataaagtatcaatt
aaaagtcaaatatctatgaaaattttaagaaggttagatgatgaagatgacataatggca
agtattgcaaaatcctatttacttgaactatggtttacatcattagcagatgagattaga
tcaatggatatgggacaaattctggaagccaccgcgaagagagcagatgttataatggaa
attaccagtattgggggaaggactacggcatattttgaaacattcttaacagaatatgtt
ttatgcaatcctgatcctaaggtaattctgaccgtaaaattaatcatagataaaactttg
gatcgaattattgattgtgtcaatacaaaatcccaaacacaagttgagaaggccttgatg
cttatctcgacatttgttaaatgtgatggtaaactaatgactcaagatcaactagtttca
ttgcagccatatttggttgatgaaaagaattcaggagaggcggtttgcttctatagttta
caaatactcaaatacgtacttccatgttttccagcgttgaggccgggatttgttgatgct
gctgagacatatttattacgtcggcttaccaaattcaatgtaaaagagttacatgaagct
atgccttgtgtttggagactatgctatatgaataaagatacagttaaactagcgaatgca
tcaatctcgtgcatgaagcttataaagccattcttcgatttatcgaagaaagatgaaaaa
ataggtttcaacactaaattacatagattgcttcatctactcggatgctttgggacatat
tgtaaacttgagaagcatagggatatatatctaaaagcccgtattggtctaaaggaaaac
gaaacagttattagtgtcattacaaagtttctattgttcttttgtgggtctaacttcctg
tctcagattaaaaaaattgcaatcaagaacattatcagcatttgttctacacacccaaaa
ttgtttatgtctgaggctatcttaaaggttttagatcgtgaatttgacgatgttgacgta
gatattaagcgcactattattcaaggatttatggatttcttaaagaacgaagataataat
tcaaagaaacttaatggggtacaaacaaaatcatcgacagaaataaagttggatgttgca
gtttttcatggtgatgctaaatcatatgttaatgatggtatctgtgctggtataattcaa
aggtatttagaaaaaatactagagttttgccttcaagaatcagatgaattagctgtacta
cctgttcaatttgttcagttagtaattaagctaggttttgcaaatcccaaaatttgcatt
ccatatataattgccttggagtcaacaacaaatccacatatcagacatattgcttttgaa
ttgcatactgaactattcgagaaacatgaatctttgactgattcgagttatctagaaggt
ttaaagttagcagtagcttttagaaagcggacatctaacaatatttatcaagaaaaattc
ttcataaataatttatattccattgtaaatggaaattattcgtcaagaaaaaagctcatt
ttatctcttgccaaagtatttaacatcaatcttggttttacaaaattggaagacaataca
tttcaaagagatacgattatttatacagcatttaacattgcagctattcattttgcatct
ttagaagaagtactcatatttgtttacaatataaacagagtaatatctagagaaggatta
gatctatctgataagatcttgaaagagacgaatcctaattcaccgaatactcagccaact
tcgtacaaacggaatttatgtgtaaatgcacaaacattaactgcgttgatatctttccga
aatcatttagttgcaacacatgctattactggtgttcagattgagaattacaaaccgaat
aggacggagctagaattgagacaacccccaaagttagttaacgaaattccattatccatt
gaaaccgaaggattgaattcagtcttaaaaaattcagaaaattttggtcctatctacaca
agattttttcaagcaatccatgaatttacagaatag
DBGET
integrated database retrieval system