Diospyros lotus (date-plum): 127796349
Help
Entry
127796349 CDS
T10632
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
dlt Diospyros lotus (date-plum)
Pathway
dlt03015
mRNA surveillance pathway
dlt03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dlt00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
127796349
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
127796349
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
dlt03041
]
127796349
Spliceosome [BR:
dlt03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
127796349
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127796349
NCBI-ProteinID:
XP_052184398
LinkDB
All DBs
Position
3:31245237..31252059
Genome browser
AA seq
471 aa
AA seq
DB search
MSGMYGHEGDGSAPPPPGGGYGGGGPSGGGNYGGAGGYGGGAGGSSGGGYGGGGGYGGSG
GGGFGGNGGGGGYGGSGGGGYVSGGGSGGGRGGRGGGGGGYGGAGGGYQGGDRGGRGGGG
GNRGGGRGGGSGREGDWRCPNPSCGNLNFARRVECNKCGAPAPTSAGDRGGSAGSGYRGG
SGGQGGRGSNYDGGSGGGSRGGSYGSSQGRDDVGYGQVPPVAPPSYGGPGGSYPPPMNNY
GGNPSYGTDAVPPPTSYTGGPNSYPPTYGAPASYGSDAGGDARNGGRGGRSGGYGGGPRN
SGGGYGTAPAEAPAKVKQCDENCGDTCDNSRIYISNLPPDVTVEELQELFGGIGQVGRIK
QKRGYKDQWPWNIKIYTDEQGNNKGDAALAYEDPSAAHCAGGFYNGHEIRGYKISVAMAE
RSAPRAPPSFGGGGGGRGGYGGGDRRRDNYRDGGGSGPDRNYYGGNRSRPY
NT seq
1416 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggtatgtacggtcacgaaggcgacggatccgctcctccgccccccggaggaggc
tatggaggtggcgggcctagcggcgggggaaactatggcggtgccggaggctatggcggc
ggcgccggaggtagcagtggtggaggatacggcggaggaggaggttatggaggcagcggt
ggtggaggatttggcggaaacggtgggggaggaggttacggaggtagcggtggtggaggt
tatgtttctggtggaggaagcgggggcggtcgaggtggcagaggaggaggaggtggtgga
tacggtggtgctggcggaggatatcaaggaggagatcgtggtggtcgtggtggaggcggt
ggcaacagagggggaggccgcggtggtggaagcggcagggaaggtgattggcgttgcccc
aaccctagctgtgggaatctgaactttgctagaagagtagagtgtaacaaatgtggtgca
ccagctcctaccagtgctggagaccgtgggggcagtgctggtagcggttataggggagga
agtggtggacaaggtggtagaggcagtaattatgatggtggaagtggtggaggtagtaga
ggaggttcttatggcagtagccaaggaagagatgatgttggatatggtcaagttcctcca
gttgcaccgccttcttatggtgggccaggtggcagttacccaccacctatgaataattat
ggtgggaatcctagttatgggactgatgctgttcctccacctacgagctatactggcggg
cctaattcatatcctccaacgtatggtgctcctgctagttatggtagtgatgctggaggt
gatgctcgtaatggtgggcgtggtggccggtcaggtggatatggtggtggtcctcggaat
tctggcggtggctatggtactgctcctgctgaggctcctgcaaaggtgaagcaatgcgat
gagaattgtggggatacttgtgacaactcgagaatttacatctcaaatttgcctccagat
gtgactgttgaggaactgcaagaactttttgggggcattggacaagttggtagaatcaag
caaaagcgaggctataaagaccaatggccttggaatattaagatctacacagatgagcag
ggaaacaacaagggtgatgcagctttggcatatgaagatccatccgctgcgcattgtgct
ggtggcttctataatggtcatgaaattaggggttataaaataagtgtggctatggctgag
aggtctgctcctcgggcccctccttcatttggtggcggcggtggaggtagaggtggatat
ggcggtggagacaggcgcagagacaattacagagatggtggaggttctggtccagatcga
aattattatggtggcaatcgttctcgcccgtactga
DBGET
integrated database retrieval system
