Diospyros lotus (date-plum): 127811983
Help
Entry
127811983 CDS
T10632
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like isoform X1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
dlt Diospyros lotus (date-plum)
Pathway
dlt03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dlt00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
127811983
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
dlt03019
]
127811983
Messenger RNA biogenesis [BR:
dlt03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
127811983
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127811983
NCBI-ProteinID:
XP_052208173
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(31971444..31977319)
Genome browser
AA seq
465 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETDEDKLKDHFGLYGEVLQTVVMRDKTNGRPRGFGFVVFSDPSVL
DRVLREKHVIDGRMVEAKRALSREDQQISSRSGNSSNARSYGGGGNFRTKKIFVGGLPPT
ITEEGFRQYFEIYGNVSDVVVMYDQQTQRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKQFHDLDGKQV
EVKRALPKDANPSGGGRSSANTASSGGGGAYQGYGASGGNSGSYDGRADSNRYMHSQNTG
GFPPYGSSAFSAPGYGYSPASNSMGYGGYSGYGGTNPGYGGPHGGAYGNPNVPSPGYGGG
PPGAPRNSWSSQTPSGYGAVGYGNASPWGTPNASGGGPGTGGPMTAATAQSPGGPSGYGN
QGYGYGGYGGADGSYANQAAYGAVGGRAGSVPNSNASAGGGGGELQGGGYMGGSYGDVNV
NAGYGIPGWRSDPSQTSGNYGVQVNGAHGAHLGYGGAPTRQAQQQ
NT seq
1398 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaggggaagctcttcatcggagggatatcgtgggagacggacgaggat
aagctcaaggaccatttcgggctctatggcgaggtcttgcagacggtggtgatgagggac
aagacaaatggaaggcctaggggtttcggttttgtcgtcttttcagatccttccgttctt
gatagagttctgcgggagaagcatgtaatcgacggtcgaatggttgaggctaagagggct
ttatctagagaggatcagcagatttcctccagatctgggaactctagtaatgctagaagc
tatggaggtggcggaaatttcaggaccaagaaaatatttgttggaggcttgccacctaca
ataactgaggaagggtttcgtcagtattttgaaatttatggtaatgttagtgatgtcgta
gtcatgtatgatcagcaaacccagcgacctcgtgggtttggatttatttcctttgacagt
gaggatgcagttgatagagttctgcacaagcaattccatgacttagatggtaagcaagtg
gaagtgaagcgggctcttcccaaagatgccaaccctagtggtggtggccgttcctcagct
aatactgcatctagtggtggaggtggtgcttatcagggttatggcgcttctggtggcaat
tcaggttcatacgatggtcgtgccgattccaacaggtatatgcattctcagaatactgga
gggtttcctccttatggttcttctgcatttagtgctcctggttatgggtattctccagcc
agtaacagtatgggctatggtggttacagtggttatggtggtaccaatccaggatatggt
ggccctcatggtggggcctatggaaacccaaatgttcctagtcctggttatggaggtggt
ccaccaggtgcccctcgaaattcgtggagctctcagactccttctgggtatggggctgtg
gggtatggaaatgcttctccttggggtacccctaatgcaagtggtggtggtcctggtacc
ggtgggcccatgacagcagccacagctcagtctccaggtggaccttcaggatatgggaac
caaggttatggttatggtggatatggaggggctgatggttcatatgcaaatcaagctgca
tatggtgctgttggaggtcgagctggcagtgttccaaatagcaatgcttctgctgggggt
ggtggtggagagctgcaaggtggaggctatatgggtggtagctatggtgatgtgaatgta
aatgcagggtatggaattccaggatggaggtctgacccctctcaaacttctggaaattat
ggggttcaggtaaatggagctcatggtgcacatcttggttatggcggtgctcctactcga
caggctcaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
