Deferrivibrio metallireducens: DSN97_04145
Help
Entry
DSN97_04145 CDS
T11962
Symbol
mutS
Name
(GenBank) DNA mismatch repair protein MutS
Organism
dmf Deferrivibrio metallireducens
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_I
MutS_III
MutS_IV
MutS_II
AAA_27
MutS_C
Rad17
AAA_14
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOD35522
LinkDB
All DBs
Position
816413..818974
Genome browser
AA seq
853 aa
AA seq
DB search
MSESDFSKLTPMMQQFYSIKKEYPDCILFFRMGDFYEMFDDDAKTASKILGIALTNRNKS
SDNSPPMCGIPYHSYQTYLNKLLSAGFKVAICEQLEDPSKVKGIVKRGVVRVVTPGTIIE
DETLSNSNFNFLVAVSKGRDFYYAAIADISTGDLFLFNSKELSEIVNKFKPKEIIGEIDN
LNGINLPFFKIERVYHYKSMLTGITDYFGGSSLKSVGITEDEYVKPVFYLLSYLKEMLIE
VKLKKPTVFLSDRQMYLDAIAQKTLELFESTSGRKDATLFNVLNKCSTPMGERLLAVYLM
SPTNDLNEIDIRLNIVEYFLYNKEKRVNIKELLKGVYDLERILTRLNAKKGTPRDLSWLK
SSLIPLTTIKKLLKGTNNPFIDDLYDNFDDLPDICEFLDKAVFDEPPISIDKGGTIKDGF
VKEIDELRFLRKNSRVELAKIESEEKEATGISNLKIKFNKVFGYYLEVPKSQIKNVPDYF
ERRQTLVNAERYIIPRLKELEEKILTSEDKLIELEKEVFEDIVEQIVKQSERIRNTSNLL
GRIDTLISFADVAESNRYVRPTVNDSGVIKIIDGRHPVIEKFLDEPFVPNDVFLNNDESR
LMIITGPNMAGKSTYIRTVALISIMAHIGSFVPAKDAEVGFIDRIFTRIGASDNLSQGES
TFMVEMVETGNILNNATEKSLVILDEIGRGTSTFDGVSIAWAISEYLLNKVKAKTLFATH
YHELSDIPLANHGAKNLTIEVKEWKNEIIFLRKIIEGSTDRSYGIYVAKLAGLPQEIVQR
SDEILKQLEKNEFGLDGLPKLARKAKKEQQIVQPMLIFEENEALEELRKIDVNNITPLEA
LNILAKLKELADE
NT seq
2562 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgagtctgacttttctaagttaacacccatgatgcagcagttttactctatcaaa
aaagagtatcccgactgcattcttttttttaggatgggtgatttctacgaaatgtttgac
gatgatgctaaaacagcaagcaaaatccttggaattgctcttactaacagaaataagtct
tcagataatagcccccctatgtgcggcatcccttatcattcttatcaaacttaccttaat
aaacttttgagcgcagggtttaaagtggcgatatgcgagcagctggaagacccttcaaaa
gttaaagggattgtaaaaaggggtgtggtgagggttgtgacacccggcaccattattgaa
gatgaaacattgtctaattcaaattttaactttcttgtagccgtatctaaaggaagagat
ttctattatgcggcaattgccgatatctctacaggggatttgttcctttttaattcaaaa
gaattgtcggaaattgtaaataaattcaaaccaaaagagattatcggggagatagacaac
cttaacggtatcaatttaccattttttaaaattgaaagggtttaccattataaaagcatg
ctcaccgggataacagactattttggtggctcatcgttgaagtcagtcggtattacggaa
gatgaatatgttaagccggttttttaccttctgtcctacctcaaagagatgttaatcgaa
gtgaaattaaaaaagcctaccgtgtttttatctgacaggcaaatgtatcttgatgctatt
gcccaaaagacgctggagctttttgaaagcacatccgggagaaaagatgccacattattt
aatgttctaaataagtgctcaacccctatgggtgaaaggctccttgcagtctatcttatg
tcccccacaaatgatttgaatgaaatagatatcagacttaatatagtggaatatttttta
tacaataaagagaaaagagttaatattaaagagcttttaaagggtgtatatgatcttgag
agaattttaacaaggttaaatgcaaaaaaaggcaccccgagagatttgagttggcttaaa
agttcccttatcccacttactactataaaaaagttacttaaggggacaaataatcctttt
atcgatgatttgtatgacaattttgatgatttgccagatatttgtgagtttttggacaaa
gccgtctttgatgaaccgccgatatccattgataagggtgggacgataaaagatggtttt
gtaaaagagatagatgaattgcggtttttaagaaaaaacagccgtgttgagcttgctaaa
attgaatcagaagagaaagaagctacggggattagcaaccttaagataaaatttaataag
gtttttggatactatcttgaagttccaaaatctcagattaaaaatgtccccgattatttt
gaaagaaggcagacccttgttaatgccgaacgatatataatcccaagattaaaagagctt
gaagaaaaaatccttacatccgaagataaattaattgagcttgaaaaagaggtttttgaa
gatattgttgaacagatagttaaacaaagtgaaaggattcgaaatacctcaaatcttttg
ggcagaatagatacgcttataagctttgccgatgtggctgagtcaaacagatatgtaagg
ccgactgtaaatgacagcggtgtgataaaaataatagatggtaggcatcctgtgatagaa
aaatttttagatgagccttttgtcccaaatgacgtttttcttaataatgatgaaagcagg
ttgatgataattacaggcccaaatatggcgggtaaaagtacatatatcaggactgtagca
cttataagcataatggcacatatcggctctttcgtgccggccaaagatgctgaggtgggt
tttattgacaggatttttaccagaatcggtgccagcgacaacctttcccaaggggaatct
acatttatggtggagatggttgagacggggaatattttaaataatgccacggaaaaatca
ttggtgatacttgatgaaataggtaggggcacttcgacatttgacggagtatctatagct
tgggcgatttcggaatatttattaaataaagttaaggccaaaacactttttgccacacat
taccatgagctttcagacatccctctggctaatcacggagcaaaaaatcttaccatagag
gtcaaagagtggaaaaatgagataatctttctaagaaagattattgaggggagcacggac
agaagttatggaatttatgtggcaaagctggcagggcttccacaggagattgttcaaaga
agcgatgagattttaaaacaattggaaaagaatgaatttggccttgatggactaccaaag
cttgcaagaaaagcaaaaaaagagcagcagattgtccaaccgatgcttatttttgaagaa
aatgaagctcttgaagagttgagaaaaatagatgtaaataatataacccctcttgaagcc
cttaatatcttggcaaaattaaaggagctggctgatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system