Desulfosporosinus meridiei: Desmer_2313
Help
Entry
Desmer_2313 CDS
T02207
Name
(GenBank) collagen triple helix repeat protein
Organism
dmi
Desulfosporosinus meridiei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFQ44246
UniProt:
J7IZV8
LinkDB
All DBs
Position
2430803..2437303
Genome browser
AA seq
2166 aa
AA seq
DB search
MAELSTGLIENTPVGGMRPTVTFTVKFSNDDSTSAEISILGYYVTGITKTLYVQEDFVLG
AGEVTDRNYFANLNSFVFQFTTSSDAVEISAWGKDVDGNLVAPHRVLPAELYQIGSEDIS
GATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGAT
GDVGATGETGATGDVGATGETGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGVT
GDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGVTGDVGATGATGATGDVGATGATGAT
GDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGAT
GDVGATGSTGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGSTGAT
GDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGSTGAT
GDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGAT
GDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGAT
GDVGSTGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGVTGDVGSTGATGAT
GDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGAT
GDVGATGATGATGDVGATGATGETGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGAT
GATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGAT
GATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGAT
GATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGDVGSTGATGAT
GDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGPTGATGATGDVGSTGATGAT
GDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGAT
GDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGAT
GDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGAT
GDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTGSTGAT
GDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGAT
GDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGETGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGAT
GDVGSTGATGATGDVGATGATGVTGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGAT
GDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGVT
GDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGETGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGAT
GDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGAT
GDVGATGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGAT
GDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGAT
GDVGTTGETGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGST
GATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGAT
GATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGST
GATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGVTGDVGSTGAT
GATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGTPQLAFNN
NTGPISVFPPLNTEVTVASVTQSVIINQRLKIDYALGVDFVVTSNWAFVFEVRLYRDATL
INTRTSNRSAQTAGSQRFPLSSTYVDTAPATSASSTYSVRVIVTTATNVTSAATGNSITL
NIITFT
NT seq
6501 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagaattaagtaccggattgattgaaaataccccagttggtggtatgcgaccaact
gtgacctttacagtaaaattttctaatgatgatagtacatcagcagaaatttcaatattg
gggtattacgtgacaggaataacaaagacattgtatgtacaggaggatttcgtattagga
gctggagaagtaaccgacagaaactattttgcaaatttaaattcatttgtgtttcagttt
acaacaagttcagacgcagtggaaatatcggcatggggtaaagatgttgatggaaacctg
gtggcaccacatcgtgtgttaccagcagagttatatcaaattggctccgaagatatatca
ggggcgacgggagccacaggagctactggcgatgttggggcaactggtgcaactggagct
acgggtgatgttggggcgacaggggcgacaggggcaactggggctacaggggatgttggg
gcaaccgggtcaactggagccacaggtgatgttggggcgacgggtgcaactggagccacg
ggtgatgttggggcaacaggtgaaactggggccacgggtgatgttggcgcaacaggtgaa
actggggccacgggtgatgttggagcaaccggggcaactggagctacgggagatgttggc
gcaaccggatcaacaggagccacgggtgatgttggatcaacaggggcaactggggtcaca
ggtgatgttggatcaacaggggcaactggagctacgggagatgttggcgcaaccggatca
acaggagccacgggtgatgttggatcaacaggggcaactggggtcacaggtgatgttgga
gcaacaggggcaactggagccacaggtgatgttggggcgacgggcgcaactggggccacg
ggtgatgttggagcaacaggtgcaactggggccaccggcgatgttggggcaaccggatca
acaggagctaccggcgatgttggggcgacaggggcaactggagccacaggtgatgttggg
gcgacaggggcaactggagctactggcgatgttggggcaactggtgcaactggagccacg
ggtgatgttggggcaaccggatcaacaggagctactggtgatgttggatcaacgggtgca
actggagccacaggtgatgttggatcaacaggtgcaactggagccacaggcgatgttgga
gcaacaggtgcaactggagctacaggtgatgttggatcaacaggatcaacaggagctaca
ggtgatgttggagcaacaggtgcaactggagctacgggtgatgttggagcaacaggtgca
actggagccacaggtgatgttggatcaacaggtgcaactggagccacaggcgatgttgga
gcaacaggtgcaactggagctacaggtgatgttggatcaacaggatcaacaggagctaca
ggtgatgttggagcaacaggtgcaactggagctacgggtgatgttggagcaacaggtgca
actggagccacaggcgatgttggagcaacaggtgcaactggagccacaggtgatgttgga
tcaacaggggcaactggagccaccggcgatgttggcgcaacgggtgcaactggagctaca
ggtgatgttggatcaacaggtgcaactggagccacaggtgatgttggatcaacgggtgca
actggggccacgggtgatgttggatcaacaggggcaactggagccacgggtgatgttgga
tcaacaggggcaactggagccacgggtgatgttggggcgacgggtgcaactggagctaca
ggtgatgttggatcaacaggatcaacaggagctacaggtgatgttggagcaacaggtgca
actggagctacgggtgatgttggagcaacaggtgcaactggagctacgggcgatgttgga
gcaacaggtgcaactggggtcacaggtgatgttggatcaacaggtgcaactggagccacg
ggtgatgttggatcaacaggtgcaactggagccacgggtgatgttggagcaacaggtgca
actggagccaccggtgatgttggggcaaccggatcaacaggagccactggcgatgttggc
gcaacaggtgcaactggagccacgggtgatgttggatcaacaggggcaactggagccaca
ggtgatgttggcgcaactggtgcaactggagctacaggggacgttggcgcaactggggca
acaggtgaaactggagctacgggtgatgttggcgcaaccgggtcaactggggccacgggt
gatgttggagcaacaggtgcaacaggagccaccggcgatgttggcgcaacgggtgcaact
ggagccacgggtgatgttggatcaacaggtgcaactggggccacgggtgatgttggatca
acaggtgcaactggggccacgggtgatgttggatcaacaggggcaactggagccacgggt
gatgttggatcaacaggatcaacaggagctactggtgatgttggcgcaacaggggcaact
ggggccacgggtgatgttggagcaacaggggcaactggagccaccggcgatgttggcgca
acgggtgcaactggagccaccggtgatgttggggcaaccgggtcaactggggccacgggt
gatgttggagcaacaggtgcaactggagctacgggtgatgttggagcaacaggggcaact
ggagccacgggtgatgttggagcaacaggtgcaactggagctacgggtgatgttggatca
acaggtgcaactggagctacaggtgatgttggcgcaaccgggtcaactggggctacaggg
gacgttggggcaactggagctactggcgatgttggatcaacgggtgcaactggagccaca
ggtgatgttggatcaacgggtgcaactggggccacgggtgatgttggagcaacaggtgca
actggagccacgggtgatgttggggcaaccggatcaacaggagccacgggtgatgttgga
ccaacaggggcaactggagccacaggtgatgttggatcaacaggtgcaactggggccacg
ggtgatgtaggagcaacaggtgcaactggagccacgggtgatgttggggcgacgggtgca
actggggccacgggtgatgttggatcaacaggtgcaactggagccacaggcgatgttgga
gcaacaggggcaactggagctacaggtgatgttggcgcaaccggatcaacaggagctaca
ggtgatgttggagcaacaggtgcaactggagctacgggtgatgttggagcaacaggtgca
actggagccacgggtgatgttggagcaacaggtgcaactggagccacgggtgatgttgga
gcaacaggtgcaactggagctacgggtgatgttggagcaacaggtgcaactggagctacg
ggtgatgttggagcaacaggtgcaactggagccacaggcgatgttggagcaacaggtgca
actggagccacaggtgatgttggatcaacaggggcaactggagccaccggcgatgttggc
gcaacgggtgcaactggagctacaggtgatgttggatcaacaggggcaactggggctaca
ggtgatgttggcgcaacgggtgcaacaggagccacgggtgatgttggatcaacaggggca
actggagctaccggtgatgttggggcaaccgggtcaactggggctacaggggacgttggg
gcaacaggggcaactggagctacaggtgatgttggatcaacaggatcaacaggagctaca
ggtgatgttggagcaacaggtgcaactggagctacgggtgatgttggagcaacaggtgca
actggggccacgggtgatgttggagcaacaggtgcaactggagccacgggtgatgttgga
gcaacaggtgcaactggagccacgggtgatgttggagcaacaggtgcaactggagccaca
ggtgatgttggatcaacaggtgcaactggagctaccggcgatgttggggcaaccggatca
acaggagctactggcgatgttggcgcaacaggtgaaactggagctacgggtgatgttgga
tcaacaggggcaactggagccacaggtgatgttggggcaactggtgcaactggagctacg
ggtgatgttggatcaacaggggcaacaggagctaccggcgatgttggagcaacaggtgca
actggggtcacaggtgatgttggatcaacgggtgcaactggggccacgggtgatgttggg
gcgacaggggcaactggagctacgggtgatgttggatcaacaggggcaactggagccacc
ggtgatgttggggcgacgggtgcaactggagccacgggtgatgttggggcgacaggggca
actggagctaccggggatgttggggcaaccggatcaacaggagccactggtgatgttgga
tcaacaggcgcaacaggagctaccggcgatgttggagcaacaggtgcaactggggtcaca
ggtgatgttggatcaacaggtgcaactggagccacgggtgatgttggatcaacgggtgca
actggagccacgggtgatgttggggcaacaggtgaaactggagccacaggtgatgttgga
tcaacaggggcaactggagccacgggtgatgttggcgcaacaggggcaactggggctaca
ggggacgttggggcgacgggcgcaactggggccacgggtgatgttggcgcaacaggtgca
actggggccaccggcgatgttggggcaaccggatcaacaggagctaccggcgatgttggg
gcgacaggggcaactggagccacgggtgatgttggagcaacaggtgcaactggagctaca
ggtgatgttggcgcaacaggggcaacaggagccacgggtgatgttggatcaacaggatca
acaggagctaccggcgatgttggggcaacaggatcaacaggagctactggtgatgttgga
gcaacaggtgcaactggagccacgggtgatgttggatcaacaggtgcaactggggccacg
ggtgatgttggatcaacaggggcaactggagccaccggcgatgttggcgcaaccggatca
acaggagccacgggtgatgttggggcaaccggatcaacaggagctacaggtgatgttggc
gcaacgggtgcaactggagctacaggtgatgttggatcaacaggggcaactggggctaca
ggtgatgttggcacaacaggtgaaactggggctacaggggacgttggggcgacgggcgca
actggagctacaggtgatgttggcgcaaccggatcaacaggtgcaactggagccacgggt
gatgttggagcaacaggtgcaactggggccaccggcgatgttggggcaaccggatcaaca
ggagctaccggcgatgttggggcgacaggggcaactggagccacaggtgatgttggatca
acaggggcaactggagccacgggtgatgttggcgcaacaggggcaactggggctacaggg
gacgttggggcgacgggcgcaactggggccacgggtgatgttggcgcaacaggtgcaact
ggggccaccggcgatgttggggcaaccggatcaacaggagctaccggcgatgttggggcg
acaggggcaactggagccacaggtgatgttggggcgacaggggcaactggagctactggc
gatgttggggcaactggtgcaactggagccacgggtgatgttggggcaaccggatcaaca
ggagccacgggtgatgttggatcaacaggggcaactggagccacaggtgatgttggatca
acaggtgcaactggggccacgggtgatgtaggagcaacaggtgcaactggagccacgggt
gatgttggggcaacaggggccactggggtcacaggtgatgttggatcaacaggggccact
ggagctactggcgatgttggggcaactggtgcaactggagctaccggcgatgttggggca
actggtgcaactggagctaccggcgatgttggggcgacaggggcaactggggccaccggc
gatgttggcgcaacaggtgcaactggggctactgggacaccacaattagcgttcaataat
aatactggtcctattagtgtctttccgccgttaaacaccgaagttactgtggcgagtgtc
acgcaaagtgttataataaaccaacgactcaaaattgattatgcattaggagtagatttt
gtagtaacgtcaaactgggcatttgtttttgaagttagattgtatagagatgcaacatta
attaataccaggacttcaaatagatctgcccaaactgctggctcccaaagatttccctta
tcgagcacctatgtggatacagcacctgctactagtgctagttcaacctacagtgttcga
gtcatcgtaacgactgctactaatgttacttcagcagctacgggtaatagtattactctg
aacatcatcacattcacgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
