Desulfosporosinus meridiei: Desmer_2861
Help
Entry
Desmer_2861 CDS
T02207
Name
(GenBank) putative transcriptional regulator containing CBS domains
Organism
dmi
Desulfosporosinus meridiei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DRTGG
CBS
GntR
HTH_11
HTH_36
Hpr_kinase_N
HTH_29
FlK
MarR
TrmB
HTH_23
MarR_2
HTH_22
4HBT
HTH_28
UBA_HYPK
HTH_24
HTH_Tnp_ISL3
NEW1_HB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFQ44766
UniProt:
J7J1C8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2987731..2989053)
Genome browser
AA seq
440 aa
AA seq
DB search
MTKHQQILTFIEDLAIGSKVSVRFIAKELDVSEGTAYRAIKEAEGKGFVRSIPKVGTIRI
EGLKERQIEDLTLREVSQIAEGVVVCGFTHLDRSPNKFVIAAMELNTMARYLEAGALCIV
GNRRDAQIFALNNNSSLLITGGLEPDEEVVELARKHELVIIQSPYDTFAVTSMINRALYD
RLIQKELILVEDIMVEDVSFLTIDATVDDWRKLSQNTDHSRFPVVDKDMTLVGIVSAVDV
AGADVKTPIKDVMNANPFLVGRDDPVTHISRIMVWEGWEIAVVADQGKLIGIISLQDVIE
AYQQVQKQPQFGETVDNLVLSGFRFVDDAEHLTIEGEITNAMSDDYGSASCGVIVTVMNM
AGYISLRKKYRLNAITENFTLYQLQPIAVGTEIVVTAKLLLVAKKHCNIEVEVMANNDLV
AKGLMTARIGDKKLVSDTAH
NT seq
1323 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgacaaagcatcaacaaattttaacctttattgaagatctggcaattggtagtaaggtt
tccgtacggtttattgccaaggaactggacgtaagtgaaggaacggcttatcgggctata
aaagaagctgaaggaaaaggatttgttcgttcgattccaaaggttggaaccattcgaatt
gaagggctgaaggagagacaaatcgaggacctgacattgcgtgaagtttcacagattgct
gaaggagttgtagtctgtggtttcacccatcttgatcgctcccccaataagttcgttatt
gctgcgatggaattaaacactatggcacgttacttagaagctggggcattgtgtattgtt
ggaaatcgaagagacgcccagatatttgctttgaataacaactcgtcacttttaataacc
gggggattggagccggatgaggaagttgtagaattagcacgcaagcatgaattagtgatt
attcagtctccctatgatacttttgcagtcacctcaatgattaatcgtgcactctatgac
cgattgattcaaaaagaacttattttagttgaagatattatggttgaggatgtcagtttt
cttacaatcgatgcgacagttgatgattggcgaaaactgtcccaaaatactgaccacagt
cgttttccggtggttgataaggatatgactctggtagggattgtatctgctgtggatgtt
gccggagcggatgttaagacacctattaaagacgtaatgaatgcgaatccatttctagtc
ggacgagatgaccctgtaacccatatttcacgaattatggtttgggaaggatgggaaatt
gccgttgtcgcggatcaggggaaattgattggcatcattagtctccaagatgtaattgaa
gcttatcagcaagttcaaaaacagccacagtttggcgaaaccgtagacaatcttgtgcta
agtgggttccgctttgttgatgatgccgagcatctcacaattgaaggagaaatcactaac
gctatgagtgacgattacggatctgccagttgtggagttattgtgacagttatgaatatg
gcaggttacatttccctgcgtaagaagtatcgacttaatgcaattaccgagaatttcact
ctttatcaattacagcccattgcagttggtacagaaattgtggtaacagctaagctgtta
ttagttgctaaaaagcactgtaatattgaagtcgaagtgatggctaataatgatttagtg
gccaaaggattaatgaccgctaggattggggacaagaaattggtgagtgatacagcccat
tag
DBGET
integrated database retrieval system
