KEGG   Drosophila miranda: 108161249
Entry
108161249         CDS       T06132                                 
Name
(RefSeq) nipped-B protein isoform X1
  KO
K06672  cohesin loading factor subunit SCC2
Organism
dmn  Drosophila miranda
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:dmn00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:dmn03036]
    108161249
Chromosome and associated proteins [BR:dmn03036]
 Eukaryotic type
  Sister chromatid cohesion proteins
   Adherin complex
    108161249
SSDB
Motif
Pfam: Nipped-B_C Cohesin_HEAT Cnd3
Other DBs
NCBI-GeneID: 108161249
NCBI-ProteinID: XP_033248708
LinkDB
Position
4:complement(19096601..19107911)
AA seq 2118 aa
MGDRDIPSVPVTTLAGLTSTSDLLSELPVSDSLLSAASLNKSLLFHALVASESDNLLSVR
DGTLVRQLVNAIEQTNSDNIELKPEYTIEQHGTNISTYPELLQGIYNFRPTVFNTPLKIT
RSEHNKAKGLTPSEHMEGQLHSSPQPTALSTDLSHNMQQCKKSSSMAGTDVLPDEYSMIS
SRTNVNEFNKRMEKPANQDQDVTQTLPKIEEMEIAQNASEIKNPSSSLYSVQQQYFSPLK
AREYSLNCDNLKPADNRPSFPRMDDEFPFLESPIYHLQAAMTESQAPTTSTSMIQGNFQN
VLNLQRQQITESAAHHKDQQKSLLPSNKNQLPTLSTNVPHEQLLPATSTSLISNNSGHAI
GQEPHQNNNSASTATSTSTSSSGKSQVRVCINRLNVEDTRLMQQSIKKFVQKSPELARSI
GLLQQSSEQQPNTRLNIAAELEVGRTTTESLNTTLDMFSTIKADEKRFASKRKMAISIGD
IPPEQIFSKPKVRRVERIIAVSNSKDSKDEVTRSQTYQHFMRNMEQIIEMLDDTESPNFD
SEHVDENIECISPKLLNTMSNDVAKLKAKQALDSIPKNKLTLLINYAMRNVYLARNYFAG
PEDEDEIVDDEVIEKILNAMDACLLICNIYSTVSDLKFLQEDNISHIIKFAQFQLRETIF
PCHDPVYTVKSTKKTTNRKKIKSHQGHQRNLQIFYSKTVELLKVFVALFDKCIFVDTIVL
PLSTLAIEPFFVDNIETLQFVCLELVTTIFRKERYDKIRNSILGDILSSIDRLPSSKKNL
RPYKLTNNGGNIQMVTALVLQLIQCATILPDSLCDNGKTTTFQLTVDNEDDLENSAKKIV
KPNKDIVVLKKYDVAVSIGGNFLTTFLNKCKSRSNETDFRPLFENFIHDLLATVNKPEWP
ASELLLSLLGTMLVRYVSDKGIEQSIRLVSLDYLGIVAARLRKDTVESRCKVNIIDSMIK
SIKVEQEKEGDLSNNNTKIELHPEEQRTEFLQKILLDFLAVNAQEENLIWDYARHFYLAQ
WYRDVIYQRRRIKDGEKGFALRKSKIRNKRKTGKYLETSDSESCEENYNEDSTKNGNPSI
ELIDYELNLEIFNVLEERKQYLISKIKPYSVSGEQHHTSHQQIKTYIDYNNAQLIAQYLA
TKRPFSQSFDGCLKKIILVVNEPSIAVRTRAMKCLANIVEVDPLVLKRKDMQMGVNQKFL
DTAISVREAAVDLVGKFVLSNQELIDQYYDMLSTRILDTGVSVRKRVIKILRDICIEYPD
FEKIPEICVKMIRRVNDEEGIQKLVTEVFMKMWFTPCMKNDKHGIQRKINQIIDVVNTAH
DTGTIWLEGLLMSIFKPKDNMLKNDGSIQEAVKKNTEPPQEIVLACQQLADGLIDRLIEL
EDTDNARMLGCITTLHLLAKVRPQLLVRHAMTIEPYLNIKCHSATAAKFICAVADILEKV
VPLVNNASESFLASLEEHLMLLVVSRNQAEVTSCVSCLGALVNKITKNYKLIRDCFQKFY
RVLDVSRNQVVQKNCSADNIYTPSFRRSLFTIGILMRYFDFKSPIALGETNGGLPASICD
DVFECLMFFCRCSNQEIRKQALISLGSFCVLNDDYLTRSELKQFYCDLLNSTTSDGGIKI
ICMRNIWIYLTESEMFMHNKEKEWEKQSKHEDLKEMNDVSSGMSSRIIQLYLEEILNCFL
NRDDTVRLWAVKVVHIVLRQGLVHPVRMVPYLICLSTDPKVESAHRADALLKDIDKTYSG
FVNMKVQFGLQLCFKLQQILQINSRGNVEIIRGYAKRGPEHVTTALNDFLYTLLRSTKPQ
RRALVQTVTKQFDDQKTSLQQMLYIADNLAYFPYVVQDEPLYLIHQIDLLISMAGTHLLA
TFKEHLNPNDKEGDALEDDDDVEDPQVLFNRLPEDMTEIKKCITSAEACMLLLILKDHLK
DMYGLTDGKISRYSPSEQKMYEKAITRRGVNDFNPKTTIDLIKKQKSQQLSNSEPDCSSR
PLTNDEKLDLVVKYLDFKQLMLKLDPEDGDSDGDELREKSNLNNSSVSDGLIYLNSSKGS
KPPNDDSSFSSTPNVSNVQSSTIPATSTDEGTPRSRIVKSSIFPTKPSGRKQYIARNKRK
RRKIMSSDDDEVSDEEYA
NT seq 6357 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggggaccgtgacatcccgagcgtacccgtcacaacgttagcgggtctaaccagcact
tctgatttgctcagcgagctacctgtatccgattctctcctgagtgcggcctcactgaat
aagtcactgctgttccatgctttagtggcaagtgaatctgataatttgctttctgtccga
gatgggactctcgtacgtcagttggtgaatgccattgaacaaacaaattcggacaatatc
gagctaaagccagagtatactattgaacaacatggaactaatattagtacctatccagag
ctactccagggcatttacaatttccggccaactgttttcaacacgccattgaagataacg
cgaagtgaacataataaagccaagggactaacccccagcgaacacatggagggtcaatta
cattcctctccgcagccgacagcgttatctactgatctatcccacaatatgcaacaatgc
aaaaaatcttccagtatggctggtactgacgtgcttccagatgagtattccatgatcagc
tccaggacaaacgtgaatgaattcaataaaagaatggagaaaccggcaaaccaagaccaa
gatgttacacaaacacttccaaaaatcgaggaaatggaaatcgctcagaacgcttcagaa
ataaagaacccaagttcatctttatattctgtgcagcaacagtatttcagtccccttaaa
gctcgggaatattcattgaattgcgataatcttaagcccgcagacaatcgtccatctttt
cctcggatggatgatgaattcccgttcttggaatcaccaatttatcatttacaagctgct
atgacagaatcccaagctcccacaacatcgacctcaatgatccaaggcaacttccaaaat
gtattaaatttacaaagacaacagattacggaatctgctgcacatcacaaagatcaacaa
aaatctttactgccaagcaacaaaaatcagttaccgacgctatccaccaacgtgccacac
gaacaattattacctgcaacttcaacatcgctgataagtaataatagtggacatgcaatc
ggccaagaaccgcatcaaaacaataattcagcttcgactgccacttcgacatcgacgtca
tcgagtggcaagtcccaggttcgggtatgtataaatcgtcttaacgttgaggatactcgc
ttgatgcagcaaagtattaaaaagtttgtacaaaagtcaccagaattggctagaagtatt
gggctactacaacaatcatcagaacaacagcccaatacgagattgaatatagccgctgag
ttagaagtcggtaggaccactacggaatctttaaacacaacattggatatgttttcaaca
attaaagcagacgagaaacggtttgcttcaaagcgaaaaatggctatttcaattggtgat
attcccccggaacaaatattctcaaagcccaaagtacgtcgcgtcgaacgaataatagcc
gtttcaaactcaaaggattcaaaggatgaagtaactcggtcacaaacatatcaacatttt
atgagaaatatggaacaaattattgagatgttggacgatacggaatccccaaattttgat
tcagagcatgttgacgaaaatattgagtgcatttccccaaaacttcttaatacgatgagc
aatgatgtggccaagttgaaagctaaacaagccttggactccataccgaaaaacaagtta
acccttctaataaattacgctatgcgtaatgtttatttagccagaaattattttgctgga
ccagaagacgaagatgaaattgtagatgatgaagtaatagaaaaaattttaaatgcaatg
gatgcttgcttacttatttgcaatatatattcgacagtgagcgatcttaagtttttgcaa
gaggacaacatttcacatattatcaaatttgcacaatttcaactgcgcgaaactatattt
ccttgccatgatcctgtatatacagtcaagagtacgaagaagactactaaccgcaaaaaa
attaagtcgcatcaaggacatcagcgaaatctacagatcttttactctaaaacagttgag
ctattaaaagtttttgtggctctttttgataagtgtatatttgtcgatactatagttttg
ccgctgtcgacgcttgctatagaaccattctttgtagacaatattgaaacattgcaattt
gtgtgcttggaactagtaactactatatttcggaaagaaagatacgataaaataaggaac
agtatcttgggagacatattgtcttcgattgatcggttgccttcatccaagaagaacctt
cgtccgtacaaacttacaaataatggcggaaatattcaaatggtgacagcacttgtgctg
caattaattcaatgtgctacaattttaccagactcgctttgtgataacggaaaaacgact
acatttcaactgactgttgataacgaagatgatcttgaaaacagtgctaagaaaatagtt
aaaccaaacaaagatatagtggttttaaaaaagtatgatgtagctgtcagtattggaggc
aatttcttaacaactttcttaaacaaatgcaagtcacggtccaatgaaacagactttcga
ccgctatttgaaaatttcatccatgatctgctggccaccgtcaacaagcccgaatggccc
gcatctgaactgctgctttcacttctgggaactatgctcgtccgatatgtgtctgataag
ggtatagagcagagcattcgcttagtgtccttagattaccttggcatagtagctgctcgt
ctgcgcaaggacacagttgagtcccgatgtaaagttaatataattgattcaatgattaaa
tcaataaaagtggaacaagaaaaagagggagatctatccaacaataacacaaaaattgaa
ctacacccagaagagcagcgaacggaatttctgcagaagattcttcttgattttctagct
gtaaatgcgcaagaagaaaatttaatttgggactacgcacgacacttttatttggctcaa
tggtaccgagatgttatctatcagagacgtcgaataaaggatggagaaaaaggcttcgcg
ttgagaaaatctaaaatccgaaataaacgaaagacaggtaaatacttggaaacatcagat
tctgaatcgtgcgaagaaaattacaacgaagactcaacaaaaaatggaaatccgtctatt
gaattgattgattatgaactcaaccttgaaatttttaacgttttagaggaacgaaaacaa
tatttaatcagtaaaataaagccatattcggtttctggcgaacaacatcacacatcacac
cagcaaattaagacttacatagattataataatgcacagctaatagcgcaatatttagct
actaaacggccctttagtcagtcatttgatggatgcttaaagaaaattattttagtcgtt
aatgaaccgtccatagcagtaaggacacgtgcaatgaaatgtctcgctaacattgtggaa
gtggatccattggtactgaaacgaaaagatatgcaaatgggtgttaaccagaaattctta
gatactgctatctcagtacgcgaagctgctgtagatttggttggaaaattcgtactcagc
aatcaagaattaattgatcagtattacgatatgctatcgactcgaatattggatactgga
gtctccgtgagaaaaagagttattaaaatattgcgtgatatttgtattgaatatccagac
tttgagaaaattcccgaaatttgtgttaaaatgatacgacgggttaatgatgaggaagga
attcaaaagcttgttaccgaggtttttatgaaaatgtggttcacaccgtgtatgaaaaat
gacaaacacggcatacaacggaaaattaatcagattatagacgtggtaaatacagctcat
gacactggaactatatggttagagggacttttaatgagtattttcaaaccgaaagataac
atgctaaaaaacgacggaagtatccaagaagctgtgaaaaaaaatactgagccaccgcaa
gaaatagtgctggcatgtcagcaattagctgatgggcttatagaccggctgattgaatta
gaagacactgataatgcgcgaatgctcggttgcataactacactgcatttgctagcaaaa
gtgcgaccacagctcctggttcggcatgcaatgactattgagccttatctaaatattaaa
tgtcattcagccacagctgcaaaattcatatgtgctgttgcagatattctcgaaaaggtg
gtgccccttgttaataatgctagcgagtcttttttggcttctttggaagagcatttaatg
ctcttggttgtttcgcggaaccaagcagaagtaaccagttgtgtatcctgtttgggcgca
ctcgtcaataagattacaaagaactataaattgatccgcgattgttttcaaaagttttat
cgcgttcttgatgtttctcgtaatcaagtggttcaaaaaaactgcagtgcagataatatt
tacacgcctagctttcgacgcagcctttttacgattggcatcctaatgcgatactttgat
tttaagtcacctattgccttaggtgaaacaaatgggggccttccggcatcgatatgtgat
gatgtgtttgagtgcttgatgttcttttgtcgttgctcaaatcaagaaattcgaaagcaa
gctctgatttcacttggttctttttgtgttctgaacgatgattacctaacacgatctgag
cttaaacagttttactgtgatttgttaaactccaccacaagcgatggtggcataaaaata
atatgtatgcgaaatatttggatatacttaacagaatctgagatgtttatgcacaataag
gaaaaagaatgggaaaaacaatcaaagcacgaagacctcaaggaaatgaatgacgtgtcg
tcaggcatgtcaagtcggataattcagctctatttggaagaaatcctcaactgttttctt
aatcgggatgatacggttcgactgtgggctgttaaagtagtacatattgttctgcgccaa
ggcctagttcatcctgttagaatggttccatatttaatatgcttaagtaccgaccctaag
gtagagtcggcccatagagctgatgccttattaaaagacatcgataaaacctattctggt
ttcgtaaatatgaaagttcaatttggattacaactttgctttaagttacagcaaatcttg
caaataaacagccgggggaacgttgaaatcattcgaggttatgcaaaacgaggaccagaa
cacgtgactacggcattaaatgactttctgtatactttacttcggtccacaaagccacag
agacgtgcactggttcagactgttacaaaacagtttgatgatcagaaaacatctctacag
caaatgctgtatatagccgataatctagcatactttccgtatgtagttcaagatgagcct
ttatatctgatacatcaaatagacttgctgatttcaatggctggaacacatctacttgca
acatttaaggaacatttgaatccaaatgataaagagggagatgcattagaggatgatgat
gacgtggaggatcctcaagttttgtttaatcgtttgccagaagacatgaccgagataaaa
aaatgtattacatccgccgaagcgtgcatgctccttttaatactgaaagatcatttaaag
gacatgtatggtctcacagatggtaaaatttcaagatattcgccttccgaacaaaaaatg
tatgaaaaggcgattacacgtagaggcgtcaacgacttcaaccctaaaacaacaattgat
ttaattaagaaacagaagtcacagcagctttcaaactcagaacctgattgttcctcaaga
ccacttactaacgatgaaaaactagaccttgttgtcaagtacctggatttcaagcaactt
atgttaaagctggatccagaggacggagattcagatggggatgaactgcgagaaaaatca
aacttaaataactcgtccgtttctgatggtcttatttacttaaactcttcaaaaggttct
aaaccaccaaatgatgacagcagctttagttcgacaccaaatgtaagcaatgttcaatca
tcaacaatacctgcgacttcaacggatgaaggtacaccgaggtctcgaatcgtgaaatca
tcaatttttcctacaaaacctagcggtcgtaagcaatacatagcacgaaataagcgaaaa
cggcgcaagataatgtcgtctgacgacgatgaagtcagtgatgaggaatatgcgtga

DBGET integrated database retrieval system