Dolichospermum sp. DL01: HEQ26_07120
Help
Entry
HEQ26_07120 CDS
T10442
Name
(GenBank) hemolysin
Organism
doc Dolichospermum sp. DL01
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Calx-beta
HemolysinCabind
SdrD_B
VWD
SpaA
CarboxypepD_reg
NOMO1-like_2nd
CarbopepD_reg_2
NOMO_3rd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSV62564
LinkDB
All DBs
Position
complement(1484976..1488560)
Genome browser
AA seq
1194 aa
AA seq
DB search
MTNLLQTTLNKTYNQLKNFAGLNDFWNLFEIAFGTQYDHTVATNLRSQWLVGDFSSFPQI
EVLDSSILGNASGAYGTSTNKIYLASNFLDTATDTDIIAVLLEEYGHFIDAHVNQKDSAG
DEGDIFSNLVRGNILSAAILQTLKSENDWATITVDGQSIEVEQATMFLSDLSFTASAGGP
FKVRDLLDAFYYENVQTINPGVFRARFKNVILPSVPNLPYNQIGSFVPGSPPTTGLTTTI
TPLDSTVKGLLIHTATSTIGGSTSAIWTPPSSIPPYSNTTTATNFLSPLPFTTISRHLFA
EDTFVGAPLNVGRMSRSSPMTTSKVTLVWTGTPSTTDSDPMLNLSLVPTSPSGATITPFT
IGINSFVGTENTTGWTGEVLTGLGAFEYVQQIEIPITYPFSSSYDVFVGGSLVSSASQDF
SIFFTSNPVVGQGHGWGDVHLVNFDGKPYDFQAVGEFILVKSLTDDFQVQTRQKPWYSGA
QVSVNTAFATTIDGYNVVYDSELAVGQELKIDGVTYNLASGQSVFLGSSKIQRSGNNYTF
TYAGLDGDISTTDDNDVVIALDNGSYIDINVNPADYRFGVLQGLLGNGDGVSTNDFALRN
GTDLGPNPTVQTIHTTYADSWRITQQESLFGTPTFADQSFPANYVSLNTLAEKNPQGVAN
AFATARKFGIAEGAFLNGGVLDFVVTGDEGFLKGAKQIADLALQNGDIKIPLGSIQGSKW
NDVNGNGVWDTGEKALAGWTIYIDSVTNGQLDPWEISTVTNADGQYTFSNLGPGEYAILE
VNQTGWIQTFPTTPYAVNLTAGQKLTGINFGNYFQLPKINLSPSNQTVVEGLTTPQNVTY
TVTLSSPTTQTISVNYATANGTATAGLDYTATIGTLTFAPGATSKVINIPILNDSLNEAD
ETFTLTLSSPTNASLGTLTTATTTITDTLTASVTTTLSANVENLTLTGTAAINGTGNAGN
NVITGNTGNNILDGGLGTDTLIGGLGTDIYVVDSATDTITEGANAGTDTIQSSVTYTIAA
LANVENLTLTGAAAINGTGNASNNVITGNGANNILNGGAGNDILTGGTGKDTLTGGLGVD
RFDYSTLTHSVLSIFDVITDFNANAGNDLFLVSTARTKFFNAGSVTTLEATGIAAKLTNT
LFTANSAAQFTFGTRTFVAINDATAGFSATTDAIIEVTGLTGTLGISNFTTTLV
NT seq
3585 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactaatcttcttcagaccactctcaacaagacctataaccaactgaaaaactttgct
ggtttaaatgacttctggaatttgtttgaaatagcatttggtacacaatatgaccataca
gtagccacaaatctccgttctcaatggcttgtaggtgattttagttcatttccgcaaatt
gaagttcttgatagtagcattcttggtaacgctagtggtgcttatgggactagcacgaat
aagatttatctcgcttctaattttcttgatacagctacggatacagacattattgcggtt
ttgttagaagaatacgggcattttattgatgctcatgtcaatcagaaagatagtgctggt
gacgaaggagacattttttctaatttggtgcgtggtaatattctcagtgctgcgatatta
cagactttgaaaagtgagaatgactgggcaacaattaccgtagatggacagagtattgag
gtagaacaggctacgatgtttctatctgatctcagctttaccgccagcgctggcggacct
ttcaaggttagagatttattggacgccttttactacgaaaatgtacaaacgattaaccct
ggcgtattcagggcgcgattcaaaaatgtaatattgccctccgttcctaatctaccttac
aatcaaattggtagttttgttcctggatctcctcctactactggactgacgacgaccatt
actccacttgactccacggtaaaaggactgcttatccacactgccacgtccaccattggg
ggttcaacatctgctatctggacaccaccttcttcaattcctccttactccaacacaact
actgcaactaatttcctatcacctcttccattcacgacaattagcagacatttatttgca
gaggatacgttcgttggtgcgcctctaaacgtggggagaatgtctcgttctagtcctatg
actacttccaaagttactcttgtttggacgggaactcctagcactaccgattcagatcct
atgttaaatctctcgttagttcctacaagtccatctggagcaactattactccatttacc
atcggtattaattcatttgtaggaacagagaatactacaggttggactggtgaggtgctt
acgggtctaggtgcatttgaatacgttcaacagattgagattcctattacctatccattt
tcgagcagttacgacgtctttgttggtggctcactggttagtagtgcctcccaagatttt
tccatctttttcacctctaaccctgtagttggtcaaggtcacggttggggagatgttcat
ctcgtaaattttgatggaaaaccctatgattttcaagcagttggggagtttattcttgtc
aaatctctgactgatgattttcaagtgcaaacccgtcaaaaaccttggtatagtggtgct
caagtttctgttaatacagcttttgccacaacgatagatggttacaatgttgtttatgac
tcagagcttgcagttggtcaagaactcaaaattgacggagtgacctataatttagcaagt
ggtcaaagtgtatttctgggtagtagcaaaatccagcgatcaggtaataactacacattc
acttatgcaggtttagacggtgatatctccaccacagatgataatgatgtagtcatcgct
cttgacaatggaagctacattgatattaatgtcaatcccgctgactatcgttttggggta
cttcaagggcttttaggtaatggtgatggggttagtaccaatgattttgctctgcgtaat
ggcacagacttgggacctaatcccactgttcaaacaatacatacaacttatgcagatagt
tggcggattactcagcaagaatcccttttcgggacaccgacatttgctgatcaaagtttt
cccgctaattatgtctccttaaacactttagcggaaaaaaatccccaaggagtagcaaac
gctttcgcaacggcacggaaatttggtattgctgagggcgcttttttaaatggtggggtt
ttagattttgtggtgacgggggatgaaggctttcttaaaggagcaaagcaaatagcggac
ttagcacttcaaaatggagacattaaaattccacttggaagcatccaaggcagtaaatgg
aacgacgttaatggtaatggtgtctgggacacgggtgaaaaagccctagcaggttggaca
atttatattgatagcgttaccaatggacaattagatccttgggaaatttccacagtcact
aacgctgatggtcaatataccttcagcaacttaggaccaggagaatatgccattctggaa
gtgaatcaaacaggctggatacaaaccttccccaccactccctatgcggtgaacttgaca
gccgggcaaaaattgactggcattaattttggcaactactttcagttacccaagattaat
cttagtcccagcaatcagactgttgttgaaggtttaactactcctcaaaacgtcacctac
actgttactctttccagtcccaccacccaaaccatcagcgttaactatgctactgctaac
ggtacagcaacagcaggattagattacaccgccaccattggaactctaacctttgcccct
ggtgctactagtaaagtcatcaatattcccattctcaatgattcccttaatgaggcagat
gaaacctttactttaactttgtcttctcctactaatgctagtcttggtacgttgacaaca
gctaccacgacgataaccgatactctcacagcctctgtcaccacgactttatcagcgaat
gtggaaaacctgaccctaacaggaacagcagcaattaacggtacagggaacgcaggtaat
aacgtcatcactggtaacactggtaataacattcttgatggtggtttaggtactgatacc
ttaattggtggtttaggtactgatatttacgttgtagatagcgccactgacaccattaca
gaaggtgccaacgcaggtacagacaccattcaatctagtgttacttacactattgcggct
cttgctaacgttgaaaacctaacactgacaggagcagcagcaattaacggtacagggaac
gctagtaataacgtcatcactggtaacggtgctaataacatcctcaacggtggtgctggt
aatgacatcctcaccggaggaactggaaaagataccctaactggagggttgggagtagac
cgttttgactacagcactttaactcattctgttctgagtatctttgatgtgattactgac
ttcaatgctaatgcaggtaatgatttattccttgtttccactgcccgcaccaaatttttt
aatgccggatctgtgacaacacttgaggcaaccgggattgcagctaagttaactaatact
ttgtttacagctaactctgcggctcaatttacctttggtactcgtacttttgtcgctatt
aacgacgctaccgcaggatttagcgccactacggatgccattattgaggtgacaggttta
actggtacgttgggaatcagtaactttactactaccttagtgtag
DBGET
integrated database retrieval system
