Dolichospermum sp. DL01: HEQ26_17155
Help
Entry
HEQ26_17155 CDS
T10442
Name
(GenBank) type I secretion system permease/ATPase
KO
K06147
ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial
Organism
doc Dolichospermum sp. DL01
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
doc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
doc02000
]
HEQ26_17155
Transporters [BR:
doc02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
HEQ26_17155
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
Peptidase_C39
SMC_N
cNMP_binding
AAA_22
AAA_21
NB-ARC
AAA_18
AAA_29
DUF87
ABC_ATPase
AAA_30
RsgA_GTPase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSV64219
LinkDB
All DBs
Position
3588415..3591018
Genome browser
AA seq
867 aa
AA seq
DB search
MLNNLPWNEPPLSWLNAEEKSELKQQAEIRNYKLGEKIWSQKLGGDAFDEGSYQFFIVTG
KVRLREEEENKTVATLQTGDWFGNCQQIFADCKAIATSKEVVVVCWNSALWKKFVNSQID
EFWTNSLEVEETEAILPVANSPISLPPSAPSPPIISNYPFVGSGNTGAACLTMVAQHLQN
PVQLEWVQRQLRGQKPKNLIEAAEKVGLVLRKLQVSWSDLRQLTFPALLLWNQSNQEGKN
NQLNWVVAYQMKGNYLIIANPQNPDYSCEQLPQSVVENCWHGTLWQAELISQQEKFNLAW
FTPAVWKYRGLLGEVLIASFTLQLLGLASPLITQVIIDKVMVQESLATLDVMAIALLLVA
TFESILGMLRLFIFTHTARRLDLSLSAQLFRHLMRLPLAYFESRRVGDTVARVQELEQIR
QFLTGTALTVILDSIFAVVYLGLMFYYNIPLTFVALAVLPLFATLTIVTTPILRNWLNET
FNRSADSQSFLVETITGIHSVKAHAAEPIARERWEGLFARFIRTSFKASTTSNISSNIGD
FLTNFSTLIILWVGAKLVIDHQLTIGQLIAFQMLSGRVTSPLLRLVQLWQNLQQVLLSVD
RIGDILNAAPETEAGTGLVLPHLKGEVNFDQVFFRYNANTEPVLKGISFNVEPGQFVGIV
GRSGSGKSTLSKIIQRLYQIESGRILIDGFDIKSADLASLRQQIGVVLQEDFLFNGSILE
NITLGNPDITSEQVVEAARLAVAHDFISQLPYGYENNVGERGTALSGGQRQRIALARLFL
ASAPILILDEATSALDSETEQQVLQNLKNVSSNRTVFLIAHRFAPLKRADLILVMEKGVI
AERGTHLELLKQKGLYWSLYQRQQANI
NT seq
2604 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttaaacaatttaccctggaatgaaccgccgctatcctggctaaatgctgaagaaaaa
agcgaattaaaacagcaagcggaaattcgtaattacaaacttggcgaaaaaatttggtca
caaaaattaggtggtgatgcctttgacgagggaagttatcagttcttcattgttactggt
aaagtccggttacgagaagaagaagaaaataaaactgtagctactttacaaacaggagat
tggtttggtaactgtcaacaaatatttgctgattgtaaagctatcgctaccagcaaggaa
gtagtagtagtgtgttggaattcggctttatggaaaaagtttgtcaattctcaaattgat
gaattttggacaaattcactagaggtagaggaaacagaagccattttaccagttgctaat
tctcccatttctctacctccttccgcaccttctccaccgataatttccaattatcccttt
gtgggaagtgggaatacaggtgcagcttgtttaacaatggtggcacaacatttacaaaat
cctgtgcaattggaatgggtacaacgccaactgcggggacaaaaacccaaaaacctgata
gaagctgcggaaaaagtagggttagtgttgcggaaattgcaggttagttggagtgattta
cgccaattaacttttcccgctttgttgttgtggaatcaaagtaatcaggaaggtaaaaat
aaccaattaaattgggtagtagcatatcaaatgaagggcaattatttaattattgctaat
ccccaaaatcctgattatagttgtgaacaattaccgcaatctgtagtagaaaattgttgg
catgggacattatggcaagctgaattaatttcccaacaagagaaatttaatttagcttgg
tttactcccgcagtttggaaatatcgaggtttgttaggtgaggttttaatagcttcattt
accttgcaattattgggattagcgtcaccattaattactcaagtcatcattgataaagtg
atggtacaggagagtttagccaccttagatgtgatggcgatcgctctcttgctagtggcg
acatttgaatctattctgggtatgctgcggctattcatatttacccacacagcccggcgt
ttagatttgagtttatccgcccaactttttcgccatttaatgcgtttacctttagcttat
tttgagtcgcggagagtgggcgatacagttgctagagtccaggaattagaacaaattcgc
caatttctcacaggtacagccttaaccgtcattcttgacagtatctttgctgtagtttac
ctgggattgatgttttattacaacattcccctgacatttgtagccttagccgtattacca
ttatttgcgactttaaccatcgtcacgacaccaattttgcgaaattggctaaatgaaacc
tttaaccgcagtgcggacagtcaatcatttttagtcgagacaatcaccggcattcattca
gttaaagcccatgcagccgaaccaatagcaagagaacgctgggaaggtttatttgcccgc
tttattcgtaccagttttaaagcctcaactacatccaatattagtagtaatattggtgac
tttctgactaacttttccaccttaatcatcctgtgggttggggcaaaattagtaattgat
catcaactgacaattggtcaattaatcgctttccaaatgttatcaggaagagttaccagc
ccactattacggctagtgcagttatggcaaaatctccaacaagtcctattatcagtagat
agaattggtgatattctcaacgctgccccagaaacagaagcaggaacaggattagtatta
ccacacctcaaaggtgaagtcaactttgatcaagttttctttcgctataatgccaacacc
gaaccagtattaaaaggaatttcctttaatgttgaacccggacaatttgtaggcattgtt
ggcagaagtggttcaggaaaaagtaccctttccaaaattattcaacgactttatcaaatt
gaatcaggacggattctaattgatggatttgatatcaaaagtgctgacttagcatcctta
cgacaacaaataggtgtagttctccaagaagactttttatttaatggttcaatcttagaa
aacatcacattaggaaatccagatattacctcggaacaagttgtcgaagcagccagatta
gcagtagcccatgacttcattagtcaactaccttacggttatgaaaacaacgtaggagaa
agaggaacagcattatctggaggacaaagacaacgcatagcattagccagattatttcta
gcgtctgcaccaattctcatattagatgaagccaccagtgccttagatagtgaaaccgaa
caacaagtattacaaaacctcaaaaatgtttcctctaaccgcacagtattcttaattgcc
caccgttttgcccccctcaaacgagccgatttaatattagtcatggaaaaaggagtaata
gccgaacgaggaacacatttagaactcttaaaacaaaaaggtttgtactggtcactttat
caaagacaacaagcgaatatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
