Dokdonia sp. Dokd-P16: DCS32_15580
Help
Entry
DCS32_15580 CDS
T05432
Name
(GenBank) polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA
Organism
dod
Dokdonia sp. Dokd-P16
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
PP-binding
Ketoacyl-synt_C
Acyl_transf_1
KAsynt_C_assoc
NAD_binding_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWH75531
UniProt:
A0A2S1QG06
LinkDB
All DBs
Position
3514260..3518879
Genome browser
AA seq
1539 aa
AA seq
DB search
MDTINSSLKKTPVAIIGLSAMFADAINVEQFWNNIISQKDSIVDVPASRWKIEDYYDADP
MVADKTYCKKGGFIPDVDFNPMEFGLPPNILEVTDASQLLALIAARDAFEDAGYGRESDK
FTALLKEKTGVILGVGGGQKLITPLTSRLQAPIWEAALRSSGISDTDIPHIVDKMKKAYI
GWNENSFPGMLGNVISGRITNRFDLGGINSVVDAACAASLSAVKMAVSELIEGRCDMMLT
GGVDTDNSPFMYMSFSKTPAFSRKGSIRPFDTDSDGMLIGEGVGMLVLKRLEDAERDGDR
IYGLLTGVGSSSDGRYKSVYAPRPQGQALAMQRAYDEAGYDASTVRLIEGHGTATGAGDA
AEFESMSMVFGKNNATKNNIGIGSVKSQVGHTKAAAGAAGMIKTALALYHKVLPGTINVT
KPHDKFGIENSPFYVNSETRPWFKNGIPRRAGLSAFGFGGVNVHFAMEEYEKKNSFTDRI
HQSFHSIYIKGANTEDLLTLLKNAHTSLNSKEGNTAFYNLKEISKEGTAEQSEARLGFVA
ESLIDCISKLEIAIKQLESNKNAWSHPRGVFFRPNGISSTTKVASLFSGQGSQYANMAKE
ATSSFERIQQTIADFDAKKGYDLANKIYPKPVFTEEDKAILEKNITNTEFAQPAIGAISL
GYYNVFKDAGFVSDMVAGHSFGELTALCASGVISQDDYMTLAIARGNAMAGKNTSGDAGT
MLAVKASASEIEPLITAITDVSIANINSSSQIVLGGTTEGIAKAKTLLDSKNHRSILLPV
SAAFHTDCVGHAQKPFEKSIETIEFTSPTIPVYSNSTGNSYPTEPSEIKRILGQHILNSV
DFKSEVENMYAAGARVFVEFGPKSILTNLVKDILADKEHFVVTTNAKATKNSDLQIREAA
IQLQVLGCKLNAIDRNARQEKKPVIQPKVAVKIAGNNYVSPATQKAYKDVLNNGFKVSGA
TDIIKTEEEIKEIEVISEVINAVPTYTSEEDPTDQETEEDMMVDVIKSAIEGIKENQSKT
LDMFQTILMEQNKQTAQLLNLLSGNLAPDENILEAPTAPLSIDTPAPEAPVTKPIVTPTA
VQPTVVNTAAPPASAPAVDTAAPATGNSEMLDLMLSVVADKTGYPAEMLELSMDMEADLG
IDSIKRVEIFGAITEQSDKLSDINPNDLTELRTLQEIVDYISAKAGISTTAAPVSSTIKE
VVAAPVAVPVARATPAAGNSEMLDLMLSVVADKTGYPAEMLELSMDMEADLGIDSIKRVE
IFGAITEQSDKLSDINPNDLTELRTLQEIVDYISAKAGISTTATPVAQTEKEVVTAPVAA
PAAQTTTTTSSNSEMLDLMLNVVADKTGYPAEMLELSMDMEADLGIDSIKRVEIFGAITE
QSDKLSDINPNDLTELRTLQEIVDYISAKAGISTTAATVETAVTASPEVVGTDLFSTPIV
ETAASTEGNSEMLDLMLSVVADKTGYPAEMLELSMDMEADLGIDSIKRVEIFGAITEQSD
KLSDINPNDLTELRTLQEIVDYISVKAGISSKKKSLSLA
NT seq
4620 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacactattaatagttcactcaaaaaaacgcctgtagcaattattggcttatctgct
atgtttgcagatgcaataaatgtagagcagttttggaataatattatcagtcagaaagat
agtatagtagatgttcctgcatcgcgttggaaaatagaagattattacgatgcagatcct
atggttgcagataaaacatactgcaagaaaggtggttttattccagatgtagactttaat
ccaatggaatttggattgcctcctaatattttggaagtaacagatgcctctcaattacta
gctttaatagctgctagagatgcatttgaggatgccggttatggtagagaatctgataag
tttacagcgttattaaaagaaaaaacaggagtgattctcggtgtaggtggtggacaaaaa
ttgattaccccacttacttctagattacaagctcctatttgggaagctgctttgagaagt
agtggaataagcgatacagacattcctcacattgtagataaaatgaagaaagcatatata
ggatggaatgaaaattcttttccaggtatgttgggtaacgttatttctggccgtattaca
aatcgttttgatctaggaggtattaactctgtagtagatgctgcttgtgccgcatcactt
tcggctgtaaaaatggctgtttctgagttaatagaaggaagatgtgatatgatgttaaca
ggaggagttgatacagacaattctccttttatgtacatgtcgttctctaaaacgccagca
ttctctcgtaagggaagtattcgtccatttgataccgattctgacggtatgttgataggc
gaaggtgtaggaatgcttgtcttaaaaagattagaagatgcagagcgtgatggagataga
atttatggtttacttactggtgtaggttcttctagtgacggtcgctataaatcagtttac
gctccccgtccacaaggacaagcgctagctatgcaacgcgcttatgatgaagcaggatat
gatgcctctaccgtaagactaatagaaggtcatggtactgctactggagctggtgatgct
gcagaatttgaatctatgtcaatggtttttggtaaaaataatgcgacaaaaaataatatt
gggataggttctgtaaaatcacaagtaggacataccaaagctgctgcaggtgcagccgga
atgattaaaacagccttagcgctatatcataaagttttacctggcactataaatgttaca
aagccgcatgacaaatttggaatagaaaactctcctttttacgtaaattcagaaacaaga
ccttggtttaaaaatgggattcctcgtagagcgggattgtctgcttttggcttcggtggt
gttaatgtccattttgcaatggaggaatatgaaaagaaaaattcttttacagatagaata
catcaatcttttcatagtatctacattaaaggagcgaatacagaagacttattaacgctt
cttaaaaatgctcatacttccttaaatagcaaagagggaaacactgcattttacaattta
aaagaaatttcaaaggaaggcacagcagaacaaagtgaagctcgtttaggttttgtagcc
gagtctctaattgattgtatatcaaaactagaaattgcaatcaaacaattagaaagcaat
aagaatgcttggtctcatcctagaggcgtgttctttagacctaatggaatttcaagcact
acaaaagttgcctcattattctcaggtcaaggttcgcagtatgcaaatatggcaaaagaa
gctactagtagttttgaaagaatacaacaaacaattgcagattttgatgccaaaaaggga
tatgatctagcaaataaaatatatccaaaacctgtatttacagaggaggataaagctatt
ttagaaaagaacattactaatactgagtttgcacaacctgcaatcggggctattagttta
gggtactataatgtgttcaaagacgctggttttgtaagtgatatggtagctggtcatagt
tttggtgaactcacagctctttgtgcatctggtgttataagtcaagatgactacatgaca
cttgctatcgcacgtggaaatgctatggcaggtaaaaatacaagtggtgacgctggtaca
atgctagcagtaaaagcatcggcttcagaaatcgaacctttgattaccgctataacagat
gtttctattgccaatatcaactcttcgagtcaaatagtattaggaggaaccacagaaggt
attgctaaagctaagacactattagatagtaaaaatcaccgctctatcttattacctgtc
tctgcagccttccacacagattgtgtaggacatgctcaaaaaccttttgaaaaaagtata
gagactatagaatttactagccctaccattccggtatactcaaactctactggaaattct
tatccaactgagccaagtgagattaagagaatattagggcagcatattttaaattcagtt
gactttaaaagcgaagtcgaaaatatgtatgctgcaggagcgagggtttttgttgagttt
gggcctaagtctattcttacaaacctggtaaaagatatactggcagataaagagcatttt
gtagttacaacaaatgcaaaagcaacaaaaaacagtgatttacaaataagagaagcagca
atacaactacaagtactagggtgtaaattaaatgcaattgatcgtaatgcacgtcaagaa
aagaagcctgtaattcagcctaaagtagccgttaaaattgcaggaaacaactatgtgagt
ccagcaacgcaaaaagcctataaagatgtgttgaacaacgggtttaaagtaagtggcgca
acagatattattaaaactgaagaagagattaaggaaatagaagttatctcagaagtgata
aatgcagttcctacatacacaagtgaagaagatcctacagaccaagaaacagaagaagat
atgatggtagatgttattaaaagtgccatagaaggcatcaaagagaatcaatctaaaaca
ttagatatgttccaaactattttgatggaacaaaataaacaaaccgcacaattactaaac
ttattatctggaaaccttgccccagatgaaaatattctagaagctcctacagctccacta
tctattgacactccagctcctgaggctcctgtcacaaaaccaattgtgactcctacagct
gtacaacctaccgtagtaaacactgcagcaccccctgcttctgcacctgcagtagacact
gccgctcctgccactggtaactcagaaatgctagaccttatgctaagcgttgtagcagat
aaaacaggatatcctgcagaaatgttagaactaagcatggatatggaagcagatctagga
atcgattctattaaacgtgtggagatttttggagcaattactgagcaatctgataaattg
tctgacatcaaccctaatgacttaactgagcttagaacattacaagaaattgtagattat
atctctgcaaaagcaggaataagcacaacagcagctccagtttcttcaactataaaggaa
gtagtcgcagctcctgttgctgttccagtagcacgagcgacaccagctgctggaaattca
gaaatgctagaccttatgttaagcgttgtagctgacaaaacgggatatcctgcagaaatg
ctagaactaagcatggatatggaagcagatctagggatcgattctattaaacgtgtggag
atttttggtgcgattaccgagcaatcagataaactttcagacatcaaccctaatgactta
acagagcttagaacactgcaagagattgtagattatatctctgcaaaagcaggaataagc
acaaccgcaactccagttgcccaaacggaaaaagaggttgttaccgctcctgttgctgct
cctgcagcacaaacgacaacaacaacttctagcaactcagaaatgctagaccttatgtta
aacgttgtagcagataaaacgggatatcctgcagaaatgctagaactaagcatggatatg
gaagcagatcttgggatcgattctattaaacgtgtggagatttttggagcgattaccgag
caatcagataaactatcagacatcaaccctaacgacttaacagagcttagaacattacaa
gaaattgtagattatatctctgcaaaagcaggaataagcacaacggctgcaacagttgaa
acagcagtcacagcttctccagaagtagttggcaccgatttattctctactcctattgtt
gagacagcagcttctaccgaaggtaattcagaaatgctagaccttatgctaagcgtagta
gcagataagacgggatacccagcagagatgctagaactaagtatggacatggaagcagat
cttggtatcgattctataaaacgtgtagaaatatttggagcaatcacagagcaatctgac
aagctatcagacatcaaccctaacgacttaacagagcttagaacattgcaagaaattgtt
gactacatctctgtaaaagcaggtatttcaagtaaaaaaaaaagtctgagcctagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
