KEGG   Dokdonia sp. MED134: MED134_00990
Entry
MED134_00990      CDS       T03275                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
dok  Dokdonia sp. MED134
Pathway
dok02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:dok00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    MED134_00990
SSDB
Motif
Pfam: CHU_C PKD_3
Other DBs
NCBI-ProteinID: EAQ39151
LinkDB
Position
1411289..1419802
AA seq 2837 aa
MKIQNYAVLIVLTLCTLPVFAQLGNTHYIPPIHARDVGGQDITSAYLYFSTPYDNPATAT
TDSIVITISLGNGTVLGTQTISAGAPASFNIGSNILITNTELNQALSTKGIIVSSTELFY
TSLRVQSSSGNHSGYLTAKGDDALGTRFRVGFSELNNTINNHNFFTSFMAVEDNTIITVS
DYETDVIFEPNITDDVLTITLNAGESYTLSGYGGASTPGNDDGFIGALITSQDDAHPIVV
TTGNINANDPSLNQGGSDILIDQIVQERLVGEEYMLVRGNGSDALERILVIATEANTDVS
INGNFLFTLTNPGDFEFIRDNDLFLPNILGEPHRNMYLSTGGGKSVYVYQLIGGDIGTDV
ANATPGMVFVPPLSCFFQNEVNLIPSVNEISPVFDAYDGRIFITSAVGDQVTVNGTILPA
MSALANPGTPDWVTYNVSNQTGDITVLSEGPIAVGLVGANFAAGFGGYYSGFAVTPEDTD
TDICTAAGPINLLDRFDGNPPTGGTWTPPLDSGTDIFDPATDPISNPSLIYNYFAVGDCD
SIDVNITITLVDYPSIDVIDDFTACETFTLADPATLSGNFLNNPQYYTALQSDPAATLID
WTIPITTTTTVFVYDENAEDPDLCPNEFSFTITIADEAIANPVPPVRICDDNTNDGTAIF
NLEMLTESIILGTQSAASFTVTWHTTVQQAIDNVMPFTTPAAYDTPSTTIYARIESNSSA
ICFDTTAIDLIVDSQPTANAVPTQNICDDSSSDGIENFDLTTLNSIILGTQSDILYNIDF
YPTPTDASSETNLITTPTNFTVTGTETITARIDNVSNDSCADFTDITLTIIPQATATDPG
SYIVCDDSADGDDTNQFTTFDLSTLDDDILNGQDPTIFTVTYHDNPGDANANNGALPTSF
INTDAEVQAITARVSNTQNDACFAIVTFNIVVAPLPVINSPASLSQCDIDQDGFAFFNLT
EAQVLLSSDPENETFLYYDLSGAAIANPTAYTNQIQNNESISVSISTINGCTRQAQIDLE
VDTSEIPDTFQLEYFECDTDSDGQSVFDFSDATAQVLALFPAGQMLTVSYYETQQEAETE
TNPITATIDAYTNNLTYTGANGQQGIWVRVDGDTANDCRGLGIHVLLNVEANPTFLPNIS
SLEECSPIANAAQFDLTQNDAQITGGDPNILVTYYENVGNYTAMNAIANPTAFSNSSNPQ
TIYYSLENATTGCTTFDFVNLAMNFEIIVNQNPVLTTPTELQVCDDDGVIDGLTTVDLSS
KDIEITGGFDANLTITYHLDQAGADASDASIPDKTMFTMTTNPQIVVARVTDNTTACYST
VNLSVRSFPVPVPVTPADYEECDDDNDGVFDFFVLSSRDAEITGGDPTLTVAYYLTQADA
DNAPVGQELDNMMYINNEPFEQIVYARVFNDAGCYSTTPLTLRVLNTPMPNQDATPYALC
DDDTDGLQIFDLSTQEANILGGLDAATHTVEWFSSLASAEAGTPAIATPTAYTSNTATVY
ALVTDTAQMTTTMTFCSNIAPLELIVNPLPTPIQPAEYELCDDIESGSDTDEFASFDLRS
RDDEITGGNDDWSVSYHFTQADADAGTPALADMYQNVVMANQTIFVRVEDIVTSCYETIT
LTLVVNPLPSPTTIAPVEECDTMANDGDPDNDGDAIFDLTGQVTTDIINGEAFVGLSFHE
TIAAAELGTPAIANPAAYQTVSRTIYVRATDTDPATSTECYRIVELELIVQPAPVLPTTI
PDLTECDDDGDGQALFDLTQNDAVIYGTQTPAAITLTYHETLASAEAMVGSAADMPIADP
VNYLASAPATQLWVRLEDTTTGCTVVGTFNLNIAMIPTITPPGLFEACDSAGALVGTDDD
GITTFDLTSLDAGITGGDPTLTVTYYESQADLDAGIANAIATPEAYINDGTSPQTLFILV
SSSDAGMCGAETTVDLQVNPLPVIGEPLPEAIACDEDNDGFGAFDLQQYNDDLLATLTDI
TLRFYETLDNATADTGAGQIDITVPYNNITGMTSLYVVAQDTNPATATACTKIYEFELVV
YPIPEIPAALETLTECDDDNNLMEIIDLTQNEVAIIGTQDATTLVITYHNTLVDAETGNN
PIIDPANYNATQMTPLEVIWVRLQVNDGSPNICAAVSSFEISVESPPTANPANDDLDLMV
CDDDADTFNVFDLTVNEASLTGGDPLLSVTYYASLADQTSDTPIADPTAYTNIQNPQTIQ
AVVSSAAGCTDQTTFDIEVLPLPTPNTMPDAVEVCDATTDIDTDGDGVIDAGSGSDTDGF
ESFDLTGVIAQIGGGEPVDILVYTDLAFAEANPDDPTLAVADVTNFINTTSGNQTLYARV
ERNVPGDDDLDSDGNLCYVIVPFEVIVNPLPVLAEAGPIDYTFCEEFDGDDTMGSVDLTT
LADEIGILAAPQVTSDFTISYHQLLVQAEANTAALSSPYTVADGEELFVRIEDNTTGCVN
FTSIIFTVESRPEVSPADNMVQCADDLGINVAPNQDEATFDLTQQNAMITGGVTATSVTY
YTSLADAEAMINAIDTPSAYVNTSNPQTIYARAVNTASNCESTMVVDFEIFVQPLPYTDL
SNEGGQICVDEITGETLEPFTIDGTVEDPQIGVTYSYAWTLDGALISEDPVVTVDAAGTY
QVLVTATYVDGTECDYLAEAVYTAESAPVFEAIVLEPSFNSTGLYTVEVINITGVDPTSE
YEFALDDGPFQSSTTFTNVTPGTHTIFGRLASGNCSTSEFEIGIIDYPRFFTPNADGFHD
TWNIIGLGVDPNLNAKIFIFDRYGKLLKQLSPTSPGWDGTFNGQPMPSNDYWFRVEFTEV
DDLGTQRTVNGHFTLKR
NT seq 8514 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaatccaaaactacgccgtacttatagtactcacgctatgtacacttcctgtattt
gcacaactgggtaacactcattacataccgcctatacacgcgagagacgtgggaggacaa
gatattacatctgcttatttatatttttctactccttatgataatccagcaaccgctaca
acagattctatagttatcaccataagcctagggaatggaacagtactaggaacacagacc
atatctgccggggctcccgcatcttttaatattggctctaatattttaataactaataca
gaacttaatcaagctttaagcacaaagggtataattgtaagctctactgaattattttac
acctccttaagagttcaatcttcctctggaaatcattctggctatttaactgcaaaaggt
gatgatgccttaggtactaggtttagagtcggtttttcggaacttaataatacaattaat
aaccacaattttttcacttcctttatggctgttgaagataatacaatcataactgtatca
gattatgaaacagatgtaattttcgaaccaaacataactgatgatgtactgactataacg
ctcaatgcaggtgagtcttatacattatctggatacggtggtgcatctactcctggtaat
gatgatggctttattggcgcactgataacatcgcaagatgatgctcaccctatcgtggtt
acgactggaaatataaatgccaacgacccttctctaaaccaaggaggatcggatatctta
atcgatcagattgtacaagaacgtcttgttggtgaagagtatatgctagtcagaggtaat
ggcagtgatgctttggagagaatattagttatcgcaacggaagcaaatacggatgtttct
attaatggtaattttttatttacgttaactaatcctggtgattttgaatttataagagat
aatgatttgtttcttccaaatattctcggagaacctcatagaaatatgtatttaagtacg
ggaggtggtaaatcggtttatgtttatcaacttattgggggagatattggtaccgatgta
gcaaatgctacaccaggtatggtatttgtgccgcccttgagttgctttttccaaaatgag
gttaatcttattccttctgtaaatgagatttcacctgtttttgatgcttacgatggtcgt
atttttattacatctgctgtaggcgatcaagttaccgtaaatggaacaatattgcctgct
atgtcagcacttgctaatcctggaacaccagattgggtaacttacaatgttagtaatcaa
acgggagatatcactgttctctcagagggccccattgccgtgggcttagttggggcaaat
tttgccgctggttttggcggatattattctggatttgctgtaacaccagaagatacagat
acagatatatgtactgctgctggccccataaatcttctggatcgatttgatggtaatccg
ccaacgggagggacttggactcctcctttagatagtggtactgatatttttgaccccgcg
acagatcccatatctaatccctctctcatatataactactttgccgtgggtgattgtgat
tctatagatgttaatatcacgataactctagtggattatccttctatagatgttatagat
gattttacagcttgtgaaacttttacacttgctgaccctgctaccctttcgggaaatttt
ctcaacaaccctcaatattatactgctttacaatctgatcctgctgcaacgcttatagat
tggactatccctatcactactactactactgtatttgtttatgatgaaaatgcggaagac
ccagatttgtgtccaaacgaatttagctttacaataaccattgcagacgaagcaatagca
aaccctgttccaccagtacgtatatgtgatgataatacaaatgatggtactgcgattttc
aacttagaaatgttaaccgaaagtatcattttaggtactcaaagcgcagctagctttacg
gtgacctggcatactacagtgcaacaggctatagataatgtaatgccttttactacacct
gctgcatatgacacaccaagtacaactatttacgctagaatagagagtaactctagtgcg
atttgttttgacaccaccgctatcgacctcatagtagacagtcaacccacagcaaatgca
gttcctacacaaaacatctgcgatgatagctcttcagatggaatagaaaactttgactta
acaacccttaacagtattattttaggaactcaaagtgatatattatataatatagacttc
taccccactcctactgatgcttcttcagaaacaaatctaattacaactcctactaatttt
actgttaccggcacagaaactattactgccagaatagataatgtaagtaacgatagctgc
gcagattttacagacattactttaactattataccacaagctacagctacagaccctgga
tcatatatagtttgcgatgacagtgcagatggagatgacacaaaccagtttaccaccttt
gacttatctacactagatgatgatattctaaatggtcaagatcctacaattttcactgtt
acatatcacgataatccaggagatgcaaatgcaaacaatggtgctctccccacctcattt
attaatactgatgcagaagtacaagccatcacggcaagagtttcaaacactcaaaacgat
gcctgctttgctattgttacttttaatatagttgttgctcctctacctgtcataaactct
cctgcatcactaagtcagtgtgatattgatcaagatggctttgcattctttaatctaaca
gaggcgcaagttttattaagcagtgatcccgaaaatgagacatttctatattatgacctt
agtggcgctgcaatagctaatcctacagcgtacacaaaccaaatacaaaacaacgaatcc
ataagcgtttctatttctaccataaatggatgtacacgtcaggctcagattgaccttgag
gtagatacttcagagatacccgatacttttcaattagaatattttgagtgtgatacagat
agtgatggtcagtctgtatttgatttttctgatgctacagcacaagtgctagctttattt
cctgctggacagatgcttacagtaagctattacgaaacccagcaagaagcagaaacagag
accaatcctataacggcaactattgatgcctatacaaataacctcacctatacaggtgca
aatggacagcaaggcatctgggtacgtgtagatggcgatactgcaaatgactgtcgtggt
ctagggatacacgtattgctcaatgtggaggctaaccccaccttcttacccaacatctct
tcacttgaagaatgttcacctatcgcaaatgctgcacaatttgatcttacccagaacgat
gcccagattactggcggtgatcctaatattctagttacttattatgagaacgtagggaat
tacacggctatgaatgccattgctaaccctactgctttttcaaacagtagcaaccctcag
accatttactacagtcttgagaatgccactacaggctgtacgacgtttgattttgtcaac
ctggcaatgaactttgagatcatcgtaaaccagaaccctgtactcaccacgcctaccgaa
cttcaagtctgtgatgatgatggtgtgatagatggccttaccacggtagacctctcttca
aaagatattgagattacgggtggttttgatgcaaaccttaccatcacctaccacttagac
caggctggggccgatgctagtgatgcaagtattccagacaaaacaatgtttacaatgacc
accaaccctcagattgtagtggctcgcgtgaccgataataccacggcttgctactcaacg
gtaaatcttagtgtgcgtagcttcccagtgccggtacccgtaacccctgcagattatgag
gagtgtgatgatgataacgacggagtttttgacttcttcgtgctttcctctagagacgcc
gaaatcaccggtggagacccaacccttaccgtcgcctattacctcacccaggcagatgca
gataatgcaccagtaggtcaggagcttgacaatatgatgtatatcaacaatgagcctttt
gagcaaattgtgtatgcccgtgtttttaacgatgccggttgttacagcactacaccgctt
accctgcgtgtgctcaacaccccaatgcctaaccaagatgcaactccatacgcactgtgt
gatgatgatacagatgggcttcaaatatttgatttaagtacacaagaagctaatattcta
ggcggcttagacgctgcaacgcatacggtggagtggttttcttcactcgcttccgcggaa
gctggtactcctgccattgcaacccctactgcttatacgagtaataccgccaccgtatat
gccctagtaaccgatactgcacagatgaccactacaatgaccttctgtagtaatattgct
cctttagaacttattgtaaacccattgccaactcctatccaacctgccgaatacgagctt
tgtgatgacatagaaagcggtagtgataccgatgagtttgcaagctttgatttacgtagt
cgtgacgatgagattactggtggtaatgatgactggagtgtaagctatcacttcacccaa
gcagatgcagatgcgggtacgccagcacttgcagatatgtatcagaatgtggtgatggca
aaccaaaccatctttgtacgtgtagaagatattgtgacgtcttgttatgagaccatcacc
ttaaccttagtggtaaatccattaccatcacctaccaccatagcaccggtagaagagtgt
gatacaatggcaaatgatggcgacccagataatgatggggatgctatttttgatcttacc
ggccaagtaacaacagacattataaatggcgaggcctttgtgggacttagtttccacgag
acaattgccgctgcagagctaggtacaccagccattgcaaacccagcagcctaccagacg
gtatcaagaactatctatgtaagagctacagatacagacccagctaccagcactgagtgt
taccgtatcgtggagttagaacttatcgtgcaacctgcaccggtactgcctaccaccatc
ccagacctaactgagtgtgatgatgatggagacgggcaagcgctgtttgatcttacacaa
aacgatgcagtgatctacgggacacaaacccctgcagctataactcttacgtatcacgag
acgctcgccagtgcagaagctatggtaggcagtgcggcagatatgcctattgcagaccct
gtaaactaccttgccagtgcaccggctacccagctgtgggtacgtctagaagacaccaca
acaggttgtactgtagtaggtacttttaatctaaacatcgcaatgattcctaccatcacc
ccaccagggctttttgaagcctgtgatagtgcgggtgccctcgtaggaaccgatgatgat
gggattaccacttttgaccttaccagccttgatgcaggtattaccggtggcgacccaacc
cttaccgtaacttactatgagtcgcaagcagacctcgatgccggtattgcaaatgctatt
gccacaccagaggcatatatcaatgatggaactagtccgcagacgctttttatcttagtc
agtagtagtgatgcaggaatgtgtggagcagaaactaccgtagacctacaagtgaatccg
ctacctgttattggagaacctttaccagaagcgatagcttgtgatgaagacaatgatggt
tttggagcctttgacttacaacagtataatgatgacttattagcaacgcttacagatatc
accctacgtttttatgaaaccctagataatgccacggcagatacaggagcagggcagata
gatattaccgttccttataacaacatcacagggatgacctcactgtatgtggtagcacaa
gataccaatcctgctacggcaacagcttgtactaagatttatgaatttgagcttgtggta
tatcctatccctgagattcctgcggctcttgaaacccttaccgagtgtgatgatgataat
aacctgatggaaattatagaccttactcaaaacgaggttgccatcatagggacacaagat
gcaaccacgcttgtcatcacgtatcacaataccctggtagatgcagaaacgggtaacaac
ccgattatagatccagccaactataacgcaacacagatgacaccacttgaggtaatctgg
gtacgtttacaagtaaatgatggtagtccaaatatatgtgctgcagtgagctcttttgaa
atctctgtagaaagcccacctacggcaaacccagcaaatgatgatttagacctaatggtt
tgtgatgatgatgcagatacctttaatgtgtttgaccttaccgttaatgaggcaagtctt
acgggaggtgatccattactatctgtgacctattatgcaagtcttgcagaccagacgagt
gatacgcctattgcagaccctacggcttatacaaacattcagaacccacaaacgatacag
gcagtagtctctagcgcagcaggatgtaccgaccagactacttttgacattgaggtgtta
ccattacctacgcctaacacaatgccagatgccgtagaggtatgtgatgccacgacagat
attgatactgatggcgatggggtgattgacgctggctctggttcagataccgatggtttt
gagagctttgatcttacgggtgtgattgctcagataggtggaggggagcctgtagatatc
ttagtgtatacagatctcgctttcgcggaagcgaacccagacgacccaacgcttgcagtg
gcagatgttaccaattttatcaataccacatctggtaaccaaacgctctatgcacgtgtg
gaacgaaatgtgccaggcgatgatgacttagacagcgacggaaacttatgttatgtgatt
gtgccttttgaggtgattgtaaatccgctacctgttttggcagaagcgggacctattgat
tataccttctgtgaagaatttgatggagatgatacaatgggaagtgttgatcttacgaca
ctggcagatgagatagggattcttgcggcgccacaggtaacaagtgattttacaataagc
tatcaccagttactggtgcaggcagaggcaaacactgctgcactaagttcgccatacacg
gtggcagatggtgaggagctgtttgtgcgtattgaagataacaccacaggctgtgtgaac
tttacaagcatcatatttacggtagaaagtcgtccagaggtatctccagcagataatatg
gtacagtgtgccgatgatcttgggattaatgttgcacctaaccaagatgaggccaccttt
gatcttacgcagcagaatgcgatgattactggaggtgtgactgcaacctctgtaacctac
tacaccagccttgcagatgcagaggcaatgataaatgcaatagacacgccaagtgcttat
gtgaatacgagtaacccacagactatttatgccagagcggttaatacagctagtaactgt
gagagtacgatggtggtagactttgagatttttgtgcaaccactaccatatacagacctt
agcaatgagggcggacagatttgtgtggatgagattactggagaaactttagaaccattt
acaatagatggtacggtagaagatcctcaaattggggtgacttatagctatgcgtggacg
ctagatggtgcattgatatcagaagaccctgtggtgactgtagatgctgcaggaacctac
caggtgctggttacagctacgtatgttgatggtacggagtgtgattacctagctgaggcg
gtatatacggcagagagtgcaccggtgtttgaggcaattgtactagaaccttcttttaac
agtaccggattatacacggtagaggtgataaatatcacaggggtagatcctacctctgag
tatgagtttgcactagatgatggcccgttccagagtagtacgacttttacaaatgtgact
ccagggacgcacactatttttggaagactagcaagtggtaactgttcaacctctgagttt
gagatagggattatagattacccacgtttctttacacctaatgcagatggtttccacgat
acgtggaatatcatagggctaggggtagatcccaacctgaatgcgaagatctttatcttt
gatagatacgggaagctcttaaaacaactaagccctacaagcccaggatgggacggtacc
tttaatggccaaccgatgccgagtaacgactactggtttagagtagagtttacagaggta
gatgacctaggcacacagagaacggttaatgggcactttacattgaagcgatag

DBGET integrated database retrieval system