Dokdonia sp. MED134: MED134_05219
Help
Entry
MED134_05219 CDS
T03275
Symbol
susC7
Name
(GenBank) TonB dependent/ligand-gated channel
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
dok
Dokdonia sp. MED134
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dok00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
dok02000
]
MED134_05219 (susC7)
Transporters [BR:
dok02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
MED134_05219 (susC7)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EAQ40127
LinkDB
All DBs
Position
490492..493482
Genome browser
AA seq
996 aa
AA seq
DB search
MKKTIIKKYLFLVLLGFMAQVTLAQKTITGTVKEQNGPLPGASVLIQGTTTGTQTDFDGN
FSLEASSTDVLTFSYVGFKEVSIPVGNQTIINVTLEEDNALDEVVIVAFGSQTKKKNVQS
VSVVGQDAIKDIPANSPQELLQGQAAGVQVVQSSGVLGAAPTIKIRGVASVSSGSRPLFV
VDGVPLNDTDLTSNQGANQGLNPLANINPNDIESISVLKDASATAIYGSRGSNGVVIVTT
KSGSKGGQTTVTLNVSTGISESTDTFDMMNADEFRQYAVDANYFGIDNVADLPQGGFNWV
DGVTRTGISNNIDASVSGGSEKTSFYISTNFKDEEGFIIGNDLKRRAGRLNINHTATDWL
EIGANIGITRNEFDRVGAENSTFAPLTSAYLIRPWVQPRDENGNLVNTGFIANTIAIESL
DINDSDVTRTTGNVSAKVSLFEGLTFNSRFGIDRVLVEEQQRSFELNSPGGTGSNFYAQD
NRYILTNTLNYDTTFGDKHDLGAVAGISYEENTIRTIAVAGTGFASDSSLNIESAAQKTT
TTSSATANSLVGYFARVNYAYDSKYVLEGSLRRDGSSRFGADNRFGTFFALGGAWNLSEE
KFLEDSSWINNLKLRASFGTTGNDRIGNFQSLALYSGGTFGQYNDQAGLAPVSAPNPDLK
WERSKAFDIGLAGDLFNNRISFSVDYYKKRTDDLILNLPLPISTAAGTNNTIARNVGEIE
NRGFDVSLTSNNFRDGDFKWTTTLNIGFNTNEVISLPGASIDTEGREFIAGSASQRAIVG
ESINTFYLVRYKGVNPQTGDAEWLDADGNATTNPNPSTDRVIAGDANPDFVGGLTNTFKY
KNFDLNVLTNFSVGNDIYVDGLRFTDNAASGSFNNRAALLNVWQQPGDNAFVPAFDSPTF
NTFAQRSTAQLRDGSFLRFKNVTLGYTIPKSVLDKTKHVKNIRLYATATNLITIKGSDLE
GIDPEVTDTSAALGQGETFFTPPQSKSFIFGATIQL
NT seq
2991 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaactattatcaaaaagtatctgtttttggttcttttaggttttatggcgcaa
gtcactttagcccaaaaaacaataacaggtacggtgaaggaacagaatggcccgctacca
ggagccagtgttttaattcaaggtaccactacgggtacccaaactgattttgatggaaac
ttctctttagaagcatcatctacagatgtattaacttttagctatgtaggctttaaagaa
gtttctattcctgtaggaaatcaaactattattaatgtgacgctagaagaagataatgcg
ctggatgaggtcgttattgtagcttttggttcacaaacaaaaaagaaaaatgttcaatct
gtatctgtagttggtcaggatgctattaaagatatcccggcaaactcaccacaagagtta
ctacaaggtcaagcagcaggtgtacaagtagtacagtcttctggtgtacttggagcagct
cctactatcaagattagaggtgtcgcttcagtatcatctggatctagaccactatttgtt
gtagatggtgtaccacttaacgatacagaccttacatctaaccaaggtgcaaaccaaggt
cttaacccacttgcaaacatcaacccaaatgatatagagtctatctctgtattaaaagat
gcttcggcaacggctatctacggttctcgtggatctaacggtgttgtaattgtaactaca
aaatctggttctaaaggaggacagactacggttactttaaacgttagtactggaatcagt
gagtctacagacacatttgatatgatgaatgctgatgagtttagacaatatgctgtagat
gcaaactactttggtatagacaacgttgcagatcttcctcaaggtggatttaactgggta
gatggtgttacaagaacaggaatctcaaacaatatagacgcatctgtaagtggtggtagt
gagaaaacttctttctacataagcacaaactttaaagatgaagaaggattcatcattggt
aatgatttaaaaagacgtgctggtcgtttaaacattaaccacactgcaacagattggtta
gaaataggtgcaaacatagggattacaagaaatgagtttgaccgtgtaggtgcagaaaac
agtacgtttgctccacttacttctgcttatttaatacgtccttgggtacaacctagagat
gagaatggaaacctagtaaacactggatttattgcaaacacaattgcaattgagtcgcta
gatatcaatgattcagatgttacaagaacgacaggtaacgtatctgcaaaggtttcttta
tttgaaggattgactttcaactctcgttttggtattgatagagttcttgtagaagagcaa
caacgttcttttgagcttaactcaccaggaggaacaggatctaacttttatgcacaagac
aaccgttatatcttaacaaacacgcttaactacgatactacatttggagataagcacgat
ttaggagcagtagcaggtatctcttatgaagagaatacaattagaactattgctgttgca
ggtacaggttttgctagtgattctagtttaaacatcgagtctgctgcacaaaagactact
actacatctagtgctacggcaaacagccttgtaggttactttgcacgtgtaaactatgct
tatgatagtaaatacgttcttgaaggttctttacgtcgtgatggatcatcacgttttgga
gcagataaccgtttcggtacattcttcgcactaggtggtgcttggaacctttctgaagaa
aaattcttagaagatagttcttggattaataaccttaaacttagagcaagtttcggtacg
acaggtaacgaccgtataggtaacttccagtcactagcactttacagtggtggtactttt
ggacagtacaatgatcaagctggtcttgctcctgtttctgcaccaaacccagatttaaaa
tgggaacgttctaaagcttttgatataggactagcaggagatctttttaacaacagaatt
tcttttagtgttgattattacaagaagagaacagatgaccttatcttaaaccttccactt
cctatctctactgcagcaggtacaaataataccattgctcgtaacgtaggtgagattgaa
aacagaggttttgacgttagccttacttctaataactttagagatggtgattttaaatgg
acaacaacgcttaacataggtttcaatacaaatgaagtaatctctttacctggagcatct
attgatacagaaggaagagaatttatagctggatctgcttctcaaagagcaatcgtaggt
gagtctattaacacattctacttagtacgttacaaaggtgtaaacccacaaactggtgat
gcagagtggctagacgcagatggtaatgcaactacaaatcctaacccatctacagataga
gttattgcaggagatgcaaacccagactttgtaggaggacttacaaacacgttcaaatac
aaaaactttgacttaaacgtcttgactaactttagtgttggtaacgatatctatgtagac
ggattacgttttacagataacgctgcttctggatcgtttaacaacagagctgctttatta
aatgtatggcaacaaccaggtgacaatgcttttgtacctgcttttgatagcccaactttt
aacacgtttgcacagagatctactgctcagttaagagatggttctttcttaagatttaag
aatgtaacgttaggatacacaattcctaagtctgtattagataagactaaacacgttaaa
aacataaggttatatgctactgcaacaaaccttattactataaaaggaagcgacttagaa
ggtattgatccagaggtaacagatacaagtgctgctttaggacaaggagaaactttcttt
actccaccacaatcaaagtctttcatctttggagcaacgatccaattataa
DBGET
integrated database retrieval system
