KEGG   Dokdonia sp. MED134: MED134_07406
Entry
MED134_07406      CDS       T03275                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
dok  Dokdonia sp. MED134
Pathway
dok02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:dok00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    MED134_07406
SSDB
Motif
Pfam: DUF11 Big_9 TSP3_bac Cadherin_4 DUF7327 NPCBM_assoc TRAP_beta bMG10 DUF7507 CARDB
Other DBs
NCBI-ProteinID: EAQ37622
LinkDB
Position
complement(1637002..1642845)
AA seq 1947 aa
MKSLLRNLSYRNNFKNSIFGFLLLSFLVSQVGNAQCNITVISTSMISACDDGGTTPDPSD
DTFTADVTVTFDMAPATGSLDITGDNLNAVTVLVADLDTATSHTFQDVLFTADGMLQSLT
ATFSDDAACTFTDPMAVSAPASCSPDCVINGIVADNISICNDGGTQGPGQDGDDTFTADI
TVTFDFPPTTGTLNLTGDNVFDQFEGVGTLDSPTSHTFVGVVFPSDGGPVDLTAAFSDST
CPFNLPNTFTAPSQCSVPVGDGGLVIDKSHCDWGYTTDDRYRIRYEGTLTNTGANPVYNI
NISDDLGTPFLGDANIVNIVSRSAGPLSLGVTPNGSFNGTTQEDVIIIDTLQELGPGESI
TYAFCIEVDAVAALDGATVVNEIFATANDAVTGDPYITSATDVELFEENLSILSAGLQVN
DATPPINTDGTSDFFYTITLRNSGSGTASNVQYVDSFDHLFNSGIPINTFTVTQLTGTLA
ANPDFDGGSGVIGTSTNLLVPGQTMTSGETASYRVDLNVGPTGNQSVRNTQGVFSGEDSN
GTAVSDISRRNTTAEHDDEQCFCDQTPVQLLFTPIPVITKTIINNDPAGTLGNRDVTFQI
EIQNDPTSPVDIFNLQVVDDIEAMCPGNIVSIGAPQIVTSTATVDPVLNAFYTGQGLNNI
FENNTGQFAPGERLILTIDVEITLPCTMENVATFTATDPNGTVVGPVQSSVILNNPPEAE
DDIDVTNVDTPITIAPLSNDSDPDMDPIIITEVDGMPITEGGAPVLLSDGTIVEYVGGEL
IITPPPGSSTPISFPYTVADPLGNQDTANVFITVNTCTIAIISLDNISACDSGGTTGDAS
DDSFTADVIVEFTNPPGLGTLDLTGAGINEFVPVSSIPAGATSYTFSGLTFASDGADVIL
TATFVNPSGCTDTQVAGTAPDSCSVAAADVGITKTLNQSGPFAPGDTVSWNIVVSNLGTD
TATNVFVTDTPTNVTITGITGAGCVTFPCNVGTILPNSPFSDVTLIVTGTIDAAGPFTNI
TSVSADQVDGNPANNVDDGTDGNNDGIAVGEADLVTVKTLVSGNATPAEGDTVSFTITVT
NNGPDDATNVSLVDAIPAGLTATVNNGNTGGDQPSTYTDPNWTIPLIGSGQFVTLTIDGV
VDGGEDGNTITNTTTAASTPDQTDPTTAGDDLNESVTVDGCIDTDGDGDCDSTDPDPNDP
CNFTPGSIADTSNPIWAAADCDGDGDPNGTDPNPTDPCDFSAGTPAPTNPMMAGTPAQNA
YDIWAAADCDGDGVTNGIENDTNGTDPYDTCSYLPGSQDYTITTTEFQDADCDGDGVTNG
NEIDPDGNGVDDGNGTDPTDPCDYEPLLVTQTQRGDWLIADCDGDGDPNGSDPDPMNPCD
FTPGTPVPTDPMMVGTPEQIAYDIWAAADCDGDGTPNGTDTAPYDPCVDDGTIGDEDTTN
AIWQAADCDGDGETNGTEDMNGSDPNDPCSVSGVATIPAPADPNYDVWAAADCDGDGETN
GEEVMNGTDPFDPCSVTTPTVQVDPMAPGTAAQNAYDVWAAADCDGDGDPNGTDPAPEDP
CDFTAGSTPDTTNAIWQAADCDGDGTPNGVDPDPLDPCTDDGVIGDEDTTNPIWQAADCD
GDGTPNGTDTAPYDPCVDDGTIGDEDTTNAIWQAADCDGDGETNGTEDMNGSDPNDPCSV
SGVATIPAPADPNYDVWAAADCDGDGETNGEEVMNGTDPFDPCSVTTPTVQVDPMAPGTA
AQNAYDVWAAADCDGDGDPNGTDPAPEDPCDFTAGSTPDTTNAIWQAADCDGDGTPNGVD
PDPLDPCTDDGVIGDEDTTNPIWQAADCDGDGTPNGTDTAPYDPCVDDGTIGDEDTTNAI
WQAADCDGDGETNGTEDMNGSDPNDPCSVSGVATIPAPADPNYDVWAAADCDGDGETNGE
EVMNGTDPFDPCSVTTPTGSGRSYGSG
NT seq 5844 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaatcactactacgtaatttatcttatcggaacaattttaaaaattcaatttttggg
tttttattactttctttcttagtatcgcaagtcggtaatgcacaatgtaacattacagtt
atctctacatctatgatatctgcttgtgatgatggaggcactactccagatcctagtgat
gatacttttactgcagatgtaacagttacatttgatatggctccggctacgggtagtcta
gacattactggtgataatctaaatgctgtaacggttttggttgcagatttagatacggca
acttcacacacatttcaagatgttctgtttacggcagatggaatgctccaaagtttgact
gctacattctcagatgatgcagcttgtacttttacagatcctatggcagtttcggcacca
gcttcttgtagtccggattgtgttataaatggtatagtggcagataatatctcaatctgt
aatgatggaggtacacaaggaccaggtcaagatggtgatgatacatttactgcagatata
actgtaacatttgattttccgccaacgacaggaaccctcaatttaacaggagataatgtt
tttgatcaatttgaaggtgttggtacgttagactctcctacaagtcatacgtttgtgggc
gttgtgtttccatcagacggagggccggtagacttaacagctgctttttctgatagtact
tgcccttttaatctccctaatacatttacagcaccgtcgcagtgtagtgtacccgttggt
gatggaggtttagtaatagataagtctcattgtgattgggggtatactacagatgatagg
tatagaatacgttatgaaggaactttaactaacactggggcgaatcctgtatataacata
aatatttctgacgatttgggtacaccatttttaggtgacgcaaatattgtgaatatagtg
tcaaggtctgctgggcctttaagtttaggagtaactcctaatggctcttttaatggaact
acacaagaagatgttattataattgatacattacaagagttaggtccgggagaaagtatt
acttacgcattttgtattgaggttgatgctgttgcagctttggacggagccacagttgtt
aatgaaatttttgcaacagcaaatgatgcagttactggagatccttatataacgagtgct
acagatgttgagttgtttgaggaaaacctttctatattgagcgctggccttcaagtaaat
gatgctactcctcctattaatacagatggaacttctgattttttctatacaattacactt
aggaactctggttcaggtacggcaagtaatgtgcaatacgtagattcatttgatcattta
tttaattcaggtatcccaatcaatacatttactgtaacacagcttacaggaacattagct
gcaaatccagatttcgatggaggctcgggagtaataggtacctccacaaatcttttagtt
cctggtcagactatgacctctggagagacagcatcttatagagttgatttgaatgtagga
cctacaggaaatcaatcagtaaggaatacgcaaggtgttttttctggtgaagattcaaat
ggaacggctgtttcggacatatcaagaagaaatacaacagcagagcacgatgatgagcag
tgtttttgtgatcaaactccggtgcaacttttattcacaccaattcctgtaatcacaaaa
acaattattaataatgatcccgctggcaccttgggcaatagagatgttacttttcaaata
gagattcaaaatgatccaacgtctcccgtagacatatttaatttacaagttgttgatgat
attgaagcgatgtgtcctggaaatattgtaagtattggggctccacaaatagtaacatca
acagcaacagtagatccagtgctcaatgccttttatactggacaaggacttaataacatt
tttgaaaataatacaggtcaattcgctccaggcgaaagacttattttaacaattgatgtt
gaaattacattaccatgtactatggaaaatgtagctactttcacggctacagatccaaat
ggcacagtagtagggcctgtccaatcgtctgtaatattaaataaccctcccgaggctgaa
gatgacattgatgttacaaatgttgatacgccaattacaatagctcctttaagtaatgat
tcagatccagatatggaccctattattataaccgaggttgatgggatgcctattacagaa
ggtggtgcgccagtgttactttcagatggtactattgtagaatatgtgggtggtgagctc
attattacacctcctcctggaagtagtactcctatatcttttccttacacagtagcagat
cctttaggtaatcaagatacagcaaatgtgtttattacggtaaatacctgtacgattgca
attatttctttagacaatattagtgcgtgtgactcaggcggtacaaccggtgatgcctca
gatgattcatttacagcagatgttatagtcgagtttacaaatccaccagggttaggtact
ctagatctaactggtgcaggaataaatgagttcgttccagtgtcttcaataccagcgggt
gcaacatcatacacgttttctggtttaacctttgcttcagatggtgcagatgttattttg
acagcaacatttgtaaatccaagtggctgtacagatacacaagtagcaggtacagcgcca
gattcttgtagtgttgctgccgccgatgtgggtataactaaaacattaaatcaatcggga
ccttttgcccctggagatacggtctcttggaatatagttgtaagtaatttgggaacagat
acagcaacaaatgtatttgttacagatactcctacaaatgttactattacaggaataact
ggagcaggttgtgtaaccttcccttgtaatgtcgggacaatattgcctaattcaccattt
agtgatgtgactttaatcgtgacaggtacaatagatgctgctggaccttttacaaatatt
acatcagtttcagcagatcaagtagatgggaaccctgcaaataatgtggatgatggtaca
gacggaaataacgatggaattgcagttggtgaggcagatttggttacggttaaaaccttg
gtaagtggtaatgctacaccggcggaaggagatacagtatcatttacaattacggttacg
aataacggtccagatgatgctactaatgtttctttagtagatgcaatcccagcaggcctt
actgcaactgtcaataacggaaatacgggaggtgaccagccttctacatatactgatcca
aactggacaatacctttaataggtagcggacaatttgttactttaacaatcgatggtgtt
gtagatggtggcgaagatggaaacacgataacaaatacaactactgcagcatcaacacca
gatcaaacagatcctactactgctggagatgatttaaatgaaagtgttacagtagatggg
tgtattgatactgacggtgacggtgattgtgatagtacagatccagatcctaatgaccct
tgtaatttcacacctggaagtatagctgatactagtaatccaatatgggctgctgcagat
tgtgatggcgatggtgatcctaacggtactgatcctaaccctacagatccttgtgatttt
agtgctggtactccggctccaactaaccctatgatggctggtactccagctcagaatgca
tatgatatttgggctgctgcagattgtgacggcgatggtgtcactaacggaatagagaat
gatacaaatggtacagatccttatgatacttgtagttatttacccggaagtcaggattat
acaataacgactacagaatttcaagatgcagattgtgatggcgatggtgtaacaaatgga
aatgaaattgaccctgatggaaatggtgttgacgatggtaatggaacagatccaacagat
ccttgtgattatgaacctttgctagttactcaaacacaaagaggagactggttaatagca
gattgtgatggtgatggtgatcctaatggaagtgatccagatccaatgaatccttgtgat
tttacaccaggaactccagtgccaacagatccaatgatggttggaacaccagaacagata
gcttatgatatttgggctgctgctgattgtgatggggatggaacaccaaacggaacagat
acagcgccttatgatccttgtgtagacgatggaacgataggcgatgaagatacgaccaat
gcgatttggcaagctgccgattgtgatggtgatggtgagactaacggtacagaagatatg
aatggttcagatcctaacgatccttgtagtgttagtggtgttgctacgataccagcacct
gcagacccgaactatgatgtatgggctgctgccgattgtgatggtgatggagagactaat
ggtgaagaagtaatgaatggtacagatccgtttgatccttgtagtgttacgacaccgaca
gttcaggtagatcctatggctccgggtactgctgctcagaatgcttatgatgtatgggct
gctgcagattgtgatggcgatggtgatccaaacggaacagatccagcaccagaagatcct
tgtgatttcacagcaggaagtacaccagatacgacgaatgcgatttggcaagctgccgat
tgtgatggtgatggaacaccaaatggagtagatccagatccacttgatccttgtacggat
gacggggtgataggagatgaagatacgacgaatccaatctggcaagctgctgattgtgat
ggggatggaacaccaaacggaacagatacagcgccttatgatccttgtgtagacgatgga
acgataggcgatgaagatacgaccaatgcgatttggcaagctgccgattgtgatggtgat
ggtgagactaacggtacagaagatatgaatggttcagatcctaacgatccttgtagtgtt
agtggtgttgctacgataccagcacctgcagacccgaactatgatgtatgggctgctgcc
gattgtgatggtgatggagagactaatggtgaagaagtaatgaatggtacagatccgttt
gatccttgtagtgttacgacaccgacggttcaggtagatcctatggctccgggtactgct
gctcagaatgcttatgatgtatgggctgctgcagattgtgatggcgatggtgatccaaac
ggaacagatccagcaccagaagatccttgtgattttacagcaggaagtacaccagatacg
acgaatgcgatttggcaagctgccgattgtgatggtgatggaacaccaaatggagtagat
ccagatccacttgatccttgtacggatgacggggtgataggagatgaagatacgacgaat
ccaatctggcaagctgctgattgtgatggggatggaacaccaaacggaacagatacagcg
ccttatgatccttgtgtagacgatggaacgataggcgatgaagatacgaccaatgcgatt
tggcaagctgccgattgtgatggtgatggtgagactaacggtacagaagatatgaatggt
tcagatcctaacgatccttgtagtgttagtggtgttgctacgataccagcacctgcagac
ccgaactatgatgtatgggctgctgccgattgtgatggtgatggagagactaatggtgaa
gaagtaatgaatggtacagatccgtttgatccttgtagtgttacgacaccgactggttca
ggtagatcctatggctccgggtaa

DBGET integrated database retrieval system