Dokdonia sp. MED134: MED134_13381
Help
Entry
MED134_13381 CDS
T03275
Name
(GenBank) two-component system sensor histidine kinase/response regulator
Organism
dok
Dokdonia sp. MED134
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_3
PAS
PAS_4
PAS_9
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PAS_8
PAS_7
OKR_DC_1_N
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EAQ37756
LinkDB
All DBs
Position
2968490..2972140
Genome browser
AA seq
1216 aa
AA seq
DB search
MAKAIKSMTLDKKPTYQELEREIAVLKSEREQSYKTLFDNSTISIWNEDFTLVYKEIERI
RTDKISDIREYLKENPDTLFLLLQSLKINSVNEATLKLFKASSKQDFLDNIQRTFGEGAT
KVFVNLIVAIWNNEKSFSSEVNYKTLKGDEFAAMISLNLPQNLFEQKTVPVTIQDISALK
EAENAKKKSILNLQQAQKIGKIGSWEWDWKTGAVYWSDEMLNIFGLKRGEMELTSLNVGQ
FVVKEDREKVNDIIRGLYKGKGMKPFKFSILRSNSEIRHLNHLAIEVENGKVFGVTQDVT
DIKNIENDLNAAQTLAKVGSWIVEIPTLKMEWSNVMYPIWGFDSSQGTPEYEKLIDRVHP
DDLELWNVSVQTAIDSGISYDIEHRVCPPDGVQKVVRSICEPVVGPNGNVISLKGTAQDI
TEQRLLDQELIRAKEEAEKSKNHFNNIIDNIGDPVFVKDDQSRLLVVNDAFCKLFGFDRL
DIIGKTLAEDVTKEERDAFLEIDRKLISDGIESINEESITIRDGETQRISTRKTRFIDNE
GEVFIVGVIHDITERFKTETIIKEAKERAEANERRFRILMQNLEAGVVVHAPDTSIVQCN
DRASEILSIDQEAIQDKALRYVNPKLINLDKSPLALSEYPVNKIARTKESINNQIIGLLG
DNDKEIKWTTLNGFPVLNDVGEITEIVTVFIDITEQRQNEKDKLKAKLLLDKTENELSDA
QALAKIGSWLVRPSGMKMEWSKEMYNIWGFDYGKKLPDYESVVERVHPDDMELLKNAIDK
AITKGEPYNIEYRICIPNRPQKTIRAICQPVMGEDGKVINLAGTNQDITEQKKLSGELIS
AKEKAEESDRLKSAFLANLSHEMRTPMNGILGFSELLRRKNISEEKKDIYLELLEKEGHR
LLSFISNIVDISKIESNIINIENSHLNLNSLIDDLYSKYQLKLEGTNIKLEVNKALSDTD
SAIETDENKLVQILSNLLENAIKFTKEGSIEFGYTLKEEILQFYVKDSGIGIDEEEQKNI
FDRFTQGKREQTHNLGVGLGLSIVKGLIKILNGSVWIESKIGEGSIFYFTIPYKQVADKI
AIVNDPSETTLENGDFTILVAEDDNLSFLYIKACLSNYNCTVIRAVNGKEAVKIVNENPS
LDLVLMDINMPEMDGNDALVEIRKTNKEIKVIAQTGLAMSGDKEKMLNAGFTDYVSKPIS
TSQLISTINKHLKIAT
NT seq
3651 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaaagctataaaaagtatgacgttagataagaaacctacgtaccaagaattagaa
agggagatagcggttttaaaatctgagagagaacagagttataagacgctctttgataat
tctaccatatctatatggaatgaagattttaccttagtgtataaagaaatagaaagaata
agaacagataaaatttctgatataagggagtacttaaaggaaaatcccgatacgttgttc
ctactattgcaaagcttgaagattaatagtgttaatgaggctactttaaagctttttaaa
gcaagtagtaaacaagattttttagataatatacaacgcacatttggtgaaggagcgact
aaagtgtttgtaaatcttatagttgctatttggaacaatgagaaatcattttcatcagaa
gtaaattacaaaacgctcaaaggagatgagtttgcggctatgatatctcttaacctaccg
caaaatttatttgagcaaaaaacggttccagttactatacaagacataagtgcgcttaag
gaggcagagaatgccaagaaaaaatcgatattaaatttacaacaggctcaaaaaattgga
aaaataggcagctgggagtgggattggaaaaccggtgctgtttactggtctgatgaaatg
cttaatatttttgggctgaagagaggagagatggagcttacaagcctgaatgtggggcaa
tttgttgtaaaggaagatagagaaaaagtaaatgatatcattagagggctttacaaaggt
aaaggtatgaagccttttaaatttagtattttaagatctaatagtgagataagacattta
aatcatctagcgatagaagttgaaaacggaaaagtttttggagtaacacaagatgttact
gatattaagaatatagaaaatgacttaaatgcagcacaaactcttgcaaaagtaggtagc
tggatagtagagatccctacattaaaaatggaatggtctaatgttatgtatcctatctgg
ggttttgattcttcacaaggtactccagaatatgaaaaactaattgatcgagtacatcct
gatgatttggagttatggaatgtctctgtacaaacagccatagattctggcatttcttat
gacattgagcatagagtctgccctcctgacggagtacaaaaagtggtgagaagtatttgt
gagcctgtagtaggtccaaacggtaatgtaataagtttaaaagggaccgctcaagacatt
acagagcagagactcttagatcaagaacttataagagcaaaggaagaagccgaaaaaagt
aaaaaccattttaataatattatagataatataggtgaccctgtttttgtaaaagatgat
caaagtagactccttgtagttaatgatgcattttgcaagctttttggttttgatagatta
gatattataggtaaaactcttgcagaagacgtaacaaaggaggaaagggatgccttttta
gagattgacagaaagcttataagcgatggtatagagagtataaatgaagagtctattact
atacgagatggagagacacaaagaatttctactagaaagacacgatttatagataatgaa
ggtgaagtttttatagtaggtgttatacacgatattacagagcgttttaagacagaaacc
ataataaaagaggcaaaggagcgtgccgaggcaaacgaacgacgttttagaattttaatg
caaaatctagaagcaggtgttgtggtacacgccccagatacttcaatagtgcaatgcaat
gatagggcttcagaaatattgagtatagatcaagaagctatacaagataaagcgcttcgt
tatgtcaatcctaaacttataaatttagataagtcaccactagcattatcagaatatccc
gtaaataaaatagcaaggactaaagagtctataaataatcaaattatcgggcttctaggt
gataatgataaggagataaaatggacaactcttaatggttttcccgtacttaatgatgta
ggagaaattacagagatagttacggtctttattgatataacagaacagcgacaaaatgaa
aaggataaacttaaagccaaactattattagataaaacagaaaacgaacttagtgatgcc
caagccctcgcaaaaattggtagttggctagttagaccatccggtatgaagatggaatgg
tctaaagaaatgtataatatttggggttttgactatggaaagaaattaccagattatgaa
agcgtagtggagagagtacatccagatgatatggaacttcttaaaaatgctatagataaa
gcaataaccaaaggagagccatataatatagagtatagaatttgtattcctaaccgtcca
caaaagactataagagcaatatgtcagcccgtgatgggggaggatggaaaagtaataaac
cttgcgggaactaatcaagatataaccgagcaaaagaaattatcaggtgaacttataagc
gccaaagagaaagccgaagagagtgatagattaaagtctgcttttctcgcaaatttaagc
cacgagatgcgcaccccaatgaatggtattttaggcttttcagaattactaaggagaaaa
aacatatctgaagaaaaaaaggatatctatctagaacttttagaaaaagaaggacaccgt
cttttgagttttatctctaatattgttgatatctctaagatagagtctaacatcataaat
atcgaaaattctcaccttaacctcaattcacttattgatgatttatattcaaaatatcaa
ttaaaactagaagggacaaatattaaacttgaagttaataaggcgctatcagatacagac
agcgctatagaaactgatgaaaataaactcgttcaaatattatctaacctactagaaaac
gcaataaaatttacaaaggagggctctatagaatttggctacactttaaaagaagaaata
ctacaattctatgttaaagattctggaataggaatagatgaagaagaacaaaaaaacatc
tttgaccgatttacgcagggtaaaagagaacaaactcataatctaggtgtaggattaggt
ttgtctattgtaaaaggtctaattaaaattttgaatggatctgtatggatagaatcaaaa
ataggtgaaggatcaatattttattttacaattccttataaacaagtagcagacaagatt
gctattgtaaatgaccctagtgaaacaactttagaaaatggtgattttacaattttagta
gccgaagatgataatttgagttttctttacataaaagcttgtctttctaattataactgt
actgttatacgggctgttaatggaaaggaggccgtaaaaattgttaatgaaaacccctca
ctagatctcgtattaatggatataaatatgccagagatggatggtaacgatgctctagta
gaaataaggaaaacaaataaagaaataaaagtaattgcccagaccggtctcgctatgtct
ggtgataaagaaaaaatgctcaatgctggctttactgactatgtatcaaaacctatttct
acctcacaactcataagcacaataaacaagcacttaaaaatagcaacgtaa
DBGET
integrated database retrieval system