Dolichospermum sp. UHCC 0315A: BMF77_00564
Help
Entry
BMF77_00564 CDS
T06185
Symbol
apxIB_1
Name
(GenBank) Toxin RTX-I translocation ATP-binding protein
KO
K11004
ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial HlyB/CyaB
Organism
dou
Dolichospermum sp. UHCC 0315A
Pathway
dou02010
ABC transporters
dou03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dou00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
BMF77_00564 (apxIB_1)
03070 Bacterial secretion system
BMF77_00564 (apxIB_1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
dou02000
]
BMF77_00564 (apxIB_1)
02044 Secretion system [BR:
dou02044
]
BMF77_00564 (apxIB_1)
Transporters [BR:
dou02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
BMF77_00564 (apxIB_1)
Secretion system [BR:
dou02044
]
Type I secretion system
alpha-Hemolysin/cyclolysin transporter
BMF77_00564 (apxIB_1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
Peptidase_C39
ABC_tran
cNMP_binding
SMC_N
Peptidase_C39_2
Peptidase_C70
AAA_22
nSTAND3
Guanylate_cyc_2
DUF87
DUF3335
NB-ARC
AAA_16
SbcC_Walker_B
RsgA_GTPase
RecA_C
AAA_29
NACHT
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEI40007
UniProt:
A0A5C0DR96
LinkDB
All DBs
Position
605469..608189
Genome browser
AA seq
906 aa
AA seq
DB search
MLSAFSQEQLVTHIRQVLGDGLSDQAVIDCTKALEIIEPPVAKQFWQATTAKPGIYVVLT
GKVRLLDSSNNLINTLTSGSSFGELTLFPEQDFSSYVARASINLKVAYLPQAILTKVMGE
FPSVYHLLLNKAELINTANSSEIPLIEAPRTVNSANLPQPIIPTPTQVKKRPQYFPIPTV
VVGNWWRKFTKRYPFFEQQSAADCGAACLVMVGRYWGKNLSINRLRDLANVSRSGASMRS
LSAAAESLGFATRPVKASLDKFAQQSLPAIAHWQGRHYIVVYEITKKQVIVADPAIGQRQ
LTIKEFLAGWTGYALLLQPTTSLKKTQEANTPFWQLFDLVKPHFQVLLEVFIASVLIQVF
GLITPLFTQLLLDRVIVQGSILTLNTVGFGLLVFGLFRVAINGLRQYLLDHTANRISVAL
MVGFIKHTFGLPLSFFESRYVGDIVSRVQENQKIQRFLTGEALSIGLDLLTVFVYVGLMF
WYSPPMALMTLAIVPPFVLLTFFATPFLRRISREVFTAGTLENSYLIQSLTGISSIRSMA
IEQTVRWHWEELLNNLIKKNFSGQVISNQLQLISSTIQSLASTGLLWFGAWLVIQNQLTI
GQLVAFNMLLGNIIQPFQRLIILWNQLQEVIVATERINDVLEAQLEEDLEHNPRQFLPRL
IGRIRFHNVTFRYHPESEINILENLSFEILPEQTVAVVGRSGSGKTTLSKLILGLYLATD
GRVLIDNQDVTSISLHSLRSQIGVVDQDTFLFGGTIRENITIAHPEASLEEIVEAAQLAG
ADEFIKRMPMGYETQIGEGGGMLSGGQRQRLAIARALLGNPRLLILDEATSHLDAESERI
IQNNLKKILQGRTSVIIAHRLSTVRHADLILVLDRGVLVESGTHEELITKKGHYFYLNQQ
QLAQTN
NT seq
2721 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctatcagcgttttctcaggaacagttagttacacacattaggcaagtcttgggtgat
ggcttatcagatcaagcagttatagattgtaccaaggctttagaaattattgaaccacca
gtagcaaagcaattttggcaagcgacaacagcaaagccgggaatttatgttgtgctgact
ggtaaggtgagattacttgatagctcgaacaatttaattaatactctcacttcagggtca
tcatttggggagttaactttatttccagaacaagattttagcagttatgtggctagagct
tctataaatttaaaggttgcctatcttccccaagcaatattaactaaggtaatgggagag
tttcctagtgtttatcatcttttgttgaataaggcagagctaattaacactgcgaattct
tcagaaatcccgctgattgaagccccaagaactgtaaatagtgccaatttacctcaacca
ataattcccacaccaacacaagtaaaaaaacgccctcaatactttcctattcctactgta
gttgttggtaattggtggcgtaaatttactaaacgctatccattttttgaacaacaaagt
gctgctgattgtggtgctgcttgcttagttatggttggccgttattggggaaaaaacctg
agtatcaaccggctgcgggatctggctaatgttagccggagtggtgcatccatgcgaagt
ttgagtgcagcagcagaaagccttggttttgctacccgtccggtgaaagccagtttagat
aaatttgcccaacagtctttaccagcgatcgctcattggcaaggtagacattacattgtt
gtctatgaaattaccaaaaaacaggtaattgttgctgatcccgctattggccaacgtcag
cttactattaaggaatttcttgcaggttggactggttacgctttactgttacagcctaca
acttcactcaaaaaaacgcaagaagctaacacgccattttggcagttatttgatttagtt
aaaccgcattttcaggttctcttagaagtatttattgcttcggtattaattcaggtattt
ggattaatcacacctttatttactcagcttttattagatagagtcattgttcaaggtagc
atcttaaccttaaatactgtcgggtttggattgttagtttttgggttgtttcgggttgcc
attaatgggttaagacaatatttactagatcacaccgctaatcgcattagtgtggcttta
atggtgggatttattaagcatacatttggcttacctctgtcattttttgagtctcgttat
gtgggagatattgtctctcgtgttcaggaaaatcaaaaaattcaacggtttctgacgggt
gaagctctatctattggcttggatttattaacagtttttgtttatgtgggattaatgttt
tggtacagtccaccaatggcattaatgacattggcaattgtgccaccctttgtgttatta
acattctttgccacaccatttttgcggcggattagtcgagaggtattcacagcaggaact
ttggaaaatagttatttgattcaaagcttgacgggaatttcttcgattcgctcaatggct
attgaacaaacagttcgttggcattgggaagagttgctaaacaatttaatcaaaaagaac
tttagtggtcaagtaattagtaatcaactgcaattaattagctctactattcaatcttta
gcaagtacagggttgctctggtttggcgcttggttagtcattcaaaatcaacttactatt
ggtcagttagttgcttttaatatgttactgggtaatattattcagcctttccaacgatta
attattttgtggaatcagttacaagaggtaattgtcgctacagaacgaattaatgatgta
ctggaagcacaactagaggaagatttagaacataaccctcgacaatttttaccgagatta
atcgggagaatccgttttcataatgttacctttcgctatcatcccgaaagtgagattaat
attttagaaaatctcagttttgaaattttacctgagcaaactgtagcagttgttgggcgc
agtggttctggaaaaacaacactttctaagttaattttgggtttatatctagcgacagat
ggaagagttttaattgacaatcaagatgttactagtatttccttacattctttgcgatcg
caaataggagttgttgatcaagatacctttttatttggcggaacaattcgggaaaatatc
acaattgcccatccagaagcctctttagaagagattgtggaagctgcccaacttgcaggt
gcagatgagtttatcaaaaggatgccaatgggttatgaaacccaaattggtgaaggaggc
ggaatgttatctggaggtcaacgtcaacggttagcaattgcccgggctttactgggaaat
ccgcgacttttaatattagatgaagctacaagtcacctggatgctgaatctgaacggatt
attcagaacaacctcaaaaaaattctccaaggacgtacaagtgtaattattgctcaccgt
ctttctacagttcgtcatgctgatctaattttagttttagatcgtggtgttttagtagaa
agcggtacacatgaagaattaattaccaaaaaaggacattatttctatctcaatcaacaa
caattagcacaaacaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
