Dolichospermum sp. UHCC 0315A: BMF77_02083
Help
Entry
BMF77_02083 CDS
T06185
Name
(GenBank) putative signaling protein
Organism
dou
Dolichospermum sp. UHCC 0315A
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
FHA
GAF
Yop-YscD_cpl
PAS_4
Cas10-Cmr2_palm2
PAS_8
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEI41492
LinkDB
All DBs
Position
2157343..2159973
Genome browser
AA seq
876 aa
AA seq
DB search
MEGNETEKIRHLLVVQDPKGQRTLPLLEATYSLGRDLRNAIVLYSPSVSRQHAILLRVTI
PNTDQYGFRIIDGNFQGKKSTNGLFVNGHKCLHHNLQNGDVIAFDSHTQAKYYVITNLSE
QIFSESCGTGDLSNFLSGKVNSVSHVSKAIIENINFGADSETALARLASFPELIPNAIIE
MDLAGRVTYLNPAAAAKFPNLRQIGQEHPILTQLLTAVKNQAQNSFVREVTVGNQIFEQS
VHYLPESDLIRTFIIREITEQKQAELELKQRDRLLQGVAEAANYLLAEMNYDLAIEKALA
ALGEATNVERVYLFQTHPHPVSGEMSISMQCEWIKSGAETSHSHWQNQSYQTPGLERWYS
KLFQGETISDFTQIFSPEEQKLLMGDHIKSLLFVPLRLETQFWGCLGLVECKSERYWSKH
EESSLITMAASISGARQRQQIEEKIRYQAMHDLLTGLPNRLRFNDILNQGIQKIIQQEES
IAVMFLDLDRFKIINDTLGHTVGDNLLKIVAQRIRDTIRIEDVVARWGGDEFTIFLPRVT
EIPPIIQIAKNILQTLEDAFYINGHELYISSSIGIALLGKDSPDAETLIQHADAALYYAK
NEGRNNYQFYKESLSQKNPELLKLEKNLRHAMKRKELMLYYQPRVNITTGKITGMEALLR
WNHPEMGVISPAVFIPLAEKSGLIISIGEWALRQACIQNKAWQDAGYQPITIAVNLSPGQ
FRQPKLVEILTDILTETQLKPEFLELEITETTAIADINFTTVALQNLAEMGLLLSIDDFG
TGYSSLNRLKVLPFHNLKIDQSFIRELTTDPKVAHIIQAIVTLGQSLGLRLIAEGVEHPA
ELEFLRSIHCDEVQGYLLYRPLSVEQATEALKNENK
NT seq
2631 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagggaatgagacggaaaaaattcgccatttattagttgtccaagatccaaaaggg
cagcgcactcttcccttgctagaagcaacatactctctaggaagggatttaagaaatgct
attgttctttattctccgtctgtatccagacaacacgcgattttattaagggtaacaatc
cccaatactgatcaatatgggtttaggattattgatggtaacttccaagggaaaaaaagc
actaacggtttatttgtaaatggccataaatgtcttcatcataatcttcaaaatggagat
gttattgcatttgatagtcacactcaagctaaatactatgtaattactaatctttcggag
caaatattttctgaatcttgtggaactggtgacttgtctaatttcctttctggcaaggta
aattctgtttctcacgttagtaaagctattatagaaaatattaattttggagctgatagt
gagacagctttagcccgcctagcttcttttcctgaacttattcctaatgctattattgaa
atggatttagcaggaagagtaacatatctaaatccggcagcagcggccaaatttccgaac
ttaaggcagataggtcaggaacacccaattttgacccaattattaacagcagttaagaat
caagcgcaaaattcctttgtccgggaagtaacagttggtaaccaaatttttgaacagtct
gttcattacttacccgaaagtgatttaattagaacttttattatcagagaaattactgag
caaaaacaagctgaactagaactaaaacaacgcgatcgcctattacaaggagtagcggaa
gcggcaaattatttattagcagaaatgaactatgatctagctatcgaaaaagcactggca
gcattaggagaagctaccaatgtagaacgagtctatctattccaaactcatccccatcca
gtgagcggagaaatgtccattagtatgcagtgtgaatggattaaatctggtgcagaaact
tcccactcccattggcaaaatcagtcttatcaaacccctggattagaacggtggtatagc
aaactttttcaaggtgagactattagcgactttacccaaatattttccccggaggaacaa
aaactgctcatgggagatcatattaaatcccttctatttgtaccgctaagattagaaaca
cagttctggggctgtttgggtttagttgaatgcaaatcagagcgttattggtcaaaacat
gaagaatctagcctgatcacaatggccgcaagtattagtggcgctcgtcaacgtcagcaa
atagaggaaaagatccgctatcaggccatgcacgacttactgactggactgcctaatcgg
ttacgattcaacgatatcctcaaccaaggcatccaaaaaataattcagcaagaagaaagt
attgccgtgatgttcctggatctggatcgctttaaaattatcaatgatactttggggcat
acagtcggagataatttattaaaaattgtcgcccaaagaatcagagacacaattagaatt
gaagatgttgtggctcgttggggtggtgatgaattcactattttcttaccacgagtaact
gaaattccacccattatccaaatagctaaaaatattctccagactttagaagatgctttt
tatattaacggacatgaactttatattagttctagtattggcatagccctattgggtaaa
gatagtcctgatgccgaaaccctcattcaacacgcagacgcggcgttatattatgctaaa
aatgaaggcagaaataattaccaattttataaagaatctctcagtcaaaaaaatcccgaa
ttattgaagttagaaaaaaatttacgccatgccatgaaacgcaaagaattgatgctttac
tatcagcctcgtgttaatattaccacgggtaaaattacaggcatggaggctttattgcgt
tggaatcacccagaaatgggtgtaatttctcccgctgtttttattcctctagcggaaaaa
agcggtttaattatctctattggtgaatgggcattacgtcaggcttgtatacaaaataaa
gcttggcaagatgcgggatatcaaccaattacaattgccgttaatctttctcctgggcaa
tttcgccaacctaagttagtagaaatattaactgatattttaacagaaactcaactaaaa
ccagaatttttagaattagaaattacggaaactacagcgatagctgatatcaatttcacg
acagttgcactccaaaatttagcagaaatggggttacttttgtccattgatgactttggt
acaggctattcttccctaaatcgcttaaaagtcttaccattccataacttaaaaattgat
caatcttttatcagagaactaactacagatccaaaagttgctcatattatccaagcgata
gttaccctaggacaatctttaggattgagattaatcgctgaaggtgtagaacatcccgca
gaattagaatttttacgctcgattcactgtgatgaagtccaaggatacctattatatcgt
ccactgtcagttgaacaagctacagaagctttgaaaaatgaaaataaatag
DBGET
integrated database retrieval system