Dolichospermum sp. UHCC 0315A: BMF77_02565
Help
Entry
BMF77_02565 CDS
T06185
Symbol
ltxA_4
Name
(GenBank) Leukotoxin
Organism
dou
Dolichospermum sp. UHCC 0315A
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Calx-beta
Big_9
Cadherin_4
HemolysinCabind
DUF4114
Cadherin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEI41961
UniProt:
A0A5C0DRD5
LinkDB
All DBs
Position
complement(2703475..2707974)
Genome browser
AA seq
1499 aa
AA seq
DB search
MATSFVPAGNTNYTLVGTADDDILDALTGGGNNILQGGDGNDELFAYTNDKLFGEAGNDE
LHSEGNGGNTLDGGDGNDIIFADRNDTILGGAGDDTIFGGRGGNTLTAGTGNDTFWLTNA
EYPISPNIITDFNPTEDRLQIAFDGITLDKLSFVPQGNDTLISINSTQLAILKNQNYELP
IFTITSASATEGSAINFTVTRTGDAQAPQNVTVATSIGTDDTASASDLTANTQTLTFAQG
ETSKTVTVQTTQDSLFEGNETFTVSLSNPTNSAVVSSTNGTAKGTINNDDAAPIFSIAAA
SATEGSAINFTVTRTGDAQAPQNVTVATSIGTDDTASASDLTANTQTLTFAQGETSKTFT
VQTTQDSLFEGNETFTVSLSNPTNSAVVSSTNGTAKGTINNDDAAPIFSIAAASATEGSA
INFTVTRTGDAQASQSVNVATSIATDDTASASDLTANTQTLTFAQGETSKTFTVQTTQDS
LFEGNETFTVSLSNPTNSAVVSSTNATAKGTINNDDAAPVFSIAAASATEGSAINFTVTR
TGDAQAPQNVTVATSIGTDDTASASDLTANTQTLTFATGETSKTFTVQTTQDSLFEGNET
FTVSLSNPNNGAVVSSTNGNGTAKGTINNDDAAPVFSIAAASATEGSAINFTVTRTGDAQ
APQNVTVATSIGTDDTASASDLTANTQTLTFATGETSKTFTVQTTQDSLFEGNETFTVSL
SNPNNGAVVSSTNGTAKGTINNDDAAPVFSIAAASATEGSAINFTVTRTGDAQAPQNVTV
ATSIGTDDTASASDLTANTQTLTFAQGETSKTFTVQTTQDSLFEGNETFTVSLSNPTNSA
VISPNNGTAKGTINNDDAAPINQAPTNITLQNSITNLPEGTSTIARLKVADIVITDDGLG
SNTISLTGVDAASFEVEGTVLYIKKDTKLDYETKNSYGVTVNVDDTTVGNTPDVFTNFTL
TVTDVNYAPEVKPNQIFSYTENKTANFQVGTVLATDDIAVTGFAIASGNDSGFFNINNQG
IITLTDKGVTSAANDFERSPNSFTLGIIAKDAAEATSQVTNVTINVTNDPTDDNKKPNLQ
SFTQSGQEDQIISFGIGDFKDKGKYQDEDNNDLMAIKVISLPTSGSLTFVNGQQVIKNQE
ILVNDLANVRYNPVVNANGNVATLTVAAIDNGTPKVESDPATITINLTPVNDPPVAQNDQ
LSVSQGSAGTINPLNNDSDPEGDSLKLTGKTDGKHGKVDINGNNLTYTLLDGNYLGNDVF
SYTVSDGGFSASADVSVTVTGKATTATVAPTQLISIAPVDRLIPKEAGALTGIVDKLGYE
FPNNYNPSLVKNSLQNALNQTTAAFNNLFGLYEVDNATGSVNGIKPGESGYAKAALSKVV
DNFIVRVGGSSSGAASDVVVSGGKIYSPFVIANGGNFSGNLQQAINAFFAANPNNSPATA
QNYTTLPVAYFSFGVANPDGAAHLRSFGNNTFGFEDLPAGVGVSDYDFNDAVFSFGAVV
NT seq
4500 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaacatcatttgtaccagcaggcaacacaaactataccctagttggtacggcagac
gatgatattcttgatgccttaactggagggggaaataatatccttcaaggtggtgacggg
aatgatgagttatttgcctatactaatgataaactctttggagaagcaggaaatgatgaa
ctccactctgagggtaatggtggcaataccttagatggtggagatggtaatgatattatt
tttgctgaccgtaatgatactattttaggcggcgcaggtgatgacacaatttttggtggt
cgcggtggcaatactttaactgctggcacaggtaacgatacattctggctgactaatgcc
gaatatcccatcagtccaaatatcattacagactttaatcccacagaagatcggttgcaa
attgcttttgatggcattacattagataaactcagttttgtaccccagggaaatgacacc
ctgatcagtatcaatagtacacaattggctattcttaaaaatcaaaattatgaattacca
atatttactattacttcagcttcagcaacagaaggaagtgccattaatttcactgtcacc
cgcacgggagatgctcaagcaccacaaaacgtaactgtagccacatctattggtactgat
gatacagctagtgccagtgacttaactgcaaatactcagactctcacatttgcacaggga
gaaactagcaaaaccgttactgtccaaacaactcaagatagcctatttgaaggcaatgag
actttcactgttagtttaagcaatcctacaaatagtgcagttgtcagttccacaaatggt
acagctaagggaacaattaataatgatgatgctgcacctatatttagtattgctgcggct
tctgcaacagaaggaagtgccattaatttcactgtcacccgcacgggagatgctcaagca
ccacaaaacgtaactgtagccacatctattggtactgatgatacagctagtgccagtgac
ttaactgcaaatactcagactctcacatttgcacagggagaaactagcaaaacctttact
gtacaaacaactcaagatagcctatttgaaggcaatgagactttcactgttagtttaagc
aatcctacaaatagtgcagttgtcagttccacaaatggtacagctaagggaacaattaat
aatgatgatgctgcacctatatttagtattgctgcggcttctgcaacagaaggaagtgcc
attaatttcactgtcacccgcacgggagatgctcaagctagtcagagtgtcaatgtagcc
acatctattgcgacagacgatacagctagtgccagtgacttaactgcaaatactcaaact
ctcacatttgcacagggagaaactagcaaaacctttactgtccaaacaactcaagatagc
ctatttgaaggcaatgagactttcactgttagtttaagcaatcctacaaatagtgcagtt
gtcagttccaccaacgctacagcgaagggaacaattaacaatgatgatgctgcacctgta
tttagtattgctgcggcttctgcaacagaaggaagtgccattaatttcactgtcacccgc
acgggagatgctcaagcaccacaaaacgtaactgtagccacatctattggtactgatgat
acagctagtgccagtgacttaactgcaaatactcagactctcacatttgccacaggagaa
actagcaaaacctttactgtccaaacaactcaagatagcctatttgaaggcaatgagact
ttcactgttagtttaagcaatcctaataatggcgcagttgtcagttccacaaatggtaat
ggtacagcgaaaggaacaattaacaatgatgatgctgcacctgtatttagtattgctgcg
gcttctgcaacagaaggaagtgccattaatttcactgtcacccgcacgggagatgctcaa
gcaccacaaaacgtaactgtagccacatctattggtactgatgatacagctagtgccagt
gacttaactgcaaatactcagactctcacatttgccacaggagaaactagcaaaaccttt
actgtccaaacaactcaagatagcctatttgaaggcaatgagactttcactgttagttta
agcaatcctaataatggcgcagttgtcagttccacaaatggtacagcgaaaggaacaatt
aacaatgatgatgctgcacctgtatttagtattgctgcggcttctgcaacagaaggaagt
gccattaatttcactgtcacccgcacgggagatgctcaagcaccacaaaacgtaactgta
gccacatctattggtactgatgatacagctagtgccagtgacttaactgcaaatactcag
actctcacatttgcacagggagaaactagcaaaacctttactgtccaaacaactcaagat
agcctatttgaaggcaatgagactttcactgttagtttaagcaatcctacaaatagtgca
gttatcagtcctaataatggtacagcgaaagggactattaataatgatgatgctgcacct
ataaaccaagctcccacaaatattactctacaaaattcaattacaaaccttcctgaaggg
acaagtaccatagcacggctcaaagtagctgatattgttattacggatgatggactagga
agcaatactatctctttaacaggtgtagatgctgctagttttgaggtagaaggaacagtt
ctttacatcaaaaaagacacaaagttggactatgaaaccaagaacagttatggtgtaaca
gtcaatgttgatgataccaccgtaggtaatactcctgatgtttttaccaacttcactctc
acggtaacagatgtaaattatgctcccgaagtcaaaccaaatcaaatctttagctacact
gaaaacaaaacagcaaatttccaagtaggaactgttttggctacggatgacatagctgta
acaggttttgcgatcgccagtggaaatgattctggtttctttaacattaataatcaaggt
ataatcaccctgacggacaagggagtgaccagtgcagccaatgactttgaacgcagtcct
aatagttttacattagggattattgctaaagatgcagcagaggctacttcccaggttacg
aatgtgactattaatgttaccaatgacccaacggatgataacaaaaaaccaaatctgcaa
agcttcacccaaagtggacaagaagatcaaataataagttttggtattggagacttcaaa
gacaagggtaaataccaagacgaagacaataatgatttaatggcaattaaggtaataagt
ttaccaacctctggaagcctaacttttgtcaatggtcaacaagtgattaagaatcaagag
atattagttaatgacctagctaatgtgcgatataatcccgttgttaatgctaatggtaat
gttgccacattgacagtagcagcgattgataatggtactccaaaagtagaatctgatcct
gctacaatcacaatcaatctgactccggtaaatgatcctcccgttgcacaaaatgatcaa
ttatctgtcagtcaaggaagtgcgggaactatcaaccctttaaacaatgatagtgaccct
gaaggagatagtttaaagctcaccggcaaaaccgacggtaaacatggcaaagtggatatc
aatggcaataatttgacctatacgctgttagatggcaattatttgggcaatgatgtcttt
agttacactgtctctgatggtggtttttccgcaagtgctgatgttagtgtgacggttacg
ggtaaagctacaactgctactgtagcaccaactcagctaatctcaattgctcctgttgat
agactgattcccaaggaagcaggtgcattaactggtattgtcgataaattgggctacgaa
tttcctaataactacaacccatcccttgtcaaaaactctctgcaaaatgctctaaatcag
accaccgcagcttttaataatctgtttggtctttatgaggtggacaatgcaacggggtct
gtaaatggcattaaacccggggaaagcggttatgcaaaagccgctttgagtaaggtagta
gataactttattgtgcgggtagggggttcaagtagtggtgctgcgagtgatgtcgttgtc
agtggtggtaaaatctattctccctttgtgattgccaatggtggtaacttctctggtaat
cttcaacaagcgattaatgctttctttgctgcgaaccctaataatagcccggctaccgcc
caaaattacacgactttacctgtagcctattttagctttggggtagctaacccggacggt
gcggctcatttgagaagttttgggaataacacctttggttttgaagatctacctgcgggt
gtgggggtaagtgactacgattttaatgatgcggttttctcttttggagcggtcgtctag
DBGET
integrated database retrieval system