Dolichospermum sp. UKL201: HEP80_20790
Help
Entry
HEP80_20790 CDS
T10192
Name
(GenBank) UvrD-helicase domain-containing protein
KO
K03657
ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA [EC:
5.6.2.4
]
Organism
doz Dolichospermum sp. UKL201
Pathway
doz03420
Nucleotide excision repair
doz03430
Mismatch repair
Brite
Enzymes [BR:
doz01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
HEP80_20790
DNA repair and recombination proteins [BR:
doz03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
HEP80_20790
MMR (mismatch excision repair)
Other MMR factors
HEP80_20790
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSV56875
LinkDB
All DBs
Position
complement(4393424..4395895)
Genome browser
AA seq
823 aa
AA seq
DB search
MSQTQPNSEQLKIINHVNGALLILAPVGTGKTRVLSSRVVKAIEAGIPPEKILCLTFTNR
AAKEMKERLAKMCPQQFRYITIKTFHSLCTSILGIEARNIGLPADFVVYDDTDCLGLVKG
IFGLRDDKKAQDKLSQISDCKTKATHLQLSPNYPLEQLFLPLGMRDARLASKYQNLLQER
HGLDFTDLIFYVRSLFSHYPEIKKRWEERFDFIQVDEVQDTHLSEYEIVRCLAARTGNIA
IIGDLDQTIYEWRGSEPEEVVSQFKQEFQPQEYSLTWNYRATKTLLNTASGFADSFEIRH
TKITPAPLCENGELIPVYTAKNEDDEGKWIAEQIQNLANNNPDFPYNRVAVLTRTHKRID
IISKSLEKSHIPCITVEQHQFFMRQEIKDALAYLRLIINPFDTGSMLRILQRPSRGIGDA
TINHIIKEGENCGFKLTDMASRQTFIDGDPFSNLITAYDSGKIVVFDVETTGFLAGKDEV
IEIAGIKLINGEIESEFHAYIKNTVSVGDSEQIHGYSDEFLAANGKNAIDVFTEFLEFIQ
DAFLVGHNLGFDIKMVIADAQKLGLSTPQFQWGDTWDLAKRFIPADSYSLENLATKLNLN
QFPNHSAINDTRATVELLAILIPLVKHRADYRQALVYRYGKGFENLADDIQSWKNTSQKL
RPADLLGNILIDSGLYDYYENHESHRLENLKRLVKIFKKQDNLELHPDTALRNIIEYTAL
AKNLDQISQENNQVLIITIHQSKGLEFDTVFIAGMCEEEFPTYFSLRDNKIEEEKRLFYV
ALTRAKKQLFISWFLKDFKNYSKSKSQFINSLPPEYLVETITS
NT seq
2472 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcacaaactcaacccaactcagaacaattaaaaatcatcaaccacgtcaacggagca
ttattaatattagctcccgtaggaactggtaaaacccgcgttttatcatcaagagttgtc
aaagcaattgaagcaggtattcctcccgaaaaaatcctctgtctaactttcactaaccgc
gcagcgaaggaaatgaaagaacggttagcaaaaatgtgtcctcaacaattccgctatatt
acaattaaaacatttcatagtttatgtacttctatcctgggaatagaagcgagaaatatt
ggtttaccagcagattttgtagtttatgatgatactgattgtttgggattagttaaaggt
atttttggattacgtgacgataaaaaagctcaagataaattatcacaaatatctgattgc
aaaactaaagctactcatttacaattatctcctaattatcctttagagcaattattttta
cccttgggaatgcgtgatgcaagattagctagtaaatatcaaaacctattacaagaacgt
catggtttagattttactgatttaatcttttatgtgcgttccttattttctcattatcca
gaaatcaaaaaaagatgggaagaacggtttgattttattcaagttgatgaagttcaagat
actcatttatctgaatatgaaattgtcagatgtttagctgctcgaactggtaatattgcc
ataattggagatttagatcaaactatttatgaatggagaggttctgaacctgaagaagtt
gtaagtcaatttaaacaagagtttcaaccacaagaatattctctcacttggaattatcgc
gctactaaaaccttactaaatactgcttctggttttgctgattcctttgaaatacgacat
acaaaaataactcctgctcctctttgtgaaaatggcgaattaattcctgtttatacagcc
aaaaatgaagatgatgaaggaaaatggattgctgaacaaattcaaaatttagctaataat
aatcctgattttccatataatcgagttgctgttttaacgagaactcataaacgcattgat
ataattagtaaaagcttagaaaaatcccatattccctgtattacagttgagcagcatcaa
ttctttatgcgtcaagaaattaaagatgctttggcttatttacggttaattattaatccc
tttgatacaggttcaatgctgagaatattacagcgtcctagtcggggaattggtgatgct
actattaatcatatcattaaagaaggagaaaattgtggttttaaattaaccgatatggca
tcaagacaaacttttattgatggtgatccttttagtaatttaattactgcttatgattca
ggaaaaattgtggtttttgatgtagaaactacaggctttttagcaggtaaagatgaagta
attgaaattgcgggaattaaattaattaatggagagatagaatcagaatttcatgcttat
attaaaaatactgtttctgtgggagattcagaacaaatacacggttatagtgatgaattt
ttagcagcaaatggcaaaaatgcaattgatgtatttacagagtttctagaatttatccaa
gatgcttttttagttggacataatctcggctttgacattaaaatggttatagctgatgct
caaaaattaggtttatcaactccgcaatttcaatggggagatacctgggatttagcaaaa
cgttttattccagcagatagttatagtttagaaaatttagcaactaaattaaacctaaat
caatttccaaatcatagtgctattaatgacacccgtgcaactgtagaattattagcaatt
ctcattcctttagttaaacatcgtgctgattatcgtcaagcattagtttaccgttatgga
aaaggatttgaaaatttagctgatgatattcaaagttggaaaaataccagtcaaaaatta
cgtccagcagatttattaggtaacatattaattgattctggtttatatgactactatgaa
aatcatgaatcacacagattagaaaatctcaaaaggttagtcaagattttcaaaaaacag
gataatttagaattacatcctgatacagcgctgagaaatattatagaatatacagcatta
gcaaaaaacttagatcaaatttcccaagaaaataatcaagttttaatcatcacaattcat
caatcaaaaggattagaatttgataccgtgtttattgcaggtatgtgtgaagaagaattt
ccgacttacttcagtttgcgagataataaaatagaagaagagaagcggctattttacgta
gctttaactagagcaaaaaaacagttatttatctcctggtttctcaaagattttaaaaat
tactcaaaatccaaaagtcagtttattaattcactacctcctgaatatttagttgaaacc
ataacgtcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
