Candidatus Babela massiliensis: BABL1_gene_39
Help
Entry
BABL1_gene_39 CDS
T02948
Name
(GenBank) mechanosensitive ion channel protein
Organism
dpb
Candidatus Babela massiliensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_2nd
MS_channel_3rd
SLATT_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDK30906
UniProt:
V6DK51
LinkDB
All DBs
Position
907148..910777
Genome browser
AA seq
1209 aa
AA seq
DB search
MNIETNTKLRSIVSFKNIILLIFLLFPYYGFGSLESLGKLFNLDQFNLDQLTQTKTFSAQ
IDKEIEGLKKRRVDQIDLYNLRKPEIESLKSSIDSFKEKIKSPAELDDEFSGRYLMILNQ
SAQTLSEVHHVHQQIINIIDNNIKLLQEFKLDPEFKSRSLRLASKSIYSIEDLQKINDIL
LQYDNKIKNIDEKIKRVSSDIEQLRKNFNLAKQEYEEKKKEQKEFKADEEGADSKFTVGQ
KAQLLDEEEKLLRYKKDLAEFKLKELEQKRHLFDTELRTSKIQLEIIIDEYERVKNELCI
DEKDLKKFEETLKNQIQELAKNQESATKKISALDLVKNAQMRRMTELKRKYKLSESNINN
IKEWSLHPNQIEGWSYLISIGKLTNYLSYELNISKEEIVAQIDNEKSKVTDKEVDNLIVN
TWYKLITGKLTNFAQEDLIAREIKNYEKLKADLKASISTTSDRQAEVVSALNSNNIIIEN
IKSRMNELKDQKDTVFKDHQTEYNKFTNELKEEGYDLEPKRNESITQLIELYNTINNVRK
TSIKKIDIIIEELRTRAQGIGVAILWKGLRNFIPDINKFFLFLYQKDWKDVLKVNKQTYS
NLVRYYKQYPSEFALILFNIAIIIFSFIFVKIYNRNFIKLFQLISPKYGIGYTISNFIIV
TFEFVVNNLSWLFLWLLGFLSVRYKFIDSYASIVFYLFSIIFWLILAYKYIRFLAKQNTE
KDYFLVSKEYQRRFLTVLSIDLYINIFIFFLREAFIISPFSKSDVPMTLQAIQFITLQIG
LIFILSKEQILKLIPRTTSFWQWIYEQVENYYYLFLVCLIFIIVMSNPYLGYGPQFFYFI
SRFLLILLLIPVVSAVHNRIKRISTSIFFYSDNEGIKERFPHAKTVYGVFVILSFLFFIG
LAAIIAANILGYNIGFQTIYNWLDKEIYHYTDLNTGKHVSVSILDFSYVGLWVLGGIIGS
YIVNRFVLSRIFDLLLVNIGIQNAIISLVRYTIIIASFVIGLRSVGLGSVIIYILAILGG
LGVAGKELITDLIGYFIILIQRPIKIGDFIKINDDVNGIVRHITLRSVILRRKNSVTIIV
PNSQVMSKPVVNWNYSRTYFAFDDILLTVPYKEDAEIVKNLIFKVIDNNINILKNPVPIV
WLYNFTDNGYQFLVRGYISFDRVLEQWQIASDIRLSIVKTLRENGIEIASPVRLLKFIDN
NPEIIHDIK
NT seq
3630 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatagaaactaatacgaaattaagaagtatagtaagttttaaaaatataatttta
ctaatatttttattattcccttattatggatttgggtcattagaaagtttaggaaaattg
tttaatttagatcaatttaatttagatcagttgactcaaacaaaaacattttctgctcaa
atagataaagaaatagaaggattaaaaaagagaagagtcgatcaaattgatctttataat
ttgagaaaacccgagatagaatctcttaaaagttctatagattcttttaaagaaaagatt
aaaagtccggcagagcttgatgatgaattttcaggtagatacttaatgattttaaatcaa
agtgctcaaactttgtcagaagttcatcatgttcatcagcagataataaatataatagat
aataatataaaacttttacaagaattcaaattagatccggaatttaaatcaagatcttta
aggcttgcttctaaatctatttattctattgaagatttgcaaaaaattaatgatatttta
cttcaatatgataataaaattaaaaatatagatgaaaaaataaaacgagtttcttctgat
attgaacaacttagaaagaattttaatttagcaaaacaagagtacgaagagaagaaaaaa
gaacaaaaagaatttaaagcagatgaagaaggagccgatagtaaatttaccgttggtcaa
aaagcacagcttcttgatgaagaagaaaaattacttagatataaaaaagatttagctgaa
tttaaattaaaggaattagaacaaaaaagacatttgtttgatactgagctaagaacttct
aagatacaacttgaaatcatcatagatgaatatgaaagagtaaaaaatgagctatgtata
gatgaaaaagatctaaaaaaatttgaagaaactcttaaaaatcaaattcaagaattagct
aaaaatcaagaatctgctacaaaaaagatcagtgctttagatttggtcaaaaatgctcaa
atgagacgtatgaccgaactcaagagaaaatataaattaagtgaatctaatattaataat
attaaagaatggtctttgcatcctaatcaaattgagggttggtcatacttaatatcaata
ggtaaattgactaattatttaagttacgaacttaatattagtaaagaggaaattgttgct
caaattgataatgaaaagagtaaagttactgataaagaggttgataatttaatagtaaat
acttggtacaaattaattacaggtaaattaactaattttgctcaagaagatttaattgct
cgtgagattaagaattatgaaaaacttaaggctgatttaaaagcaagtatttcaactacg
tctgacagacaagcagaagtagtgagtgctttaaattcgaataacataattattgagaat
ataaagtcaagaatgaatgagcttaaagatcaaaaagatacggtatttaaggatcatcag
accgaatataataaatttactaatgaattaaaagaagaaggatatgatctagagcctaaa
cgcaatgaatccattacgcaattgattgagctttataatactatcaataatgttcgcaaa
acttctattaaaaagatagatataataatagaagaattaagaactagagctcagggtatt
ggtgtagctatattatggaaaggtctcaggaattttattccagatataaataaatttttc
ttatttctttatcaaaaggattggaaggatgtcttaaaagttaataaacaaacttatagc
aatttagttaggtattataagcaatatccatcggaatttgctttaattttatttaatata
gcaatcataatattttcttttatatttgtaaaaatatataatcgtaattttataaaactc
tttcagttaataagtcctaaatatggtataggttatactataagtaattttattatagtt
acttttgaatttgtggttaataatttatcctggttgtttttatggttattaggattttta
tcagtaagatataaatttatcgacagttatgcttctatagttttttacttgttttctatt
atattttggcttattttagcttataaatatattagatttcttgcaaaacaaaatactgaa
aaagattattttttagttagtaaggaatatcaaaggcgatttttaactgttttgtctata
gatttatatattaatatatttatattttttttaagagaagcttttattatatctcctttt
tctaaatctgacgttcctatgactttacaagctatacagtttattacgcttcaaataggt
ttaatatttatcttgagtaaagaacaaatcctaaagcttattcctcgtactacaagtttt
tggcaatggatatatgaacaagttgaaaactactattatctatttttagtatgtttaata
tttattattgttatgagtaatccttatcttggatatggccctcaattcttctattttatt
tctaggtttttacttatattacttttgatacctgtggtctctgctgtacataatagaatt
aaaagaatttccacttcaatatttttctattcagacaatgaaggtataaaagagcgattt
ccgcatgctaaaacggtatatggggtttttgttattttgagttttttattttttatagga
cttgccgcaattatagctgctaatatattaggttataatataggttttcaaactatatat
aattggcttgataaagaaatatatcattatacagatcttaatacaggtaaacatgtatct
gttagtattctagatttttcctatgtcggcttatgggtcttgggaggtattataggttct
tatattgttaatagatttgtattaagtagaatttttgatttacttttagtaaatatagga
atacaaaatgctataatatctttggtgagatatacaattattattgcttcttttgtaatt
ggtctgagaagtgttggtctaggctctgtaataatatatattttagcaatacttggtggt
cttggtgttgcaggtaaagaacttattaccgatttgatcggttattttattatattaata
caaagacctattaaaattggtgactttatcaagattaatgatgatgttaatggtatagtt
cgtcatattactttaagatcagtaattttaagaagaaaaaatagtgttactattatagtt
cctaattcccaagttatgtcaaaaccggttgttaattggaactattcaagaacctatttt
gcgtttgatgatattttgctcactgtgccctataaagaagatgcagaaattgtgaaaaat
ttaattttcaaagttattgataataatattaatatattaaaaaatcctgttcctattgtt
tggctttataattttacagataatgggtatcaatttttagtaagaggatatataagtttt
gatagagtacttgaacaatggcaaatagcctctgatatacgtctttctatagttaaaact
ttaagggaaaatggtatagaaattgcatcgcctgttcgcttgttaaagtttatagataat
aacccagaaattattcatgatataaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
