Desulfovectis peckii: JCM17209_06160
Help
Entry
JCM17209_06160 CDS
T11978
Name
(GenBank) 2-hydroxyacyl-CoA dehydratase
Organism
dpk Desulfovectis peckii
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF2229
BcrAD_BadFG
DEDD_Tnp_IS110
ROK
FGGY_N
Hydant_A_N
FGGY_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BGR83565
LinkDB
All DBs
Position
complement(642957..647195)
Genome browser
AA seq
1412 aa
AA seq
DB search
MNSVLNVGLDVGSTTIKMVVLDNQNNIVYKKYLRHFSDIKNSLIALLEDAKPVLKRRLLT
IMITGSGGFNISRNLNVSFIQEVIACAHAIKNIIPKTDTAIELGGEDAKITYWGDSVEQR
MNGTCAGGTGAFIDQMAALLQTDAAGLNELAKNYRHIYPIASRCGVFAKTDVQPLLNEGV
AKEDIAASVLQAVVNQTISGLAQGRPISGKVAFLGGPLHFMSELRKRFIETLNLKSEDVI
APSDSQYFVAIGAALSSREEEPVPFECLYERSPNIWKMNDDESEKTEPLFANEAEYEEFK
ARHARHKVKRLDLASYQGNAFLGIDAGSTTTKVALISEKGELLFSHYGSNMGNPLESTIE
ALKKLYAKMNDKTKIVCSAVTGYGERLIKAALKVDIGEIETVAHYKAASFFLPNVNFVLD
IGGQDMKSLVIRDGAIDSIMLNEACSSGCGSFIETFAHSLNMGVKEFARLGIKAKNPVDL
GTRCTVFMNSRVKQAQKEGADIADISAGISLSVIKNALFKVIRLRSPEDLGKNIVVQGGT
FYNDAVLRAMEKIIGREVVRPDIAGIMGAFGAALIAKENYQPGYQTTLLPSSELNEFTTE
TSMKRCGLCGNNCLITVKRFSNGEEFYSGNRCERGAGKQKVKSNIPNLYEYKYKRVFNYK
PLSEKEATRGTIGIPRVLNIYEDYPFWFTFFTELGYRVIISRRSSKRLFELGMHTIPSES
VCYPAKLVHGHIMDLLNRGVKKIFYPCIPFNIPEDPEANNKYNCPIVTSYPETINANIEI
LRDKDITFYHPFLPIDRPKRLVKRLVEELAPEGLSKREIVRAVKKAYGELNRYKGDVRRK
GEETLAYINKHNIKGIVLAGRPYHIDPEVNHGIPEMIRSYGFAVLSEDAIRHLAKIERPI
RVVDQWVYHSRMYAAATFVARQKNLELVQLNSFGCGLDAVTTDQVQEILESYGKIYTVLK
IDEISNLGAARIRIRSLIAAIKERDKRNFTPKKLYRYPGRVLFTKEMKETHTILSPQMSP
IHFQFLRTGFEKAGYNIEVLPSVDKAAIDEGLKYVHNDACYPTIIVVGQLMKALQSGKYD
LNKTSLIISQTGGGCRATNYIAMIRKALKDAGLEHIPVISLSTGLEKNPGFKVTMPILNN
LLMGLVYGDLLMRVLYRVRPYEKVPGSANSLYQYWVDKCQQSLKNDNRDEFIQNIYDIVR
DFDHLEIYEDLIKPRVGVVGEILVKYHPTANNNVVELLEAEGAEAVVPDLIDFFLYCAYN
SEIKYRLLSGSFRKALGGRFSINKIESYRHDMKKALQESKRFEPPVSIEQKAKYAAKHLS
LGNQTGEGWFLTAEMLELIHSGVNNILCLQPFACLPNHITGKGMIKELRRSYPAANIAAI
DYDPGASEVNQLNRIKLMLSVAEENIKKSQAI
NT seq
4239 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacagcgttttaaatgtagggcttgatgttggttctactaccataaaaatggttgta
ttggataaccaaaacaatatcgtatataaaaagtatttaagacacttctctgacattaaa
aacagcttgatagctttgcttgaagatgccaagcctgttttaaagagaagattgttaact
attatgatcaccggttccggcggctttaatatttcacgaaatttaaacgtatcctttatt
caagaagtaattgcctgtgcccatgccattaaaaatatcattcccaaaactgataccgcc
attgaattaggcggcgaagacgctaaaatcacctattggggtgattctgttgaacaaaga
atgaacggaacttgtgccggcggtaccggagcctttattgaccaaatggcggcattgttg
caaaccgatgctgccggattaaacgaactggctaaaaactatcggcatatttatccaata
gcttccagatgcggtgtgtttgctaaaacagatgttcagccattgctaaatgaaggggtg
gcaaaagaagatattgccgcatccgtacttcaggcggtagtaaaccaaacaatcagcgga
ttggctcaaggaagaccaattagcggtaaagtagcttttttgggcggaccgctgcatttt
atgtccgaactgagaaaacgctttattgaaaccttgaatttaaaaagtgaagatgtaatt
gctcctagcgattcccaatactttgtcgctatcggagcggctttgtcatcccgtgaggaa
gaaccggttccctttgaatgtttatatgaaagaagccctaatatctggaagatgaatgat
gacgaaagcgaaaaaacagaaccgctgttcgccaatgaagccgagtatgaagaatttaaa
gccaggcatgcccggcataaagtaaaaagattagatttagcaagctaccaaggcaacgct
ttccttggtattgatgccggatctactaccacaaaggtagctctgatcagcgaaaagggc
gaattactgttttctcactacggcagtaatatgggcaacccattggaatcaaccattgaa
gccctaaagaaactgtatgccaagatgaacgataaaaccaaaattgtctgctcagctgta
accggttatggagaacgcttaatcaaagcggcgctaaaagtagacattggggaaattgag
accgttgcccactacaaggctgccagcttttttctgccgaatgtaaattttgtgctggat
atcggcggacaggacatgaaaagcttagtcattcgtgacggtgctattgattccatcatg
ttaaacgaagcttgttcttcaggctgcggatcatttattgaaacctttgcccattcgctg
aatatgggtgtaaaggaatttgcccggctgggaattaaggctaaaaaccctgttgatctc
ggcacccgctgtactgtatttatgaactcccgggtaaaacaagcccaaaaagaaggtgcc
gatattgccgatatttcagcggggatttctctttcggtgattaaaaacgctttgtttaaa
gtaattcgcttaagaagcccggaagatttaggtaaaaacatagtggtgcaagggggaact
ttctataacgacgccgtactgcgggcgatggaaaaaatcatcggccgtgaagtagtgcgc
ccggatattgccggcattatgggtgcctttggcgcggcattaattgccaaagaaaattat
cagccgggatatcaaaccaccctattgcctagcagtgagcttaatgaatttacaacggaa
acatcgatgaagcgctgcggattatgcggcaacaactgcttaattaccgttaagcgcttt
tctaacggggaagaattttactccggaaacagatgtgaacgaggtgcgggaaaacaaaaa
gttaaaagcaacataccaaacctttatgaatacaaatacaagcgggtatttaactacaaa
ccgctgtcagaaaaagaagccaccagagggacaatcggcataccaagagtgttgaatatt
tatgaggattaccccttttggtttacatttttcaccgagttagggtatcgggtaattatt
tcccggcggtcatccaaacgtttatttgagttgggcatgcataccattccctcagaatcc
gtctgttatccggcaaaactggtgcacggacacatcatggatttacttaataggggagtt
aaaaagatattttatccgtgtataccttttaatattcctgaggatccggaagctaacaac
aagtacaactgcccaattgttacttcttacccggaaacgattaatgcaaatatagaaatt
ttaagagataaagacattactttttaccatcccttccttcctattgaccggcccaagcga
ttagttaaaagattagttgaagagctggcaccggaaggattgtctaaacgtgaaattgtc
agggcggttaagaaagcttatggggaacttaatcgatacaaaggggatgtgcggagaaaa
ggggaagaaaccctggcttatataaataaacataatatcaaaggtatcgtgctggccgga
cgaccctatcatattgatccggaagtgaatcacggcataccggaaatgatcagatcctac
ggttttgccgttttgtcggaggatgcgatcagacacctggcaaagatagaaaggccgatt
cgggtagttgaccaatgggtatatcactcccgcatgtatgcggccgctactttcgtggcc
cggcaaaaaaatctggaattagttcagcttaattctttcggctgtggtttagacgcggta
actaccgaccaagtgcaagagatattggaatcttacggtaaaatttataccgtgctgaag
attgatgaaatcagtaacttgggggcagcccgcattcgcattcgttcgctgattgccgcc
attaaagagcgggataaaagaaactttacgcccaagaaactgtaccgctacccagggcgt
gtactgtttaccaaagaaatgaaggaaactcatactatattgtcgccacagatgtcgccc
attcattttcaatttttaagaaccgggtttgaaaaagccggttataatatcgaggtgctg
ccgtcagttgataaggctgccattgacgaaggcttaaaatacgtacacaatgatgcctgc
taccccacaataattgtcgtcggtcagttaatgaaagccttgcaatccggaaaatacgat
ttgaacaaaacttcgctgatcatcagccaaacgggcggcggctgtcgcgccaccaactat
attgccatgattagaaaggccttaaaagatgccggacttgaacatataccggtaatttca
ctatcaaccggtttagagaaaaaccccggatttaaggttaccatgcccattttaaataac
ttactgatggggctggtttacggcgatttgctgatgcgagtgttgtatcgggtgcggccc
tatgaaaaagtgcccggttcggcaaacagcctgtatcaatactgggtagataagtgccag
cagtcgttaaagaatgataaccgtgacgaatttattcaaaatatttatgacatcgtcaga
gattttgaccacttagaaatctatgaggatttaattaaaccaagagtgggcgtagtgggt
gaaattttagttaaatatcaccccactgcaaacaacaatgttgtagaactgttggaagcg
gaaggtgcggaagcggtagtgcctgatttaattgacttctttttatactgcgcttacaac
agcgaaattaaataccggctgttgtcgggaagttttcgcaaagcacttggcggacggttt
tcgatcaacaaaatagaatcttaccgccatgatatgaaaaaagcactacaagaaagtaag
cgctttgagcctcccgtttctattgagcaaaaggctaaatacgccgccaaacacctgtca
ctgggtaaccagaccggagaaggctggtttttaacggcggaaatgctagagctgattcac
agcggggtaaataacattctttgcttacagccctttgcctgcctgccgaaccatattacc
ggcaagggcatgattaaagaactgcgccgcagttatccggctgccaacattgccgccatt
gactacgacccgggtgccagtgaagtcaatcagcttaaccgcataaaactgatgctttcg
gtagcggaagaaaatatcaaaaagtcccaggcaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
