Drosophila pseudoobscura: 6901985
Help
Entry
6901985 CDS
T01032
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(I) chain
Organism
dpo
Drosophila pseudoobscura
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBM_14
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
6901985
NCBI-ProteinID:
XP_033238859
UniProt:
A0A6I8W8B1
LinkDB
All DBs
Position
X:complement(42467520..42472965)
Genome browser
AA seq
1575 aa
AA seq
DB search
MTTNRSTRLLVLLVLTALVANHQARGAAAVLKCGGKSAVCVGPLTYQICVDDLTTGAVIA
CQTSTRCVTDGIEICEPIKSDAEAPTAAVAKMVTITDSPAAVSESAPLVVASNATPEVIS
TEGPGSSAPAETTTAPVETTTAPVETTTAPAETTTAPAETTTAPAETTIITETTTETAWS
ELPLDPESTISVIPEDTTTDASWDPNAPVETTLSPGSDGSNTTIDPNAPLDPNAPEGSTV
DPNAPIDPNAPLDPNAPEGTTAAPGEVNPNDPAGSTPAPGVPADPNAPLDPNAPLDPTAP
EGTTAAPGEINPNDPAGSTPAPGAPADPNAPLDPNAPLDPNAPEGTTAAPGEVNPNDPAA
STAAPGSPADPNAPLDPNAPLDPNAPEGSTAAPGEVNPNDPAASTAAPGTPADPNAPAGS
TAAPGAPADPNAPLDPNAPLDPNAPEGTTAAPGEVNPNDPAGSTPAPGAPADPNAPLDPN
APLDPNAPEGTTAAPGEVNPNDPAASTAAPGSPADPNAPLDPNAPLDPNAPEGSTAAPGE
VNPNDPAASTAAPGTPADPNAPAGSTAAPGAPADPNAPLDPNAPLDPNAPAGSTAAPGTP
ADPNAPAGSTAAPGAPADPNAPLDPNAPLDPNAPAGSTAAPGTPADPNAPLDPNAPLDPN
APVDPNAPAGSTAAPGAPADPNAPLDPNAPLDPNAPLDPNAPAGSTAAPGTPADPNAPAG
STAAPGAPADPNAPLDPNAPLDPNAPAGSTAAPGTPADPNAPLDPNAPLDPNAPLDPNAP
AGSTAAPGTPADPNAPAGSTAAPGAPANPNAPLDPNAPLDPNAPAGSTAAPGTPADPNTP
AGSTAAPGAPADPNAPLDPNSPLDPNAPAGSTAAPGTPADPNAPAGSTAAPGAPADPNAP
LDPNAPLDPNAPLDPNAPLDPNAPVDPNAPAGSTAAPGAPADPNAPLDPNAPLDPNAPLD
PNAPASSTAAPGTPADSNAPAGSTAAPGTPADPNAPAGSTAAPGTPADPNAPAGSTAAPG
TPADPNAPAVSTAAPGTPADPNAPAVSTAAPGTPADPNAPAGSTAAPGTPADPNAPAGST
AAPGTPADPNAPAVSTAAPGTPADPNAPAVSTAAPGTPADPNAPAGSTAAPGTPADPNAP
AVSTAAPGTPADPNAPAVSTAAPGTPADPNAPAGSTAAPGTPADPNAPAVSTAAPGTPAD
PNAPAVSTAAPGTPADPNAPAVSTAAPGTPADPNAPPVSTAAPGTPAAPGTPAAPGTPAA
PGAPAVPNAPAVSTAAPGTPADPNAPAVSTADSILPGQTRPTFRPIPQLPFWPLGPHRPG
QTDKAEGPNNGNSQPTSPNRPLPFWPNWQNWVNSWRTTRKPVTVTQAPATSPEPASPQRP
EKPSNNSPEAVESVEQAAPAPPSGGAASSENASVEESNKGSGEKPKDKPKSGEDQSKEQE
QKKPSSAEKDSSREEKKEQEKEKSKDSKEEKEEKEEKDSESKKSKDDEKNDEDKLSSKEK
KKYVKNIIKKLKNEEDCNEEDVFPDVRDCKKYYRCEVKSSSEKHKFVHLRCDKKKRFDWL
EQSCVPKDEARCLEK
NT seq
4728 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaacgaaccgatcgaccagacttctggtcttacttgtgcttacagccctagtggca
aaccaccaggcaagaggagccgccgccgtcctcaagtgcggtggcaagtcggctgtctgc
gtgggacctctcacctaccagatctgcgtggacgatctgaccacgggcgccgtcattgcc
tgccagacgagcacccgttgcgtcaccgatggcatcgagatttgcgagcccatcaagtcg
gacgcagaggcacccacggcggctgttgcgaagatggtgacgatcaccgacagtccggcc
gccgtgagtgaatctgccccgcttgtcgttgcctccaacgccacccccgaagtgatctcc
actgagggtccaggatcatctgctccagctgagacgaccacagccccagttgagacgacc
acagctccagttgagacgaccacagccccagctgagacgaccacggctccagctgagaca
accacagctcctgctgagacaaccatcatcacggaaacaaccacagaaacggcatggtcc
gagctgcccctagacccggagtccaccatatcagtcattcccgaggacactaccaccgat
gcttcctgggatcccaacgcgcctgttgagacaactctgtctcccggctctgatggaagc
aacacaacaatcgatcctaatgcaccattggaccccaatgcgcccgaaggatctactgtt
gatcctaacgcacccatcgatcccaatgctcctctggaccccaacgcaccagaagggaca
accgctgctcctggagaggtaaaccccaacgatcccgctggttcgactcctgctccagga
gtacctgctgatcccaacgcaccgctggatcccaatgctcctctggaccccaccgcacca
gaaggaacaaccgcggctcctggagaaataaaccccaacgatcccgctggttccactcct
gctcctggagcccctgctgatcccaacgcaccgctggatcccaatgctcccctggacccc
aacgcaccagaaggaacaaccgctgctcctggagaggtaaaccccaacgatcccgctgct
tcgactgccgctcctggatctcctgctgaccccaacgcacccctggatcccaatgctcct
ctagaccctaacgcaccagaaggatcaaccgctgctcctggcgaggtaaaccccaacgat
cccgctgcttcgacagccgctcctggaactccagcggatcccaacgctcccgctggttcg
acagccgctcctggagctcctgccgatcccaacgcaccgctggatcccaatgctcctctg
gaccccaatgcaccagaaggaacaaccgctgctcctggagaagtaaaccccaacgatccc
gctggttcaactcctgctcctggagcccctgctgatcccaacgcaccgctggatcccaat
gctcccctggaccccaacgcaccagaaggaacaaccgctgctcctggagaggtaaacccc
aacgatcccgctgcttcgactgccgctcctggatctcctgctgaccccaacgcacccctg
gatcccaatgctcctctggaccccaacgcaccagaaggatcaaccgctgctcctggcgag
gtaaaccccaacgatcccgctgcttcgacagccgctcctggaactccagcggatcccaac
gctcccgctggttcgacagccgctcctggagctcctgccgatccgaacgcacccctggat
cccaatgctcctctagatcccaacgctcccgctggctcgacagccgctcctggaactcca
gcagatcccaacgctcccgctggttcgacagccgctcctggagctcctgccgatcccaac
gcacccctggatcccaatgctcctctagatcccaacgctcccgccggttcgacagccgct
cctggaactccagctgatcccaacgctccactggaccctaatgctcctctggaccccaat
gctcctgtggaccctaacgctcccgctggttcgactgccgctcctggagctcctgccgat
cccaacgcaccactggatcctaatgctcctctggaccccaatgctcctctggatcccaac
gctcccgccggttcgacagccgctcctggaactccagcagatcccaacgctcccgctggt
tcgacagccgctcctggagctcctgccgatcccaacgcacccctggatcccaatgctcct
ctagatcccaacgctcccgccggttcgacagccgctcctggaactccagctgatcccaac
gctcctctggaccctaatgctcctctggaccccaatgctcctctggatcccaacgctccc
gccggttcgacagccgctcctggaactccagcagatcccaacgctcccgctggttcgaca
gccgctcctggagctcctgccaatcccaacgcacccctggatcccaatgctcctctagat
cccaacgctcccgccggttcgacagccgctcctggaactccagcggatcccaacactccc
gctggttcgacagccgctcctggagctcctgccgatcccaacgcacccctggatcccaat
tctcctctagatcccaacgctcccgccggttcgacagccgctcctggaactccagctgat
cccaacgctcccgctggttcgacagcagctcctggagctcctgccgatcccaacgctcca
ctggaccctaatgctccactggaccctaatgctccactggaccctaatgctcctctggac
cccaatgctcctgtggaccctaacgctcccgctggttcgactgccgctcctggagctcct
gccgatcccaacgcaccactggatcctaatgctcctctggaccccaatgctcctctggat
cccaacgctcccgccagttcgacagccgctcctggaactccagctgattccaacgctccc
gctggttcaactgccgctccgggtactcctgccgatcccaacgctcccgctggttcgaca
gctgctcctggtacccctgctgatcccaacgctcccgctggctcgactgccgctcctggc
actcctgctgatcccaacgctcccgctgtttcgactgctgctcctggtactcctgccgat
cctaacgctccggctgtttcgactgctgctcctggtacccctgccgatcccaacgctccc
gctggttcaactgccgctcctggtacccctgctgatcccaacgctcccgctggctcgact
gccgctcctggcactcctgctgatcccaacgctcccgctgtttcgactgctgctcctggt
actcctgccgatcctaacgctccggctgtttcgactgctgctcctggtacccctgctgat
cccaacgctcccgctggctcgactgccgctcctggcactcctgctgatcccaacgctccc
gctgtttcgactgctgctcctggtactcctgccgatcctaacgctccggctgtttcgact
gctgctcctggtacccctgctgatcccaacgctcccgctggctcgactgccgctcctggc
actcctgctgatcccaacgctcccgctgtttcgactgctgctcctggtactcctgccgat
cctaacgctccggctgtttcgactgctgctcctggtacccctgctgatcccaacgctccc
gctgtctcgactgccgctcctggtactcctgccgatcccaacgctccccctgtttcaact
gccgctcctggtaccccggctgctcctggtaccccggctgctcctggtaccccggctgct
cctggtgctccagcagttcccaacgcacccgctgtttcgactgctgctcctggtactcca
gctgatcctaacgctccggctgtttcgactgccgattctattctgccaggccagactcga
ccaactttccgcccaattccgcagctgccgttctggccattgggcccacatcgtccagga
caaaccgacaaggctgaaggacccaacaatggcaattcccagcccacctctcccaatcgg
ccacttccattctggccgaactggcagaactgggtaaacagctggcggacaactcgtaag
ccagtcaccgttactcaagcccccgctaccagtccggaaccagcgagtccccagcgacca
gagaagcccagcaacaatagccccgaagctgtcgagagcgtagagcaggctgcccctgca
cccccatcaggtggagctgcatccagcgagaacgcctctgtcgaagagagcaacaaggga
tctggcgagaaaccaaaggacaagccgaagtcaggcgaagaccagtccaaggagcaggag
cagaagaagcccagctccgctgagaaggacagttcccgcgaagagaagaaagaacaggag
aaggaaaagtcgaaagattccaaggaggaaaaggaggaaaaggaagaaaaggacagcgag
tcgaagaagtccaaggatgatgagaagaatgacgaggacaagctgagctcaaaggaaaag
aagaagtacgtgaagaacatcatcaagaaactgaagaacgaggaggactgcaacgaggag
gacgtcttccctgatgtccgtgactgcaagaaatactaccgctgtgaggtgaagagttcc
tctgagaagcacaagttcgtgcacctgcgctgcgacaaaaagaagcgattcgactggctg
gaacagagctgtgtgcccaaggacgaggctcgctgcctggagaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
