Dictyostelium purpureum (cellular slime mold): DICPUDRAFT_148703
Help
Entry
DICPUDRAFT_148703 CDS
T02090
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K20178
vacuolar protein sorting-associated protein 8
Organism
dpp
Dictyostelium purpureum (cellular slime mold)
Pathway
dpp04148
Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpp00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04148 Efferocytosis
DICPUDRAFT_148703
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
dpp04131
]
DICPUDRAFT_148703
Membrane trafficking [BR:
dpp04131
]
Endosome - Lysosome transport
Tethering complex
CORVET complex
DICPUDRAFT_148703
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
VPS8_N
Beta-prop_VPS8
TPR_Vps8
TPR_Vps41
TPR_VPS8_2
Clathrin
Beta-prop_HPS5
zf_RING_Vps8_fungal
zf-C3H2C3
WD40_CDC20-Fz
zf-rbx1
Beta-prop_EML
zf-RING_5
zf-RING_Vps41
zf_RING_Vps8
zf-C3HC4_2
zf-RING_2
zf-RING_11
Beta-prop_IFT140_1st
EIF3I
zf-RING_UBOX
Beta-prop_NOL10_N
Zn_Tnp_IS91
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10506973
NCBI-ProteinID:
XP_003284887
JGI:
Dicpu1_148703
UniProt:
F0ZBS6
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1722 aa
AA seq
DB search
MSNNNNNNNLTPTKMSTSPSGSGWKIGSKMNQSPSQQIPNKNENSSPSSTPFELVSLLSA
PPPSTKRVFDPNASSLKSTPSTPTKVNSNLSSPILSSPKTEQKNVGFVRNNSTGNFGSLT
SFHPSSSTSFIPSTQFHPSSSMALLKNNPMSNSSTSISSGMSNSNSDINFINDPKYKQHS
SSPSKNQNILNKSSSNAINNPNINNSNPNSPNNKNTNQLIDKIITGKINDDIEDLEISDD
EADDIVNSIVNGELPQRITTTTTTTTQNNNEEELSDSSYSIKNSTSNFKFEDIDDVEVDP
EILKKILTEQDDEIIDESITVDDILKDTGIDEIEENEILNELIKSPTNTLQVQLEQELNI
TESRQPMLWKFKNSRKLVSGIVVEPQSLQKISEQLSSSEIRKVVGYPTCFSITKYICIGT
SHGYLMIFNYNQELISIIGGSICSDCGPVTAIDLPSCRVNEDWLISGHQSGHIILWDVQT
GKPIKVIEKVHKLPLLHLKFFADGSRFISSDSSGVTNVIVITKGFMSIGTEQQLLLNGNL
GQVLAISILLPGNFDHPTDRSNIVALATSRKILIISASTEGVSILNNKITRPKNLVDKTA
LPYLSWRRVTFNRSLGHTKPLEPILAIGWGTNIQLLQIVTAPNDVKFLSPEFIVVAEYQT
DHIICGLEWLDSQTILFHNSKDEIRVFDPFALEEVESVNIKSMQLVHHSKFQSVYSFHNS
IKTIKNRIYFLGLNGVFTAHILTWLERLSILISNGQWFEALCLGLDFYEGKAKATSGLSS
NTVDSKLITSEKIIEMLSNLCQTIFNNNPEDLVGKSLIPKHFLQDMDPRIEYFNIFQQLA
LICIEFCVSIKHTNLLFGEIFNYFLESGMKSCILDFLEPYILNDRLTHLNPEVMQTMMTY
YQELGILVRAEQCVLHLDISSIDFHQTVVLCRKHGLYSALIYLYNKGLDDYITPLEDMME
MLIKPKNLNTQLTASEKKFRDEVANHLLLYLKLSLSGKAFPTGLIQQNRVLSLKAEIYEY
LFLRNIDPDDPTPYPRIFNLLNLETTGLLKILSSGFYDKNFQVPNHSNDDLVPELSVPNL
PLNFPVSRSNLTTFNMISVLLLVMIDKQQNPFNLKQNDQWAFSFQQQGQLLCILGKVYAD
GLFRVDSTLLNRIIGMISVPPVENTPLFTLNERQSVLLRILQKLTTDLNTKKDFDYDKLL
LSCEGNEFFKVCQYIYSFKDNYSKMITCQIKDQENKHQSFDYIRTILAKPNLSKENRETV
KNTSISNLAQLILIDSVKTAQLIMDCFSNDHEKVLKELAAFPKLQYTYLQGLFKKSLTGS
TIIQQYGLHISQETHELYLRLMCEFSPSNVYKYLSSNDDYPLDSCLRICQQYNNFEGAIY
LLERIGDVFKALDMILMVLNEKLQALLDHFAQVYVNVKQLKNEENTPASQQEKDVVKDLF
SAISLCQRNSPKLNDNENEPLWFTLFDTIVSYIQKVKIQTMKGQFSKTSSIYSKSISFLT
KLVHSIINNMMGYVALPVILSRIVNEYGNNDLGDFKQIIQDMLDTCNFETIILETANDLI
QQDMYSATRHYVDKLSRAYSPNISRCGNCLRPLRESPISNQQPNHTMVLDMLVVFQCNHT
FHSECLGKHRVCPLCSKEKEKNTASKNKKQQQQNKNNNSTADNQDNQLNANKFDMSKYER
EKAQRETAKYMERLERFSKMNQRSSFKFNHNSRHYQQQQQQQ
NT seq
5169 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaataataataataataataatttaacaccaacaaagatgtctacatcaccaagt
ggatcagggtggaaaattggtagtaaaatgaatcagtcaccttcacaacaaataccaaat
aaaaacgaaaattcatcaccatcatcaacaccattcgaattagtatcccttttatcagca
ccaccaccatcgaccaaaagagtattcgacccaaatgcatcatcattgaaatcgacacca
tctacaccaacaaaagtaaatagcaatttatcatcaccaattctatcatcaccaaaaact
gaacaaaaaaatgttggatttgttagaaataatagcacaggtaattttggttcattaaca
tcatttcatccatcatcatcaacctcatttatcccatctactcaattccatccatcgtca
tcaatggcacttttaaagaacaatccaatgagtaacagttcaacaagtattagcagtgga
atgagcaatagtaattctgatattaattttataaacgatccaaaatacaaacaacattca
tcatcaccatcaaaaaatcaaaacattttaaataaaagtagtagtaatgcaataaataat
ccaaatattaataatagtaatccaaacagtccaaataataaaaatacaaatcaattaatc
gataaaataataacaggtaaaattaatgacgacattgaagacttggaaataagtgatgat
gaagccgatgatattgttaatagtatagtgaatggagaattaccacaaagaataaccacc
acaaccaccaccacaacccaaaataataatgaagaggaattaagcgatagcagctatagt
attaaaaatagtacaagtaattttaaattcgaagatattgacgatgttgaagtggatcca
gaaattttaaaaaaaatattaacagaacaagatgatgaaattatcgatgaaagtattaca
gtcgatgatattctaaaagatactggaatagatgaaatcgaagaaaatgaaattttaaat
gaattaattaaatcaccaacaaatacattacaggttcaattagagcaagaattaaatata
acagagtcacgacaaccaatgctatggaaatttaagaattcaagaaaattggttagtggt
atagtagtggagccacaatcgttacaaaagatatcagaacaattatcatcatcagaaatt
cgaaaagtcgttggataccccacatgtttttcaatcacaaaatatatttgtattggtacc
tctcatggttatttaatgatattcaattacaatcaagagttaatttcaattattgggggt
tcaatttgttcagattgtggtccagtcacagcaatcgatttaccaagttgtcgtgtaaac
gaggattggttaatttcaggtcatcaaagcggtcatattattttatgggatgttcaaact
ggtaaaccaatcaaagttattgaaaaagtacacaaattaccattattacatttgaaattt
ttcgcagatggttcaagattcatttcttcagactcaagtggtgtaacaaatgttatagtt
atcaccaaaggctttatgtccattggcaccgagcaacaattattattgaatggtaattta
ggtcaagttttagcaatttcaattttattaccaggtaattttgatcatccaactgataga
tccaatattgtagcattggccaccagtagaaagattttaatcatttcagcatcaaccgaa
ggtgtttcgattttaaataataagatcactagaccaaagaatcttgttgataaaactgca
ttgccttatctctcatggcgtcgtgtcacattcaatagatccttgggtcatactaaacca
ttggagccaattttagctattggttggggcacaaatattcaattacttcaaattgtaaca
gcaccaaacgatgtaaagtttttatcaccagagtttattgttgttgcagagtatcaaact
gatcatataatttgcggtttagagtggttggatagtcaaactattctattccataattca
aaagatgaaattagagtatttgacccatttgctttggaggaagtcgagagtgtcaatata
aaatcaatgcaactcgtacaccattcaaaattccaatcagtttattcattccataacagt
ataaagacaataaagaatagaatctactttttaggtttaaatggtgtatttacagctcat
attttaacttggttagaacgtttatcaattttaattagtaatggacaatggttcgaagct
ctttgtttaggtttggacttttatgaaggtaaagccaaagcaacatcaggtctttcaagt
aatacagtggattcgaaactaatcacatctgaaaagattattgaaatgttatcaaatctt
tgtcagactattttcaataataatccagaggatcttgttggtaaatctttaattccaaaa
cattttcttcaagatatggacccaagaattgaatatttcaatattttccaacagttggct
ttaatttgtattgaattttgtgtatccatcaaacacaccaatttattatttggcgaaatt
ttcaattatttcttagagagtggtatgaaaagttgtattttagatttcttagaaccttat
attttaaatgatcgtcttactcatttaaatccagaagtaatgcaaaccatgatgacctat
tatcaagagttgggtattctggttagagccgaacaatgtgttttacatttagatatttca
agtatagatttccatcaaaccgttgtactctgcagaaaacatggtctttacagtgcttta
atttatctctataacaaaggtttggacgactatattacaccattagaagatatgatggag
atgttaatcaaaccaaagaatttaaatactcaactaacagcaagcgaaaagaaatttaga
gatgaagttgcaaatcatttattattatacttaaaattatctcttagtggaaaagcattc
ccaactggtttaattcaacaaaatcgtgtattatctttaaaagctgaaatctatgaatac
ctcttcctccgtaacattgacccagatgacccaacaccatatccaagaatctttaatctt
ttaaatttagaaactactgggttattaaaaattttatcatctggattctatgataaaaat
ttccaagtaccaaatcacagcaacgatgatttagtcccagagctttcagtaccaaattta
ccattaaatttcccagtcagtcgttcaaacttaactaccttcaatatgatatccgtattg
ctattggtaatgatcgataaacaacaaaatccattcaatttaaaacaaaatgatcaatgg
gcattctcattccaacaacagggtcaacttttatgtatattgggaaaagtttatgctgat
ggtttattccgtgtagattcaacattattaaatagaattattggtatgatttcagttcct
ccagttgaaaacactccattattcacattgaacgaaagacaaagtgttttattaagaata
ttacaaaaattaacaaccgatctaaataccaagaaagactttgattatgataaacttttg
ttatcatgcgaaggtaatgaattctttaaagtatgtcaatatatttatagcttcaaggat
aattatagcaagatgattacatgtcaaattaaagatcaagagaataaacaccaatcgttc
gattatattcgtacaattctagctaaaccaaatctttcaaaagagaatagagagaccgtt
aaaaacacatcaattagcaacttggctcagttaattttaattgatagtgttaaaactgct
cagttaattatggattgtttctctaacgatcatgaaaaagtcttaaaagaattggcagct
tttccaaaacttcaatatacatatcttcaaggtctctttaagaaatctttaaccggttca
acaatcatccaacaatatggtttacatatttctcaagaaacacacgagctttatctaaga
ttaatgtgtgaattctcaccatcgaatgtttataaatatctttcaagtaacgacgattat
ccattagatagctgtttaagaatttgtcaacaatataacaactttgaaggtgcaatttat
ttattagaaagaattggcgatgttttcaaagctttggatatgattttaatggtattaaac
gaaaagcttcaagctcttttagatcatttcgcacaggtttatgtaaatgtaaaacaattg
aaaaacgaagaaaatactccagcatcacaacaagaaaaggatgttgttaaagatttattc
tctgcaatatcgctttgccaacgtaactcaccaaaacttaacgataacgaaaatgaacca
ttatggtttacactattcgataccatcgtttcatatattcaaaaagttaaaattcaaacc
atgaaaggtcaattcagtaaaacctcatccatttactccaaatcaatttcattccttaca
aaattggtacactctattattaataatatgatgggatatgtagcattaccagttatcctc
agtagaatcgtcaacgagtatggcaataacgatttgggtgattttaaacaaattattcag
gatatgttggatacttgtaatttcgaaactataattttagaaacagcaaacgatttaata
caacaagatatgtatagtgccacccgacattatgttgacaaattatcgcgtgcttattca
ccaaatatttcacgatgcggtaattgtttacgtccacttcgtgaaagtccaatttcaaac
caacaacccaatcatactatggttttggatatgttggtagttttccagtgtaatcatact
tttcattctgaatgtcttggaaagcatagagtttgtccactatgttcaaaagaaaaagaa
aaaaatacagcatcaaaaaataaaaaacaacaacaacaaaataaaaacaataattcaact
gccgataatcaagataatcaattaaatgctaataaatttgacatgtcaaaatacgaacgt
gaaaaagctcaaagagaaacagccaaatatatggaaagattagaaagattttctaaaatg
aatcaaagatcatcttttaaatttaatcacaattcacgtcattatcagcaacaacaacaa
cagcaataa
DBGET
integrated database retrieval system