Dictyostelium purpureum (cellular slime mold): DICPUDRAFT_156198
Help
Entry
DICPUDRAFT_156198 CDS
T02090
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K23288
syndetin
Organism
dpp
Dictyostelium purpureum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
dpp04131
]
DICPUDRAFT_156198
Membrane trafficking [BR:
dpp04131
]
Protein recycling
Others
EARP complex
DICPUDRAFT_156198
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Syndetin_C
Vps54_N
EXOC6_Sec15_N
DUF4745
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10507764
NCBI-ProteinID:
XP_003291590
JGI:
Dicpu1_156198
UniProt:
F0ZVZ1
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1005 aa
AA seq
DB search
MNRNYSSASLNNSNNNNNNNNNNGGGLRASTSEVDLFQLTSNLNTLSDVSRLLMNKRNSI
QSNTRRPYTEKTPEEIKKENEIIENLDKVYFDENFDSSFILESIGANDPIETIDALTVKI
SGYHEAVDSRFNDLIRKSYSGFVQGMSQVYEIERDLTHSARMCSSGKEYLDGVQSNLTAF
GFKLLAKHRIRQYSKYMLQEMSRIYEITQTARKIDSYLNMNEFAQALELLTQWNQVITKY
SKYSYIEDLTSKFDFREDTVLGKIDSSFVGVCHVFDPKSMKFVELCQILKEDQYIPSLMG
ILEHLSDLMWSHYMMKQWILLRLQAIKSDCEEKKFYIEIFKLFCSNKKTIWNSIQNQVRH
ILNSLKPKFKIELFIKVLDSINQFIEVGIQFSGEEANLLKGIMREKSLDYFQYFHKETIE
RLKTMLENEMWHKIPLPNNFTVLDVKEFGIIMNSFNESNLDSEGGSRSRKSSSSKPPQPQ
INQPAISGFLTITDQQKQQQQQLSLCPQDYEIPFLNHFKDNGNPFSLIEGRRTLSEAAGN
RNSLSTSQTELPTFNNNNATTSSPLISSTTINVIKQIGYYLQMMKILKQLAYPIFTAISQ
LLEYYVYSVFTFFGSMNEKNTILDIANNNSNINPMLIKTLQRLKNKFSPPPVQEKTSLLS
ASTFQSKISSPHLSIKSDKSPNLNQPKENIFLPNLSLSNSSNSINSNSNNSNNGSNHNNG
LNSLNNNFNSEEEIIINWSLPKLNDSLDLTQSKNLFGLEHKIIGLESMMFLVDCIMEAQP
LVLDLIPPEKSSQTTNFYVETVSVVASLRNLLYKNITSQFLELETIPNLITNTKWELKEA
PTTENHYVSSIIIQFHKFAGNLDAIASPKTTLITPKIKNLLWENTIVFAMETLIESYSKI
KKCNNFGRNLMIMDVKKLQSDLEPLTTIRPIPHIKHVEHYITAYYLPRKELYEMARDSEY
TVKQIISIVNIQNHLPKPEKQKLLSDLDDLEKQKLKENQMMLNIK
NT seq
3018 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagaaattacagtagtgcttcattaaataatagtaataataataataataataac
aataataatggtggtggcttaagagctagcactagcgaagttgatttatttcaattaaca
tcaaatttaaatacattatcagatgtttcaaggcttttaatgaataaaaggaatagtatt
caaagtaatactagaagaccatatacagaaaaaacaccagaagaaattaaaaaagagaat
gaaattatagaaaatttagataaagtatactttgatgaaaattttgatagctcatttatt
ttagaaagtataggtgctaatgacccaatagaaactattgatgcattaactgtaaagatt
agtggctatcacgaagctgtggattcaagatttaatgatttaattagaaagtcatatagc
ggttttgttcaaggtatgtctcaagtttatgagattgaaagagatttgacacactcggcg
agaatgtgttcatcaggtaaagaatatttagacggtgtgcaatcaaatttaacagcattt
ggtttcaaattattagcaaagcatagaattagacaatattcaaaatatatgttacaggaa
atgtctcgtatctatgaaattactcaaacagcacgtaaaattgattcatacttaaatatg
aatgaattcgcacaagcattggagttattaacacaatggaaccaagtaattacaaagtat
tcaaaatattcgtatattgaagatttaacatctaagtttgattttagagaagatacagtg
ttgggtaaaatcgattcatcatttgttggggtatgtcatgtatttgatccaaagagtatg
aaatttgtagaattgtgtcaaatattaaaagaagatcagtatataccatctttaatgggt
atattagaacatttatccgatttaatgtggtcacattatatgatgaagcaatggatatta
ttaagattacaggctattaaaagtgattgtgaagaaaagaaattttacattgaaatattt
aaattattttgctcaaataaaaagaccatttggaattcaatacaaaatcaagttagacat
atattgaactcattgaaacctaaatttaaaatcgagttattcattaaagtattggattca
attaatcagttcatagaagttggtattcaattttcaggtgaagaggcaaacttactaaag
ggtataatgagggagaaatctttagactatttccaatatttccataaagagaccatcgaa
agacttaaaacaatgttggaaaatgaaatgtggcataaaatcccattaccaaataatttt
acggtattggatgtaaaagaatttggtattattatgaatagcttcaacgagagtaattta
gatagtgaaggtggtagccgtagtagaaaatcatcatcatctaaaccacctcaaccacaa
ataaatcaaccagctatatcagggtttttaacaatcacagaccaacaaaaacaacagcaa
caacaactaagcctttgtccacaggattatgaaataccattccttaatcatttcaaggac
aatggtaacccattctcattgatcgagggtagaagaactttatcagaggcagcaggtaac
aggaatagtcttagtacaagtcaaaccgaattaccaacatttaataataacaacgcaact
acaagtagcccattaatttcatcaactacaatcaatgttataaaacaaattggttattat
ttacaaatgatgaaaattttgaaacaattggcctatccaatttttacagccatatcacag
ttattagagtattacgtttattcagtatttacattctttggtagcatgaatgaaaagaac
actatattggatatcgcaaataataatagtaatatcaatccaatgttaattaaaacacta
caaagattaaaaaataaattctcaccaccaccagtacaagaaaaaacatcattattatca
gcatcaacatttcaaagtaaaatttcatcacctcatttatcaattaaaagtgataaatca
ccaaatttaaatcaaccaaaagaaaatatatttttaccaaatttatcattatcgaatagt
agtaatagtattaatagtaatagtaataatagtaataatggttcaaatcataataatggt
ttaaatagtttaaataataattttaatagcgaagaagagattattattaattggtcccta
cccaaacttaacgattctttggatttaacccaatctaaaaatctttttggtttagaacat
aaaattattggtttggagtcaatgatgtttttagtagattgtattatggaagcccagcct
ttagttttagatttaatcccacctgaaaagtcttcacaaactacaaatttttatgttgaa
actgtttcagtcgttgcatcattaagaaatttattatataaaaatataacttcacagttt
ttagagctcgaaactataccaaatttaattacaaatacaaagtgggaattgaaagaggca
ccaacaacagaaaatcattatgtatcatcaattattatacagtttcataaatttgcaggt
aatttagacgcaatagcatcaccaaaaaccacattgataacaccaaaaatcaaaaattta
ttatgggaaaatacaattgtatttgcaatggagacattaatagagtcttattcaaaaatc
aaaaaatgcaataactttggtagaaatttaatgattatggatgtaaaaaaattgcaatca
gatttagaacctttaactacaatcagaccaattccacatataaaacacgtcgaacattat
attaccgcttattatttaccaagaaaggagttatacgaaatggcaagagattcagaatac
actgtaaaacaaatcattagtattgtaaacattcaaaatcatttaccaaagcccgaaaaa
cagaaattattatctgatttagatgatttagaaaaacaaaaactaaaagaaaatcaaatg
atgctaaatataaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
