Dictyostelium purpureum (cellular slime mold): DICPUDRAFT_34586
Help
Entry
DICPUDRAFT_34586 CDS
T02090
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K19022
AP-5 complex subunit beta-1
Organism
dpp
Dictyostelium purpureum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
dpp03400
]
DICPUDRAFT_34586
DNA repair and recombination proteins [BR:
dpp03400
]
Eukaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AP-5 complex
DICPUDRAFT_34586
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AP5B1_middle
AP5B1_C
AP5B1_barrel
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10499306
NCBI-ProteinID:
XP_003288776
JGI:
Dicpu1_34586
UniProt:
F0ZMY5
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1228 aa
AA seq
DB search
MDNTTYTSNEWYSIIQNWRNQKFYAPIPLNQTSSQQSSNLSIFSPLVSGALQILTDDSKS
TQQSAQLSPSSTQQTGSQQSTSSDTSSASFIIIENLLKSLKNEKDDILRINLLLFLQENS
SILLEDDSKRLDRVISILQSLITSQTETYPVKSQVLTTITTIFICESIIKTNPKLIETFI
EILMDIIKKINNSPDRLLRGSACNCLLEFELTYPCLLSEYKKTITDYCQQENTHLIQNYT
VLLSTILQNVTLSTYEEASSHQQNANTIINSTNNSNITNQSTPLNTIVSPNTNTISIPVS
PVSTLQINQLNQQLTQLQMQQQQQQQQQLSSSSNKSYMASPQLSYSSSNSLASAGNSSQN
SLNYSSSRRSQMFPLPLPNSVFTDTDPNLRGTSFAIPPNVKYSPISLEKINNEMIIRHLS
NVRLPDSFEKDVFTCASIIADQSAYLNQWGLLTSVQQLVPLIDIVNIPHNFFKNHLHLLY
KLFFTNNTVQFHMILYLTLTFQDLYSQAELDYCLKRIIGIINDSSISLENRVLTIDWFLS
LPQKLNKSILINQNPSQPSHQPPSHLLPISIFQFYPNFYPSSFDSIQLKESKLYTLCKCL
IASPTNLNIQPEYNTNINLLIRELLKSLICLDEFKHNSEAALSTRIVFSCLLMFLTNFSN
LMFGCVEIFLSETLINYPQFLNVIIGLLNGVNNNKIKINLFLSLSKTIVLLKPLRFLQYL
PLVERIIVEDQIDPTGLLEKTFDLVRRKKICTSGNWFIGNIILSICRRAIMFHHTTIVAK
PLKLILSNLSSYFSNLEIRDRASFYQRLISHLPDDKIKIILNTQQNDEANVSGLLSAPLS
SDKNKLIKSVPNFISISQINNREISNSIQPLSIFEPVLSSNNTATEENKDSFDDDFNNYL
SLIRDHNKIEAKIIIPYQIRYKKHISGSSGNSGSSGNSGANGSSGSNTNNNQTTINNFNS
NGIPLKVYALLIQLQQSPYYSPIHPIRIPYLCYPSLNDFDNNSNSNNNNNNNSNNGDSDE
NNNNENNNESKFKEFPYCYDIDLSFKPIYPIPTSFSIKMIFNDDEGKTCKSDGSIISIQL
SSLFMKTPIPSHIIDSEDIISKFRLNLFNKFWSLSQPSIIAPTNNYQIQITNSVKQINIP
NKQIKEILNSELSNYIVIDEEKENNDNNNDEKEIIKVLIFLPPQFHLLLQFEIGKDSTII
YIKTDYWRCLVYLDQYLSNLSTIINKNE
NT seq
3687 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataatactacctatacatcgaatgaatggtatagtataattcaaaattggagaaat
cagaaattttatgctccaataccattaaaccaaacttcatctcaacaatcaagtaattta
tcaatattttcaccattagtaagtggtgcattgcaaattttaacagatgactcaaagtct
actcaacaatcagcacaattatcaccttcctcaacacaacaaactggttcacaacaatcc
acatcatcagatacatcatcagcaagctttataattatagaaaatttattaaaatcttta
aaaaatgaaaaagatgatatacttcgaattaatttattattgtttcttcaagagaactct
agtatccttttagaagatgactcgaaaagattagacagagtaataagcattcttcaatca
ctaataacatctcaaaccgaaacctatccagttaaatctcaagtattaacaaccattaca
accatttttatttgtgaaagtatcatcaaaacaaatccaaaattaattgagacttttata
gagattttaatggatataatcaaaaaaataaataatagtcctgatagactattaagaggt
tcagcatgtaattgtttattggaatttgaattaacctatccatgtttactatcggaatat
aaaaaaacaattacagattattgtcaacaagagaatacccatttaattcaaaactataca
gttttattatcaactatactacaaaatgttacactaagtacatatgaagaagcatcatca
catcaacaaaatgcaaataccataataaactctacaaataatagcaatattacaaatcaa
agcacaccacttaatacaatcgtatcaccaaatacaaataccattagtattccagtttca
ccagtctcaacactacaaatcaatcaattaaatcaacaactaacgcaattgcaaatgcaa
caacaacaacaacaacaacaacaattatcatcatcatcaaataaatcatatatggcatct
ccacaattatcttattcgtcatcaaatagtttagcatcggcaggtaatagttctcaaaac
tcattaaattactccagtagtaggagatcccaaatgtttccgttaccactaccaaatagt
gtattcacagatacagatcctaatcttcgtgggacttcatttgccatcccacctaatgta
aaatactcgccaatctctttagaaaaaataaataacgaaatgatcattaggcatttgtca
aatgttagattaccagattcatttgaaaaagatgtatttacctgtgcctctataattgca
gatcaatcagcatatctaaatcaatggggtttacttacaagtgttcaacagttggtccct
cttattgatattgttaatattccacacaacttttttaagaaccatttacatttgctctac
aaattatttttcaccaacaatacagtacaatttcatatgatcctctatttgacattaact
tttcaggacctatacagtcaagctgaattagactactgcttaaaacgtatcattggcatt
atcaacgacagctcgatatcattagagaacagggttttaacaattgattggtttttatct
ttgccacaaaaactaaacaaatcaattctaatcaaccaaaacccatcacaaccatctcat
caaccaccatcacacctattaccaatttcaatattccagttctatccaaacttttatcca
agctcattcgatagtattcagttaaaagaatcaaagctctatacattatgtaaatgttta
attgcatccccaaccaatttaaatatacaaccagaatataatactaatattaatttgtta
attagggaattattaaaatccttaatctgtttagacgaatttaaacacaatagcgaagca
gctttgtcaacaagaatagtttttagttgtttattaatgtttttaacaaacttttcaaat
ttaatgtttggatgtgttgaaattttcctatcagagactcttatcaactatccacaattt
ttaaatgttatcattggtttgttgaatggtgtgaataataacaagataaaaattaattta
tttttatcactttcaaaaacaattgtattattaaaaccattaagatttttacaatattta
ccattagtcgaaagaatcattgtcgaagatcaaattgatccaactggattattagaaaaa
acatttgatttggttagaagaaagaaaatatgtacaagtggtaattggtttataggtaat
attatactttcaatttgcagaagagcaataatgttccatcatacaactattgtagctaaa
cctttgaaattaatattatcaaacctttcatcatatttttcaaatcttgaaatcagagat
agagcctcattttaccaacgtttaatttcacatttaccagatgataaaattaaaattata
ctaaatacccaacaaaatgatgaagcaaatgttagtggattattatcagcacctttatca
tcagataaaaataaattaattaaatctgttccaaattttatatcaatatcacaaattaat
aatagagaaatttcaaactcaattcaaccattatcaattttcgaaccagttttatcaagc
aacaatacagctacagaagaaaacaaagattcatttgatgatgattttaataattattta
tcattaattagagaccataataaaatcgaagctaaaattattattccatatcaaattcgt
tataagaaacatattagtggttcaagtggcaacagcggcagtagtggtaatagtggtgca
aatggtagctctggcagtaacaccaataataatcaaacgacaattaataactttaatagc
aatggtataccattaaaagtatatgcattattaattcaacttcaacaatcaccatattat
tcaccaatacacccaattagaattccatatttatgttatccttcattaaatgattttgat
aataatagtaatagtaataataataacaataataatagtaataatggtgattcagatgaa
aataacaataatgaaaataataatgaaagcaaatttaaagaatttccatattgttatgac
atagatttatcatttaaaccaatctatccaattccaacaagcttttcaatcaaaatgata
ttcaatgatgatgaaggtaaaacatgtaaatcagatggatcaattatttcaatccaacta
tcaagtttatttatgaaaaccccaattccctcacacattatcgattctgaagatatcatc
tccaaattcaggttaaatttattcaataaattttggtcgttatcacaaccatcaatcata
gctcccaccaacaattatcaaattcaaattacaaactctgttaaacaaattaacatccct
aataaacaaattaaagaaattttaaattcagaattatcaaactatatagttattgatgaa
gaaaaagaaaataatgataataataatgacgaaaaagaaattattaaagttttaatattt
ttaccaccacaattccatttattacttcaatttgaaattggtaaggattcaacaatcatt
tatattaaaactgattactggagatgtttagtatatttagatcaatatttatcaaattta
tcaacaattattaataaaaatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
