Dictyostelium purpureum (cellular slime mold): DICPUDRAFT_41231
Help
Entry
DICPUDRAFT_41231 CDS
T02090
Symbol
ABCA8
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K05643
ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
dpp
Dictyostelium purpureum (cellular slime mold)
Pathway
dpp02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpp00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
DICPUDRAFT_41231 (ABCA8)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
dpp02000
]
DICPUDRAFT_41231 (ABCA8)
Transporters [BR:
dpp02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCA (ABC1) subfamily
ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
DICPUDRAFT_41231 (ABCA8)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC2_membrane_3
AAA_21
R1_ABCA1
SMC_N
SRP54
AAA_29
CUB_M02D8_5_2nd
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10509052
NCBI-ProteinID:
XP_003292864
JGI:
Dicpu1_41231
UniProt:
F0ZZM0
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1614 aa
AA seq
DB search
MVREFSGQLRTLLKKNYLIKKKNKCGVCFEIVLPIVIVLIIFALLGLISSVKPNYDSYNV
SNILINRLNNNTILLYGAPETLNVEQQGVINIIKLQVEQSRKLQPNEVDSFFLEINDQTA
MEEYFSNHSNSIYGAVWFNNSQVASKTVPFQYNIRLDSENVNNNNETTNKNGNSEIYLKG
NFASIQVAVDQAIFEYYGINKTLVVSGQRYPDPYTKPWQKWIVVRNAILKDAGSVFVTAA
FFIFGFCLVTDLVIEKETKIREGMKMMGLNDLAYFFSWIITSLTISLPVDLIIVTIFKGS
QVIYSTPWGLVIATFVLYLLTLLFLAFIFAIFFDKSKFCGLISIIIILIINIAGVFIAKG
DFNPNIKMFLSILSPIAFSCSFYTMVVRDIPEEVLSVNFNSLVTEKQAIYMLIIDLFFYL
FLIWYLQEVVPTEYGTKKPFYFIFSPKYWCSIGSNSNIYDIESTYQNDDVELIPNDIKSK
VTISIRNLRKEFSTGDGIRVAVNDLYLDMYENQIHAFLGPNGSGKSTTIGMLTGLISPTG
GTALIQGYDIGSQMSKVRRSLGVCLQQDIIWNQLSVLEHLKIYGSLKGITKNVEKEAEKM
AIEIGLGEKIHTPAGSLSGGQKRKLCLGIAFIGRSSVVFLDECTSGMDPLSRRSVWDFLL
KYKKGRTIILTTHFMDEADFLGDRISIISYGKLRCDGSSLYLKNKFGCGYLLTCSKDINN
LDYFSTSNVTEFVHRYIPEANILSDAGTELSYRLPTSSLPIFSQFFEDFDEQLSYFGITT
YGISVTTMEEVFLKIGQEANSGNVGDIYQNTNSNINSEGEGSLLLKTGISTPSSGINAGQ
QIKGLLIKRIRTSIKDWKSLFLTLIIPLVCIICSIVIFVSMDSAQTYYNDVTTPLTMSLA
SFGANDVVPIQTISQEDFDTLNQSPFFNQFKYVNQSANFKNYLIENNLISAGAINVTTQL
AQNNSVVGYNSFYNIKYLHSIPIHINLINSALLEHSTDIRIQITSMPFKHVLSMFDLSTE
GLNISSILYFNIIMLAGLALMVGSFAGSISQERTNRVKRLLYISGCKKYVYWLSNLIWDY
IFSFIIILATSIILAIAKEEFREQFGIFFLSLILYCVATIPLCYLLSYLFNTHGKATGAI
AAILFAKAIVLMITSLNIRGQVLVNLNEGTQTAADICDIIFSLVSPLYAYSRILALVSKF
PGTTRLGSWKIDNYWSLDYGGTPIIILIFHCIVWTSWILLLDYSPEIKGFFKNPKNLKSP
PPPVYEDSDVSNERSRIHTVSDEIVKVDSLHKLFKGKGKNGDKIAVHNTCLGIPRGQTFG
LLGLNGAGKTSTLSMLCGDIIPTSGQVSINGHDLISDRSKALQNISMCPQFDALVGLLSA
REQLYLYCRIKGVAENNIENVVESFINMMDMSRIANSSSGGYSGGNKRKLSLSIAMLGDP
SVVFLDEASTGCDAVVRRYIWNVISELSKGRSIIITTHSMEECQALCSRITIMKDGKFTC
LGSIQHVKNKFGAGYSFDVKFKREYFENGVETVLHNFPNARLLDQHDLIASFELPNEASN
PVKVSRIFNTLQNDLGSILDDYSVSQTSLEQVFLKLTGASYDDRLNQNAQNHDQ
NT seq
4845 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtcagagagttttcagggcaattaagaaccctacttaaaaaaaactatctaataaaa
aagaagaataagtgtggtgtttgttttgaaatagtattaccaattgttatagtactgatc
atttttgctttattaggtttaattagttcagttaaaccaaattatgattcatataatgtt
tcaaatattttaatcaatagattaaataataatacaatattattgtatggtgcacctgaa
acattaaatgttgaacaacaaggtgtcattaatataattaaactacaagtagaacaatca
agaaaattgcagccaaatgaagtagattcattctttttagaaataaatgatcaaactgca
atggaagagtatttctcaaatcattcaaatagtatttatggtgctgtatggtttaataat
agtcaagttgccagtaagactgtaccattccaatataacattagattagatagtgaaaat
gtaaacaacaataatgaaactacaaataaaaatggaaattctgaaatttaccttaaaggg
aattttgcctcaattcaggttgctgtagatcaagctattttcgaatactatgggattaat
aaaacgttggtagtttcaggtcaacgttatccagatccatatactaaaccatggcaaaaa
tggattgttgttagaaacgcaattcttaaagatgcaggttccgtttttgttactgcagca
ttctttatatttggtttctgtcttgtcactgatcttgtaattgaaaaagaaactaaaatt
cgtgaaggaatgaagatgatgggtttaaatgatctagcttactttttcagttggatcatt
acaagtttaacaatttcattaccagtggatcttattattgttacaattttcaaaggttca
caagtcatctactcaacaccatggggtcttgttattgccacatttgtgctttatctttta
actcttttgttcttggcttttatctttgcaattttctttgataaatcaaagttctgtggt
ctcatctcgataatcattattttaataatcaatatagctggtgtgtttattgctaaaggt
gactttaatccaaatattaaaatgtttctctcaattttatcacctattgccttttcatgt
tccttctatactatggtagttagagatattcccgaagaagtgttatcagttaactttaat
agcttggtaacagagaaacaggccatttatatgctaattatagatctttttttctattta
tttttaatatggtatttacaagaggttgttccaacagaatatggaactaaaaaaccattt
tattttatattttcacctaaatattggtgtagcattggttctaatagtaatatttatgat
atcgaatcaacatatcaaaatgatgatgtcgaattaattccaaatgatattaaaagcaaa
gttacaatttcaattagaaatttaagaaaagagttttctactggtgatggcataagggtt
gctgttaatgacttatatttagatatgtatgaaaatcaaatccatgcatttttaggtcca
aatggaagtggtaaatcaacaaccattggtatgttgactggtttaatttctccaacaggt
ggtactgcattaattcaaggttatgatattggttcacaaatgtcaaaagttagaagatct
ttaggtgtttgcttacaacaagatattatttggaatcaattatcagttttagagcattta
aaaatctatgggtcattgaaaggtataacaaagaatgtggaaaaagaagctgaaaaaatg
gccatagaaattggtttaggagaaaagattcataccccagcaggttcattatccggtggc
caaaaaagaaaattatgtttaggaatagcattcattggtcgtagctcagtagtttttctt
gatgaatgtacttcaggtatggatccattaagtcgtcgtagtgtttgggactttttactt
aaatataaaaaaggaagaactattattttaacaactcactttatggatgaagctgatttt
ttgggtgatagaatttcaattatttcttatggtaaattaagatgcgatggttcgagtcta
tatttgaaaaataaatttggttgtggttatttattaacatgtagtaaagatattaataat
ctagattattttagcacttccaatgtaacagagtttgttcatcgttacattccagaagca
aatattttatctgacgccggtacagagttaagctaccgtcttccaacctcatccctacca
atattttcacaatttttcgaagattttgatgaacaactatcttattttggaattacaact
tatggtatttcagtcacaaccatggaagaagttttcttaaaaattggacaagaagcaaac
tctggtaatgttggtgatatctatcagaatacaaatagtaatattaatagtgaaggtgaa
ggtagcctattactaaaaactggaatttcaacaccatctagtggtatcaatgctggtcaa
caaattaaaggtctgttaattaagcgaattcgtacctcaattaaagattggaagtctctc
tttttaacactcattattccattggtatgcattatttgctccattgttatatttgtatct
atggatagtgcacaaacctattataatgatgttacaacaccattaacaatgtctttagct
tcttttggagcaaatgatgtcgtcccgatacagactataagtcaagaagattttgacact
ctcaaccaaagtcccttctttaatcaatttaaatatgttaaccaatcagctaattttaaa
aactatttaattgaaaataatttaattagtgctggtgcaataaatgttacaacccaatta
gcccaaaataatagtgtcgttggatacaattcattctataatataaaataccttcactca
ataccaattcatattaatttgattaatagtgcattattagaacactcaaccgatattagg
attcaaattacaagtatgccattcaagcatgtccttagtatgtttgatttatcgactgaa
ggtcttaatatttcatctattctttatttcaatatcataatgttggctgggttagctcta
atggtggggtcttttgccggtagtatatctcaagaacgtaccaatcgtgttaaaagacta
ttatacatctctggttgcaaaaaatatgtctattggttatcaaatctcatttgggactat
atattttcttttattataatacttgctacatcaattattttagctattgccaaagaagag
tttagagaacaatttggtatctttttcttgtctttaattttatattgtgtagcaacaatt
cctctttgctatcttttatcatatctttttaatacccatggtaaggcaacaggggctatt
gctgcaattcttttcgcaaaggctattgttttaatgatcacctcattaaatattcgaggt
caagttttagttaatttaaatgaaggtactcaaactgctgctgatatttgtgatattata
ttttcacttgtctcaccattatatgcatatagtagaattcttgcactagtcagcaaattc
ccaggtaccactcgtttaggatcttggaaaatagataactattggtctttagattatggt
ggcaccccaattataatcctcatttttcattgtattgtttggacatcttggattctactt
ttagactactcccctgaaatcaagggtttctttaagaatcccaaaaacttaaaatcaccc
ccaccaccagtttatgaagactctgacgttagtaatgaaagatcaagaatccatacagtt
tctgatgaaattgttaaagttgactcactacacaaattattcaaaggtaagggaaagaat
ggtgataaaattgcagttcataacacttgtttaggtattcctcgtggccaaacatttggt
ttacttggtttaaatggtgctggtaagacctctaccctctcgatgctatgtggtgatatc
attccaacctctggtcaagtttcaatcaatggtcatgatctaattagcgatcgttcaaaa
gctttacaaaatatttcaatgtgtcctcaattcgatgctcttgtaggtttattatcagcc
cgagaacaactttacctatattgtagaattaaaggtgttgcagaaaataatattgaaaat
gttgtagaatctttcattaatatgatggatatgagtcgtattgcaaatagtagctctggt
ggctattctggaggtaataaaagaaaactttcattatcaattgcaatgttgggtgatcca
tcggtcgttttcttggatgaagcaagtactggttgcgatgctgttgtacgtcgttatata
tggaatgttattagcgaattaagtaaagggcgttcaattattattacaactcactcaatg
gaagaatgccaagcactttgttcaagaataacgatcatgaaagatggcaaatttacatgt
ttgggatcaattcaacatgtaaaaaataaatttggtgcaggttattcttttgatgtcaaa
tttaagagagaatattttgaaaatggtgttgaaacagttttacataatttccccaatgct
cgtcttttagatcaacacgatttaatcgcatcattcgagttaccaaatgaagcctcaaac
cctgttaaagtttctagaatatttaatactcttcaaaacgatttaggatcaattttagat
gactattcagtttcacaaacctctttagaacaagtcttcttgaaattaacaggtgcaagc
tatgatgatagattgaatcaaaatgctcagaatcatgatcaatga
DBGET
integrated database retrieval system
