Dictyostelium purpureum (cellular slime mold): DICPUDRAFT_49821
Help
Entry
DICPUDRAFT_49821 CDS
T02090
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K12600
superkiller protein 3
Organism
dpp
Dictyostelium purpureum (cellular slime mold)
Pathway
dpp03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpp00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
DICPUDRAFT_49821
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
dpp03019
]
DICPUDRAFT_49821
Messenger RNA biogenesis [BR:
dpp03019
]
Eukaryotic type
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Ski complex
DICPUDRAFT_49821
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_19
TPR_14
TPR_2
TPR_8
TPR_17
TPR_CcmH_CycH
TPR_12
TPR_11
TPR_1
TPR_7
ChAPs
EH_Signature
ANAPC3
ARM_TT21
ARM_TT21_C
Fis1_TPR_C
TPR_10
ARM_TT21_4th
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10507631
NCBI-ProteinID:
XP_003291442
JGI:
Dicpu1_49821
UniProt:
F0ZVK2
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1775 aa
AA seq
DB search
MDYIKDKLKEARVAIDKKDYKTVLEICTEIIQYDDKNPMIHLFMGLANYNLNNYTQAEKS
YIAAVKLQPNSPTPLKGLYELYSKTNENEKITNIIKQLLPLTTDLAKKKEYSLKLIDLST
AQKDYKTALDLILPMIEEVEKENSSGSSDEEKIKFLEKCENINFLYYQSVLKSRVDEKLR
EKNIPIIDPNQSAMSIGGPKLTPDQVIERDKIEFEINKQLINGDHFDLSKYNFLINNDDN
IKYLNNDTLLRIYNHYIQILILKRRYQTSENEQKIYREKINKECQRMNSILGNPSYSLEQ
LINLLEEDIGNSSDPLDEVYEEINRLSTILTSKYPVRGLGWIGLGFYAMSKKSDYSDSSK
QLIEKGFSNTGSTDSLLGYLALSKWYLEQMRASPSTSNHDRIRDIIKKSSIVFEKKQKAV
GPFFDGIYIELQLILVESFCFNSNFDFAVNTLEKLLEREDFPTYQHQKIIFELAKLYFET
KDYEKSKLQFKTLLDQSKEYYLVKSKTYLPWIDVLSKANDKEYLLSTSKPMILECIKIKE
TYLNLYVLGLICLATTQDKTEATQSLLKSAKLNPNFSDTFAKLGTIYKDTDKERSKKCYQ
KSLSLDILNAEAGFNLGQFYADAGQTSLVMSLYKEITEYCTSHVKRFPINIAKCSWAYYR
LAIYQMDNKDTHGSVVSLLAAIKGEPNNESYWRALAEAYRRQFKYVASLKSLRKAEEILD
SEHRVASDINFQIATLSKTLALYSDAVQEYDRVLAQIENNVPSLKGKAECLLELSKDNFK
YRNFTEALKLLKIAEESVKAALEKEPEFHSLWRLYGDICGFYLNLPVNDQVSKVEKSKQS
SEAYFKCVKIHSNASSLQDLSIGYYNQYIIYKNQLKLKLQQEKSNSTSSPTTKAITLEET
DNLLKSSIKCIIESINLSPNDFRLWNLLGVTLMDNFPEQSQHAFIRSIQLDSSKSEPYNN
LTLLYLQYGFFELSEKSLMIAKNNNIDSATSWSIQGLLNEIKSSIINHNTESGNNEKEQP
IDDYNFIDNELDSSPIGEGLLGYGITSMLGGYSETSFSVLYKYVEMNPKSVEANNCLGLV
YSNQKDYTSSEKYFQDALQLLLNNQDSNSIGTGIPVGVDEEKDMEINNSNQISIGSILFK
DKSVNFGKNNNIIFKKEEKIKYISINLARSQYNQNKYAQALETLKPYINDNDCKTKNSLS
NSLLWELFSLIYCKLDKTDLSIDSIKKAITLLPKQSQTSQQTFNNLRKQNLLLILAKVQF
SSKDNSKQFDTIIKTLEAIITIDSKFYKAWYFMASVYVSFKKYDMAIKTLKRLQDTVKDL
EIESYLLLSQIHVLNNNDIENAKRELEKAVHLFPNDEQGWTALAELELQFHQKEDPLNLP
LKLLGHSLNKKTSNYEYSGMGQLSIGPNHKVELGPSVHDLEILAKAHLFEQQSPYNKSLD
SAISIMKRIIHSNPSLSEPWLNLLNLIYWRSIYTVASSNDNNNTDEINENWENVKACWNT
VQYKCKSEINGDSQLKFQQDIIELEFLIVLNPQLFKEKLESQLKEFKADPLKQSVLLSLQ
AKFHLRNNEKDQALTILKNSLKIEPNSIETYHQISDIYESNDSLELSLLCLNRSLLILKN
NLLNSSNNNNNNNNNNNIGLYSTTLCKIIRILIIQKKFKEANKLLDQQMANEQPNISDNT
IIKLLKAILIVSGSKLTNSNMKQYNNDMKNAFTLLEETIVSNSKLSLTNFYLAVVEFNLK
NFVNSEKLLQKELNISPSTLIQINSLQDKIKQFTK
NT seq
5328 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattatattaaagataaattaaaagaagccagagtggctatagataaaaaagattat
aaaacagtgttagaaatttgcactgaaattatacaatatgatgataaaaacccaatgata
catttatttatgggtcttgcaaactataatctaaataactatacacaagccgaaaaatca
tatattgcagcagttaaattacaaccaaattcacccaccccattaaaagggttatatgaa
ttatacagcaaaaccaacgaaaatgaaaaaattacaaatataatcaaacaattattaccg
ttaaccactgatttagcaaaaaagaaagaatattcattaaaattaattgaccttagtact
gcacaaaaagattataaaacagcattagatttaattttaccaatgatcgaagaagtggag
aaagagaacagcagtggctcatctgatgaagagaaaataaagtttttagagaaatgcgaa
aatattaatttcttatattatcaatcagttttaaagtcaagagtagatgaaaaattacgt
gaaaaaaatattccaatcatcgatccaaaccaatctgctatgtcaattggtggcccaaaa
ctcactcctgatcaagtaatcgaaagagataaaatcgaatttgaaataaataaacaatta
ataaatggtgatcatttcgatctttcaaaatataattttttaataaataatgatgataat
attaaatatttaaataatgacaccttacttagaatttacaatcattatattcaaatttta
atattaaaaagaagatatcaaacatcagagaacgaacaaaaaatttatagagaaaaaatc
aataaagaatgtcaacgtatgaatagtattttaggtaatccaagctattcactagaacaa
ttaataaatttattagaagaggatataggaaacagtagcgatccactagatgaagtatac
gaagagattaatagactttcaacaattttaacttcaaaatatccagtaagaggtttaggt
tggataggtttaggtttctatgccatgtcaaaaaaatccgattacagtgattcaagtaag
caattgattgaaaaaggtttctcaaacacaggctcaacagattccttattaggctatttg
gcattatcgaaatggtatttagaacaaatgagagcctctccatcaacctcaaaccatgac
agaataagagatatcataaagaaatcatcaattgtatttgaaaagaaacaaaaagccgtt
ggcccattctttgatggtatttatattgagcttcaattaattttggttgagtccttttgc
ttcaattctaactttgatttcgctgtaaacacccttgaaaaactgcttgaaagagaagac
ttccctacctatcaacaccaaaagattattttcgaattggccaaactctattttgaaact
aaagattacgaaaaatcaaaactacaattcaaaactcttttggatcaatcaaaagaatac
tatcttgttaaatccaaaacctatttaccatggatcgatgttttatctaaagccaacgat
aaagaatacctattaagcacctcaaagccaatgattttagaatgtatcaaaattaaagag
acctatttaaatctttatgtgttaggtttaatctgtttggctaccactcaagataaaact
gaagcaacccaatcactcttaaaatcagcaaaacttaacccaaatttttcagatacattc
gcaaagttgggtaccatttataaggacaccgataaagaaagatcaaaaaaatgttatcaa
aagagtttatcattggatatattaaatgctgaggctggttttaatcttggtcaattttat
gcagatgcaggtcaaacctcattggtaatgtcgctctataaagaaattacagaatattgt
acctctcatgttaaaaggttcccaattaatattgcaaagtgctcatgggcttattacaga
ctggccatctaccaaatggataataaagatacccatggatcagtagtatcattattagct
gctatcaaaggtgagccaaataatgaatcctattggcgtgcattagctgaagcctataga
cgtcaatttaaatatgtagcctcattaaaatcattaagaaaggctgaagaaattttagat
agtgaacatcgtgtagcctctgatatcaatttccaaattgcaactcttagcaaaacatta
gcactctatagtgatgccgttcaagagtatgaccgtgttttagctcaaatcgaaaataat
gttccatcattaaaaggtaaggccgagtgtttattagagctatcaaaagataattttaaa
tatagaaatttcaccgaagcattaaaactcttaaagattgccgaagaatcagtcaaagct
gcattagaaaaagaaccagaattccatagtctttggagattatatggtgatatttgtggt
ttctacttgaatttaccagttaatgatcaagtttcaaaagttgaaaaatcaaaacaatca
tctgaagcctactttaaatgtgttaaaattcattcaaatgcctcatcacttcaagatctt
tcaattggctactacaatcaatatattatttataaaaatcaattaaaattaaaattacaa
caagaaaaatcaaatagcacatcctcaccaaccaccaaagcaatcaccttagaggaaact
gataatttattgaaatcatcaatcaaatgtattattgagtcgatcaatttatcaccaaac
gattttagactttggaatttattaggtgtaactctgatggataatttcccagaacaaagt
caacatgccttcatcagatcgattcaattggactcttcaaaatctgaaccatataacaac
ttaacacttttatatttacaatatggtttctttgaactatcagaaaaatccttaatgatt
gcaaagaataataatattgactctgcaacatcatggtcaattcaaggtttattaaatgaa
attaaatcatcaattataaaccacaacactgaaagtggcaataatgaaaaagagcaacca
atcgatgactataattttattgacaacgaattagactcatcaccaatcggcgaaggttta
ttaggctatggtataacatcaatgcttggaggatatagtgaaacatcattctctgtatta
tacaagtatgtcgaaatgaatccaaaatcagtcgaagcaaataattgtttaggtttggtc
tacagtaatcaaaaagactatacaagctctgaaaaatactttcaagatgctttacagcta
ttattaaataatcaagatagcaatagtatcggtaccggtattccagtaggggtagatgaa
gaaaaagatatggaaattaacaatagcaatcaaatatctattggctccatactttttaaa
gataagtctgtaaattttggtaaaaataataatattatctttaaaaaagaagaaaaaatc
aaatatatctcaattaatttagcaagatcacaatacaaccaaaacaaatatgcacaagca
ctcgaaaccctcaaaccttacataaacgataatgattgcaaaactaaaaactcactttca
aatagtttattatgggaattatttagtttaatttattgtaaattggataaaactgattta
tcaattgattcaattaaaaaagcaattacattattaccaaagcaatctcaaacatcacaa
caaacattcaataatttaagaaagcaaaatcttttattaattttagcaaaagttcaattt
agttcaaaagataatagtaaacaatttgatacaattatcaaaactttagaagcaatcatt
acaatcgatagtaaattttataaagcatggtacttcatggcatccgtttatgtttcattc
aagaaatatgatatggctatcaagaccctaaagagattacaagacacagtcaaagattta
gaaatcgaaagctatttacttttatctcaaatccatgttttaaataataacgatattgaa
aatgccaaaagagaattagagaaggctgttcatttattcccaaatgatgaacaaggttgg
accgctttagctgaattagaattacaattccatcaaaaagaagatccacttaacttacca
ttgaaactattaggtcactcattaaacaaaaaaacatcaaactatgaatactctggtatg
ggtcaactttcaattggtccaaatcataaagtcgaattaggtccatcagttcacgattta
gagattttagccaaagcccatcttttcgaacaacagtcaccatataacaaatcattagat
agcgccatttctattatgaaacgtatcatccattcaaatccatcactatcagaaccatgg
ttaaatttattaaatttaatttactggcgttccatctacaccgtagcctcatccaatgat
aacaacaataccgatgaaattaatgaaaattgggaaaatgtcaaagcatgttggaatact
gtacaatataaatgtaaatctgaaattaatggtgactctcaattaaaattccaacaagat
atcatcgaattagaatttttaatcgtattaaacccacaattattcaaagaaaaattagaa
tcccaattaaaagagtttaaagcagatccattaaagcaatcagtacttttatcattacag
gccaaattccatctcagaaacaatgaaaaagatcaagcattaacaattttaaagaactct
ttaaaaattgaaccaaactcaattgaaacctaccaccaaatctcggatatttatgaatca
aatgactctttagaactatcactattatgtttaaatagatcacttttaattttaaaaaat
aacttgttgaacagtagtaataataacaataataataataataataataatataggttta
tattcaacaacattatgtaaaattattagaattttaattattcaaaagaaatttaaagaa
gcaaataaactattagatcaacaaatggcaaacgaacaaccaaatatttcagataataca
atcattaaactattaaaagcaattctcattgtatctggaagtaaattaacaaatagtaat
atgaaacaatacaacaatgatatgaaaaatgcattcaccctcctagaagaaaccatcgtt
agtaattccaaactttcattaacaaatttctatttagccgttgtagaatttaatcttaaa
aattttgtaaactctgaaaaattattacaaaaagaattaaatatctcaccctcaacttta
attcaaattaattctcttcaagataaaattaaacaatttacaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
