Dictyostelium purpureum (cellular slime mold): DICPUDRAFT_96890
Help
Entry
DICPUDRAFT_96890 CDS
T02090
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K18443
golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1
Organism
dpp
Dictyostelium purpureum (cellular slime mold)
Pathway
dpp04144
Endocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpp00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04144 Endocytosis
DICPUDRAFT_96890
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
dpp04131
]
DICPUDRAFT_96890
Membrane trafficking [BR:
dpp04131
]
Endosome - Golgi transport
Arf GTPases and associated proteins
Arf GTPase associated proteins
DICPUDRAFT_96890
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sec7
Sec7-like_HUS
TPR_28
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10507166
NCBI-ProteinID:
XP_003284970
JGI:
Dicpu1_96890
UniProt:
F0ZC34
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1664 aa
AA seq
DB search
MIDPINIIQGEVYGLISNLKLNSRWSYNNSSYHDTIFPENPILRSLKNLTNILHNITDFK
LLDTCVYLEPFLSVIKSNQTSGFITGAALTSVNKFLTLFINEESNNIHKGIRDIAEAAAH
CKFEATDARSDEIVLMKILQVLISCVKNPAGIFISNELIYEVTVTCYHMSDQSRSSELLK
KMAENAIQEIISTIFTRYNVFTSPPPPPPPPPPSDSNNSNMEEQEDQNSTVINNFDEDLA
SVEPPPIPQDEPDSANTTVDFSPNNDLFFSNLPVAEDSSNNNNEQQPSNQPPPLPTPAQA
SQPKVQAPPSPTPVHVDTSANNSNSHKHHQKANSLNTVTSPTLSNNTQQPSQQQPTFTIN
PRGVRFDSSNATEKPYDETVLIKLFKFFTNNIASPNTQDDMSKLLCLNLINTIVQIRGEL
LESIPEILTIIQQELFRFLLLNLQQKSVQIYSLSMRIFFNLFISLKRTLKSQFEAFFNVL
MVSIQENNKNHYELQELALEGLRDFCKLPHTMVDLFVNYDCELHCSNVFENLCKFLYKNS
FPISQSITSLHLLSFENLLSIVQSIEDRRNRTLNDNGANNNNKIDYLKKKEIKKQLIVAA
EHFNRSPKDALEYLKNNNLYSPITEPLNIAKFLLEVPKLNKTQVGEYLGKRGPFNERVRH
EYISSFNLKNPNCMQIFREFLESFKIPGDSAVVMIIFEQFAQLIYENRTDNLFTSADNVY
LYIYSGLMLHTSIFNPSIPTKDRMNFQSFKQMLYKDLPLELIQECFDDIFKSELILEEEP
VPGVINNGNWRNILKRSKRIGDYIPANTNDYDREIFSIVLNLVIPAISKVFEKIENESLC
QRILDGFQLCAQVSANYNIIEVIDNLMTSLCNNTNLIDTEQVLATTGSSNSSGAGSGSGS
INASSGASSSSVSSSSYDYYNTSGGNNSSSYNGNGAFIGDNKAQLATIATFEIAIKYSSL
LGESWRFIIAIICKLNKMDLLDNIFETIDFPIENKNNNKKEQEPQKSKNTSSNFLSFKWF
ITEEDEEVVIDPYREKAKTCIDNCHITDLFQETKSLPMHSLDHLLQSLFIITNPSKSQQQ
PQSSSLSLQPSSSSASSLNNSSNSITPSNNSAPNSNLNTPPQNHNSNNTTPTTINNTNSP
SIIPTNNIANTTTATTTNIIPITTHYYSINQKQELFCFDLLSHIILLNQERLGLVWKKYF
EHCELIINIFEQVVSVNSANSRLMIPLIEKIVVSIMYLIIRLLDKKEVLDTLQPFVKVLI
RIGPVLDNIAEKMSISLIQLVKNNIKFISKTPEAWEPIIALVMLLSGNPKSSSRACEALT
IMINQDYLTPQFCKYCLEPITCFLSSKTIPPSVVVKSMELLYFIFNSINKSVVSDIQKIN
SLTNGVEAFKVKAQLRKVDDKIKENWGVFWSPILKKFAALCLDSKNDIRNNAMTYLQKTI
LSPTLEEYLPPQRWIEFFVDIFFPLLDSLKENSKETNFEDTRLRASALLSKVFLQNLNTI
IKSDQFTLLWTYILSFLKVYMGLSELLSESVPESLKNMLLVMNNSGVFKPPVKDDTSSSA
QISEHLWNTTWSTIKEFCPKISDDVLSRVDPNHLKQAPPQPLQQNNSDNDNNNNSNTNID
NNSNENTNIDNNSNTNINNTPINTNVDNNINSNNINSNLDNNIN
NT seq
4995 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagatccaattaatataattcaaggtgaagtttatggattaatatcaaatttaaaa
ttaaattcaagatggtcatataacaactctagttatcacgatactatttttccagagaat
ccaatacttagatctttaaaaaatttaacaaatattttacataatataacagactttaaa
ttattagatacatgtgtttatttagaaccatttttatcagtaatcaaatcgaatcaaaca
agcggatttataacaggagctgctttaactagtgttaacaaatttttaacattgtttatt
aatgaagaatcaaataatattcataagggtattagagacattgccgaagcagcagcacac
tgtaaatttgaagcaacagatgcaagaagtgacgaaattgtattgatgaaaatcttgcaa
gtcttaatatcatgtgttaaaaaccccgctggtattttcattagcaatgaattaatttat
gaagtcactgtaacatgctatcatatgtctgatcaatctcgttcatctgaactcttaaag
aaaatggcagagaatgcaattcaagaaataatttcaactatttttacaagatataatgtt
tttacatcaccacctccaccacctccaccacctccaccatctgacagtaataatagtaat
atggaagagcaagaggatcaaaattcaacagtcattaataactttgatgaagatcttgct
agtgttgaaccaccaccaatcccacaagatgaaccagatagcgcaaacacaactgttgat
ttttcaccaaataatgacttgtttttcagtaatttaccagttgccgaggatagtagtaat
aataacaatgaacaacagccatcaaatcaaccaccaccattaccaacaccagctcaagca
tcacaaccaaaagtacaagcaccaccatcaccaacaccagtacatgtagatacttcagcc
aataatagcaatagtcataaacatcaccaaaaagcaaatagcttaaatacagttacatca
cccaccttatcaaataatactcaacaaccatctcaacaacaaccaacatttacaattaac
ccaagaggtgttagatttgattcatcaaatgctacagaaaagccctacgacgaaacagtt
ttaattaaattatttaagtttttcacaaataatatagcatcgccaaatactcaagatgat
atgtccaagttattatgtttgaacctcatcaatactattgttcaaatccgtggtgaacta
ttagaatcaattccagagatattaacaataattcaacaagagttatttagattcttacta
ttaaaccttcaacaaaagagcgttcaaatctactcactgtcaatgagaatatttttcaat
ttattcatctcattaaaaagaacattaaagtctcagtttgaagctttctttaatgtatta
atggtctctattcaagaaaataataagaatcattacgaactccaagaattagctttagag
ggattaagagatttttgcaagttaccacatacaatggtcgatttattcgtcaactatgac
tgtgaattacattgctccaatgtatttgagaacctttgtaaattcctttataaaaactct
ttcccaatctcccaatccattacatcactacatttattatcatttgaaaatttattatca
attgtccaatccatcgaagatcgtagaaatagaactttaaatgataatggtgcaaataat
aataataaaattgattatttaaagaaaaaagaaattaaaaagcaattaatagtcgcagca
gagcacttcaatcgtagtccaaaagatgccttggaatatttaaagaataataatttatac
tcaccaataactgagccattaaatattgcaaagtttttattagaagtaccaaaattaaat
aaaactcaagttggtgaatatttgggtaagagaggaccatttaatgaaagggttagacat
gaatatattagctcatttaatttaaagaatccaaattgtatgcaaatttttagagagttt
ttagaaagctttaagattccaggggattcagcagtggttatgatcatttttgaacaattt
gcgcaactaatttacgaaaatagaaccgacaacttatttacatctgccgataatgtttat
ttatatatttattctggtttaatgttgcacacctcaatttttaatccatccattccaaca
aaagatagaatgaactttcaatcatttaagcaaatgctttacaaagatcttccattagaa
ttaatccaagagtgttttgacgatattttcaagagtgaattaatccttgaggaagaacct
gtaccaggtgtaattaacaatggaaactggagaaatatactcaagcgttcaaagagaatc
ggtgattacattcccgccaacaccaatgactatgatagagaaatcttttcaattgtatta
aatttagttattcctgctataagtaaggtattcgaaaaaattgaaaacgaatcgttatgt
caacgtattttggatggtttccaattatgtgcccaagtcagtgccaattataatattatt
gaagttattgacaatttaatgacatcattatgtaacaacaccaatttaatagataccgag
caagtattagcaacaactggttcatcaaatagctctggtgcaggttcaggtagtggaagt
atcaatgcatcatctggtgcttcatcatcatcagtgtcctcttcatcatatgattattat
aataccagtggaggtaacaatagcagtagttataatggtaatggggcatttattggtgac
aacaaagcccaattagccaccattgcaacatttgaaattgctattaaatactcaagttta
cttggtgaatcttggagatttattattgctatcatttgtaaattaaacaaaatggattta
ctcgataacatttttgaaactatcgacttcccaatcgaaaacaaaaacaataacaagaaa
gagcaagaaccacaaaaatcaaaaaatacaagttcaaactttttatcattcaaatggttt
attaccgaagaagatgaggaagtcgtaattgatccatacagagaaaaggccaaaacatgc
atcgataactgtcacattacagatctcttccaagaaactaaatcattaccaatgcactca
ttagatcatttattacagtcattatttataataacaaacccatcaaaatctcaacaacaa
ccccaatcaagctcattatcattacaaccaagttcatcatcagcatcctcattaaataat
agctcaaatagtattacaccatcaaataacagtgcaccaaatagtaatttaaatacccca
ccacaaaatcataatagtaacaatactacaccaacaacaataaataatactaattcacca
tcaataataccaacaaataatatagcgaatacaaccacagcaacaaccacaaatattata
ccaattacaacccattattattcaattaatcaaaaacaagagttattttgttttgattta
ttatcacatattatattattaaatcaagaaagattaggtttggtttggaagaaatatttt
gaacattgtgagttaatcataaatatttttgagcaagtagtttcagttaattcagcaaac
tcacgtttaatgattccattaattgaaaagatcgtagtttcaattatgtatttaataatt
cgtttattagacaagaaggaagtattggatactctccaaccatttgtcaaggttctaatt
agaattggccctgtattagacaacattgccgaaaagatgtcaatatcattaattcaatta
gttaaaaacaatatcaagtttatttcaaagacaccagaagcatgggaaccaattattgct
ttagttatgctcttaagtggtaatccaaaatcatcaagtcgtgcttgtgaagccttaact
ataatgattaatcaagactatctcactccacaattttgtaaatattgcttagaaccaata
acctgtttccttagttcaaagaccattccaccttcagttgtagtaaaatcaatggaatta
ttatactttattttcaatagtatcaacaaatctgtagtctctgatattcaaaagattaat
agtttaaccaatggtgtcgaagcatttaaagttaaggctcaattaagaaaagtggatgat
aagattaaagagaattggggcgtattctggtcaccaatattaaagaagtttgcagctctt
tgtttagattcaaaaaatgatatcagaaacaatgcaatgacatatcttcaaaaaaccatt
ctttcaccaactcttgaagagtatttaccaccacaacgttggatagaattctttgtcgat
atatttttcccacttttagatagtcttaaagaaaactcaaaagaaaccaactttgaagat
actcgtttacgtgcatcagcccttttatcaaaagttttccttcaaaatttaaatacaatt
ataaagagcgatcaatttacacttttatggacctatatcttatcattcttaaaagtttat
atgggtttgtctgaattactttcagaatctgtaccagaatcactaaagaatatgctttta
gttatgaataactctggtgtatttaaaccacctgtaaaagatgataccagtagctctgct
caaatatccgaacatctttggaatacaacttggtcaacaattaaagaattttgcccaaaa
attagtgatgatgttttatcaagagtagatccaaatcatttaaaacaagcaccacctcaa
ccattacaacaaaataatagtgataatgataacaataataatagcaataccaatatagat
aataatagtaatgaaaacacaaatatagataataatagtaataccaatataaacaatact
cctataaataccaatgtagataataatataaatagtaataatataaatagtaatttagat
aataatataaactaa
DBGET
integrated database retrieval system