Desulfotalea psychrophila: DP2104
Help
Entry
DP2104 CDS
T00192
Name
(GenBank) hypothetical outer membrane protein
Organism
dps
Desulfotalea psychrophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_13
DUF5122
Big_5
AbrB_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAG36833
UniProt:
Q6ALE2
LinkDB
All DBs
Position
2397652..2405709
Genome browser
AA seq
2685 aa
AA seq
DB search
MKNLLLIEVLAGGEVVEHPLTISASFGAQAGAIYSVLDQDHRIPDNLIIKRSGDNLDIEI
DEEPVAQIEDFYGQELGARYSVDGSLAPAEGMAITDTTTAGPTDEIVWQASEGAESISPW
VWAGGLLGAGGIAVAAGGGSSDSSSSVDKGSDSHDVTVRGVAGPFLATSHAIVEVYDGQG
NLLGGGKFETSGQVKLTIGDYKGAILVKVIDNNEGAGDYLDEASGLSLSLGAPLRAMGYS
DGNGDVYISVTPLTELAARQAGITGNEVNEADLAANDQIAELFAVEDILAPVVTVVEDGY
DSSDEINETAEHYGEILAQLSGADSTTTGMAKTLDQLENAITELGDGKLALSQEGVELLA
DGVDAFTNGVNGNRADLGNSLIQPPLIEAANDGINAADKDAGILVKISGVKADDGVSLQW
GEQTQDFIIAGIDIDDEGMASITLPASIVEAAGDGSTVVRYQINAGDMSPAVIIEVDTMA
PDAPTLAELITTDLDDTLMNAAESLSTDFQATLPTTGSLAVAGDSIELLLDGSSFATAKT
VILSADDITNGSVNFTVTNADLGSDGAKALTTQLTDMAGNVGIISNAMDFTLDTTLPAAP
TLAELTSTDLGDTLMNAAESLSTDFQATLPTTGSLAVAGDSIELLLDGSSFATAKTVILS
ADDITNGSVNFTVTNADLGSDGAKALTTQLTDMAGNVGIISNAMDFTLDTTLPAAPTLAE
LTSTDLGDTLMNAAESLSTDFQATLPTTGSLAVAGDSIELLLDGSSFATAKTVILSADDI
TNGSVNFTVTNADLGSDGAKALTTQLTDMAGNVGIISNAMDFTLDTTLPAAPTLAELTST
DLGDTLMNAAESLSTDFQATLPTTGSLAVAGDSIELLLDGSSFATAKTVILSADDITNGS
VNFTVTNADLGSDGAKALTTQLTDMAGNVGIISNAMDFTLDTTLPAAPTLAELTSTDLGD
TLMNAAESLSTDFQATLPTTGSLAVAGDSIELLLDGSSFATAKTVILSADDITNGSVNFT
VTNADLGSDGAKALTTQLTDMAGNVGIISNAMDFTLDTTLPAAPTLAELTSTDLGDTLMN
AAESLSTDFQATLPTTGSLAVAGDSIELLLDGSSFATAKTVILSADDITNGSVNFTVTDA
DLGSDGAKALTTQLTDIAGNVGIISNAMDFTLDTTLAAAPTLAELTSTDLDDALMNAAES
LSTDFRATLPTTGSLAVEGDSIELLLDGSSFATAKTVILSADDITNGFVNFTVTNADLGS
DGAKALTTQLTDMAGNLGIISNAMDFTLDTTLPAAPTLAELTSTDLDDTLINAAESLSTD
FRATLPTTGSLAVAGDSIELLLDGSSFATAKTVILSADDITNGFVNFTVTDADLGSDGAK
ALTTQLTDMAGNLGIISNAMDFTLDTTLPAAPTLAELTSTDLGDTLMNAAESLSTDFRAT
LPTTGSLAVEGDSIELLLDGSSFATAKTVILSADDITNGFVNFTVTDADLGSDGAKALTT
QLTDIAGNVGIISNAMDFTLDTTLAAAPTLAELTSTDLDDALMNAAESLSTDFRATLPTT
GSLAVEGDSIELLLDGSSFATAKTVILSADDITNGFVNFTVTNADLGSDGAKALTTQLTD
MAGNLGIISNAMDFTLDTTLPAAPTLAELTSTDLDDTLINAAESLSTDFRATLPTTGSLA
VAGDSIELLLDGSSFATAKTVILSADDITNGSVNFTVTDADLGSDGAKALTTQLADVAGN
VGITSNAVDFTLDMTVAPPNFALATDSGSSNSDGITKNGMVNVTLAGDVASWEYSLDAGS
SWNNGSGSSFALTDNTDYPAGAIQVRQADRAGNLSSTASNPGTIKVDTISLTTGSIFGLD
TSFGGGDGRTFIDGGSRADEGNHATINEVADEKYVISGQNQTKANFFVARVNVDGSTDSS
FGGGDGVATAKVTTDVKQYQYIYGESVVDAKGNIYIPGVISGGTYYNDAVVAKISADGSL
DSSFGGDGFVLNNFGRTDKAETACAVAVQTDGKVIMGGRVQNERTLDSAIARYNPDGSLD
TDFGSGGNAIFDLAPGKHDSVQDIEIQADGKLMFTGSLDDNTYLLRLNSDGSRDASFGGG
DGFISADIHSGLYDSILDTAIDGVGNIYVLTNGSRALNVARFNAKGELDIGWAGDGIATL
STDGYASNRGGGIAFDSSGKIIISSGFNSSTTGGLDSVIMRLDRDGNLDASFADNGVFAA
DLSGNGGADEAYDVIVDANDNIVIGGYVNTGGETGKDFMIARLTDSMDTSIADGAKGVAA
NLGLTMTFTESIGLGSGNIKLVDDTDASNTITIDVGNHAGQLAISDGKLMITPSSPMDSL
SKYHLEIEDGAVTDLAGNGYAGISDPATLNFTTATGSLAPVAIDLTNDGLSFIGLGQSTI
FYDYTADDIGDRTAWVGADDGLLIIDLLGDSSVTDRSEFVFTDHAPDAGTDMEALQQVFD
TNQDNYLNHADEQWSKFAIWQDLNSNGVSETGEVRTLDEWGIERISLINDGESYLAADGV
YVHGHSEVVMSDGTTTTAADSEFSFDISTQTDSSDIPLLEVNSALPVDTTFVAFDLIEDV
SSDSSGRSFKSEAGYDIDIKGASGAEQLNTDGEELGATVLWDEANLLSGNDSVILVGTGA
VVHKSDGGLASICSLAGTVLSAIGSDSQIYPIAMPMNIFTSQGLA
NT seq
8058 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatttattattgatcgaagtattggctggcggagaagttgttgaacatcctctg
acaatatcggcgtcctttggcgcccaggcgggggcgatttactctgtcctcgaccaggac
catcgcatcccggacaatctcatcataaaacgaagcggcgataatcttgacattgaaatc
gatgaagagcctgttgcccaaattgaagatttctacggtcaggagcttggggctagatac
agtgtcgatggatccctggcccccgctgaggggatggccatcactgacaccacaacggct
ggcccaacggatgaaatcgtctggcaggcctccgagggggcagagtcaatcagcccgtgg
gtttgggccggtggcctgttgggtgccggcggtatcgccgtcgcagcaggcggaggcagt
tcagatagtagcagctcagtagataagggtagtgatagccacgacgtcaccgtcaggggt
gttgccggtccatttctggccacttcccatgcgatcgttgaagtttacgatggccagggc
aatctgctcggcggtggtaaatttgagaccagcggccaggttaaactcaccattggcgac
tataagggggcaattcttgtcaaggtaatcgacaacaatgagggtgcaggggattacctt
gatgaggccagcggcctttctctcagcctcggtgcgcccctgcgcgccatgggctattcc
gatggaaacggtgatgtctatatcagcgtcacccctctgaccgagcttgccgcccgccag
gccggcatcaccggcaatgaggtcaacgaagccgatcttgccgccaacgaccagatcgca
gaactctttgccgttgaagatatcctggcccccgttgtcaccgttgtcgaagacggctac
gacagcagcgacgagatcaatgagacggcagaacactatggtgagatcctcgcccagctg
tccggtgccgatagtaccaccaccggaatggccaagacccttgaccaactggaaaacgcc
atcaccgagctgggggatggaaaattagccttaagtcaagagggggttgagctactcgct
gacggtgttgatgcctttacaaacggagttaatggcaatcgggctgacctcgggaacagc
ctcattcaacctcccctgatcgaggcggccaatgacggtattaatgctgccgacaaggat
gccggcatccttgtaaaaatatctggggtaaaagctgatgacggggtcagcctccaatgg
ggagagcaaacgcaagactttatcattgcaggcatagatatcgatgacgagggaatggcc
tccatcaccctgcccgccagtattgttgaggccgcaggtgatggctcaactgtcgttcgc
tatcagatcaacgccggtgatatgagtccggccgttataattgaggtcgacaccatggca
ccagatgcaccgaccttagccgaactcattacaaccgatctggacgacactctcatgaat
gctgctgagtcgctatcaacagacttccaagcaacactaccaacaacaggttcacttgca
gtggcaggtgacagcatcgagttgcttcttgatggcagctcatttgcaacagcaaagacg
gtgatactttctgctgatgacatcactaacggctctgtgaatttcactgttactaacgct
gatctcggtagcgacggtgccaaggcattgactacacagttaaccgatatggctggcaat
gtgggcattatcagcaatgcgatggacttcacccttgataccaccctaccagctgcaccg
accttagccgaactcactagcaccgatttgggcgacactctcatgaatgctgctgagtct
ctatcaacagacttccaagcaacactaccaacaacaggttcacttgcagtggcaggtgac
agcatcgagttgcttcttgatggcagctcatttgcaacagcaaagacggtgatactttct
gcagacgacatcactaacggctctgtgaatttcactgttactaacgctgatctcggtagc
gacggtgccaaggcattgactacacagttaaccgatatggctggcaatgtgggcattatc
agcaatgcgatggacttcacccttgataccaccctaccagctgcaccgaccttagccgaa
ctcactagcaccgatttgggcgacactctcatgaatgctgctgagtctctatcaacagac
ttccaagcaacactaccaacaacaggttcacttgcagtggcaggtgacagcatcgagttg
cttcttgatggcagctcatttgcaacagcaaagacggtgatactttctgcagacgacatc
actaacggctctgtgaatttcactgttactaacgctgatctcggtagcgacggtgccaag
gcattgactacacagttaaccgatatggctggcaatgtgggcattatcagcaatgcgatg
gacttcacccttgataccaccctaccagctgcaccgaccttagccgaactcactagcacc
gatctgggcgacactctcatgaatgctgctgagtcgctatcaacagacttccaagcaaca
ctaccaacaacaggttcacttgcagtggcaggtgacagcatcgagttgcttcttgatggc
agctcatttgcaacagcaaagacggtgatactttctgcagacgacatcactaacggctct
gtgaatttcactgttactaacgctgatctcggtagcgacggtgccaaggcattgactaca
cagttaaccgatatggctggcaatgtgggcattatcagcaatgcgatggacttcaccctt
gataccaccctaccagctgcaccgaccttagccgaactcactagcaccgatctgggcgac
actctcatgaatgctgctgagtcgctatcaacagacttccaagcaacactaccaacaaca
ggttcacttgcagtggcaggtgacagcatcgagttgcttcttgatggcagctcatttgca
acagcaaagacggtgatactttctgctgatgacatcactaacggctctgtgaatttcact
gttactaacgctgatctcggtagcgacggtgccaaggcattgactacacagttaaccgat
atggctggcaatgtgggcattatcagcaatgcgatggacttcacccttgataccacccta
ccagctgcaccgaccttagccgaactcactagcaccgatttgggcgacactctcatgaat
gctgctgagtcgctatcaacagacttccaagcaacactaccaacaacaggttcacttgca
gtggcaggtgacagcatcgagttgcttcttgatggcagctcatttgcaacagcaaaaacg
gtgatactttctgctgatgacatcactaacggctctgtgaatttcactgttactgacgct
gatctcggtagcgacggtgccaaggcattgactacacagttaaccgatattgctggcaat
gtgggcattatcagcaatgcgatggacttcacccttgataccaccctggcagctgcaccg
accttagccgaactcactagcaccgatctggacgacgctctcatgaatgctgctgagtct
ctatcaacagactttcgagcaacactgccaacaacaggttcacttgcggtagaaggtgac
agcatcgagttgcttcttgatggtagctcatttgcaacagcaaagacggtgatactttct
gctgatgacattactaacggctttgtgaatttcactgttactaacgctgatctcggtagc
gacggtgccaaggcattgactacacagttaaccgatatggctggcaatctgggcattatc
agcaatgcgatggacttcacccttgataccaccctaccagctgcaccgaccttagccgag
ctcactagcaccgatctggacgacactctcattaatgctgctgagtctctatcaacagac
tttcgagcaacactgccaacaacaggttcacttgcagtggcaggtgacagcatcgagttg
cttcttgatggcagttcatttgcaacagcaaagacggtgatactttctgctgatgacatt
actaacggctttgtgaatttcactgttactgacgctgatctcggtagcgacggtgccaag
gcattgactacacagttaaccgatatggctggcaatctgggcattatcagcaatgcgatg
gacttcacccttgataccaccctaccagctgcaccgaccttagccgaactcactagcacc
gatttgggcgacactctcatgaatgctgctgagtctctatcaacagactttcgagcaaca
ctaccaacaacaggttcacttgcggtagaaggtgacagcatcgagttgcttcttgatggt
agctcatttgcaacagcaaagacggtgatactttctgctgatgacattactaacggcttt
gtgaatttcactgttactgacgctgatctcggtagcgacggtgccaaggcattgactaca
cagttaaccgatattgctggcaatgtgggcattatcagcaatgcgatggacttcaccctt
gataccaccctggcagctgcaccgaccttagccgaactcactagcaccgatctggacgac
gctctcatgaatgctgctgagtctctatcaacagactttcgagcaacactgccaacaaca
ggttcacttgcggtagaaggtgacagcatcgagttgcttcttgatggtagctcatttgca
acagcaaagacggtgatactttctgctgatgacattactaacggctttgtgaatttcact
gttactaacgctgatctcggtagcgacggtgccaaggcattgactacacagttaaccgat
atggctggcaatctgggcattatcagcaatgcgatggacttcacccttgataccacccta
ccagctgcaccgaccttagccgagctcactagcaccgatctggacgacactctcattaat
gctgctgagtctctatcaacagactttcgagcaacactaccaacaacaggttcacttgca
gtggcaggtgacagcatcgagttgcttcttgatggcagttcatttgcaacagcaaagacg
gtgatactttctgcagacgacattactaacggctctgtgaatttcactgttactgacgct
gatctcggtagcgacggtgccaaggcattgactacacagttggctgatgtggctggtaat
gtgggcattaccagcaatgcggtcgattttactcttgatatgacagtcgcgcccccaaac
tttgccttggcaacggacagcggtagcagtaacagcgatgggatcacaaagaatggcatg
gttaatgtcactctggcaggcgacgttgccagctgggagtacagccttgacgctggcagc
agttggaataatggttcgggtagcagtttcgccctgaccgataatacagactaccctgct
ggtgcgattcaggtgcgccaggccgacagggctggaaacctcagtagcaccgccagcaat
cccggcaccattaaggtcgacactattagccttacaacgggaagtattttcggtctggat
acaagctttggcggcggcgatggtcgtacctttatcgatggagggagcagggctgacgaa
ggaaatcatgcgacaatcaacgaggtcgctgatgaaaaatacgtcatcagcgggcaaaac
cagacaaaggccaatttttttgtcgcccgggtcaatgtcgatggtagcacagatagcagc
tttgggggtggggacggggtggcgaccgccaaagtgactacagatgtaaaacaataccaa
tacatctatggcgaatcggtcgttgacgccaagggcaatatttatatccctggcgtgatt
tctggtgggacatattataatgatgccgttgttgctaaaattagcgcagatggaagcctc
gatagcagctttggtggagacggctttgtcttaaataattttggcaggaccgacaaggcg
gagactgcctgtgctgtagcggttcagacagacggcaaagtgatcatgggcggtcgtgta
cagaatgaacgtacactggatagcgcaatcgcccgttacaatcccgacggcagcctcgat
accgacttcggtagcggcgggaacgctatctttgaccttgcacctgggaagcatgactct
gttcaggatatcgagatccaggccgatggaaaactcatgttcaccggcagtcttgatgac
aacacatatctcctgcgtctcaactccgatggtagtcgcgacgccagcttcggaggtggt
gatggttttatctctgcggatatacattcaggcttatacgactctatccttgataccgcc
atcgatggggtaggaaacatctatgtcttaacaaacggttcacgtgccctcaacgtggct
cgattcaacgctaagggagaactggacataggctgggccggggatggtatcgctaccctt
agcaccgatggttacgcgagcaaccgcggtggcgggattgcctttgattccagcgggaaa
atcataatttcttctggctttaactcttcaaccacaggcggattagacagcgtcattatg
cgcctagacagagatggcaatctcgatgccagctttgctgacaatggcgtcttcgcagct
gatctttcaggaaatggcggcgcggatgaagcgtacgatgtcatcgtcgatgccaatgac
aatattgtaatcggtggttacgttaatactggcggggaaacaggtaaagatttcatgatc
gctcgtctgactgactctatggacaccagtattgctgatggggcaaagggtgtggccgcc
aatcttggcctcaccatgacctttacggaaagtattggcctgggaagcggtaatatcaag
ctggtggacgatacggacgccagcaacacgatcactatcgatgtcggcaatcatgccggt
cagttggctattagcgacggtaaattgatgattaccccctcatccccaatggatagcctc
agcaagtaccatctggagatcgaggatggggcagtgactgacctggcaggaaatggctac
gcaggtatttctgatcctgccacattaaattttacgacggcgacaggatcactggctcct
gttgcaattgatctcaccaatgacggtcttagcttcattggtttaggtcagagcacgatt
ttttatgattacacggcagatgatatcggtgatcgaacagcatgggttggtgccgatgat
ggtctgctgatcattgatctattgggtgatagcagcgtgacggatcgttctgaatttgtc
tttactgatcacgcacccgatgcagggaccgatatggaggctcttcaacaggtttttgat
accaatcaagacaactatcttaatcatgctgacgagcagtggagtaaatttgcgatctgg
caggacctcaacagcaatggggtgagcgaaacaggtgaagtgcgcactttagatgagtgg
ggcattgaacgtatcagtcttataaatgatggtgaaagttatctggccgctgatggtgtt
tatgtacatggccatagcgaagttgtaatgagtgatggaaccaccaccactgctgccgac
agtgaatttagctttgatatatcaacgcagacagatagcagtgatatcccgttgctagaa
gtgaacagcgccctgccagtggatacaacgttcgtagcattcgacctgatcgaggatgta
tcctctgactcaagcgggcgatcttttaagagcgaagccgggtatgatattgatattaaa
ggcgcgagcggtgcggagcagttgaacacggatggcgaagagctgggagcaacagtcttg
tgggacgaagccaacttattgtctggtaacgatagcgtcatcttggtaggtacgggagcg
gttgttcacaagagtgatggtggactagcctctatatgcagcttagccggtaccgtacta
tctgctatcgggtcagatagccaaatatatcctatagctatgccaatgaatatttttacc
agccaggggctcgcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system