Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite): 113789085
Help
Entry
113789085 CDS
T05775
Name
(RefSeq) pre-mRNA-processing-splicing factor 8
KO
K12856
pre-mRNA-processing factor 8
Organism
dpte
Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite)
Pathway
dpte03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpte00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
113789085
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
dpte03041
]
113789085
Spliceosome [BR:
dpte03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U5 snRNP specific factors
113789085
Complex C
U5 SnRNP specific factors
113789085
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PROCN
PRP8_domainIV
U6-snRNA_bdg
PRO8NT
U5_2-snRNA_bdg
PROCT
RRM_4
JAB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113789085
NCBI-ProteinID:
XP_027194373
UniProt:
A0A6P6XNM8
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2393 aa
AA seq
DB search
MSGHQHHYPPPPMPGYFIPHHMPPHPMQQQQQPPLMPQMQQPPPQMIPQMQQQPPPPISQ
QIDLANLPLPPSNEYNRNSFLTDDELKEKSRKWQQLQTKRYAERKKFGFVEQQKEDMPPE
HLRKIIRDHGDMTSKKYRHDKRVYLGALKYIPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVQVLYHITG
AITFVNEIPWVVEPIYIAQWGSMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNLLD
VEPLEAIQMDLDPEEDRHVYEWFYDHKPLVDTKHVNGSSYRRWNLTLPQLATLYRLANQL
LTDLVDDNYFYLFDSTSFFTAKALNMAIPGGPKFEPLVKDINPADEDWNEFNDINKIIIR
HPIRTEYRIAFPYLYNNLPNEHVYISWYHTPNVVFIKTEDPDLPAYYFDPLINPISHSRI
DRSYEPLPEEDKDEPFMLPETVEPILSKCPLYTDNTANGISLLWAPRPYNLRSGRSRRAI
DVPLVQSWYREHCPPGMPVKVRVSYQKLLKYFVLNALHHRRPKPQKKRYLFRSFKSTKFF
QTTTIDWVEAGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGN
AFHLCREILRLTKLVVDSHVQYRLNNVDAYQLADGLQYIFSHVGQLTGMYRYKYKLMRQI
RMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAPSWRVWLFFMRGITPLLERWLGNLLSRQFEG
RHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRASVMHDIVDMMPEGIKHNKARTILQHLSEAWRCWKA
NIPWKVPGLPMPIENMILRYVKMKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRL
YLKAEQERQHNYLKDGPYVSAEEAVAIYTTTVHWLESRRFSPIPFPPLSYKHDTKLLILA
LERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFREVSIEFMDLY
SHLVPVYDVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRHLFPAWIKPADSEPPPLLVYKWCQGINNL
QDVWDTTHGECNVMLETKFEKMYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDM
NHTNSYGIIRGLQFSSFIVQYYGLVLDLLVLGLQRASEMAGPPQMPNDFLTYQDVATEIS
HPIRLYSRYIDRIHVFFRFTADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRL
MKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTIQWDNSFVSVFSKDNPNLLFNMGGFECRILPKCRM
ALEEFVHKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNK
WNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKEL
GGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHDEDQVIPNLYRYIQPWETEFIDS
QRVWAEYALKRQEALAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTDF
KQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEGLF
WEKASGFEESMKYKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFM
HGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESVVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKM
NSSCADILLFAAYKWNVSRPSLLADSKDVMDGTTTQKYWIDVQLRWGDYDSHDIERYARA
KFLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGSKPLIQQAMAKIMKANPALYV
LRERIRKGLQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKP
INGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQII
VTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMILFNLYDD
WLKTISSYTAFSRLILILRALHVNNERTKVILKPDKTTITEPHHIWPSLTDEEWIKVEVQ
LKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIRDIILGMEISAPSAQRQQIAEIEKQTKEQSQLTAV
TTRTVNKHGDEIITSTTSNYESQSFASKTEWRIRAISATNLHLRTKHIYVSSDDIKETGY
TYILPKNVLKKFIIISDLRTQIAGYIYGISPPDNPQVKEIRCIVMPPQWGTHQTIHLPNQ
LPQHELLSELEPLGWIHTQPNELPQLSPQDVTTHAKIMMDNQTWDSEKTIVITCSFTPGS
CSLTAYKLTPSGFEWGRQNTDRGNNPKGYLPSHYEKVQMLLSDRFLGFYMTPAQCSWNYN
FMGVRHDPSMKYELQLSNPKVFYHEIHRPAHFSNFTTIDESDYVGADREDVFA
NT seq
7182 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccggacatcaacatcattatccaccaccaccgatgcccggatattttattccgcat
catatgccaccgcatccaatgcaacaacaacaacaaccaccattgatgccgcaaatgcaa
caaccaccaccacaaatgataccgcaaatgcaacaacaaccaccgccacccatatcgcaa
caaatagatttagctaatttaccattaccaccatcaaatgaatataatcgtaatagtttt
ctgaccgatgatgaattgaaagaaaaatctagaaaatggcaacaattacaaacaaaacgt
tatgccgaaaggaaaaaatttggttttgttgaacaacaaaaagaagatatgccacctgaa
catctaaggaaaattatacgtgatcatggtgatatgacatcgaaaaaatatcgtcatgat
aaacgtgtttatttaggcgcattgaaatatattccacatgcagtattgaagctattggaa
aatatgccaatgccatgggaacagattcgtgatgtacaagttctttatcatataaccgga
gctataacatttgtcaatgaaattccatgggtagttgaaccaatttatattgcacaatgg
ggttcaatgtggattatgatgcgtcgagaaaaacgtgatcgtcgtcattttaaacgtatg
cgttttccaccattcgatgatgaagaaccaccattagattatgctgataatctgttggat
gttgaaccattagaagctatacaaatggatttagatccagaagaagatcgtcatgtttat
gaatggttttatgatcataaaccattagttgatactaaacatgttaatggatcatcatat
cgtcgttggaatctaacattaccacaattagcaacattatatcgtttggctaatcaatta
ttaaccgatctggttgatgataattatttttatctatttgattcaacatcattttttact
gctaaagcattaaatatggctatacctggtggaccaaaatttgaaccattggtcaaggat
ataaatccagccgatgaagattggaatgaatttaatgatattaataaaataataatacgt
catccaattcgtactgaatatcgtattgcatttccatatctttataataatctaccgaat
gaacatgtttatatttcatggtatcatacaccgaatgttgtttttattaaaactgaagat
cctgatctaccggcttattattttgatccacttataaatccaatttcacatagtcgtatt
gatcgttcatatgaaccattacctgaagaagataaagatgaaccatttatgttacccgaa
acagttgaaccaattttatcaaaatgtccattatatacagataatactgcaaatggaata
tcattactatgggcaccacgtccttataatctacgttctggtcgtagtcgtcgtgctatt
gatgttccattagtacaaagttggtatcgtgaacattgtccacccggaatgccggttaaa
gttcgtgtatcatatcaaaaactattgaaatattttgttttaaatgcattacatcatcga
agaccaaaaccgcagaaaaaacgttacctatttcgttcatttaaatcgacaaaatttttt
caaacaacaactattgattgggttgaagctggtctacaagtttgtcgtcaaggttataat
atgctaaatttattgattcatcgaaaaaatctaaattatttacatttggattataatttc
aatttaaaacctgtaaaaacattgacgactaaagaaagaaaaaaatctcgttttggtaat
gcttttcatttatgtcgtgaaattcttcgtctaacaaaattagttgtcgatagtcatgta
caatatcgattgaataatgttgatgcatatcaattggctgatggtttacagtatattttt
tcacatgttggacaattaactggaatgtatcgttataaatataaattaatgagacaaata
cgaatgtgtaaagatttaaaacatttaatatattatcgatttaatactggaccagttggt
aaaggaccgggttgtggtttttgggcaccaagttggcgtgtttggttattttttatgcgt
ggtataacaccattattggaacgttggttaggaaatcttctttcacgtcaatttgaaggt
agacattcaaaaggtgttgcaaaaactgttactaaacaacgtgttgaatcacattttgat
ttggaattacgtgcttcggttatgcatgatattgttgatatgatgcctgaaggtattaaa
cataataaagcacgaactatattgcaacatctgagtgaagcatggcgttgttggaaagca
aatataccgtggaaagttcccggtttaccgatgccaattgaaaatatgattttacgttat
gtaaaaatgaaagctgattggtggacaaacacggcacattataatcgggaacgtattcgt
cgtggtgctactgttgataaaactgtttgtaaaaaaaatcttggacgtttaacacgttta
tatttgaaagctgaacaagaacgacaacataattatctgaaagatggtccatatgttagt
gcagaagaagctgttgcaatttatacaacaacagtacattggctggaaagtcgtcgtttt
tcaccgataccatttccacctctttcatataaacatgatacaaaattattaattttagca
ttagaacgtttaaaagaagcatattcagtaaaatctcgattaaatcaatcacaacgtgaa
gaattaggtttaattgaacaagcatatgataatccacatgaagcattatcacgaattaaa
cgtcacctattaacacaacgtgcatttcgtgaagttagtattgaatttatggatctttat
tcacatttagttcctgtttatgatgttgaaccattggaaaaaattaccgatgcatattta
gatcaatatctttggtatgaagctgataaacgacatttatttccagcatggataaaaccg
gctgattctgaaccaccaccattattagtttataaatggtgtcaaggtattaataatcta
caggatgtttgggatacaacacatggtgaatgtaatgttatgttggaaacaaaatttgaa
aaaatgtatgaaaaaatcgatttaaccttattgaatcgtttgttacgtttgattgttgat
cataatattgctgattatatgacagctaaaaataatgttgttatcaattataaagatatg
aatcatacaaattcatatggtattatacgtggattacaattttcatcatttatcgttcaa
tattatggtcttgtattggatttattagtactcgggttgcaacgtgcaagtgaaatggct
ggtccaccacaaatgccaaatgattttcttacctaccaggatgttgctacggaaatttca
catccaattcgtttatattcaagatatattgatcgaatacatgtattttttcgttttaca
gctgatgaagcaagagatttgattcaacgttacttgactgaacatcctgatccaaataat
gaaaatattgttggttataataataaaaaatgttggccaagagatgcacgaatgcgtctg
atgaaacatgatgttaatcttggtcgtgctgtattttgggatataaaaaatcgtttacca
agatcagtaacaacaatacaatgggataatagttttgtttcagtttttagtaaagataat
ccaaatcttttattcaatatgggtggttttgaatgtcgaatactaccaaaatgtcgtatg
gcattagaagaatttgtacataaagatggtgtatggaatttacagaatgaagtaaccaaa
gaacgtactgcacaatgttttctacgtgttgatgatgaatcaatgcaacgttttcataat
cgtgtacgacaaattctaatggcatctggttcaacaacatttacaaaaattgttaacaaa
tggaatacagcattaattggtttgatgacatattttcgtgaagcagttgttaatacacaa
gaattattagatttattggtaaaatgtgaaaataaaatacaaacccgtattaaaattggt
ttgaattcaaaaatgccaagccgttttccaccggttgtattttatacaccaaaagaatta
ggtggactaggtatgctttcaatgggtcatgtattaataccacaatctgatttacgttgg
tcaaaacaaactgatgttggtataacacattttcgttctggaatgtcacatgatgaagat
caagttataccgaatctttatcgttatatacaaccatgggaaacagaatttattgattca
caacgtgtttgggctgaatatgcattgaaacgtcaagaagcgctagcacaaaatcgtcgt
ttaacattggaagatctggaagatagttgggatcgtggtataccacgtattaatacatta
tttcaaaaagatcgtcatacattagcatatgataaaggatggcgtgtacgtactgatttt
aaacaatatcaagttttaaaacagaatccattttggtggacacatcaacgtcatgatgga
aaactgtggaacctgaataattatcgtaccgatatgatccaggcattaggtggtgttgaa
ggtatccttgaacatacattattcaaaggaacatattttccaacatgggaaggtttgttt
tgggaaaaagccagtggttttgaagaatcaatgaaatataaaaaattaacaaatgcacaa
cgttccggtttaaatcaaataccaaatcgtcgttttacattatggtggtcaccaacaatt
aatcgtgcaaatgtttatgttggtttccaggttcaattagatttaactggaatatttatg
catggaaaaatacctacgctaaaaatttcattaattcaaatatttcgtgcacatttatgg
caaaaaattcatgaaagtgttgttatggatttgtgtcaagtttttgatcaagaattagat
gcattggaaattgaaaccgtacaaaaagaaacaattcatccacgtaaatcatataaaatg
aatagttcttgtgcagatatcctattgtttgctgcatataaatggaatgtatcaagacca
tcattattggctgatagtaaagatgtaatggatggtacaacaacacaaaaatattggatc
gatgtccagttacgttggggtgattatgattcacatgatattgaacgttatgcacgtgcg
aaatttttggattatacaaccgataatatgagtatttatccatcaccaactggtgtattg
attgctatcgatttagcttataatttacattcagcatatggtaattggtttcctggttca
aaaccattaatacaacaagcaatggcaaaaataatgaaagctaatccagcattatatgta
ttgagagaacgtattcgtaaaggtttacaactttattcatctgaaccaactgaaccatat
ttatcatcacaaaattatggtgaattattttccaatcaaatcatatggtttgttgatgat
acaaatgtatatcgtgttacgatacataaaacatttgaaggaaatctaacaacaaaacca
attaatggtgctatttttatattcaatccacgtactggacaattatttttgaaaattatt
catacaagtgtttgggctggacaaaaacgtttaggtcaattggctaaatggaaaacagcc
gaagaagttgctgcactgattcgttcattaccggttgaagaacaaccaaaacaaattatt
gtaacacgtaaaggaatgttggatccattagaggttcatttattagattttccaaatatt
gtaatcaaaggaagtgaattacagctaccatttcaagcttgtttgaaagttgaaaaattt
ggtgatcttattcttaaagcaactgaaccacaaatgattctatttaatctgtatgatgat
tggttgaaaacaatttcatcgtatacagcattttcacgtttgattctcattctacgtgca
ttacatgtaaataatgaacgaactaaagtaatattgaaaccagataaaacaaccataacc
gaaccacatcatatttggccaagtttaacggatgaagaatggattaaagttgaagtacaa
ttaaaagatttaattttagctgattatggtaaaaagaataatgttaatgtagcatcatta
acacaatcagaaattcgtgatattattcttggtatggaaatatcggcaccatcagcacaa
cgacaacagattgctgaaattgaaaaacaaactaaagaacaatcacaattaacagcagta
acaaccagaactgttaataaacatggtgatgaaattattacatcgacaacatcgaattat
gaatcacaatcatttgcaagtaaaactgaatggcgtattcgtgctatttcggctacaaat
cttcatctacgtactaaacatatttatgtttcatccgatgatattaaagaaactggttat
acttatatattaccgaaaaatgtattgaaaaaatttattatcatatcggatcttcgtaca
caaattgccggttatatttatggtatttcaccgccggataatccacaggtaaaagaaatt
cgttgtattgtaatgccaccacaatggggtacacatcaaacaatacatttaccaaatcaa
ttaccacaacatgaattattaagtgaattagaaccacttggttggatacatacacagcca
aatgaattaccacaattatcaccacaagatgtaacaacacatgctaaaataatgatggat
aatcaaacatgggattcggaaaaaactattgtcattacctgttcatttacaccgggttca
tgttcattaacagcttataaattgacaccaagcggatttgaatggggccgtcaaaatact
gatcgtggtaataatccaaaaggttatctaccatcacattatgaaaaagtacagatgctt
ttgtcggatcgttttcttggattttatatgacaccggcacaatgttcatggaattataat
tttatgggtgtacgtcatgatccatcaatgaaatatgaattacaattatcaaatccaaaa
gttttctatcatgaaattcatcgtccagcacatttttcaaattttacaacaatcgatgaa
tcggattatgttggtgcagatcgtgaagatgtttttgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
