Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite): 113790893
Help
Entry
113790893 CDS
T05775
Name
(RefSeq) serine/threonine-protein kinase SMG1-like
KO
K08873
serine/threonine-protein kinase SMG1 [EC:
2.7.11.1
]
Organism
dpte
Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite)
Pathway
dpte03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpte00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
113790893
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01001 Protein kinases [BR:
dpte01001
]
113790893
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
dpte03019
]
113790893
Enzymes [BR:
dpte01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.11 Protein-serine/threonine kinases
2.7.11.1 non-specific serine/threonine protein kinase
113790893
Protein kinases [BR:
dpte01001
]
Serine/threonine kinases: Other
PIKK family [OT]
113790893
Messenger RNA biogenesis [BR:
dpte03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Surveillance factors
Other surveillance factors
113790893
mRNA cycle factors
Common to processing body (P body) and stress granule
113790893
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SMG1
PI3_PI4_kinase
FATC
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113790893
NCBI-ProteinID:
XP_027196397
UniProt:
A0A6P6XSF5
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2469 aa
AA seq
DB search
MSGRRESAAMGSGGGGGSGNYRYNNQFNHQNRGDNRRDRNYHSNSSTTTPIKSYYSNGLI
GDNDRRRNVSNERQQQQQHDADDDTDESEKSNGYNKNGNFSHGKHPYYHHQNNQNNNQSQ
QRMTTIPIQCQNDLQNFLNIIRPFTSLTEKKSWPNTFKDLTIFYRSAKSMRNNIFIERIF
TESLRAFEKIFKEKLYKNTVEEMIDCMAALCDSLETSKSDLFEWIFKIYFQQSTSEENRL
IILRCLSSIMINCQMIAMDNYFFIQLKLKKSLETTNNIEIFLQILELIIVIGQRSPNSLQ
RHIEDLMDILLGWYLDGHQTIMTLYLIENIILSFDFKNHLKFSNMLLRSFIEDVEKYFHE
SMFNLKRTTESSSKANVESINSRLHTMALRIRLFAIFYRKIFMENRKECQKLMLVNTEQN
FQFCIDSMAIIIKVIINLSPYKSLTMFEELLIECNQSIIILMETFSILFDADICFRLLEK
DCHDYCQILFDIMDIQISSKKSIITGLDFIRLFVKNSKNINDEIVDKLFCLKFQSLKFSM
DKNVQQSFISLFFGLLKIKSVEIIDKSYRHILSNIKVSFNFLQKIKQKNENENFVPIIKN
LDLPQQDQPYHSIITNEQKCLIGLYVDLILLTEIANTKHSLIAMLALSPNFLELMLYHIN
LSNEWLADEYSSIHHSLLYLFCSYCQKHHNFLPQSSLFVNQSSSSINNNNNNVLRYSTNS
NALNSIFPLSNIGSILDNHHSQSSLANTAINISSSNNNNSSLRFSPNSHASNYFVDIIKN
LKSILSINKLKMDSIIVCLRLCENIVQYFGTVNKQSTTVIALDEFVELIEIVSEYSFAND
YQICRLSCTIAKNLMPLIDDQSLSLYWQVFYNYRRACEFNLAHTDNNINHLFLDLLSLLP
VCSMTKTRLKIPNQIRSTLCYLPLISNNLDMIKIFQYNYWTAIFWICFEFVQLCIENRLK
TPLGKPQDTFTKIESLIKMFVAEISTNSNVNRLQINATNNNQMTTSKPNTIRIHMLLMIM
DNFDKLIYNAIHGNSLRLYCSSKLSKQFFKKNRATCSEWLNRNRRSIMVLASKVGQLSIV
VHHGQELLRNYQSDRTLFTLDEIEFILLLMIDALIQMKASETIRGYYNWVKQYLAVKFVW
IKAATDEANGRYERALIQYRNLLQDKVIDNGINVGGEQQQQQSSAANLNTLNLISSSKNF
ICNSYTVNFFRKRILNCLLNIENYDNALEWWKSTNCESNKTNINQMATNLFGSANIDYSY
LKSLSTFTTEIHNDNDDDKNCRMTNDIVTSIDQLQQQQQRSMFFDIESSYHQIQSKLFQF
ANEFYQSYNDDNNVEMSKKFVEKLDDLIGQRIDPLIRSFNMCGMSVEIHFAMLQKISHQL
RAIIQPPPTTTTTSEKIRFDLFEWEDLNIDQLINGLSWYRVFAKLNEKTNHIEQDNMKYS
LNRLLLKTARKARKTQNMQLAEELLFQFANVTALMNVNDHSLENNNRLINIVQNSLNNTL
LNQNLLDFCYETSEYLYDKQEQESAINILLKSVDILLETTSKYTADSNNNNKTMSECTSR
IFLKLVHYIQSDSNECCCLKQFEKLDMNTKFLAIDEKMSCIRNLNYFDNISGKLLLLSVN
NCPSMAKAWYQLGDWCYRWGRRLSDIDTVGDVGGGEQSTTTTATTTMMTNVIESSNGREA
NIIEFYKLAANSYIRFLHISGHNGCDDIDATLRLLRLILKHAPELREILEIGLKETPTKP
WKNITLQLFSRLNHHEPYVRQSICELLCRIGSDSPHLIIFPAITGLLDDQVKSKNFDYTS
TKNEDEDEDDEEVNSTDIDQSLVRNCYTSLLDTLSQRDPKLIVQAKLFVHELRRITVLWD
ELWIGILQHGMNEMKKQVVALEKEIEKTRKNINLYEKEKILFIKEQHNIFFRRLLYSLQL
TNMLTSDTPETPHEEWFQKNFNQLINQLIESIANPENIYEPSNILFNYQNLFQTIRKRSL
ASNNYRFYMHDISPRLATLDNTIIPLPGLNGSNVMLKGVFKTVSILHTYTKPKKIILIGS
DGRNYSYLFKGHEDLHLDERIMQFLSIINQMIAKFGPTISQQNNNINNDRLFIRARHYSV
TPLGNKSGLIQWVEGGHALYNLYKRWLSNREISLDDINKRITANEIFKCKLAEHGMTSEN
RNDWNTDLLRKVFDELSTETPNDLIAKELWCSSVNSFDHWNLTQNFITSNAIMSVIGYIL
GLGDRHLDNILLDLTTGEVIHIDYNICFEKGKTLRVPEMVLCRLTQNIVNTFGVTGVDGT
FRISCENVLKILRKGKETLLTLLEAFVYDPLIDWTPEHEEGFTGAIYGGAKIAQLANEGK
IIPKKQMEKENQEAIERLKQLMKSVEQRNSDWPKINNEEPQQDLQILANQAKQSDNNKNN
QQQQVIETRKNKRNVYAFSVWKRIRMKLDGRDPDPNKRLSIYDQVNHLINESISMENLSR
MYEGWTSWV
NT seq
7410 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggtcgtcgtgaatcggctgcgatgggtagtggtggtggcggtggttctggaaat
tatcgttataataatcaatttaatcatcaaaatagaggtgataatcgtagagatcgaaat
tatcattcaaattcatcaacaacaacaccgataaaatcctattattcaaatggattaatc
ggtgataatgatcgacgaagaaatgtttcgaatgaacgacaacaacaacaacaacatgat
gcggatgatgacacggatgaatcagaaaaatcgaatggttacaataaaaatggtaatttt
tctcatggaaaacatccatattatcatcatcagaataatcagaataataatcaatcacaa
caacgaatgacaaccataccgatacaatgtcaaaatgatttacaaaatttcctaaacata
atacgtccatttacgagtcttaccgagaaaaaatcctggccaaatacattcaaagattta
acaattttttatcgttccgctaaatcaatgcgtaataatatatttattgaacgtattttc
accgaatcattacgagcatttgaaaaaattttcaaagaaaaattatataaaaatactgtt
gaagaaatgatcgattgtatggctgcattatgcgattcattggaaacatcaaaatccgat
ctattcgaatggatatttaaaatatattttcaacaatcaactagtgaagaaaatcgttta
ataatattacgttgtttatcatcgataatgatcaattgtcaaatgatcgctatggataat
tattttttcattcaattaaaattgaaaaaatcattagaaacaaccaataatattgaaata
tttttacagattttagaattaattattgtgattggtcaacgttcaccaaattcattacaa
cgtcatattgaagatttaatggatatacttttgggttggtatttggatggtcatcaaaca
ataatgacattatatttaattgaaaatataatattatcatttgattttaaaaatcattta
aaattttcaaatatgttattacgatcatttattgaagatgtggaaaaatattttcatgaa
tcaatgtttaatttgaaaagaacaactgaatcgtcatcgaaggcaaatgttgaatcaata
aattcaagattacatacaatggcattacgtatacgattatttgccatattttatcgtaaa
atttttatggaaaatcgtaaagaatgtcaaaaattgatgctagtaaatacggaacaaaat
tttcaattctgtattgattcaatggcaattataattaaagtaattattaatttatcacca
tataaatcattaacaatgtttgaagaattattaattgaatgtaatcaatcgataatcatt
ttaatggaaacattcagtatattatttgatgcggatatttgttttcgtttattggaaaaa
gattgtcatgattattgtcaaattttattcgatataatggatattcaaatatcatcgaaa
aaatctattataactggattggattttattcgattgttcgtaaaaaattccaaaaatatt
aacgatgaaattgttgataaacttttttgtttaaaatttcaatcattaaaattttcaatg
gataaaaatgttcaacaatcatttatatcgttattttttggtttattgaaaattaaaagt
gttgaaattattgataaatcatatcgacatattttatcaaatataaaagtgtcattcaat
tttctacaaaaaatcaagcaaaaaaatgaaaatgaaaattttgttccaattatcaagaat
ttagatttaccacaacaagatcaaccatatcattcgattataacgaatgaacaaaaatgt
ttaatcgggctatatgttgatctgattttattgaccgaaattgccaatacaaaacattca
ttgattgcaatgttagcattatcaccaaattttttggaattaatgttatatcatataaat
ttatctaatgaatggttagctgatgaatattcatctattcatcattcattattatattta
ttttgttcatattgtcaaaaacatcataattttctgccgcaaagttcattgtttgttaat
caatcatcatcatcgatcaacaacaacaataataatgttttacgatattcaaccaattcc
aatgcattgaattcaatatttccattatccaatattggctcaattttagataatcatcat
tcgcaatcatcattagcaaacactgccataaatatatcaagcagcaataacaacaacagt
tcattacgtttttcaccaaattcacatgcaagcaattattttgttgatattattaaaaat
ttaaaatcaattttatcgattaataaattgaaaatggattcaattattgtctgtctacgt
ttatgtgaaaatattgttcaatattttggtacagtaaataaacaatcgactactgttatt
gcattggatgaatttgttgaattgattgaaattgtttcggaatatagttttgctaatgat
tatcaaatatgtcgattatcatgtacgattgccaaaaatttaatgccattaatcgatgat
caatcattatcattatattggcaagttttttataattatcgtcgagcatgtgaatttaat
ttagcacatactgataataatattaaccatctgtttcttgatctattatcattattacct
gtttgttcaatgacaaaaacaagattaaaaataccgaatcaaatacgatcaacactttgt
tatttaccattaatatcaaataatttggatatgataaaaatatttcaatataattattgg
acggcaatattttggatttgtttcgaatttgttcaactttgtattgaaaatcgtttgaaa
acaccgttaggaaaaccacaagatacatttactaaaattgaatcattaatcaaaatgttt
gtggctgaaatttcaaccaattcaaatgttaatcgtttacagataaacgcaacgaacaat
aatcaaatgacaacttcgaaaccgaatacaattcgtattcatatgttattgatgattatg
gataattttgataaacttatctataatgctatacatggtaattcacttcgtctttattgt
tcatcaaaattatcaaaacaattttttaaaaagaatcgtgccacctgttcagaatggcta
aatcgtaatcgtcgttcgataatggtattggcttcaaaagttggacaattaagtattgtt
gttcatcatggtcaggaattgttacgtaattatcaatctgatcgtacattgtttacattg
gatgaaattgaatttattttattgttaatgatcgatgcattgatacagatgaaagcatcg
gaaacaatacgtggttattataattgggttaaacaatatttggccgtaaaatttgtttgg
attaaagcagctacggatgaagcaaatggccgttatgaacgtgcattaattcaatatcga
aatctattacaggataaagttattgataatggaatcaatgtcggtggtgaacaacaacaa
caacaatcatccgcagctaatctgaatacattgaatttaattagttcaagtaaaaatttt
atctgtaatagttatacggtaaatttttttcgtaaaagaattttaaattgtttgttgaat
attgaaaattatgataatgcattggaatggtggaaatcgactaattgtgaatcgaacaaa
acaaatattaatcaaatggctacgaatttatttggttcggcaaatattgattattcatat
ctgaaatctttatctacttttactactgaaattcataatgataatgatgatgataaaaat
tgtcgaatgaccaatgatatagtgacatctattgatcaattacaacaacaacaacaacgt
tcaatgtttttcgatattgaatccagttatcatcaaattcaatcaaaactttttcaattt
gccaatgaattttatcaatcatacaacgacgataataatgttgaaatgtcgaaaaaattt
gttgaaaaacttgatgatttaatcgggcaacgaatcgatccattaatacgttcgtttaat
atgtgtggtatgtcggtggaaattcattttgcaatgttgcaaaaaatatctcatcaatta
cgtgcgattattcaaccaccaccaacaacaacaacaacatcggaaaaaattcgtttcgat
ctatttgaatgggaagatttaaatattgatcaattaattaatggtctatcatggtatcgt
gtgtttgctaaattgaatgaaaaaactaatcacattgaacaggataatatgaaatattca
ttgaatcgattactattgaaaacggcacgtaaagcaagaaaaacacaaaacatgcaatta
gctgaagaattattgtttcaatttgccaatgtaacagcattaatgaatgtgaatgatcat
tcattggaaaataataatcgattaatcaatattgttcaaaattcattaaacaatacatta
ttgaatcaaaatctattagatttttgttatgaaacatcggaatatttatatgataaacaa
gaacaagaatcagctattaatattttattgaaaagtgttgatattttacttgaaacaaca
tcaaaatatactgcggatagtaataataataataaaacaatgtcggaatgtacatcgcga
atattcttgaaattagtacattatattcaatcagattcaaatgaatgttgttgtttgaaa
caatttgaaaaacttgatatgaatacaaaatttttggcaatcgatgaaaaaatgtcttgt
attagaaatttaaattattttgataatattagtggtaaattattattattatcggtaaat
aattgtccatcaatggcaaaagcttggtatcaattaggtgattggtgttatagatggggt
agacgtcttagcgatattgatacagttggtgatgttggtggtggtgaacaatcaacaaca
accacagcaacaacaacaatgatgaccaatgttatcgaatcgtcgaatggacgtgaagca
aatattattgaattttataaattggctgcaaattcttatataagatttttacatattagt
ggtcataatggatgtgatgatattgatgctacattacgtttacttcgtttaatattaaaa
catgcacctgaattacgtgaaatattggaaattggtttgaaagaaacaccaacaaaacca
tggaaaaatataacattacaattattttcacgtttaaatcatcatgaaccatatgtacga
caaagtatttgtgaattattatgtcgtattggatccgattcaccacatttaattatattt
ccagctattaccggtttattagatgatcaggttaaatcaaaaaattttgattatacatca
actaaaaatgaagatgaagatgaggatgatgaagaagtcaattccacagatatcgatcaa
tcattagtacgtaattgttatacatcattattggatacattaagtcaaagggatccaaaa
ctaattgtacaggcaaaattatttgtacatgaattacgaagaattactgtattatgggat
gaattatggatcggtatattacaacatggtatgaatgaaatgaaaaaacaagttgttgca
ttggaaaaagaaattgaaaaaaccaggaaaaatattaatctttatgaaaaagagaaaata
ttgtttataaaagaacagcataatatattttttcgtcgattactttattcattacaatta
acaaatatgttaacatcggatacaccggaaacaccgcatgaagaatggtttcaaaaaaat
ttcaatcaattaattaatcaattaatcgaatcgattgcaaatccagaaaatatttatgaa
ccatcaaatatattgtttaattatcagaatctttttcaaacaatacgtaaacgttcatta
gcatcgaataattatcgtttttatatgcatgatattagtccacgtttagctacgcttgat
aatacaattataccgttgcctggtttgaatggttcgaatgtaatgttgaaaggtgtattc
aaaacagtttccatattacatacgtatacgaaaccgaaaaaaatcatattaattggatcg
gatggtcgtaattattcatatctatttaaaggtcatgaagatctacatcttgatgaacgt
attatgcaatttttatcaataatcaatcaaatgattgcaaaatttggaccaacaattagt
caacagaataataatattaataatgatcgtttgtttatacgtgcacgacattattcggtt
acaccattaggtaataaatccggtttaatacaatgggttgaaggtggacatgcattatat
aatctttataaacgatggctttcaaatcgtgaaatatcattggatgatattaataaacgt
ataacagcaaatgaaatatttaaatgtaaattagccgaacatggaatgacgtcggaaaat
cgcaatgattggaatactgatttattacgtaaagtatttgatgaattatcaaccgaaaca
ccaaatgatttgattgcaaaagaattatggtgttcatcagtaaattcatttgatcattgg
aatttaacacagaattttattacatctaatgcaataatgtctgtaattggctatatactt
ggtcttggtgatagacatttagataatattctattggatttaactactggtgaagtaatt
catattgattataatatttgttttgaaaaaggtaaaacattacgtgtacctgaaatggta
ttatgtcgtctaacacaaaacattgtcaatacattcggtgtaactggtgtggatggtaca
tttcgtatatcatgtgaaaatgtattgaaaatattacgtaaaggaaaagaaacattatta
acattattggaagcatttgtttatgatccattaattgattggacacctgaacatgaagaa
ggttttactggtgctatttatggtggtgctaaaattgcacaattagctaatgaaggtaaa
ataataccaaaaaaacaaatggaaaaagaaaatcaagaagcaattgaacgtttaaaacaa
ttaatgaaatcagttgaacaacgtaatagtgattggccaaaaattaataatgaagaacca
caacaagatttacagatattggctaatcaggcaaaacaatctgataataataaaaataat
caacaacaacaggtgattgaaacaagaaaaaataaacgtaatgtttatgcattttctgtt
tggaaacgaatacgaatgaaattagatggacgtgatccggatccaaataaacgtttatca
atatatgatcaggttaatcatttgattaatgaatcaatatcgatggaaaatctttcacgt
atgtatgaaggatggactagttgggtatga
DBGET
integrated database retrieval system