Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite): 113791479
Help
Entry
113791479 CDS
T05775
Name
(RefSeq) endoribonuclease Dicer-like
KO
K11592
endoribonuclease Dicer [EC:3.1.26.-]
Organism
dpte
Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpte00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
dpte03036
]
113791479
Chromosome and associated proteins [BR:
dpte03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
RISC (RNA-induced silencing complex)
113791479
microRNA pathway
RISC loading complex
113791479
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Dicer_dsRBD
Dicer_platform
Ribonuclease_3
Dicer_dimer
Ribonucleas_3_3
PAZ
Helicase_C
dsrm
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113791479
NCBI-ProteinID:
XP_027197063
UniProt:
A0A6P6XVR2
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2323 aa
AA seq
DB search
MATNKNLSTTNNSDNNVVNSTNSKSNYKYGHRNSMNNPNTRLIRSFALFDNRDFLPRPFQ
IELYETCKNRDTIVFLRPGQGKYFISVMLVKYFNPHLFPSDNVVDLKNPKKIFFLAKSPN
SIKLYSSVFNAHCNLRIGEYIETDDAKQWSPDIWHKKLQSYDIHLMMDCLFEYLIEQKLI
HANDLNLLILNDVHKILLCTSPADDCYTKIIHRLRLQTTNEKQYRILGLSASILLENVSS
NVFEKMIEQIEKNLCCSCETYADLRMISKYSIQCRIKLRSYYSLLASEKSFIQNDIKYRM
ALFMIRNYSGQFFNFITNVSMDGGITTEQLINHETIAKMIVDILNVYGILGEWCALKLID
LINRELYDTILLMSKTASNYLRLLNSCHSTLCLIRKSILSYMDQDIVAKYENTTSSSSSS
NGSESQRLTIEQFLLISSPKLHLLAQVLIEYLEELSSPSSTNQQQQQTTHSSFTFPSNIC
SLIYVENRLMARVLNEWIRELIAIVREINSGKACILDFLQSDYVFLAEDDGKNELKNFYY
RKHQKSLHEIYYYRQQEETLRRFRLPQQCNVLITTSMSSEGLDVNRCNMVICFDIPKTFH
QFIQSKGRVRVERGQFIVLVEQNDHKDYVEKFLQFCNIEKIFTKLVPLNNQVYIENEPKN
IDLITSIQSIKPIHSSSLKSSSIVQKSKKFDKQQQQQQSNQSATLQLTLENAISILNRYC
NKLPSDTFTKLVPNYKIESVKEEEENQSEENSEIITKYRCRLFLPINSTYRDEIVGNVQP
TQSLAKQSVAFEAIKTLREIGELDQNFYPVGKETSRYIEKLGLQDCFINIPKNNNNNQQV
LHQHQQQQPQHQHHHHHRGPYHQKGNRFNRIQNRNIASKRRQYFKKKVADSLCGQIFSNV
DNDDDNYCFQYLYEFQMKLTYRLSEEHNTRGRRIIDPAETTRTFGIISPNHLPTICDFTI
YNRSGEVTVSIVPIRNTDLEKNGFEINEIKRQQIENFHQYTFENVLPLGKSSIRFDRMNG
SNGNYLIVPINTIDNGDQKTIDWEFLELIWHHKNDPKSYDQEKFHHDDQNRFIFEEKLYQ
DAVVIPKYRKDKLQSFYYVAEICHDLTPQSPFPDHEYQTFEKYYNQKYEKQITNLEQPLL
DVDHTSARLNLLTPRFLNRRGINLSSSSSLKSSGSGHHQSKRNPQQKQILVPELCFIHPF
PASFWRKAVCLPCILYRLNLLLIAEELRFKIAKEAKIGVIQLPDGEKWPKLDFGWSVLVE
QSRQQTKSIECASNNNQHSNLDDSNEKQKTTINQDDDFIIDTFDPSMAPPASDQFFNENQ
NNFINFDSYNNEMIPQIEIISGPFNESKMNYNNSQKQMLSEISMDDDFDEEESGIIEVDN
ENNPIIQPGQKLPVRAGSPTYWKDRENLESDRNGKIPADFDWRFYESDGNDNESNNEEID
PARAEFRLNFKKFLEDIQQISKMPSLVDDDDEIQDNEHEFEEFDNKFSGNNRKKSSRNNN
NQKRKPMVTSLSDLDDDDDDDDGSYSDFDDLDDSSDDYDQDDDDDDLDDDGNFNSHDEDD
DDDDYDYSGDDDNGNNDDDDDDLDNFPKKYSKYKNRKAKTDFDQKIRKLSQTMDAYQTKS
VIYDILKIELLYDSRQIEQKSLKYYYRHRFSLAEQHSEHLRKRKIFDEMYFDEKNQVMQC
VQRIQNETLMNENSKSKNENDHVCCDPEIDTFRNDKNFNEINLNQSLLSVLMEKIDTNLL
DMMKIKHEIEDEKIDQQVQNRSQFANILGKNSSLSSTKIEVKFGELLPNRDENLAEFTSN
DKNPIDLFQAQRKLALQTLPRWLQLENSFETQIQMGPHPSLILQAITMSNSSDGINLERL
ETVGDSFLKYSITAFLFCMLDNWCPPSYQALDNVEQESNDNVKTTTSNKVPYNLLTQHSI
PNKSIADCVEALIGTYLISSGSQGAIQFMDWLGLKVLPKGMKIITKNLTSEPVEHKDDSN
QNHERWLPQPRSPLIIPKHLRNDIAKVKEIEDKLQRNYYKHHLDRFEEIIGYRFRDRAYL
VQAFTHNSYYENKVTDCYQRLEFLGDAVLDYLITRYLYEDPRCHSPGTLTDLRSALVNNT
FFAALAVKYNFHKYLMMLSSELYRVIDGFVRKFNIYYNQNLANGESKKILSAISDFQQGN
EDDERMDENSYSNYNYWELFVSENEAEHLEDIEVPKALGDIFESVAGAIYLDSDMSLEAV
WKAYYPMMKPEIENFSEKVPKSPIRVLLEKQPQSVKFGKPEINSGRRIRVTVEVFGLGKF
VGIGRNKRIAKCTAAKRALRALESEKRRKELERKRRQMDEFDD
NT seq
6972 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccacaaataaaaatttgtcgacaaccaacaattcggataataatgttgtcaattcg
acaaattcgaaatcaaattataaatatggtcatcgtaattcaatgaataatcctaataca
agattgattcgttcatttgcattgtttgataatcgtgattttcttccacgtccatttcag
attgaattatatgaaacatgtaaaaatcgcgatacaatcgtttttcttcgccctggtcaa
ggaaaatatttcatatcagtaatgttggtaaaatattttaatccacatttatttccttcg
gataatgtggtggatttgaaaaatcctaaaaaaatatttttcttggccaaatcaccaaat
tctattaaactttattcatctgtgttcaatgctcattgtaatcttcgtattggtgaatat
attgaaacggatgatgcaaaacaatggtctccagatatttggcataaaaaacttcaatca
tatgatattcatttgatgatggattgtctttttgaatatctaatcgaacagaaattaatt
catgctaatgatttaaatttgttaatattgaatgatgtacataaaattttactctgtaca
tcaccagccgatgattgttatacgaaaattattcatcgattacgtttgcaaacaactaat
gaaaaacaatatcgaattctaggtctttcggcatcgatattattggaaaatgtttcatcg
aatgttttcgaaaaaatgatcgaacaaattgaaaaaaatctttgttgttcatgtgaaaca
tatgccgatctacgtatgattagtaaatattcaattcaatgtcgtataaaacttcgaagt
tattattcattattggcatcagaaaaatctttcattcaaaatgatataaaatatcgtatg
gcattgtttatgataagaaattattcgggacaattttttaattttataacaaatgtttca
atggatggtggtataactaccgaacaacttattaatcatgaaactattgccaaaatgatt
gtcgatattcttaatgtatatggaatacttggtgaatggtgtgcattaaaattaatcgat
ctaattaatcgtgaattatatgatacaattttacttatgtccaaaacggcatcaaattat
cttcgacttttaaattcatgtcattcaacattatgtttgattcgtaaatcaatattatca
tatatggatcaagatattgttgcaaaatatgaaaatactacatcatcatcatcatcatca
aatggatctgaatcgcaacgattaacaatcgaacaatttcttttgatttcttcaccaaaa
cttcatctattagcacaagtattaatcgaatatcttgaagaattatctagtccatcatcg
acaaatcaacaacaacaacaaacaacacattcttcatttacatttccatcaaatatttgt
tcattaatttatgtggaaaatcgtttaatggcacgtgttttgaatgaatggatacgtgaa
ttgatagcaattgttcgtgaaataaattccggaaaagcatgtatacttgattttcttcaa
tcagattatgtatttttagccgaagatgatggaaaaaatgaattgaaaaatttttattat
cgtaaacatcaaaaatcattacatgaaatttactattatagacaacaagaagaaacatta
cgaagatttcgtttaccacaacaatgtaatgttttaataacaacatcaatgtcatcggaa
ggacttgatgtaaatcgttgtaatatggttatttgttttgatataccgaaaacatttcat
caatttattcaatcaaaaggacgtgtacgtgttgaacgtggacaatttatagtgttggtt
gaacaaaatgatcataaagattatgtggaaaaatttttacaattttgtaatattgaaaaa
atttttacaaaattagtaccattaaacaatcaagtttatattgaaaatgaaccaaaaaac
attgatttgataacatcaattcaatcgattaaaccaatacattcatcatcattaaaatca
tcttcaattgtacagaaatcgaaaaaatttgataaacaacaacaacaacaacaatcaaat
caatcggcaactttacagctaacattagaaaatgctatatcaattttgaatcgttattgt
aataaattaccaagtgatacatttacaaaattggttccaaattataaaattgaatcggtt
aaagaagaagaagaaaatcaatcggaagaaaatagtgaaattattacaaaatatcgttgt
cgactatttttacctataaattcaacttatcgtgatgaaattgttggcaacgttcaacca
acacaatcattagctaaacaatcggttgcatttgaagcgattaaaacattaagagaaatt
ggtgaattggatcagaatttttatccagttggaaaagaaacaagtcgttatatagaaaaa
ttaggtcttcaagattgttttattaatataccgaagaataataataataatcaacaggta
ttgcatcaacatcaacaacaacaaccacagcaccaacatcatcatcatcatcgtggtcca
tatcatcagaaaggaaatcgttttaatcgtatacagaatcgtaatatagcatcaaaacga
cgtcaatattttaagaaaaaagttgccgattcactttgtggacagatttttagtaatgtt
gataatgatgatgataattattgttttcaatatttatatgaatttcaaatgaaattaaca
tatcgtttatcggaagaacataatactagaggacggcgtattattgatccggcggaaaca
acacgaacatttggtataatttcaccaaatcatttgccaacaatatgtgattttactatc
tataatcgatcgggtgaagtaactgtttcgatagttcctattcgaaatacagatttagaa
aaaaatggttttgaaatcaatgaaataaaacgacaacaaattgaaaattttcatcaatat
acatttgaaaatgttttaccacttggaaaatcatcaattcgttttgatcgtatgaatggt
tcgaatggaaattatcttattgtaccgatcaatactattgataatggtgatcaaaaaaca
attgattgggaatttttagaattgatttggcatcataaaaatgatccaaaatcctatgat
caggaaaaatttcatcatgatgatcagaatagatttatttttgaagaaaaactttatcaa
gatgccgttgtcattcctaaatatcgtaaagataaattacaatcattttattatgtagct
gaaatttgtcatgatcttacaccacaaagtccatttcctgatcatgaatatcaaacattt
gaaaaatattataatcaaaaatatgaaaaacaaattaccaatcttgaacaaccattatta
gatgttgatcatacatcagcacgtttgaatttattaacaccacgttttttaaatcgtaga
ggtattaatctatcatcatcatcatcattaaaatctagtggtagtggccatcatcaatcg
aaaagaaatccacaacaaaaacaaattcttgtaccggaattatgtttcatacatccattt
ccagcatcattttggcgtaaagcagtttgtttaccttgtattttgtatcgtttaaattta
ttattaattgctgaagaattacgttttaaaatagcaaaagaagctaaaattggtgttatt
caattaccggatggtgaaaaatggccaaaattagattttggttggtcagtgttagttgaa
caatcacgtcaacagacaaaatcgattgaatgtgccagtaataataatcaacattcgaat
cttgatgattcaaatgaaaaacaaaaaacaaccataaatcaagatgatgattttattatc
gatacttttgatccatcaatggctccaccagcttcggatcaattttttaatgaaaatcaa
aataattttataaattttgattcatacaataatgaaatgattccacaaattgaaatcatt
agtggtccattcaatgaatccaagatgaattataataatagccaaaaacaaatgttatca
gaaatttcaatggatgatgattttgacgaagaagaaagtggaataattgaagttgataat
gaaaataatccaatcattcaaccagggcaaaaattaccggttcgtgctggttcaccaaca
tattggaaagatcgagaaaatttagaatcagatcgaaatggaaaaataccagctgatttt
gattggagattttatgaatcggatggtaatgataatgaatcgaataatgaagaaattgat
ccagcacgagctgaatttcgattaaattttaaaaaatttttagaagatattcaacaaatt
tcaaaaatgcccagtttagttgatgatgatgatgaaattcaagataatgaacatgaattt
gaagaatttgataataaattttcgggaaataataggaaaaaaagttcccgaaacaataat
aatcaaaaacgaaaacctatggtaacatcgctttcagatttagacgacgacgatgatgat
gatgatggttcatattcagattttgatgatcttgatgattctagtgatgattatgatcaa
gatgatgatgatgatgatcttgatgatgatggtaatttcaattcacatgatgaagatgat
gatgacgatgattatgattatagtggcgatgatgataatggtaacaatgatgatgatgat
gatgatttggataattttccaaaaaaatattcaaaatataaaaatcgtaaagcaaaaaca
gattttgatcaaaaaattcgtaaactatcacaaacaatggatgcatatcaaacaaaatcc
gttatttatgatatattaaaaattgaattattatatgattcaagacagattgaacagaaa
agtttaaaatattattatcgtcatcgattttcattagccgaacaacattcagaacattta
cgaaaaagaaaaatttttgatgaaatgtattttgatgaaaaaaatcaagtaatgcaatgt
gtacaacgaattcaaaatgaaacattaatgaatgaaaattcaaaatcgaaaaatgaaaat
gatcatgtttgctgtgatccggaaattgatacatttcgtaatgataaaaattttaatgaa
attaatcttaatcaatcattattatcggttttaatggaaaaaattgatacaaatctgttg
gatatgatgaaaattaaacatgaaattgaagatgaaaaaattgatcaacaagtgcaaaat
cgaagtcaatttgcaaatattcttggcaaaaattcatcattatcatcaacaaaaattgaa
gttaaatttggtgaattattgccgaatagagatgaaaatctggctgaatttacatcgaat
gataaaaatcctatcgatttgtttcaagcacaacgaaaattagcattgcaaactttacca
cgatggcttcaattggaaaattctttcgaaacacaaatacaaatgggaccacatccaagt
ctgatattacaagcaattacaatgtccaattcaagtgatggtattaatcttgaacgttta
gaaactgttggcgattcatttttaaaatattccataacagcattcttattctgtatgttg
gataattggtgtccaccttcttatcaggctttagataatgttgagcaagaatcaaacgat
aatgttaaaacaacaacatcgaataaagtgccatataatttattgacacaacattctatt
ccgaataaatctattgccgattgtgttgaagcattgattggaacatatttaatttcttct
ggatctcaaggtgctattcaatttatggattggcttggacttaaagtattaccgaaagga
atgaaaattataacaaaaaatttgaccagcgaaccagttgaacataaagatgattcgaat
caaaatcatgaacgatggcttccacaacctcgatcaccattgattattcctaaacattta
cgaaacgatattgctaaagtaaaagaaattgaagataaacttcaaagaaattattataaa
catcatttggatcgttttgaagaaattatcggttatcgatttcgtgatcgtgcctattta
gtacaagcatttacacacaattcttattatgaaaacaaagtaactgattgttatcaacga
ttagaatttcttggtgatgctgttcttgattatcttataacaagatatctttatgaagat
cctcgatgtcattcacctggtacattgactgatcttcgatcagcattagttaataatact
tttttcgctgcattagctgttaagtataattttcataaatatcttatgatgctttcatcc
gaactttatcgagttatcgatggttttgtacgtaaatttaacatttattataatcaaaat
cttgccaatggtgaatcgaaaaagattcttagcgctataagcgattttcaacaaggcaat
gaagatgatgaacgaatggatgaaaattcctattcaaattataactattgggaattgttt
gttagcgaaaatgaagctgaacatcttgaagatattgaagttcctaaagctttaggtgat
atttttgaatcggttgctggtgcaatttatttggattctgatatgagtttggaagcagtt
tggaaagcatattatccaatgatgaaacctgaaattgaaaattttagcgaaaaagttcca
aaaagtccgataagagttttgttggaaaaacaaccacaaagtgttaaatttggaaaacct
gaaatcaattctggtcgtcgtattcgtgttactgttgaagtatttggtttaggaaaattt
gttggtattggtcgtaataaacgaattgccaaatgtacagcagcaaaacgtgcattacgt
gcacttgaaagtgaaaaacgacgtaaagaattggaacgaaaacgtcgacaaatggatgaa
tttgatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system