Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite): 113791662
Help
Entry
113791662 CDS
T05775
Name
(RefSeq) DNA mismatch repair protein Msh2-like
KO
K08735
DNA mismatch repair protein MSH2
Organism
dpte
Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite)
Pathway
dpte03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpte00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
113791662
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
dpte03400
]
113791662
DNA repair and recombination proteins [BR:
dpte03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
113791662
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_I
MutS_II
MutS_IV
AAA_29
AAA_27
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113791662
NCBI-ProteinID:
XP_027197262
UniProt:
A0A6P6XV18
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
895 aa
AA seq
DB search
MTDNDNLGSKTDITFDLEFIQFYSEIRKTQTENVFILFNHGSFYTLHDNNAEYVSKNFLN
TTESLKIFQTKDFHTVCYTWISQTRFSSLIRHLLIENNFAVEIYSKTNPKSNIKQWRLEI
EASPGCLGPFENLLYDADVNISIQLLAVYIVDNDEDEDRNNHVSVVSIDPMACQIFIGHF
QDNDCLRYLETILVRLNPKECFIPDSGSHSKKLTQLLKRNHVMIRKYSIQYQNDIVKLEK
IFKNLAVPECREMIENFLQQTTGYTHEILCPLYPLLSKQKLLVDDVESLVDYPFGCFFIN
IINPKQFVRLDLSSIQHLHLFPSKLNSKSKQSLFQILNQCKTYCGMKLLEQFIRQPSTDR
MTIQTRLDIVEFFLENSSIMDSIREQILPRIPDMTKLYKKLTAGHYQIKDVFQLYFILEY
LRQLKIVFDNYDCPFPTIVQQVLINKLLKILTQTNQLYIRLVQALDLTSYAEHNEFKLNV
KTFPELTEIHSMMEQLSKQVRDEHRSLQKKYDNGISLEQNSDLGWYYEVSKKNIDIINKS
IVYQTISSKSEKSMKFFTRLLNEINDEFLDFAKQFEKLSKNCMRLLLKECQDDLYRISSI
QSYISLLDILTSFAKVTADFPIPLKKPTILESDANEIELKQFRHPILESINGGQFVPNDI
RFSESLKAFIITGPNMGGKSTLLRSVALSILMAQIGCFVPCESARISITDAIYTRMSSSD
DLSLGMSTFMAEMCEIAGVLKSATSNSLILIDELGRSTSTNDGFGLAQSIIEHIARNIRA
YTLFATHFHNLGSSLTKGLINRLHMESSFNEQKQLIIHYRALSDQQSQYNSQSFGIEVMK
SVGMPEHIIHSAQDRLERIYDSTIDSKIFNEAMDLITDETDSSISNSIEKILNLV
NT seq
2688 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgataatgataatttaggttcgaaaactgatattacatttgatttggaattcata
caattttattcggaaattcgtaaaactcaaacagaaaatgtgttcattctgtttaatcat
ggatcattctatacattacatgataataatgctgaatatgtttcgaaaaattttctaaac
actactgaaagtttgaaaatatttcaaacaaaagattttcataccgtttgttatacttgg
attagtcagacacgtttttcatcattgattcgtcatttattgattgaaaataattttgct
gttgaaatttattcgaaaacaaatccaaaatcaaatatcaaacaatggcgtttagaaatt
gaagcatcacctggttgtttaggtcctttcgaaaatcttttatatgatgctgatgttaat
atttctattcaattattggctgtttatattgtcgataatgatgaagatgaagatcgtaat
aatcatgtatcggtggtttctattgatccaatggcatgtcaaatttttatcggtcatttt
caagataatgattgtcttcgttatttagaaacaattttagttcgtctgaatcctaaagaa
tgtttcataccagattcgggtagtcattcaaaaaaattaacacaattattgaaaagaaat
catgttatgatacgtaaatattcgattcaatatcaaaatgatattgttaaattggaaaaa
atttttaaaaatttagctgtacctgaatgtcgtgaaatgattgaaaattttcttcaacaa
acaactggctatacgcatgaaatattatgtccactttatccattattatcgaaacaaaaa
ttacttgttgatgatgttgaatcattggtcgattatccgtttggttgtttttttatcaac
ataatcaatccaaaacaatttgtacgtttagatttatcatccattcaacatttacattta
tttccatcgaaattgaattccaaatccaaacaatcattgtttcaaattttaaatcaatgt
aaaacttattgtggtatgaaactattggaacaatttatccggcaaccatcaaccgatcgt
atgaccatacagactagactggatattgtggaattttttctggaaaattcatcaataatg
gattcgattcgtgaacagattcttcctcggataccagatatgaccaaattgtataaaaaa
ttaacagctggtcattatcaaatcaaagatgtatttcaactttattttattcttgaatat
cttcgtcaattgaaaatagtgtttgataattatgattgtccatttccaacgattgtacaa
caagtgttaatcaataagcttttaaaaattctaactcaaaccaatcaattatatatacgt
ttggtacaagctttagatttaacaagttatgctgaacataatgaatttaaattgaatgta
aaaactttcccggaattaactgaaattcattcgatgatggaacaattatccaaacaagta
cgtgatgaacatcgatcgttacagaaaaaatatgataatggaatatcattggaacaaaat
tccgatttaggttggtattatgaagttagcaagaaaaatattgatataataaataaatcc
attgtttatcaaacaatttcatcaaaatcggaaaaaagtatgaaattttttacaagatta
ttgaatgaaattaatgatgaatttttggattttgcaaaacaatttgaaaaattaagcaaa
aattgtatgcgtcttttattgaaagaatgtcaggatgatttatatcgaatatcttcaata
caatcatacatttctttgttggatattttaacatcattcgctaaagttacagccgatttt
ccaataccattaaaaaaaccaacaattttggaatcagatgcaaacgaaattgaattaaaa
caatttagacatcctattttggaatcaattaatggtggtcaatttgtaccgaatgatata
cgttttagtgaatcattaaaagcatttataattactggaccaaatatgggtggaaaatca
acactattacgatcggtagcactttcaatattgatggcacagattggttgttttgtacca
tgtgaatcggcacgtatttctataaccgatgctatctatacacgaatgagttcaagtgat
gatctatcattaggtatgtcaacatttatggctgaaatgtgtgaaattgctggtgtttta
aaatcggctacatcaaattcattgatattgatcgatgaactgggacgttcaacatctacc
aatgatggatttggtttagcacaatctattattgaacatattgctcgtaatattcgtgcc
tatacattatttgctacacattttcataatttaggatcatcattaacaaaaggtttaatc
aatcgtcttcatatggaatcaagttttaatgaacaaaaacaattaatcattcattatcgt
gcattatctgatcaacaatcacaatataattcacaatcatttggtattgaagtaatgaaa
tcggttggtatgcctgaacatattattcattcagcacaagatcgtttagaaagaatttat
gattctacaattgattcaaaaattttcaacgaagcaatggatttaattacagatgaaact
gattcatcaatatctaattcaattgaaaaaattcttaatcttgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system