Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite): 113792888
Help
Entry
113792888 CDS
T05775
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2-like
KO
K03021
DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
dpte
Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite)
Pathway
dpte03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpte00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
113792888
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
dpte03021
]
113792888
Enzymes [BR:
dpte01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
113792888
Transcription machinery [BR:
dpte03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
RNA polymerase III
Core subunits
113792888
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_4
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_5
PHF5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113792888
NCBI-ProteinID:
XP_027198645
UniProt:
A0A6P6Y046
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1110 aa
AA seq
DB search
MGKLWKIVENYFKVHDIAEHHINSYNSFIAKGMKDIVAANDRITSEVDPNWYVKYLNIHV
GMPEIRDGHNKHSLTPQECRLRDLTYSAPIYVDIEYTRGQEVLTQKNLLIGRMPIMLRSN
NCVLNQKNRDDYFQLQECPLDPGGYFIINGSEKVILMQEQQSKNRIFTFKNDDEIICEVT
CIATEKKSRLTLQMNKKRQIMVKHGNIKDGVPVIIMMKAMSGLSDREITSLILRDCERNM
EMFKLLLPSLEQCIDSKIYSEINALEFIGKKISLSNESSRHPAVIAYYFIYNSVLTHIPV
VNDSFYPKFFYLAFMVRRLLLAHIDPDNHIDNRDFYGNKRLELAGTLIGFLFEDAFKRYN
LTIMGTANKMIPKVKVCQFDVTKHMTSNLITHALNNAIATGNWSIRRFRINRIGVSQVLS
RLSHLASLGMLTRINSQFEKTRKTTGPRSLQSSYWGIVCPSDTPEGESCGLVKNIALMCQ
VSTEDCDDEIVRICSESNLVLPYGCVDLDQIDLNLYYLFINGVIVGYVTDPKPFTAFIRQ
NRREGNIPKFTTVFTNDYHQSVYICSDAGRLCRPYIIVDENGRHRLTEQFCKLVERNVMN
FNDLIDMGIIEYLDMNELNDCFIALNDDGIIAGHTTHMEIEVFTILGICASIIPFPHCNQ
SPRNTYQCAMGKQAMGVIALNQNLRNDSLLYTIQYPQYPLVQTKPMKMFNWIPAGQNPTV
AVMSYSAYDLEDATILNKSSIQFGYARCFVYKNAKIDLKTYPNRSCRDTLYFPRQNEMTK
SQNKYATLDCDGIASPESLVHSGQILVNKQSPDVKNSNNLLGHQQTKYYDNGLVYRSENS
SVIDKVTISNNDDELIIKVSYRQMRPPIVGDKFSSRHGQKGVIGAIFNKSILPFSSAGIS
PDKIMNPHGFPSRMTVGKLKEMTASKAGSLKGTIHDATVFNGTSMNDCFDIMHKHNHLYS
GKELLCSGITGELLPNEVFIGPIYYQRLKHMVMDKVHSRSIGPTISLTRQPTEGRSRNGG
LRVGEMERDCLIGHGTSNSLLERFMFSTDVYEVEICHNCNFLVASRFCMLCNSSDNVTKV
RIPYAFKLLIQELFAMGIHPAMGFRLSKKL
NT seq
3333 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtaaactatggaagattgtcgagaattatttcaaagtgcatgatatcgccgaacat
catattaattcatacaatagtttcatcgccaaaggaatgaaagatattgttgcagccaat
gatcgtattacatcagaagttgatccgaattggtatgtcaaatatttgaacattcatgtt
ggtatgcccgaaattcgtgatggccacaataaacattcattaacaccacaagaatgtcga
ttaagagatttaacgtattcggcacctatctatgttgacatcgaatatacacgtggtcaa
gaagttttaactcaaaaaaatttattgattggacgtatgccgattatgcttcgcagcaat
aattgtgtattgaatcaaaaaaatcgtgatgactattttcaattacaggaatgtccactt
gatccgggtggctatttcatcataaatggcagtgaaaaagtaatattaatgcaagaacaa
caatcaaaaaatcgaatattcacattcaaaaacgatgatgaaattatctgtgaagtaaca
tgtattgcaaccgaaaagaaatcgcgtcttacattgcagatgaataaaaaacgacagata
atggtgaaacatggtaatattaaagatggtgtcccggttatcattatgatgaaagcaatg
tccggtttaagtgatcgagaaataactagcctaatacttcgtgattgtgaacgtaatatg
gaaatgtttaaattattattaccatcgttggaacaatgtattgattcaaaaatttattcc
gaaatcaatgcattggaatttattggaaaaaagattagcttatcgaatgaaagtagtcgt
catcctgcagtaatagcttattattttatttataattcagttttgacacatatacccgtt
gtaaatgattcattttatccaaaatttttctatcttgcttttatggtacgaagattatta
ttagcacatattgatccggacaatcacattgataatcgtgatttttacggtaataaacgt
ctagaattggctggaacattaattggttttttatttgaagatgcattcaaacgttataat
ctaaccataatgggtacggcaaacaaaatgataccaaaagttaaagtttgtcaatttgat
gttaccaaacatatgaccagtaatcttataacacatgctttaaataatgcaatcgcaacg
ggtaattggtcaatacgacgttttcgtattaatcgaattggtgtatcacaagtattatct
cgattaagtcatctggccagcttgggaatgttgacccgtattaattctcaatttgaaaaa
acacgtaaaactactggtcctcgttcattacaatcatcatattggggtattgtttgtcca
agtgatacaccagaaggtgaaagttgtggtcttgttaaaaatattgcccttatgtgtcaa
gtatccactgaagattgtgatgatgaaattgtacgaatttgttcagaatccaatttagtt
cttccatatggttgcgttgatctagatcaaattgatttaaatttatattatctttttatt
aatggtgttattgtaggttatgtgactgatccaaaaccattcacagcatttatacgacaa
aatcgacgtgaaggaaatataccgaaatttaccactgtatttactaatgattatcatcaa
tcagtgtatatttgttcggatgcaggaagattatgtcgtccatatataattgttgatgaa
aatggtcgtcatcgtcttactgaacaattttgtaaattagtcgaaagaaatgtaatgaat
tttaatgatctaatcgatatgggcatcattgaatatttggatatgaatgaattgaatgat
tgttttattgcattgaatgatgatggtattatagctggacatacaacacatatggagatt
gaagtgtttaccatattaggcatatgtgcatcgattataccatttccacattgtaatcaa
tcaccacgtaatacttatcaatgtgcaatgggtaaacaagcaatgggtgttattgcattg
aatcaaaatcttcgtaatgattcattattgtatacaatacaatatccacaatatccatta
gttcaaacaaaaccaatgaaaatgtttaattggattccggctggtcaaaatccaaccgta
gctgtaatgtcatacagtgcatatgatcttgaagatgcaaccatattgaataaatctagt
atacaatttggttatgcaagatgttttgtatacaaaaatgcaaaaattgatttgaaaacc
tatccaaatcgtagttgtcgtgatacattatattttcctagacaaaatgaaatgacaaaa
tcacagaataaatatgcaacattagattgtgatggtattgcatcacctgaaagtttagta
cattctggtcagatattagtcaataaacaatcaccagatgtaaaaaatagtaataattta
ttgggacatcaacaaacaaaatactatgataatggtttagtttatcgatcggaaaatagt
tcggtaatcgataaagttactatttcaaataatgatgatgaattgataatcaaagtttca
tatcgtcaaatgagaccacctattgttggtgataaattcagttcaagacatggacaaaaa
ggtgttatcggtgctatatttaataaatcaattttaccattttctagtgctggtattagt
ccggataagattatgaatccacatggttttccatcacgtatgacagttggtaaattaaaa
gaaatgacagcatcaaaagcaggttcacttaaaggaacaatacatgatgctaccgtattt
aatggaacatcaatgaatgattgttttgatataatgcataaacataatcatttatattcg
ggtaaagaattactttgttcaggtattactggtgaattattaccgaatgaagtttttatt
ggtccaatttattatcaacgattaaaacatatggttatggataaagtacattcacgatca
attggaccaacaatatcattaacaagacaacctactgaaggtcgttcaagaaatggtggt
ttacgtgttggtgaaatggaacgtgattgtttaattggacatggaacatctaattcatta
ttagaacgttttatgttttcaaccgatgtatatgaagtagaaatatgtcataattgtaat
tttcttgttgcatcaagattctgtatgttatgtaattcaagcgataatgtaacaaaagtt
cgtataccatatgcatttaaattattaatacaggaattatttgctatgggtatacatccg
gcaatgggatttcgtttaagtaaaaaactttga
DBGET
integrated database retrieval system