Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite): 113794741
Help
Entry
113794741 CDS
T05775
Name
(RefSeq) nuclear pore complex protein Nup160-like
KO
K14303
nuclear pore complex protein Nup160
Organism
dpte
Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite)
Pathway
dpte03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpte00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
113794741
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
dpte03019
]
113794741
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
dpte03036
]
113794741
Messenger RNA biogenesis [BR:
dpte03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
113794741
Chromosome and associated proteins [BR:
dpte03036
]
Eukaryotic type
Centrosome formation proteins
Spindle formation proteins
113794741
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_NUP160_120_M
Beta-prop_Nup120_160
TPR_Nup160_C
HEAT_Nup120
NUP160_helical
TPR_NUP120_160
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113794741
NCBI-ProteinID:
XP_027200676
UniProt:
A0A6P6Y6P7
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1797 aa
AA seq
DB search
MMNDSSALLLEQQHSLKNSMNDHDQSKFSENLIVINCASNSTLQDLKIPKCSGVFTYNDS
DVLTSVTSNRYIVWQTYDDILELNEHSLHRDLHYNQLRIQFKNSLILQNGVSIQETADKI
IILVTTIVSAHRLIFRHPHQLNSNPKSIGSLSCLGPSLSSSNDSPCYSIFYNVTCFDDSD
TSFVQLQNSFSQNAILGQPTMLPYLSACSWANIDDLDAFFILSTTSGSLQIIRLPSASNS
SESQSEIKIQTFDLKQSNLIGKLISGYLPSLNKSLGSFAVESAICLLQYNIGDDNLIFAL
CRDGRIRVISLNQQSLLLCHNIFNQSMTFNSRDVSSSDNNSKTAILSTQKPISMKFWWYE
NETYWPNVIVYCTDTHYNQFYFYQIILPNQSSHSPGKNHSINHHSTANYSTNQEPHLRYL
FQRCIPSQYDLIDYFVCNSQLWAMWQHDEQINIQYYSIDTNYNDEQPFEWMPVVADVNAY
PEIGSRSPLVNPREFYLNGIFWQGNFSCHTIAKAINVLKRSIGDEKCVVNNLQKIDLLIQ
EAIKLVDNIIRNQADCKLEMNVDEYIQYEVDAWNKLYQFCLDYHVAENEPLSIFVDHKTG
IKGIVRRSRLEFIASLSPFDDMINHYFLHCKQNNRIAHQQNGDIQSPFNYRSTQSNSNDS
FDLFSISAFEYRLNTLIKPIQDSHQLNQTSDMFSTIENMKSSILALLHGMSAINVTLKDE
DLLDFEAFMQRVSSFSTETKLSLVEITKKITENSLLPEMSSLSDHSFVPLIDDFFEKCPH
VVEAIKFFILQLSFDFMSKNELNDYLGLNNEMQLLLTSNNEDAHCKMDEALQFEIKPMFA
NLLSSQCGLNFTVSTIQRIIQARYKFCRDLFLLQYMLTSFHSKVKSDYRTRIIHDVQAFM
IPATSQVMFALNHLNWISETPMITPNIWWSESTSCDKLYGGITSIVNLNTSPSQNLTGSN
RGSSFENSELLSVLEMRDFINLNRVGLLSHESIFYDAYPRANILYLFCQFSGGILAKRLL
SYSLTWEYNQGQLDQSTLTGDGIWSNLLPMYMDSICQLVWPFSSGQFKLAEFLLGIGQYH
LVERFVDKLHPWCKMFAYSRYFARGICYLMTGEGDKAIIKLKQSVYGINQEPFLFKIFAQ
RPKSVQLTDKEIASTLDNDDNTKESDSILRKIHLKKLNDAKTILNARTLFRYYNKLIHLF
NRYSTYDLVIELANCALKCLGPDFDPEFNQHSSILHSILFSCHLRLGNIDQAYKSMIDNL
DPDQKQNCLRQFIVNLCENGQLKQLVSYPYIDLEDNFVSILDSKARSSSCLINDDHEGKM
EKSINSLNRQKSTILESESSHSVNYFHILYSYFINTFNYRRAAQTIYDYYRQLNQEYSGG
EHQILKIQANCLLIARNCLKCLDDSKYSWIVKNSLKKTTDDTKQQMKRKRGYFSSDDNDK
NCNYNQDKTIIEIVDDEELLREYLLIDARLKLLERNSKEYAIASSPLSPDETVILCTDAS
LYEQSFKISELFSLPLEPIFDGMASKYVQLLNGLYNRRRIDDETMLGLLAQSSVVDMDPE
MMISPKLKLPIDENNFSVDLFDIFYENTASNIECDYICYSSLSICDRMWYLIMYYLYRYQ
RQPHISTDYFKTVAEKLLSNGIMIPVSLMKIYQKSNCPQLLRLLMTYNFLTEATQLSIDY
MNAFMGHGVEYFDLKNHLYPNCPPLCIPMHLFDCLAKILAEENERNRYDTNKTETEKWQK
SLYSIKANNDQGDNDSEAVDDDDDIRSETIIDYDSLLRNLNKTKQKLEQTIISCSNV
NT seq
5394 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaatgattcttcagcattgttgcttgagcaacaacatagtttgaaaaattcaatg
aacgatcatgatcaatcgaaatttagcgaaaatttaattgttattaattgtgcaagcaac
agtacattacaagatttaaaaattccaaaatgttcgggagtatttacctataatgatagt
gatgtgctaacatcagttacatcaaatcgttacattgtttggcaaacatatgatgatatt
ttggaacttaatgaacatagtttacatcgtgatttacattataatcaacttagaattcaa
tttaagaatagtttaattttacaaaatggtgtttctattcaagaaactgccgataaaatt
attatattggtcacgacaattgtttcagctcatcgattaatttttcgtcatccacatcaa
ttgaattcaaatccaaaatcaattggttcgttatcttgtttgggaccctcgttatcatct
tcaaatgattcaccttgttattcaattttttataatgtcacctgtttcgatgattcggat
acaagttttgtacagctgcagaattcattttcacagaatgcaattcttggtcaaccaaca
atgttaccatatttgtctgcatgttcatgggcgaacatcgatgacttggatgcatttttt
attttatccactacttctggttcattacaaattattcgtctcccatcggcttcaaattcc
agtgaatcacaatcggagattaaaattcaaacatttgacttgaaacaaagcaatctgatt
ggtaaattaatctccggttatttaccttcgcttaataaatcattggggtcatttgctgtt
gaatcagcaatttgtttgcttcaatataatatcggtgatgataatctaatatttgctctt
tgtcgtgatggccgtatacgagttatatcattgaatcaacaatcactattactttgtcac
aatatattcaatcaatcgatgacattcaattcaagagatgtatcatcatcggataataat
agcaagacagctattttatccacacaaaaaccaatatcaatgaaattttggtggtatgag
aatgaaacctattggccaaatgtaattgtatattgcaccgatactcattataatcaattt
tatttttatcaaataatattgccaaatcaatcatcacattcaccaggtaaaaatcattcc
attaatcatcattcaacggcaaactattcaacaaatcaagaaccacatttacgttatcta
tttcaacgttgtattcctagccaatatgatttgattgattattttgtttgcaatagtcaa
ctatgggcaatgtggcagcatgatgaacaaattaatatacaatattattccatcgatacc
aattataatgatgaacaaccattcgaatggatgcccgttgtggccgatgtaaatgcttat
ccagaaattggttcacgttcaccattagttaatccaagagaattttatttgaatggaatt
ttttggcaggggaatttttcctgccataccattgccaaagcgattaacgttttgaagcgt
agtattggtgatgaaaaatgtgttgtaaataatttgcaaaaaattgatctattaattcaa
gaagctatcaaacttgtcgacaacataattcgtaatcaagctgactgtaaattggaaatg
aatgttgatgaatatattcaatatgaagttgatgcatggaataaactttatcaattttgt
ttggattatcatgttgccgaaaatgaacccttatcaatatttgttgatcataaaactggt
atcaagggaattgttcgcagatcacgattggaatttattgcatcactgtcaccattcgat
gatatgattaatcattattttttacattgtaaacaaaataatcgtattgctcatcaacaa
aatggtgatatacaatcgccgtttaattatcgttccacacagtcaaattcaaacgatagt
tttgatctattttccatttcagcatttgaatatcgtttaaatactttgataaaacctata
caagattctcatcaattaaatcaaacatcggatatgttttcaacgattgaaaatatgaaa
agtagtattctggctttattacatggtatgtcagctattaatgtcacattaaaagatgaa
gatctattggattttgaagcatttatgcaacgggtttccagttttagtacggaaactaaa
ctttcattagtcgaaataacgaaaaaaattaccgaaaattctttattgcctgaaatgtca
tcactttcggaccattcatttgtaccattgattgatgatttttttgaaaaatgtccacat
gttgttgaagctataaaattttttattctgcaattaagttttgattttatgtcgaaaaat
gaattgaatgattatttaggattgaataatgaaatgcaattactactcacatcgaacaat
gaagatgcacattgcaaaatggatgaagcattacaattcgaaatcaaaccaatgtttgct
aatctattatcaagtcaatgtggtttaaattttactgtttcaacaattcaacgaatcatt
caagcacgttataaattttgtcgtgatttattcctgctacaatatatgttgacaagtttt
cattcgaaagttaaaagtgattatcgtacccggattattcatgatgtacaagcattcatg
ataccggcaacatcgcaagtaatgtttgcattgaatcatttgaattggatatcggaaaca
ccaatgataacaccaaatatttggtggtctgaatcaacatcatgtgataaactttatggt
ggtattacatcgattgttaacctgaatacttcaccttcacaaaatttaactggttcgaat
cgtggttcatcatttgaaaacagtgaattattgtcagtgttggaaatgcgtgattttatc
aatttgaatcgtgttggcctattgtcacatgaatcaattttctacgatgcttatcctcgt
gcaaacatattgtatttattttgtcaatttagtggtggtattttagctaaacgattacta
agctattcacttacctgggaatataaccaaggtcaattggatcaatctacattgacaggt
gatggtatctggtcaaatttattacccatgtatatggattccatttgtcaattggtatgg
cctttttcatccggacaatttaaattggctgaattcctgttaggtattggtcaatatcat
ctggtcgaaagatttgttgataaattacatccatggtgtaaaatgtttgcatatagtcga
tattttgctcgtggaatttgctatctaatgactggtgaaggtgataaagcaattatcaag
ctgaaacaatctgtttatggaatcaatcaggaaccatttttattcaaaatattcgctcaa
cgaccaaaatctgtccaactaactgataaagaaattgcatcaactttagataatgatgat
aacacgaaagaatcggattctattttacgcaaaattcatttgaaaaaactaaatgatgct
aaaacaattcttaatgctcgaacattgtttcgttattataacaaattaattcatctgttt
aatcgttattcaacttatgatttggttattgaactggccaattgtgcattgaaatgttta
gggccggattttgatccagaattcaatcaacatagttcaatattacattcaatattattt
tcctgccatcttcgtttgggaaatattgatcaagcttataaatcaatgatcgataatctg
gatcctgatcaaaaacaaaattgtcttcgacaatttattgtaaatctttgtgaaaatggc
caattaaaacaattagttagctatccatatattgatttggaagataattttgtttcaatt
ttggattcgaaagctagatcatcatcttgtctgataaatgatgatcatgaaggaaagatg
gaaaaatctataaattcattgaatcgtcaaaaatcaaccatattggaatctgaatcaagt
cactcagtgaattattttcacattctttatagctattttatcaataccttcaattatcgt
cgtgctgcgcaaacaatctatgattattatcgtcaattaaatcaagaatatagtggtggt
gaacatcaaatattaaaaattcaagcaaattgtttattaattgctagaaattgtcttaaa
tgtttggatgattcgaaatattcatggattgttaaaaattcgttgaaaaaaactactgac
gatacaaaacaacaaatgaaacgtaaacgtggatatttttcttcggatgataatgataaa
aattgtaattataatcaagataaaaccatcatcgaaattgttgacgatgaagaattgttg
cgtgaatatttgttgattgatgcacgattaaaattattggaaagaaattcgaaagaatat
gctatagcttcatcaccattaagtcccgatgaaacggttattctttgtacggatgcatca
ttatatgaacaatcattcaaaatatccgaattgttttcactaccactcgaaccgatattc
gatggtatggcatccaaatatgttcaacttttgaatggactttataatcgtcgaaggatc
gatgatgaaacaatgttgggattattggcacaatctagtgttgtcgatatggatccggaa
atgatgatatcaccaaaattaaaactgccaatcgatgaaaacaatttcagtgtagatttg
tttgatattttctatgaaaatactgcatccaatattgaatgtgattatatttgttattca
tcattatcgatatgtgatcgaatgtggtatcttataatgtattatttatatcgctatcaa
cgtcaaccacatatatcaaccgattatttcaaaactgttgccgaaaaacttttatccaat
ggtattatgatacctgtttccttgatgaaaatctatcagaaatcgaattgcccacaatta
cttcgtttgttgatgacttataatttcctaaccgaagctactcaattgtctattgattat
atgaatgcatttatgggtcatggtgttgaatattttgatctcaaaaatcatttgtatcca
aattgtccaccactttgtattcccatgcatttgtttgattgtttggcaaaaattttggcc
gaagaaaatgaacgaaatcgttacgatacaaacaaaaccgaaacagaaaaatggcaaaaa
tctttatattcaatcaaagcaaacaatgatcaaggtgataatgatagtgaagctgttgat
gatgatgatgatattcgatcagaaacaattatcgattatgattctctattacgaaacctg
aacaaaaccaaacaaaaactagagcaaacaatcatttcatgttcaaacgtttga
DBGET
integrated database retrieval system
