Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite): 113795073
Help
Entry
113795073 CDS
T05775
Name
(RefSeq) pre-mRNA-splicing factor SYF1-like
KO
K12867
pre-mRNA-splicing factor SYF1
Organism
dpte
Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite)
Pathway
dpte03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpte00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
113795073
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
dpte03019
]
113795073
03041 Spliceosome [BR:
dpte03041
]
113795073
Messenger RNA biogenesis [BR:
dpte03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
113795073
Spliceosome [BR:
dpte03041
]
Complex B
Other components
Prp19-related factors
113795073
Complex C
113795073
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_Syf1_CNRKL1_C
HAT_Syf1_M
HAT_Syf1_CNRKL1_N
HAT_PRP39_N
HAT_PRP39_C
TPR_14
Suf
TPR_15
TPR_8
TPR_12
TPR_2
Mad3_BUB1_I
TPR_10
NRDE-2
TPR_7
RPN7
Mad3_BUB1_I_2
Sigma70_ner
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113795073
NCBI-ProteinID:
XP_027201057
UniProt:
A0A6P6Y6H5
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
868 aa
AA seq
DB search
MEKHSSIIINEEDLAHEEDILRNSYSISHWLRYIDRKKDSSSNDIVNLLYERALKLMPGS
YKLWYGYLKLRIKQTNSLSILDPIVNETNNCFERSLVFMHKMPRIWIEYLQFLMSQCDLT
RTRRTFDRSLQALPITQHNRIWPLYLKFVKSHNLPETSIRIYRRYLMLLPEEAEDFIDYL
ISIERWDEAALKLTEIVNDEHFVSKQGRSKHQLWTELAEILCRHPDRIHSLDVDAIIREG
IKRYVDQQGKLWISLAEYYTRSGLFDKARDIFEEALASIKTVRDFSQIFDAYTQSEEKLI
QVRMNQSNLSEEDEIDLDLRMIRYEDIIERRPLLLNNVALRQNPHNVEEWLKRVKLLENK
PTEIVDVYSDAVQTVQAKHAIGKYYLLWVKFAQFYEANGQLEDARLIFEKAVTVDYVKVE
DLANVWCEYVEMEVRNNNFELALKLMQRAVSVPSKRSTSYYDQSESVQNRLYKSLKIWSM
YADLEESFGTFESTKAVYDKIIELKIVTPQMIINYGLFLEENGYFEESFKAYEKGIALFR
WPNVYDIWNTYLTKFLQRYRGSKLERIRDLFEQCLEYCPSKYCKHFFFLYAKCEEEYGLA
RNATTIYDRATKKVPSNERMEVFNIFIRKVAEMFGVTHTRSIYEKAIDMLPDSEAREMCL
KFADLERKLGEIDRARAIYAHCSQICDPRTATRFWNAWKDFEIKHGNEDTVREMLRIKRS
VMATFNTQVNFMSAQMIASAFHQQQDNKESTNKMNDLENLAQANQSDGSEIIKNSVQFVK
SDSSTVNNGGNRVNDIIVSSDQANPDEINLDDDEDLDAEQSDDDDDNDDDDDEQQSSSKK
TKLSEIEQKMVPKEVFGSLRNDDDDDDD
NT seq
2607 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaacattcatcaatcattatcaacgaagaagatctggcacatgaagaagatata
cttcgaaattcttattcaatttcacattggttacgttatattgatcgtaaaaaagattca
tcatcaaacgatattgttaatttattatatgaaagagctttaaaattaatgcccggtagt
tataagctatggtatggttatctaaaacttcgtatcaaacaaaccaattcattatcaata
ttagatccaattgtaaatgaaacaaataattgttttgaacgttcgctagtttttatgcat
aaaatgcctcgaatatggattgaatatttacaatttttaatgtcacaatgtgatttgaca
cgaacacgtcgaacatttgatcgttcattacaagcattaccaattacacaacataatcgt
atatggccactgtatttgaaatttgtaaaatcacataatctacctgaaacatcgattcgt
atttatcgtcgttatctaatgttattacctgaagaagctgaagattttatcgattatctt
atatcgattgaacgttgggatgaagctgcattgaaattaaccgaaattgttaatgatgaa
cattttgtttccaaacaaggacgatctaaacatcaattatggactgaattagctgaaatt
ctttgtcgtcatccggacagaattcattcattggatgttgatgcaattatacgtgaagga
attaaacgttatgttgatcaacagggaaaattatggattagtttggctgaatattatacc
cgaagtggtttatttgataaagcacgtgatatttttgaagaagcattggccagtattaaa
actgttcgagatttttcacaaattttcgatgcttatacacaaagtgaagaaaaattgata
caagtacgtatgaatcaatcgaatctaagcgaagaagatgaaattgatctagatttacgt
atgatccgatatgaagatattattgaacgtcggccattattattgaacaatgtagcatta
cgacaaaatccacataacgtagaagaatggttaaaacgtgtaaaattattggaaaataaa
cccaccgaaattgttgatgtttatagtgatgctgtacaaacagtacaggcaaaacatgcc
ataggtaaatattatttattgtgggtaaaatttgcacaattttatgaagctaatggccag
ttggaagatgctcgtttaatttttgaaaaagccgttacagttgattatgtaaaagttgaa
gatcttgctaatgtttggtgtgaatatgttgaaatggaagtacgtaataataattttgaa
ttggcattaaaattaatgcaaagagccgtttcagttccatcgaagcgatcaacatcttat
tatgatcaatcggaatcggtacaaaatcgcttgtataaatcattgaaaatatggtcaatg
tatgctgatttggaagaaagtttcggtacatttgaatcaaccaaagctgtttatgataaa
attattgaattgaaaatcgttacaccacaaatgatcattaattatggactgtttttggaa
gaaaatggctattttgaagaatcatttaaagcatatgaaaaaggtattgcattgtttcgt
tggccaaatgtttacgatatttggaatacatatttaacaaaatttttacaacgttatcgt
ggttcaaaattagaacgtatacgggatctatttgaacaatgtttggaatattgcccttcg
aaatattgtaaacattttttctttctttatgcaaaatgtgaagaagaatatggtttggct
agaaatgcaaccactatttatgatcgtgcaacgaaaaaagtaccatcgaatgaacgaatg
gaagtttttaatatatttattcgtaaagtagccgaaatgtttggtgtaacacatacaaga
tcaatttatgaaaaagctattgatatgctaccggattcggaagcacgggaaatgtgttta
aaatttgccgatttggaaaggaaacttggtgaaattgatcgtgcacgtgctatttatgca
cattgtagccaaatttgtgatccacgtacggccaccagattttggaatgcatggaaagat
tttgaaattaaacatggaaatgaagatacagttagggaaatgttacgaataaaacgttca
gtaatggctacatttaatacacaagtaaattttatgtcagcacaaatgatagcatcagct
tttcatcaacaacaagataataaagaatcgacgaataaaatgaatgatttagaaaatcta
gcacaagctaatcaatcggatggttcggaaataattaaaaattctgtacaatttgttaaa
tctgattcatcaacggtgaataatggtggtaatcgagtgaatgatattattgtcagctcg
gatcaggctaatcctgatgaaataaacctcgatgatgatgaagatttggatgccgaacaa
agtgatgacgatgatgacaatgatgatgatgatgatgaacaacaatcatcgtctaagaaa
actaaattgtcagagattgaacagaaaatggttcccaaagaagtttttggaagtttacgt
aacgacgatgatgatgatgatgattga
DBGET
integrated database retrieval system