Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite): 113796258
Help
Entry
113796258 CDS
T05775
Name
(RefSeq) syndetin-like
KO
K23288
syndetin
Organism
dpte
Dermatophagoides pteronyssinus (European house dust mite)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpte00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
dpte04131
]
113796258
Membrane trafficking [BR:
dpte04131
]
Protein recycling
Others
EARP complex
113796258
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Vps54_N
Syndetin_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113796258
NCBI-ProteinID:
XP_027202297
UniProt:
A0A6P6YA87
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1177 aa
AA seq
DB search
MEIGKKKFRSILKQVQSSTEVLSPKSSTLSPQNSVCNNDDQGKPTLDLSAAIEYNYCLIN
SYVQERSQRTLSPYEEIAKTFTDADDEDRIIESIGAEFFLDPNQNADHVDDDNNEIVEQD
NGQARIMEQCVLAKLPSLDHSMELLNYIETEKKKLTRQQTIVSKRLTQMILANDSHFQSE
LIRVRCIEQDLASAIRICADGRRAFGESKRDFTETSMTIIDNHRQRETIVQIIDCLQTIK
RLKQTVERIGYMLEYEKNFATAINLLSEQLEMLEILSEKYGCVAEMQDRLLAAIQLVGDQ
MDAVLGKMCDRFCFRTYQQLAQAYAQLDKTEFSLQQLQLYFANTIHDKAFSIVLGYVKLF
SPDHHSSNDAQSSFKSKRLIELCQHLNPESFLQCLVDLCRALWDVMANYHQCLTFYQRQK
HKPSASLTKEEIDFAIKKLSYGALRIWSDVQHKIRTLLSSVKFVQQPSEIQSTNQSLEQN
SDHHHQDQLLFSFEEFIKILTVSERMIEIGEQFCQLYQAENDSNVENNNNDENQQRSHSP
TLELQNTLYQQTRAYIQSYHQVSMFELKIFLENEIWTRCPIETCDEFELIANLHEFSFIK
QRLLRMKANEGKYSKTKKDIQTAKVNTLLLSPVASGANRERRYFTDLNPNDDVDDDDDNE
MVLSTVSPFDELITRDSIVSQQTFDLDSDSDDDSDQSTTNAIVSSSTMEIVTTNTALNVV
RLMGRYMNIMFLLRPISHDIIKALLELFDYYFYSVYHFFAEDALPVPWLAHTLTNSNQQS
SSNNIGLQQQSNRLQLNHKFSSFIKRINESLILNEETGSSSSNTTSPSKVPATCLSSSSS
SPSSKMPKYPCPALPDYVPIESADRHYALVERIMAIQSMIFIARQFYHLCPLLLEFLRSS
PDPNESNVETNQKSEDGFKSLQFYHDKMCSSVASLQYQCLYAVATKLLPYETIVKQMQQT
RWDLKEIPSMHSTYVNVIIDGLSRFDVSYRQLLQSHDLSFLAVIPDSSIGDDLLDDMPLI
KLENLSRRIPITIWECLLRASNRTFIEGFSTVRKCTNEGRALMQLDYEQFLSHMEKLMTS
YYNQQERSTGTSKSNLKCYLANERLNVEEFIKAFYITESTFTEWIRQKTNVYTGKQIVSL
INCIAADNKKLRTSLLSAIDASSLDQPLQSTNLDITQ
NT seq
3534 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaattggtaagaaaaagtttcgatccatcttaaaacaagtgcaaagttcaaccgaa
gttttgtcaccaaaatcatcgactttatcaccacaaaatagtgtttgcaataatgatgat
caaggaaaaccgacattagatttatcggctgcaatcgaatataattattgtttgataaat
tcatatgtacaggaaagaagtcaacgtacattgtcaccttatgaagagatagccaaaaca
tttaccgatgccgatgatgaagatcgtattattgaatcgatcggagcggaattttttctc
gatccaaatcaaaatgctgaccatgttgatgatgataataatgaaatagttgaacaggat
aatggtcaggctagaataatggaacaatgtgttctagcaaaattaccttcacttgatcat
tccatggaattacttaactatattgaaacggaaaaaaagaaactaacacgtcaacagaca
atcgtatcaaaacgattgacccaaatgatattggccaacgatagccactttcaatcagaa
ttaattcgtgtccgatgtattgaacaggatttagcatcagccatcagaatttgtgctgat
ggtcgtcgagcattcggtgaatcaaagcgtgattttaccgaaaccagtatgacaattatc
gataatcatcgacaacgagaaacaattgtccagattattgattgtttacaaacaatcaaa
cgattaaaacaaacagtcgaacgtattggttatatgcttgaatacgagaagaattttgct
actgccattaatttattaagtgaacaattagagatgcttgaaatactttcggaaaaatat
ggttgtgtagctgaaatgcaagatcgattattagctgctattcaattggttggtgatcaa
atggatgctgtattgggtaaaatgtgtgatcgattttgttttcgaacatatcaacaactg
gcccaagcatatgctcagcttgataaaacagaattttctctacaacaattacaactttat
tttgccaatacaattcatgacaaagcttttagtattgttcttggttatgttaaacttttt
tcacctgatcatcattcatcgaacgatgctcaatctagctttaaaagcaaacgattgatt
gaactttgtcaacatctgaatccagaatcttttctacaatgtttagtcgatttatgtcgt
gctctatgggatgtaatggccaattatcaccaatgtttaacattctatcaacgtcaaaaa
cataaaccatccgcttcgttaaccaaagaagaaatagattttgcaatcaaaaaactttca
tatggtgcattaagaatttggtcagatgttcaacacaaaatacgaactcttctttctagt
gtaaaatttgtccaacaaccgtccgaaattcaatcaaccaatcaatcattggaacaaaat
tcagatcatcaccatcaagatcaattattgtttagctttgaagaatttatcaaaattttg
accgtatccgaacgaatgattgagattggtgaacaattctgtcaattgtatcaggcggaa
aatgattcgaacgtggaaaataataataatgatgaaaatcaacaacgatcgcacagtcca
accttggaattgcaaaatacattatatcaacaaacaagagcttacattcaatcctatcat
caggtatcgatgtttgaattgaaaatttttcttgaaaatgaaatctggacacgttgccct
atcgaaacctgtgatgaatttgaattgattgcaaatctacatgaattttcattcatcaag
caaagattgttacgaatgaaagcaaacgaaggcaaatattcgaaaacaaaaaaagatatt
caaacggctaaagtcaatacattgttgttgtcgcctgttgcttctggtgcaaatagagaa
cgtcgttattttaccgatttaaatccaaatgatgatgtcgatgatgatgatgataatgaa
atggttttgtccactgtatcgcctttcgatgagctaattactcgtgattcaatcgtttca
cagcaaacattcgatttggattcggacagcgatgatgacagcgatcaatctactacgaat
gcgattgtgtccagctccactatggagatagtgacaaccaacacagcattgaatgttgtt
cgattgatgggtcgttatatgaacataatgtttttgctacgaccgatttcgcatgatatc
atcaaagctttacttgaactttttgattattatttctattcggtctatcatttttttgcc
gaagatgcattaccggtaccgtggcttgctcatacattaacaaattcaaatcaacaatca
tcatcgaacaacataggtttgcagcaacaatcaaatcgattgcagcttaatcataaattc
tcttcgtttatcaaacgtatcaatgaaagtttgattttgaatgaagaaactggttcgtca
tcatccaacactacatctccgtcgaaagttcctgctacttgtctatcatcatcatcatca
tcgccatcatcaaaaatgcctaaatatccatgtcctgctcttccggactatgtgcccatt
gaatcggctgatcgacactatgcattggttgaacgtattatggccattcaatctatgata
tttattgcccgtcaattttatcatctttgtccattgctattggaatttttacggtccagc
ccagatccaaacgaatctaatgtggaaacgaatcaaaaatcagaagatggattcaaaagt
cttcaattctatcatgacaagatgtgttcgagcgttgcaagtttgcagtatcaatgttta
tacgctgtagccaccaaattgttaccctatgaaacgatagtcaagcagatgcaacaaact
cgttgggatctgaaagagataccatctatgcattcgacatatgttaatgttattattgat
ggattgagccgttttgatgtttcctatcgccaattgctgcaatcgcatgatttgtccttt
cttgccgtcattcctgatagttccatcggtgatgatttgttggacgatatgccattgatc
aaattggaaaacttgtctcgacgaattccgatcactatttgggaatgtctgttacgtgcc
tcaaatcgaacttttatcgaaggtttttccaccgtccgcaaatgtacgaacgaaggtcga
gctttaatgcaattggattacgaacaatttctgtcgcatatggaaaagctaatgacatca
tattacaatcaacaagaaagatcaactggaacaagcaaaagcaatctcaaatgctatcta
gccaatgaacggctaaacgtggaagaatttatcaaagctttttatattaccgaatctaca
tttaccgaatggatacgccaaaaaaccaatgtctacactggcaagcaaattgtatcgctt
atcaattgcattgctgctgataacaaaaagttacggacttctttgctttcggccatcgat
gcttcatcacttgatcaacctttgcaatcgaccaatcttgatattactcaatag
DBGET
integrated database retrieval system