Dryobates pubescens (Downy woodpecker): 104301951
Help
Entry
104301951 CDS
T08526
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
KO
K24333
multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
Organism
dpub
Dryobates pubescens (Downy woodpecker)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpub00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
dpub04990
]
104301951
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
dpub04990
]
Laminin domain-containing proteins
Laminin EGF-like domain-containing proteins
104301951
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FXa_inhibition
EGF_laminin
cEGF
EGF_CA
EGF_2
EGF_TEN
EGF
hEGF
EGF_Teneurin
EGF_PEAR1L
EGF_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104301951
NCBI-ProteinID:
XP_009900714
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1581 aa
AA seq
DB search
MVELNVIDHANQNDSLFYTMPNVCPVVELALVGHQQPCVQAFSRMVKMWKQGCTKRRWCM
GYERRSGYYTVYKQVYKLEHQTVYKCCPGWVQRDREPGCLHLLCTVGTCFNGGKCSETGS
QMCQCPAGFQGPRCQYDVNECTTENGGCQDQCCNTIGSYHCKCPAGQKLEGDGKSCGDVD
ECTVVNGGCQQGCVNTQSSFYCQCQAGFRLHADGRTCIGNSSSQLVEFSSFNASVAPAIN
SCSVNKGGCEQQCIQLSEDHYKCQCQPGYQLKRDAKSCEVINPCTSGNGGCSQICQNERG
VAKCECHPGHFLPADKKSCVDIDECAEGRARCAHRCVNTLGSFTCACNPGFELGADGKQC
YRIEMEIIDSCQADNGGCSQRCQHTAAGPRCSCDHGYRLPQTLHSCPFLAEVDECETGES
CCSQFCINYAGGYECACKAGFQPSADGCACDDVDECHLDNGNCDHFCVNSLGSYECACKE
GYRLGANRRSCIGGEEVDVEEATGFAGTPGLQFRGPPQLLHYALGALNEDEDPRGELTLV
HRVVCLDNTFGNDCSLSCEDCLNGGSCNSERSGCVCPPGWTGIICNETCSPGTYGRGCAS
ICKCQNGGSCDPITGQCHCPPGVHGKLCEDGCPKGFFGKNCDKPCNCANNGYCHRLYGAC
LCDPGLYGRFCHLTCPRWAFGAGCSEECQCVKEQTLECSARNGTCTCKPGYHGKKCQKEC
LPGFYGAGCKLRCSCPPDALCDHETGACKHLCPPGFHGEKCYLSCQPGSFGVNCQQRCSC
GEAPCHPKTGQCLCPAGKTGATCEQDCPVGWWGPDCQSSCEPCTNGGQCNKETGACDCPP
GYTGPSCSAXCPEGSFGLSCEGSCQCQNGAACDHVSGACTCTAGWTGTFCERACPDGFFG
LDCHQVCKCKNAAGCDHILGTCRCLPGWLGETCEQPYQGDSYGPGCSPLCHCHSRAHCRH
VSGMCLCSPGYQEACPHGWYGANCQQLCVCHGQATCHSVTGECRCPQGRMGIACELECGD
RRFGEGCEQNCSCHHGVCDLHSGKCICHNGWTGDRCDVVCPPGFFGERCEEQCDCLHALS
CHHQTGACHCEKGWRGRHCDKPCLPGRYGTGCAQRCRCPAGVPCHHLTGHCGCPPGFTGY
GCQKTCPPGTYGENCNRVCQCSAENEECHPVTGVCACRPGYHGARCHLRCPKGTYGSNCQ
NLCKCMNGGHCDPAAGTCDCAPGFIGADCSQTCPENRYGKDCTQLCACGKGQCDPRTGKC
TCPPGQMGPGCQQVCPQGQYGPNCHLTCTCQNGGICDHVDGNCTCGLGWTGRWCEKECLP
GKYGSGCRLDCVCQHNGTCDRFTGCCQCPQGYYGHSCEHRCPLGFYGLNCLHACACENGA
SCDAVTGQCLCPLGYQGVHCEKGCDKGWFGERCQHRCDCGDAPCDPETGKCLCPPGKTGD
KCDIAMISILGTSSGQLGYSLGRPCDRXNLKTARLSRMSSFNVHRCNCLSGFLIPVNYEG
TXNALPNTSVLPECRSDRYGPNCSLRCQCASKSQCNPYNGNCVCPATWMGPTCKEGGPPK
LPFYEEQTQERGNIFPRALQQ
NT seq
4746 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttgaactcaatgtcatagatcatgccaaccaaaatgattctctgttctacacaatg
ccaaatgtctgtccagtggttgagttggcactggtaggccaccagcagccatgtgtccaa
gccttcagtcgtatggtcaagatgtggaaacaaggctgcacgaagaggagatggtgcatg
gggtacgagagaaggtctggctactacacagtttacaagcaggtgtacaaactggagcat
cagactgtctataagtgctgccctggatgggttcaacgtgacagagaacctggctgtttg
cacttgctgtgcaccgttggcacttgtttcaatggagggaagtgttctgaaactggatcc
cagatgtgtcagtgtcctgcaggatttcagggtcctcgctgccagtatgatgtaaatgaa
tgtaccactgagaatggtggctgtcaggaccagtgctgtaataccatcggcagctaccac
tgcaagtgtccagctggccagaaactggagggagatggaaaatcatgtggagatgtggat
gagtgcacggtggtgaatggtggctgccagcagggttgtgtcaacacacagagctccttc
tattgccagtgccaggcgggattcaggctgcacgctgacggccgcacatgcataggtaat
tcaagcagtcaacttgttgaattctcttccttcaatgcttctgtggctccagccatcaat
tcctgcagtgttaacaagggaggctgtgagcagcagtgcattcagctcagtgaagaccat
tacaagtgccagtgccagccaggctaccagctgaagagggatgccaagtcctgtgaagtg
ataaacccctgcacaagtgggaatggaggatgctcacaaatctgtcagaatgagagaggg
gttgccaaatgcgagtgtcatccagggcatttccttcctgcagacaaaaagtcctgtgta
gacattgatgagtgtgcagaagggagagccaggtgtgctcatcgttgtgtgaacactctg
ggatccttcacctgtgcctgtaatccgggtttcgagctgggcgctgatggaaagcagtgc
taccgcatcgaaatggaaatcattgacagctgccaggctgacaacggaggctgctcacag
cgctgccagcacacggcggcagggccacgctgttcctgcgaccacggctatcgcctcccc
cagaccctgcacagttgccctttccttgcagaggtggacgagtgtgagactggagagtcc
tgctgctctcaattctgcatcaactatgcgggaggctatgagtgtgcctgcaaagcaggg
ttccagcccagcgccgacggctgcgcctgtgacgatgttgatgaatgtcatcttgataat
ggcaactgtgaccacttctgtgttaattctctggggtcgtacgagtgtgcatgtaaggag
ggttacaggcttggtgccaacaggaggtcctgcatcggtggggaagaggtggatgtggag
gaggccacagggtttgctggaactccagggctgcagttcagaggtccccctcagctcctt
cactatgccctcggtgccctcaacgaagatgaagacccacgaggagagctcaccctggtg
cacagggtcgtttgccttgataacacgtttggcaatgactgtagcttgagctgtgaggat
tgtctgaacggaggcagctgcaacagtgaacgcagtggctgtgtttgcccacccggatgg
actggaattatctgtaatgaaacttgctcccccgggacatatggcagaggctgtgccagc
atttgcaagtgccagaatggaggttcctgtgaccccatcacagggcagtgccactgcccg
cccggcgtgcatggcaagctctgtgaggatggttgcccaaaaggattctttgggaagaac
tgtgacaaaccttgcaactgtgccaacaacggctactgccacagactctatggagcctgc
ctgtgtgaccctgggctctatgggcgcttctgccacctcacctgtcccaggtgggctttc
ggagctggctgctcagaggagtgtcagtgcgtgaaggagcagacgctggaatgcagcgcc
aggaatgggacctgcacctgcaagcctggttatcatggcaagaagtgtcagaaagagtgc
ttgcctggcttttatggagctggttgcaagctgaggtgcagctgtcctcctgatgctttg
tgcgatcatgagacgggagcctgcaagcatctgtgtccacctgggtttcatggagaaaaa
tgctatttgtcttgtcagcctgggagctttggggtgaactgccagcagaggtgcagctgt
ggagaagcaccgtgccacccgaagacagggcagtgtctttgcccagctgggaagactggt
gctacatgtgagcaagattgcccagtgggatggtggggaccagactgccagtcctcctgt
gagccctgcaccaatggaggccaatgcaacaaagaaactggagcctgtgactgcccccct
ggctacactgggccatcctgctccgcatgatgccccgagggaagctttggcctgagctgc
gagggcagctgtcagtgccagaacggagctgcctgcgaccacgtgagtggagcctgtact
tgcacagcaggatggacaggaaccttttgtgaaagagcttgtccagatggattctttggg
ctcgactgccaccaggtgtgcaagtgcaagaatgctgctggctgcgaccacatcctggga
acctgccgctgcctccccggctggctgggagagacctgcgagcagccctaccaaggggac
agctatgggccaggctgcagtcctctttgtcactgtcacagcagagctcactgtcgtcat
gtaagtgggatgtgcctttgtagtccagggtaccaggaagcctgtccacatggatggtat
ggtgcaaactgtcagcagctctgtgtctgccatggccaagcaacgtgtcacagtgtgaca
ggagagtgccgctgtccccagggccggatggggatagcgtgtgagctggagtgtggtgac
aggagatttggagagggctgtgagcagaactgtagctgtcaccatggagtttgtgacctg
cactccgggaaatgcatctgccacaacggctggactggggaccgctgtgatgttgtctgt
cccccaggatttttcggcgagcgctgtgaggagcaatgtgactgcttgcatgccttgtcc
tgccaccatcaaactggagcatgtcactgtgaaaagggatggcgagggaggcactgtgac
aaaccttgcttgcctggccgctatggcacagggtgtgcccagcggtgccggtgtccagct
ggtgtcccctgccatcacctgacaggtcactgtggctgtcctccaggattcactggctac
ggctgccagaaaacttgtccaccaggcacgtatggtgagaactgtaaccgagtgtgtcag
tgctctgctgagaatgaagagtgtcacccagtgaccggcgtctgtgcatgccgccccggg
taccatggggcccgctgccatctccgatgtccaaaaggtacttatggttccaactgccaa
aacctctgcaagtgcatgaatggaggccactgcgaccccgcagcagggacttgcgattgc
gcgcctggcttcatcggagccgactgcagtcaaacttgccctgaaaaccgatacgggaag
gactgcacccagttgtgtgcctgtggtaaaggtcagtgtgacccacggactggcaagtgt
acctgtcctcctggccaaatgggacctggctgtcagcaagtgtgtccccagggacaatat
ggccccaactgccacctaacatgtacctgtcagaatggtggcatctgtgaccacgtggat
ggcaactgcacctgtgggcttggctggacaggaagatggtgtgagaaagaatgtcttcca
gggaagtacgggtcaggctgcagattggactgtgtgtgccagcacaacggcacctgcgac
aggttcacaggctgctgccagtgtccccagggttactacggccactcctgcgagcacaga
tgtccccttggattttatgggctcaactgtcttcatgcgtgtgcctgtgaaaatggagcg
agctgcgatgcagtgacaggacagtgcctttgtcctttgggctatcaaggtgtccactgt
gaaaaaggctgtgacaaggggtggtttggagagagatgccagcaccggtgtgactgtggg
gatgctccttgtgacccagaaactggaaagtgcctttgcccacctgggaagactggagac
aaatgtgacattgcaatgatttccattctgggaacttcttcaggacagctgggctacagt
ttgggcagaccatgtgacagatgaaacttgaagactgcaaggctttccagaatgtcatct
ttcaatgttcacagatgtaattgtctaagcggtttcctgatcccagtgaactacgaggga
acanttaacgcacttccaaacacttctgtccttccagaatgcaggtcggaccggtatggc
cccaactgctccctgcgatgccagtgtgccagcaaatcccagtgcaatccatacaatggc
aactgtgtatgcccagccacgtggatggggccaacctgcaaagaaggtggccccccgaag
cttcctttttatgaagagcaaactcaagaaagagggaatatttttccaagagctctacaa
cagtaa
DBGET
integrated database retrieval system