| Entry |
|
|---|
| Name |
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)
|
|---|
| Organism |
dsa Maridesulfovibrio salexigens
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
1669697..1672513
|
|---|
| AA seq |
938 aa
MSENTTASKSSLLKFKKGERSISRDLAACLVFALAIIIGLVTAYEYIGRSKMLRQEYEDK
ADNYIEQLAKSVTFPIWNFDMGSLKHVCSAYTQNEQFAKLKIVDMNGEVLFNFVRPGDKD
DNPIVRVRDLYISKEKIGSIRMELSSRIYRRNLDWILFVSSLTFLTSVAVIYIITGFLMD
YFIRNPIARLRKGMDKVAMGDFSYRFDEFQYIELLEIGSRFNRMTEEIASRESRLEEVNK
VLQGEILMREKAARSLVKSEKRYRALVETTAEGFFMIDESSILLDVNPAFCTMIGLTREE
VLGGDIGAILGDTAAERFRNNEGHSHKFELSFVNSNGREVDIFINATNLFESDNVKLTFA
FVTDVSGYKMMEKALRASEEEYRTIAEYTFDWEMWIGPTGAVKYVSPSCERISGYPKAYF
MEGPVRVEHILHKNDREFWQKALRGTFPSADGTDMRLFRRDGLLRWVSLTGHQVFADDGT
SLGLRISLRDITKRKFMEKQLQYEALHDPLTGLANRTLCCDRILQAVERSRRRDNYYFAV
VFMDLDRFKIINDSLGHNIGDKLLVEVSKRLLQTIRELDTVSRFGGDEFIVVLEELASPR
EGIRIVRRIRDCLNDPIMIEGHKINIAASYGVLLSPTEYDKPEEIIQNANVAMHQAKESG
RDRIKVFNKRMLEEAVQAMQLESDLRAAMLSGDELYLDYQPIYSLQSQSVVGFEALIRWE
HPRRGLVMPGEFIPMAEESGLIFELGSWVVSEACRQMKSWQVNYDSASEMMMSINISPRQ
FSQPALVDNILSKLSEFDLPARNLKIEITETAIMERAKQSVDMLNRLKSAGVLVSIDDFG
TGYSSMSNLQEFPLDQLKIDLSFVRKMNESTENLEIVRAIVNLAHNLGLNVVAEGVEEIE
QQDALRDLGCEFGQGYLFSKPISRSKVEAFFKNEIKLS |
|---|
| NT seq |
2817 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgtctgagaatacgaccgcttcaaaaagttcattattgaaattcaaaaaaggtgaaaga
tcaatatcccgtgatctggctgcctgccttgtttttgcgcttgccattattatcggcttg
gtaacggcgtatgaatacattggccgttctaaaatgttgcgtcaggaatatgaggataaa
gctgataactatattgaacagttagctaaatcagttacttttcctatctggaacttcgat
atgggctcacttaagcatgtctgtagtgcttatacccagaatgaacagttcgccaagctc
aagattgttgatatgaacggtgaggtgttgttcaactttgtgcgccccggcgataaagat
gacaaccctattgtccgtgttcgtgatctgtatatatccaaggaaaaaatcggttccatc
cgcatggagctcagcagcaggatctaccgtcgcaatctcgactggattctgtttgtatcc
agtttgacttttcttacctcggttgcggtcatctatataatcaccggttttctcatggat
tattttatccgaaatccaatagcacgcttgcgtaaagggatggataaggttgccatgggg
gacttttcataccgtttcgatgaatttcagtacatagaattgctggagatcggttctcgg
ttcaaccgtatgaccgaagagatcgccagtcgtgaaagcaggcttgaggaagtgaataag
gtcttgcagggtgaaatacttatgcgtgaaaaagccgcccgttcacttgttaagagtgaa
aaacgctaccgtgcgttggtggaaactaccgctgaaggttttttcatgattgatgaatct
tcaattctgcttgatgtgaaccctgccttttgcaccatgattggccttacacgcgaagaa
gttcttggtggagatattggagcaattctaggagatactgcagcggaaaggtttcgtaac
aacgaagggcattcccacaagtttgaactcagttttgttaatagtaacggacgtgaagtt
gatatctttatcaatgctaccaatctttttgaaagtgacaatgtaaaactgacttttgca
tttgttactgatgtttccggctacaaaatgatggaaaaggccctgcgtgcttccgaagag
gaatacaggaccattgccgaatatacatttgactgggaaatgtggatcgggcctaccgga
gcagtcaaatatgtaagtccttcatgtgagcgcatttccggttaccccaaagcgtatttt
atggaaggtccggtcagggtagagcatattctacacaagaatgaccgggaattctggcaa
aaggccttacgtggaacatttccttctgctgatggtacggatatgcgtcttttccgtagg
gacgggctgttgcgctgggtttctcttaccgggcatcaggtctttgctgatgacggtact
tcgctcggcttaagaatttcattgcgtgatattacaaaacgcaagtttatggaaaagcag
cttcagtacgaagctctgcatgatccgcttaccggactcgccaaccgaaccttgtgttgt
gatcgaattcttcaggctgttgagcgctcccgccgtcgcgataattattattttgctgtt
gtttttatggatttggatcgcttcaagatcattaatgacagcctcgggcacaatattggc
gataaattgctggtggaagtttccaaacggttgctccaaaccattcgcgaactggatact
gtatcccggttcggtggcgatgagtttattgtagtgctggaggaacttgcttccccgcgt
gaaggtatccgaattgtgcgtcgcataagggattgcttgaatgatcctattatgatcgaa
gggcataaaatcaatattgcggccagttacggagttttgctcagccctactgagtatgac
aagcccgaagaaattatccagaatgccaacgttgccatgcatcaggctaaagagtcgggc
agagacaggatcaaggtctttaataaaagaatgctggaagaggctgttcaggctatgcag
cttgagagtgatcttcgggcggcaatgctttccggcgatgaactttatctggattaccag
cctatttattctctgcaaagccaaagcgttgttggcttcgaagccttaatccgttgggag
catcctcgtcgcggtctggttatgcccggtgaatttatacctatggcagaggagtccggc
cttattttcgaacttggcagttgggttgtcagtgaagcttgtcgtcagatgaaaagttgg
caggttaattacgactccgcttctgagatgatgatgtccattaatatctccccgcggcag
ttttcacagcctgcacttgtagataatattctttcaaagctgagcgaatttgatcttcct
gcccgtaatttaaaaattgaaattactgaaacggcaatcatggagcgcgccaagcagtca
gtggatatgcttaacaggcttaaatccgccggtgttctggtttccatcgatgattttgga
acaggttattcctcaatgagtaatttgcaggaatttccgcttgatcaactgaagatagat
ctcagttttgtgcgtaaaatgaatgagtccaccgagaaccttgagattgtccgcgcaata
gttaaccttgctcacaaccttggtttgaacgttgttgccgaaggtgtggaagagattgag
cagcaagacgctttgcgtgatctcggttgtgaattcgggcagggttacttattttctaaa
cctatcagccgcagcaaagttgaagctttttttaagaatgagattaagctgagttaa |
|---|
