Drosophila sechellia: 6620115
Help
Entry
6620115 CDS
T01064
Name
(RefSeq) glutamate receptor ionotropic, kainate 2 isoform X1
KO
K05313
glutamate receptor, ionotropic, invertebrate
Organism
dse
Drosophila sechellia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dse00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
dse04040
]
6620115
Ion channels [BR:
dse04040
]
Ligand-gated channels
Glutamate (ionotropic)
6620115
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lig_chan
ANF_receptor
Lig_chan-Glu_bd
SBP_bac_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
6620115
NCBI-ProteinID:
XP_002044327
UniProt:
B4IKR7
LinkDB
All DBs
Position
4:1123211..1134424
Genome browser
AA seq
1073 aa
AA seq
DB search
MVRKKRETIIKKNIQGRSYLKKICFSYIILSIFVIANALPPVIRVGAIFTEDERESSIES
AFKYAIYRINKEKSLLPNTQLVYDIEYVPRDDSFRTTKKVCSQLEAGVQAIFGPTDALLA
SHVQSICEAYDIPHIEGRIDLEYKSKEFSINLYPSHTLLTLAYRDIMAYLNWTKVAIIYE
EDYGLFNLMHSTTETKAEMYIRQASPDSYRQVLRAIRQKEIYKIIVDTNPSHIKSFFRSI
LQLQMNDHRYHYMFTTFDLETYDLEDFRYNSVNITAFRLVDVDSKRYLEVINQMQKLQHN
GLNIINGIPYIQTESALMFDSVYAFANGLHFLNLDNHQNFYIKNLSCTSDQTWNDGISLY
NQINAAITDGLTGTVHFMEGRRNIFKLDILKLKQEKIQKVGYWHPDDGVNISDPTAFYDS
NIANITLVVMTREERPYVMVKEDKNLTGNLRFEGFCIDLLKAIATQVGFQYKIELVPDNM
YGVYIPETNSWNGIVQELMERRADLAVASMTINYARESVIDFTKPFMNLGIGILFKVPTS
QPTRLFSFMNPLAIEIWLYVLAAYILVSFALFVMARFSPYEWKNPHPCYKDTDIVENQFS
ILNSFWFITGTFLRQGSGLNPKISDRAQTKFFSFIAPFAIEIWFYIAFGYIFVSVSIWIV
ARLSPIEWVISKPPCSMACEHILREIQKENYFDESLELINKQKIPENEVYSTEHKIKKSN
NYVEHDDTTCGHGTLPLQLPNDVNEEASDDNTVDLVRIQNNFTLKNSFWFAIGALMQQGS
DLYPRATSTRIVGGCWFFFCLIIISSYTANLAAFLTVERMISPIESASDLAEQTEISYGT
LEGGSTMTFFRDSKIGIYQKMWRYMENRKTAVFVKTYEDGIKRVIEGSYAFLMESTMLDY
AVQRDCNLTQIGGLLDSKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGIIQILYDKWWKNTGD
VCNRDDKSKESKANALGVENIGGVFVVLLCGLALAVVVAIFEFCWNSRKNLNTENQSLCS
EMAEELRFAMHCHGSKSKHRPRKRNCLNCSSVPTYVPSNVSTSSVGVYYNYFN
NT seq
3222 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtacgaaaaaaacgggaaaccataataaagaaaaatattcaaggacgaagttacctt
aaaaaaatatgtttttcgtatataatattgtccatattcgtaattgctaatgccttgccc
ccagtaatacgcgtaggtgccatatttacggaagatgaacgtgaaagcagtattgaatcg
gcatttaaatacgcaatataccgtattaataaggaaaagagtcttcttcccaatacccaa
ttggtttacgatattgagtatgtgccccgagatgactcgtttcgcactacgaaaaaggtt
tgcagccagttggaagcaggtgttcaagcaatttttggaccaacagatgctcttctagct
agtcatgtacaatccatatgcgaagcatatgatataccccatattgaaggtcgaattgac
ctcgaatataagtctaaagaattttctataaatttatatccgtcgcatacgctcttaact
ctagcatatagagatataatggcgtatttgaactggacgaaggtggcaataatttatgaa
gaagattatggtctatttaatttgatgcactcaacaactgagacgaaagcggaaatgtat
ataaggcaagcgagtccggattcctaccgtcaagttctgcgagcgatacgccaaaaggaa
atttacaaaataatagtggatacaaacccatcccatataaaatcgttttttagatccatt
ttgcaactacaaatgaatgaccatcgttaccattatatgtttacaacattcgacttggag
acatatgatctggaagatttcagatataacagcgtaaatataactgcatttcggctggta
gatgtcgatagcaaaagatatctcgaagtaattaatcaaatgcagaaattacaacacaat
ggattgaacattataaatggaattccttatatacagacggagtccgcattaatgtttgat
tcggtgtacgcgtttgcgaatggactgcactttctaaatttagataatcaccaaaatttt
tatatcaaaaacctatcctgcacctccgaccaaacctggaatgatggaatttcgttgtat
aaccaaataaatgcagccatcacagacggactgactggcactgtccattttatggaaggt
cggcgaaacatatttaagcttgatattcttaaactaaagcaagaaaaaattcaaaaggtt
ggatattggcatcccgacgacggtgttaacatttcggatccaacggcattctacgattca
aatatcgcaaatattaccttggtcgttatgactagagaggagcggccgtatgttatggtt
aaagaagacaaaaatctaactggaaatttaaggtttgaaggattttgtattgatctttta
aaagcaatcgccacacaagttgggtttcaatataaaattgaattagttcccgataatatg
tacggcgtttacataccagagactaattcatggaatggaatcgtgcaggaattaatggaa
aggcgtgctgatcttgctgtagcgtcaatgacaattaattatgctcgggaaagtgttatc
gactttacaaagccatttatgaacttgggcattggcatattattcaaggtgccgacaagt
caaccaacacgactgttctcctttatgaaccctttggcaatcgagatatggctttatgtg
ctagctgcatacatattagtttctttcgcgctctttgtaatggctcgattctctccatat
gagtggaaaaacccccatccatgctacaaggatacggatatagtggaaaatcagttttct
atattaaacagtttttggtttataacaggaacattcttacgccaaggatctggacttaat
ccgaagatatcagaccgagctcaaacgaaatttttctccttcattgctccattcgctatt
gaaatttggttttatattgctttcggatacatttttgtatcagtatccatttggattgtg
gctcgattatcaccgatcgaatgggttatttcaaagccaccatgttcaatggcttgtgaa
catatattgcgcgaaattcaaaaagaaaattactttgacgaaagcctggagcttataaac
aaacaaaaaatcccagaaaacgaagtatatagtacagaacataaaataaaaaagtccaac
aattatgttgaacatgatgatactacttgtggacatggtactttacctttacaactacct
aatgatgttaatgaagaagcgtcggatgataatacggtggatttagttcgaatccaaaac
aattttaccttaaaaaatagtttttggtttgccattggggctcttatgcaacaaggttct
gacttatatcctagggcaacctcgacgcgtattgttggcggatgctggttctttttttgc
ctaatcattatatcttcatacactgccaacctagctgcatttctaacagttgaacggatg
atttcccccattgaaagcgcttctgatttggcagagcaaaccgaaatatcatatggaact
ttggagggtggatcgacaatgacattttttagggattcaaaaattggtatatatcaaaaa
atgtggcgttatatggaaaaccgtaaaacagctgtatttgtcaaaacctatgaagacgga
attaaacgagtaatagaaggaagctatgcttttttgatggaatcgacaatgctagactat
gctgttcaacgtgattgtaatctgacccaaataggaggccttcttgattctaaaggttat
ggtatcgcaacgccaaaaggctctccatggagagataaaatttcacttgctattttagag
ctacaagaaaagggtattattcaaatattatatgacaaatggtggaaaaatacaggtgac
gtttgcaacagagatgataagagcaaggagtccaaagccaatgcacttggagtagaaaat
attggtggcgtgtttgttgttctcctttgtggacttgcgcttgcagttgttgtggcaata
tttgagttttgctggaattccagaaaaaatttaaatactgaaaatcaatctctgtgttca
gaaatggctgaggaactacgttttgcaatgcactgccatggttcaaaatcaaaacatagg
ccgcgaaaacgtaattgccttaattgttcgtctgtaccaacatacgtgccaagtaatgtg
agcacgtcaagtgtgggcgtttactataattattttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system