Dyella terrae: DYST_03336
Help
Entry
DYST_03336 CDS
T08348
Name
(GenBank) Extended Signal Peptide of Type V secretion system
Organism
dta
Dyella terrae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ESPR
YadA_stalk
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ULU26390
LinkDB
All DBs
Position
3697218..3702569
Genome browser
AA seq
1783 aa
AA seq
DB search
MTRAGKAHMDLYAQTHNVHCAGQEGTLQMNRIYRLVWSESRHSWVPASELSVQRRRMSRQ
VGFMPSARALLVGGLALCALAYHPASHAESADDAKLNDLMGLAAKYDHPASQATAPVAVS
ASVQPLLNRVAVTLPGDNDVAPSSSSTPSAHRSKGVVASVRARVGIPIVPTSQQIGSGVT
IPADLKSRVGAMSGGADVAALGQGVVSAVLPSNNDVADRNRSVTLAEHANVTSSLVDKNA
HAALGADGLVHLGTPAAAPVDPLVASLAPVDATVGARAAVLASNGDLVDAHAHIGVAVPV
LSSTPLVNANVNLHVGGQLVSSLEPVLQPITGSLGAGNLGGVVGKLPATVDGVSGAVNGI
VGGVTAGTPLAGVTGSVLPPVESTLHNVATTLAGTATGSGAGLGGVLGSNGLVSTLPATV
DGVNHAVNSVVGGVTAGTPLAGVTGSVLPPVESTLHNVATALAGTTTGSGGGLGGVLGSS
GLVSTLPATVDGVNHAVNSVVGGVTAGTPLAGVTGSVLPPVESTLHNVATALAGTTTGSG
AGLGGVLGSSGLISTLPATVDGVNHAVNSVVGGVTAGTPLAGVTGSVLPPVESTLHNVAT
ALAGTTTGSGAGLGGVLGSSGLISTLPATVDGVNHAVNSVVGGVTAGTPLAGVTGSVLPP
VESTLHNVATALAGTTTGSGAGLGGVLGSSGLISTLPATVDGVNGAVNSVVGGVTAGTPL
ASVTGSVLPPVESTLHNVATTLAGATTGSGAGLGGLGGVLGTGNGLGGVVSGVVTTVNGV
LSGVAGVGSGSGLGGLGGVLGAGNGLGGLVSGVTSTVGSVLNPGTGGAGIGNLGGVVSGL
TSTVGSVLNPGTGGGLGGVLGSGNGLGGVVTGVTNTVTGVVGGVTAGTPLAGTVSGVVQP
VVTTVNGVLGGVGSGGGLGGVLGSGNGLGGVVTGVTNTVTGVVGGVTAGTPLAGTVSGVV
QPVVATVNGVLGGVGTGGGLGGVLGSGNGLGGVVTGVTNTVTGVVGGVTAGTPLAGTVSG
VVQPVVATVNGVLGGVGTGGGLGGVLGSGNGLGGVVTGVTNTVTGVVGGVTAGTPLGGTV
SGVVQPVVTTVTGVLSGVGSGGGLGGVLGSGNGLGGVVSGVTSTVGSVLNQGTGNSGGLG
NVGGLVSNLPATVTGVTNTVTGVVGGVTAGTPLAGTVSGVVKPVVSTVNGVLSGVGSGGG
LGGVLGSGNGLGGVVSGLTSTVGSVLNPAAGGAGAGNLGGVLSGLTTTVGSVLNPGTSGG
GLGGILGSNGSSLGKVVPDLGKTVGAVTSTVGAVLAQPNGTGLTNVLGQDGTASSLLGNL
TNTVADTVNSVPGVQLGQTGNGLTSGQNLIGAIPGASNLLDKALPGVASLLGVTPAISGT
GGSGTGTGAAGVPVVPAPSATPTGLIVGNGGVVGTAGQLLGSTTNALFNNTNGYVTNGGL
QVNAANFTQGYSVTSVLGIPVVNGTPVGTVLTTVGGAALGGTGSNSHLTLIGAVSSDSYI
TNINNGAPGGLLGLALPNSAPAWASTCANVLGVVKTSCWAVNAAQDYQVLMGDGATANGS
KEVVIGTNASHTLPAETAAAAFPGAGTNDPNNPTGVPTDDYAARLGHSVVIGDSASGTAN
AQTIIGAQATASVANSVALGYASSATRGAQTGYTAYGLSTLQNSAGEVSIGSPGQERQIT
NVAAGSAATDAVNLAQLQAVSFAAGNAVQYDDATHNTVTLRQHRQHQRRRHGRHHVEQPA
PGRHQRHQHAGDQRCAAVELDAEHRQRLQQLQPVQRYPEHQTR
NT seq
5352 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgcgcgccggcaaagctcacatggacctgtatgcgcagacacacaacgtgcactgc
gccggccaagaggggacacttcaaatgaaccgtatctatcgtctcgtatggtccgaatca
cggcactcatgggtgcctgcgtcggaactctccgtgcaacgccgtcgcatgtcgcgccaa
gtgggctttatgccctcggcgcgcgccctgctggtgggcggcctggcgctttgcgcgctg
gcataccacccagcctcgcatgcggaaagcgcggatgacgccaagctcaacgatctcatg
ggtctggcggccaagtacgatcatcctgcgtcgcaagccaccgctcccgtggccgtgagt
gccagcgtgcagccgctgttgaatcgcgtggcggtgacgctacccggcgataacgatgtc
gcgccgtcttcgtcttccacgccatccgcacatcgcagcaagggtgtcgtggccagtgtg
cgtgcacgcgtgggcattcctatcgtgccgaccagtcagcagatcggctcgggcgtcacc
attcccgctgacctgaagtcgcgcgtgggtgcgatgtctggcggagccgacgtggctgca
ctggggcagggcgtggtgtctgcggtgcttccctccaataacgatgtcgcggatcgcaat
cgctccgtgacattggcggagcatgccaacgtcaccagttcactggtcgataagaatgcg
catgcagcgctgggcgccgatgggcttgtccatcttggtacgcccgctgctgctcccgtg
gacccgttagttgcgtccctggcgccggtggatgccactgttggtgcgcgtgctgcggtg
ctcgccagcaacggcgatctcgttgacgctcacgcgcacatcggcgttgccgtgccggtg
ttgtccagcacgccgctggtgaacgccaacgttaacctgcatgtcggtgggcaactcgtt
tcgtcgctcgaacctgtgttgcagccgatcaccggcagcctgggtgcaggcaacctgggt
ggcgttgtgggcaagctgcccgcgacggtggatggcgtcagtggtgccgtgaacggcatc
gtcggtggcgtcaccgcgggtactccgctcgctggcgtgacgggctccgtgttgccgccg
gtggaatccaccttgcacaacgtggcaaccacgttggcgggtacggcgacgggatcgggc
gctggtctcggtggtgtgttgggttcaaatgggttggtatccacgctgcccgccaccgtc
gatggcgtgaatcacgccgtgaacagcgtggttggcggtgttaccgccggcacgccgctc
gccggtgtcaccggttcggtgttgccgccagtcgaatcgacgctgcacaacgtggcgacc
gcgttggcaggtacgacgacaggatcgggtggcggcctcggtggtgtgctgggttcgagc
ggtctggtatcgacactgcccgccaccgtcgatggtgtgaatcacgccgtgaacagcgtg
gttggcggtgtcaccgccggaacaccgctcgccggtgtcaccggttcggtgttgccgcca
gtcgaatcgacgctgcacaacgtggcaaccgcgttggcaggcacgaccacgggatcaggt
gcaggtctgggtggtgtgctgggttcgagtggcctgatatccacgctgcccgccacggtg
gatggcgtgaatcacgcagtgaacagtgtagttggcggcgtaaccgccggtaccccgctc
gctggtgtcacgggttcggtgttgccgccagtcgaatcgacgctgcacaacgtggcaacc
gcattggcaggcacgaccacgggctcgggtgcaggtctgggcggcgtgctgggatcgagt
ggcctgatatccacgctgcctgccacggtggatggcgtgaatcacgcagtgaacagtgta
gttggcggcgtaaccgccggtaccccgctcgctggtgtcacgggttcggtgttgccgcca
gtcgaatcgacgctgcacaacgtggcaaccgcattggcaggcacgaccacgggctcgggt
gcaggtctgggcggcgtgctgggatcgagtggcttgatatccacgctgcctgccacggtg
gatggcgtgaacggcgcagtgaacagcgtggtcggtggcgttactgccggtacgccgctc
gcgagtgtcacgggttcggtgctgccgccggtggaatcgacgctgcacaacgtggcgacc
acattggcaggtgcaaccacgggatcgggtgccggccttggcggcctgggtggcgtgctc
ggtacgggtaacggcctgggtggtgtggtgtccggtgtcgtcaccaccgtcaacggtgtc
ctgagtggcgtagcgggcgtgggttcgggcagcggcctgggcggtcttggtggcgtgctg
ggcgcgggcaacggcctgggtggtcttgtgtcgggcgtgacgtcgacggtgggtagcgtg
ctgaatcctggcaccggcggtgcgggcatcggcaaccttggcggcgtggtatcgggcctc
acctcgacggtcggcagcgtgctgaatcctgggacgggtggcggcctcggtggcgtgctc
ggctcgggcaacggattgggtggcgtcgtaacgggcgtgacgaacacggtgacgggtgtg
gtcggcggtgtcactgctggcaccccgctagccggcacggtgtctggtgtggtgcagcct
gtcgtaaccacggtcaacggtgtgctcggtggcgtgggttcgggcggtggcctcggcggt
gtgctcggctcaggcaatggattgggtggcgtcgtcacgggcgtgacgaacacggtgacg
ggtgtggtcggcggtgtcactgctggcaccccgctagccggcacggtgtctggtgtggtg
caacccgtggttgccaccgttaacggcgtgctcggtggcgtggggacgggtggcggcctc
ggcggcgtgctcggctcaggcaatggattgggtggcgtcgtcacgggtgtgacaaacacg
gtgacgggcgtggtcggtggtgtcactgctggcacaccactcgccggcacggtgtccggt
gtggtgcaacccgtggttgccaccgttaacggcgtgctcggtggcgtggggacgggtggc
ggcctcggcggcgtgctcggctcaggcaatggattgggtggcgtcgtcacgggtgtgaca
aacacggtgacgggcgtggtcggtggtgtcaccgctggcactccgctaggcggcacggtg
tctggcgtggtgcagcctgtcgttaccacggtgaccggcgtgctgagtggcgtgggttcg
ggcggcggccttggtggcgtgctcggctcgggcaatggattgggtggcgttgtgtcgggc
gtgacgtcgaccgtcggcagcgtgttgaatcaggggacgggtaatagcggcggcctcggc
aacgtgggcggccttgtgtccaacctgccggcgacggtgacgggggtgacgaatacggtg
accggtgtggtcggcggtgtcaccgccggtacgccactcgccggcaccgtgtccggtgta
gtgaagccggtggtgtccacggtcaacggtgtgctcagtggcgtgggttcgggtggcggc
ctcggcggcgtgctcggctccggcaatggattgggtggcgtcgtgtccggcctgacctcg
acggtaggcagcgtgctgaatccggccgcgggcggtgcgggcgctggcaacctcggtggc
gtgctatccggcctcaccacaacggtcggcagtgtgttgaatcccggcacatccggtggc
ggcttgggtggcatcctgggttcgaatggttcgtcgcttggcaaagtcgtgcccgacctg
ggcaagaccgtcggcgctgtgacctctaccgtgggcgcggtactcgcgcagcccaacggc
acggggctgacgaatgtgcttggccaggacggcacggcgtcttcgctgctcggcaatctc
accaataccgtggctgacacggtgaatagcgtgccgggcgtgcagctgggtcagacgggt
aacggcctcacctctgggcagaacctgatcggcgctattccgggcgcatcgaacctgctc
gacaaggcgctgccaggcgtagcgtcgctgctcggcgtaacgcctgcgatttcaggcacg
ggtggttctggcacgggtaccggcgcggccggtgtgccggtggtgcccgctccgtcggca
acgcccaccggtctcatcgtcggcaacggcggcgtcgtgggtacagccggccagttgctg
ggcagcaccaccaatgcgctgttcaacaacactaacggctacgtgaccaacggcggcctg
caggtgaatgcggccaacttcacgcagggttattcggtaaccagcgtgctgggtattccg
gtggtgaatggaacgccagtgggcacggtactcaccacggtgggtggtgccgcgttgggc
ggcaccggcagcaactcgcatctgacgctgatcggcgcggtgtcgtcggacagctacatc
accaacatcaacaatggcgcaccgggtggcctgcttgggctggccttgccgaacagcgcg
ccggcctgggcctcgacctgcgccaacgtgctcggcgtggtgaagacctcctgctgggcg
gtaaatgcggcgcaggactatcaggtgctgatgggcgacggcgccaccgccaatggttcg
aaggaagtggtgatcggcaccaacgccagccacaccttgccggccgagacggcggcggct
gccttcccgggcgctggcaccaacgacccgaacaacccgaccggcgtacccacggacgac
tacgcagcacgcttgggccattccgtggtgatcggcgacagcgccagcggcacggcgaat
gcgcagaccatcatcggcgcacaggcaacggcctcggtggccaacagcgtggcgctgggt
tatgcctccagcgcaacacgcggcgcgcagaccggttacaccgcttacggtctgagcacg
ctgcagaattccgcaggcgaagtgtcgatcggttcgccgggccaggagcgtcagatcacc
aacgttgccgcaggtagtgcggcgaccgatgcggtcaacctcgcgcaattgcaagcggtg
tcgttcgcggcgggcaacgccgtgcagtacgacgatgccacgcacaacaccgtcaccctg
agacagcaccgccagcaccaacggcggcgtcacgggcggcaccacgttgagcaacctgca
ccagggcgccatcagcgccaccagcacgcaggcgatcaacggtgcgcagctgtggaactg
gacgcagaacaccggcaacgtctacagcaactacagcctgtacaacgctatccagaacat
caaacccggtag
DBGET
integrated database retrieval system
