KEGG   Dendrobates tinctorius (dyeing poison frog): 141091247
Entry
141091247         CDS       T11000                                 
Symbol
COL2A1
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(II) chain
  KO
K19719  collagen type II alpha
Organism
dtc  Dendrobates tinctorius (dyeing poison frog)
Pathway
dtc04510  Focal adhesion
dtc04512  ECM-receptor interaction
dtc04518  Integrin signaling
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:dtc00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    141091247 (COL2A1)
   04518 Integrin signaling
    141091247 (COL2A1)
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    141091247 (COL2A1)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:dtc00536]
    141091247 (COL2A1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:dtc00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   141091247 (COL2A1)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI VWC VWC2L_2nd TILa
Other DBs
NCBI-GeneID: 141091247
NCBI-ProteinID: XP_073432783
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1491 aa
MFNFVDSRTLVLFAAIQAILLAVVRCQGEDILDAGSCVQDGQRYSDKDVWKPEPCQICVC
DTGTILCDEIICEENKDCPNAEIPFGECCPICPTEPSSTTSGQSGIKGQKGEPGDIKDVL
GPRGPPGPQGPSGEQGPRGDRGDKGEKGSPGPRGRDGEPGTPGNPGPVGPAGPAGPPGLG
GNFAAQMTGGFDEKAGGAQMGVMQGPMGPMGPRGPPGPTGSPGPQGFQGNPGEPGEPGAA
GPMGPRGPPGPSGKPGDDGEAGKPGKSGERGPPGPQGARGFPGTPGLPGVKGHRGYPGLD
GTKGESGAAGAKGEGGAPGEAGAPGPMGPRGLPGERGRPGASGAAGARGNDGLPGPAGPP
GPVGPAGAPGFPGSPGSKGEAGPTGARGPEGAQGSRGESGTPGSPGPSGSPGNPGTDGIP
GAKGSTGGPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPLGPKGQTGDPGIAGFKGEQGPKGELGPS
GPQGAPGPAGEEGKRGARGEPGAAGPLGPPGERGAPGNRGFPGQDGLAGPKGAPGDRGVP
GLGGPKGGNGDPGRPGEPGLPGARGLTGRPGDAGPQGKVGATGASGEDGRPGPPGPQGAR
GQPGVMGFPGPKGANGEAGKPGEKGLVGAPGLRGLPGKDGETGSQGPNGPAGPAGERGEQ
GAPGPSGFQGLPGPPGPPGEGGKPGDQGVPGEGGAPGLVGPRGERGFPGERGSSGPQGLQ
GPRGIPGTPGTDGPKGASGPTGPNGAQGPPGLQGMPGERGASGISGPKGDRGDTGEKGPE
GASGKDGSRGLTGPIGPPGPSGPNGEKGESGPPGAVGIVGARGAPGDRGETGPPGPAGFA
GPPGADGQAGIKGEQGESGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVNGPKGARGAQGPAGAT
GFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGGAGKDGPKGARGDGGPPGRAGDPGLQGPAGAPGEK
GEPGEDGPNGPDGPPGPQGLAGQRGIVGLPGQRGERGFPGLPGPSGEPGKQGGPGGAGDR
GPPGPVGPPGLTGPSGEPGREGNPGSDGPPGRDGSVGVKGDRGETGPLGAPGAPGSPGAP
GPVGPTGKQGDRGESGSQGPLGPSGPAGARGLPGPQGPRGDKGEGGEAGERGQKGHRGFT
GLQGLPGPPGTAGDQGATGPGGPSGPRGPPGPVGPSGKDGSNGLPGPIGPPGPRGRGGET
GPAGPPGQPGPPGPPGPPGPGIDMSAFAGLSQPEKGPDPLRYMRADQASSNLRQHDVEVD
ATLKSLNNQIESIRSPDGNKKNPARTCRDLKLCHPDWKSGDYWIDPNQGCTVDAIKVFCN
METGETCVYPNPTKIPKKNWWTSKTKDKKHIWFGETINGGFQFSYGEDSSAPNTASIQMT
FLRLLSTDASQNITYHCKNSIAFMEEASGNLKKALLLQGSNDVEIRAEGNSRFTYTALED
GCKKHTGKWGKTVIEYRTQKTSRLPIVDIAPMDIGGADQEFGVDIGPVCFL
NT seq 4476 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttaactttgtggattcaaggacactagtgctgttcgcagccatacaagcgatatta
ttagcagttgtaagatgccaaggtgaagacatcctggatgcagggagctgcgtacaggat
gggcagagatatagtgacaaagatgtgtggaaaccagaaccctgccaaatctgtgtctgt
gacactgggactattctgtgcgacgagataatctgcgaggaaaataaagactgccccaat
gctgaaatcccctttggagagtgttgccccatttgcccaactgagccgtcctccaccacc
agtgggcaaagtggaataaagggtcaaaaaggcgaacctggtgatattaaagatgtatta
ggaccaagaggacctccaggaccacagggaccttctggtgaacaagggccaagaggtgat
cgtggtgataaaggtgaaaaaggttcacccggcccccgtggaagagatggcgaacccggt
actcctggaaacccaggacccgttggcccagctggacctgccggaccccctggccttggt
ggaaactttgctgctcagatgacaggaggttttgatgagaaagccggaggcgcacagatg
ggtgttatgcaaggaccaatgggccctatgggacctagaggacctcctggaccaactggc
tctcctggacctcaaggtttccaaggaaatcccggtgaacctggtgaacccggtgctgct
ggccctatgggtccccgtggccctcctggcccctctggaaagcctggtgatgatggtgaa
gctggaaaacctggtaaatctggtgagcgtggacccccaggaccacagggtgctcgagga
ttccctggaaccccaggacttccaggagtaaaaggacacagaggttaccctggtctggat
ggcacaaagggagagtctggtgctgctggtgccaagggtgaaggtggtgctcctggtgag
gctggtgctcctggcccaatgggtccacgtggtctccctggtgagagaggacgtcctgga
gcttctggtgctgctggtgctcgtggtaatgacggtctgcccggtcccgctggcccacct
ggacctgttggcccagctggagctcctggtttccccggttcccctggctctaagggtgaa
gctggtcccactggtgcccgtggtcctgagggggctcaaggttcccggggagagtctgga
acacctggatcacctggaccctctggctctcctggtaaccctggtactgatggtattccc
ggagctaaaggttcaactggtggtcctggtattgctggtgctcctggtttccctggccca
cgtggtccacccgggccacagggtgccactggccctcttggtccaaaaggtcaaacgggt
gaccctggtattgcaggatttaagggtgaacaaggtccaaagggtgaactgggaccatca
ggtcctcagggtgctcctggtccagctggtgaagaaggcaaaagaggcgcccgtggtgag
cctggcgccgctggtccacttggtccacctggtgaaagaggtgctcctggcaatcgtggt
ttccctggtcaagatggtcttgctggtccaaagggtgctcctggtgatcgtggtgtccct
ggtcttggtggtccaaaaggaggtaatggagaccctggtcgtcctggtgaacctggtctc
cctggtgctagaggtctcactggtcgccctggtgatgccggtcctcaaggaaaagttggt
gcaacgggtgcttctggtgaagatggtcgtcctggacctcctggacctcagggtgcccgt
ggtcagcctggcgttatggggttcccaggacctaagggtgccaatggtgaagctggcaag
cctggtgagaaaggattggtcggtgctcccggtctaagaggtctgcccggaaaagatggt
gaaactggttctcaaggtccaaatggtccagctggacctgctggtgagagaggtgaacaa
ggtgctcctggcccatctggcttccagggtcttccaggtcccccaggtcctcctggtgag
ggtggcaaaccaggtgatcagggtgttccaggagaaggtggtgccccaggtcttgttggt
cccagaggtgaacgtggtttccccggagaacgtggctcctcaggtcctcaaggtctccaa
ggtcctcgtggtattcctggtactcctggtactgatggtcctaagggtgctagtggtcca
actggtccaaatggtgctcaaggtccacctggtcttcaaggtatgcctggtgaaagagga
gcatctggtatttcaggacctaaaggtgacagaggtgacactggtgaaaagggtccagaa
ggcgcttccggaaaagatggttctagaggtttgactggtccaattggtccacctggtcct
tctggtcctaatggtgagaagggagaatctggtcctccaggcgcagttggtatcgttggc
gcccgtggtgctcctggtgatcgtggtgaaactggtccacctggccctgctggttttgct
ggtccacctggtgctgatggtcaagctggtatcaagggtgagcagggagaatctggtcag
aaaggtgacgctggtgctcctggtccacaaggcccatctggcgctccgggtccacagggt
ccaactggtgttaatggtcctaaaggagctcgtggtgcccaaggtccagctggtgctact
gggttccctggtgctgctggcagagttggtccacctggctcaaatggaaaccccggtccc
cctggtccacctggtggtgctggaaaagatggacctaagggtgcccgtggtgatggtggt
ccacctggccgtgctggtgatccaggtcttcagggtcctgctggagctcctggtgagaag
ggagagcctggtgaagatggtcctaatggtcctgatggtcctcctggtcctcaaggtttg
gctggacagcgtggtattgttggtttgcctggtcagcgtggtgagagaggtttccctggt
cttcctggaccatctggtgagcctggaaaacaaggaggcccaggaggtgctggtgaccgt
ggaccccctggacctgttggcccacctggcttgactggaccttctggagagcctggacgt
gaaggtaaccctggatctgatggtcctcctggccgtgatggttctgttggtgtaaagggt
gaccgtggtgagaccggccctcttggcgctcctggtgcccccggttcccctggtgctcct
ggccctgttggcccaactggaaaacaaggagacagaggagaatctggttctcaaggtcct
ttgggtccatctggtcctgctggagctcgtggtctgcctggtcctcaaggtcctcgtggt
gacaagggtgagggtggtgaagctggagagagaggacaaaagggacacagaggattcact
ggtcttcagggtcttcccggacctccaggtactgctggtgatcaaggtgctactggtcct
ggcggtccttctggtccaagaggtcctcccggccctgttggtccttctggaaaagacggt
tctaatggtctgcctggtccaattggtccacctggtccccgtggtcgtggtggtgaaact
ggccctgctggtcctcctggtcaacctggtccacctggtcctcctggtccccctggccct
ggcattgacatgtctgcatttgctggactatctcaacctgagaaaggacctgatcctctc
cgttacatgcgtgctgaccaggcctctagtaatcttcgccagcatgatgttgaggttgat
gccactcttaaatcactgaacaaccaaatcgagagcattcgtagcccagatggtaacaag
aagaacccagctcgtacttgccgtgacctgaaactgtgccatcctgactggaagagtggt
gactactggattgatcccaaccagggttgcactgtggatgccattaaagtgttctgtaac
atggaaactggagaaacatgtgtataccccaacccaaccaaaatacccaagaagaactgg
tggacaagcaagaccaaggacaagaagcacatctggtttggagagaccatcaatggtgga
ttccaattcagctatggcgaagacagctctgcacccaatactgccagtatccagatgacc
ttcctgcgcctgttgtctactgatgcatcacagaacatcacctaccactgcaagaacagc
atagctttcatggaagaggcctcaggcaacctgaaaaaggctctcctgctccagggatcc
aatgatgtcgagatcagagctgagggcaacagcagatttacatacaccgccttggaagat
ggctgcaagaaacacactggcaaatggggcaagacagttatagagtacaggacacagaaa
acttcccgcctgcccattgtagacattgcacctatggatattggtggagctgatcaggaa
tttggcgttgacattggcccagtttgcttcttgtaa

DBGET integrated database retrieval system