Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera): 126895620
Help
Entry
126895620 CDS
T09738
Name
(RefSeq) DNA mismatch repair protein Msh6
KO
K08737
DNA mismatch repair protein MSH6
Organism
dvt
Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera)
Pathway
dvt03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dvt00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
126895620
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
dvt03400
]
126895620
DNA repair and recombination proteins [BR:
dvt03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
126895620
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_I
MutS_IV
MutS_II
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126895620
NCBI-ProteinID:
XP_050523673
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1166 aa
AA seq
DB search
MSKNTLFNYFSKSPGTPSSKVKESPKRVETKTPKRSAQREVVTPKNVKDSSKKPKLNKSS
TKKTIEKRRQKHEESDEDEDIQLPKKKKRRLALEEISDDEEDSGDEYIPDKKATVESETE
SEDSVEESDEDSFINDDSDGESPMNKVSKSKPKSIKSNRKLNGKKSFVSNVEKSNKEIIK
GVVDHDNWPHLKLEFLKSDKIRDANRKSPSEPNYNPRTLFVPEDFKQKLTPAVRQWWELK
SQHYDCILFFKVGKFYEMYHMDAVTAAKELNLLYMKGDFAHVGFPESAYGRFSAILVEKG
YKVARIEQTETPDMMLERCKTLKKTTKFDKVVRREICRITTKGTRTFGVIDGETNDPENS
FLIALSEKELSPSSSMYGVCFIDTSIGLFYLGQFEDDCHCSRLRTLCAHYPPVQILFERN
KLSPHTKKVIDTMLSSAIKEALIPEVEFWSSSKTLVTLTEGDYFKKDNNTVYPEKLKEFL
GCDSDFQLNANDACDLGIKSLGAVIWYLKQCKFDYQLLTRGRFEIFKPVDIECINIYNHD
DIKIKHMILDAITLKNLHIIENSIGSCAGTLLNKLNHCSTPFGKRLLYQWLCNPLTDISN
IKARQNAISSLMIIPDLVREIRSELSTLPDLERLFSRIYSQSCNGVESDHAETRAIYFEE
KIYSKRKIIDFISILKGFRTSMKIMKILQSENIESNDSECNLLTKICNHPSSVHPGIYPN
LTELLDNFENSFDHNEAMKHGRIFPEPGMDEQYDAVLEKIHNLEADLKCYLKEQCKHFGC
NVVYFGTDKKRYQLEVPEVASKRAGDEYELQSQRKGFKRYTTNYTKKFLDQMISYEEEKI
DVLKNLRERIFTRFCDKFEDWNNAIQCLATLDVFISLAEYCRCEEQTMCIPKFYPALLNK
KPFVELIDGRYPCGTSEENFIPNDIIISKENNNLWNSSLILVTGPNMGGKSTLMRQLGII
TIMAHMGCYVPAKRFELNPVDRIFTRIGANDNIIAGESTFFVELCETSAILHHASRFSLV
LVDELGRGTSTYDGTAIASAVVKELVQKQCRTLFSTHYHSLVEDFKTNLLVALGHMACMV
ENDETNDTDTDKDLETITFLYKFANGACPKSYGFNAARLAGMPSEIIKLGLCRAKEFETV
AKRRILFNTLFSSDDPTAVKNAILAL
NT seq
3501 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaaaaacacattgttcaattactttagtaagtcgcctggaacacctagttctaag
gttaaagaatcacctaaacgagttgaaacaaaaactcccaagagatcagctcaaagagaa
gtagtgactcctaaaaatgttaaggacagttcgaaaaaacctaaattaaacaagagtagt
acaaaaaaaactatcgaaaaaagaagacaaaaacatgaagaatcagatgaagatgaagat
attcaattaccaaaaaaaaaaaagcgaagacttgctctagaagaaatcagtgatgatgaa
gaagattccggagatgaatatataccagataaaaaagctacagttgaaagtgaaacggaa
tctgaagatagtgtggaagaatctgatgaagattcttttattaatgatgacagtgatggt
gaatctcccatgaataaggtttcaaaatctaaaccaaaatctattaaatcaaacagaaaa
ttgaatggtaagaaatcatttgtttcaaatgttgaaaaatcaaacaaagagataatcaag
ggagttgtagatcatgataattggcctcatttaaaattggagtttttgaaatctgacaaa
attagagatgctaatcgaaaatcaccatctgaacctaattataatcctcgtacattattt
gtaccagaagatttcaaacaaaaattaactccggctgtccgtcagtggtgggaacttaaa
tcacaacattatgattgtatacttttttttaaagttgggaaattttatgaaatgtatcac
atggatgcagtaactgctgctaaagaacttaatcttttgtatatgaagggtgattttgct
catgttggattcccagaaagtgcatatggtcgattttctgctattcttgtagaaaaaggt
tataaagtagcacgtattgaacaaacagaaacacctgatatgatgttagaacgctgtaaa
actttaaaaaaaacaactaagtttgataaagttgttcgccgtgaaatttgtcgaatcact
accaaaggtacgagaacttttggtgtaattgatggtgaaaccaatgatccagaaaattca
tttttaattgcattatcagaaaaagaattaagtccatcttcgtccatgtatggagtatgt
tttatagatacctcaattggtcttttttatcttgggcaatttgaagatgattgccactgc
tcaaggctaagaacattatgtgcacattatcctcctgtgcagattttgtttgaacgtaat
aaattatcgccacatactaaaaaagtaatagatactatgctctcaagtgctataaaagag
gctttaattccagaagtagaattctggtcttcatcaaaaacattagtaacattaaccgaa
ggagattattttaagaaagataataatacagtatatcctgaaaaattaaaggaattcctt
ggatgtgattctgattttcagttgaatgctaatgatgcttgtgatttgggaataaaaagt
ttaggtgcagttatttggtatttaaaacaatgtaaatttgattatcaacttcttacaaga
ggtcgatttgaaatttttaaaccagttgacatagaatgcatcaatatatacaatcatgat
gatataaaaataaaacacatgatattagatgccatcactttaaaaaatttacatattata
gaaaactctattggatcttgtgctgggacattattgaataaattgaatcattgttctact
ccatttggaaaaagattactgtatcagtggttatgtaatcctttaacagatatttctaat
attaaagctagacaaaatgccatatcatcattaatgatcattccagatttagttcgggaa
attcgtagtgaattatcaactttgccagatttagaacgattattttcaagaatttattct
cagagctgtaatggtgttgaatctgaccatgctgaaactagagctatatactttgaagaa
aaaatatattctaaaagaaaaattattgattttatttcaatattgaaaggatttagaaca
agcatgaaaataatgaaaattttgcaaagtgaaaatattgaaagtaatgattctgaatgt
aatttattgacaaaaatttgcaaccacccatccagtgtccatcctggaatatatcctaat
ttgacagaattgttggataattttgaaaattcatttgatcacaatgaagcgatgaaacat
ggcagaatttttcctgaaccaggaatggatgaacaatatgatgcagttctagaaaaaatt
cacaacctagaagctgatttaaaatgctatttaaaagaacaatgtaaacactttggatgt
aatgttgtttattttggaactgataaaaaacgttaccaattagaagtgccagaagttgca
tcaaaaagagctggtgatgaatatgaacttcaaagtcaaaggaaaggatttaaaagatat
actactaattatactaagaaatttcttgatcaaatgattagttacgaagaagaaaaaatt
gatgtgttaaaaaatctaagagaacgtatttttactagattctgtgataagtttgaagat
tggaataatgctattcaatgtttagctacacttgatgtttttatatcattagcagaatac
tgtcgctgcgaagagcaaaccatgtgtattcctaaattttatccagctctacttaataag
aaaccatttgttgaactaattgatggacgctatccttgtggtactagcgaagaaaatttc
attccaaatgatataataattagtaaagaaaataataatttgtggaattcgagtctaatt
ttagttactggccccaatatgggaggaaaatctacattaatgagacaacttggaattatc
acaataatggctcatatgggctgttatgtaccagcaaaacgttttgaacttaatccagtt
gatagaatttttaccagaattggtgctaatgataatatcattgctggtgaatcaacattt
tttgtagaattatgtgaaacttctgctattctacatcatgctagtcggttttcattagtt
cttgttgatgaattaggtagaggaacttcgacctatgatggtactgcaattgcctcagct
gttgtcaaagagttagtacaaaaacaatgccgaactcttttttctacacattaccattca
ttggtagaagatttcaaaacaaatctacttgttgccttaggacatatggcatgtatggta
gaaaatgatgaaacaaatgatacagatactgacaaagatcttgagaccattactttcctt
tataagtttgctaatggagcatgtcctaaatcatatggatttaatgcagcacgtcttgca
ggaatgccttcagaaataattaaacttgggctgtgtagagcaaaagaatttgaaactgtt
gctaaacgtagaattctttttaatactttattttcatctgatgatccaactgcagtaaaa
aatgctattttagcattataa
DBGET
integrated database retrieval system
