Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera): 126897455
Help
Entry
126897455 CDS
T09738
Name
(RefSeq) neogenin isoform X1
KO
K06766
neogenin
Organism
dvt
Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera)
Pathway
dvt04350
TGF-beta signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dvt00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
126897455
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04515 Cell adhesion molecules [BR:
dvt04515
]
126897455
Cell adhesion molecules [BR:
dvt04515
]
Immunoglobulin superfamily
DCC/UNC5 family
126897455
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
I-set
Neogenin_C
Ig_3
Ig_2
ig
FN3_DSCAM-DSCAML_C
Pur_ac_phosph_N
Fn3_VIN3
V-set
Interfer-bind
C2-set_2
CRLF2-like_D2
Unc5_NetrinR_N
fn3_SORL1
Tissue_fac
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126897455
NCBI-ProteinID:
XP_050527005
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1428 aa
AA seq
DB search
MLRTNKKQVKWKLLFYCWIIALIANVQGSVRFITEPSDIITSAGKTVRLDCEAKFDSVVT
HPQIRWRNPDGENFDFIGDTHRSVLSNGSLLIKNIFNNDEKEASEGFEAYQCVAFVDNIG
SAVSRTATITLARLSPFEKQPINLKLSPGQTAYFSCVINSQPSPRIVWLKDHSPLIVDDS
RMTIFPSGSLEIDDVHKGDAGSYRCNVTGLDRHRLSDPGVLIVEDNEDLLKRSKAPEFVA
KPHSTIALEGSVITLDCAAVGNPRPQISWLKDGTTIDVSYLDSRFRIIGTGGLQIAQVNK
KDDGNYVCRAENHEDSTDVSATLEVQSKPIFIRKPKDTMVLEKEDVTLECDVEGKPTPRI
IWLKNGDRIKQDEYLQFVKGTNLKILGLMTMDTGMFQCLASNPAGNIQASAFLNVLHADS
LLSTNSSLNINNDTINSLSIAEKPKDSKINLPSAPRSLEVKSVSTRFATLTWTNPIKSNG
DILTYTVFYQQEGSDRERMTNTSLTEITITNLLPDKHYLFRITAINEYGIGESSPRLKVL
TKPEVNLPGPPLNVTVIPTSSSSIFVSWAKPEQGAETIKEYKLFYIEDYSTEEKFVITKH
SDYEITNLKIFTKYKVWVVAYNQNGQGPSSLEVNVTTTSSSPSKPPQDVMVEAVSDTEIS
IKWVPPPKLSQNGVITGYKIRYRKRDKKSFGDTITTAGDRTSYQISNLDKNSVYQVRLWT
LNTEGISPPTDWLTVETFESNLRENTVPDPPENFKVRAYSNSLVVTWSPPKEKAIMVRKY
TLSWGKGIPDVYVEDLGPKTRQYEIKGLESNADYVLSLAASNEMGVSPIVYQMASTRDHN
INTLETNNLIPPIGLKANVISPNAIEVSWTDNSLLDFDSNVNDERLYIIRYNAYAPGNEK
YKYSNTTDLSCIINDLKPNTQYEFTVKLVKGQFESEWSMLVSNNTKEAKPASPPRDLTAI
KIDDKPQMITLNWQPPKYSNGQIVAYIVLYSIDEKSPDSDWVSETIEGDLMSYTIKGLTP
NTNYFFKIQSKNSVGYGPFSTTINIKTLSATNVHNSDGTSLKDGKSGINNTTILYILIAC
CLLLISCIGIGIVLLCCKQDRPINNRSKKGYIKGSTGKAIKAAQSPNLKPPDLWIHHDQM
ELKSIEKSSQGSLDTSSGCGQGSTNTYDGTDTRVTIHHVPHSTNSLDKSNYVSSYVGNSL
MQPLLSEERMSTLKRSKPKPVVLPIDAFDSIYNDTMSTLSSHESRSPYPRSQYATTRAHV
TVDLTAGAPENNYIVQATTIPEKYESIPVTSTSSIQQHTGSLNTSEKRQQGHPLKSFSVP
APPPQSAPSTPQQKHIVTVRPQGSSSPYKKPITYSTVNSSPTNTALLSGQKIWKPQINNS
NSNDLGPEVESLSKIQTSYSTEELNQEMANLEGLMKDLSAITASEFQC
NT seq
4287 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaagaactaacaaaaaacaagtaaaatggaaactattattctattgttggataatt
gcactcattgcaaatgttcaaggaagcgtcagatttataacagagcctagcgacattatt
acatcagcaggaaaaacagttcggcttgattgtgaagcaaagtttgatagtgttgttaca
catccacaaataagatggagaaatcctgatggagaaaattttgattttattggagacaca
cacagatctgtgttaagtaatggttcattacttattaaaaatatatttaacaatgatgaa
aaagaggcatctgaaggatttgaagcatatcaatgtgttgcgtttgttgataatattggt
tcagctgttagtcgtacagcaactattactcttgctcgattatctccttttgaaaaacag
cctataaatcttaaactgtctcctggacaaactgcatatttttcatgtgttattaactct
caaccatcacctagaattgtttggcttaaagatcattcaccattaatagtggatgattcc
cgcatgacaatattcccatcaggatcgttggaaattgatgatgtgcataaaggagatgct
gggtcatatcgatgtaatgtcactggattagataggcatagacttagtgatcctggtgtt
ttaatagttgaagacaatgaagaccttctaaaaagatcaaaggctcctgaatttgtggct
aaaccacattcaacaatagctttagaaggatctgtaattacattagattgtgcagcagtt
ggtaaccctagaccacaaatttcatggttaaaagatggaactacaattgatgtttcgtat
ttagacagccgtttcagaataataggaacaggtggtcttcaaattgcccaagtaaataag
aaagatgatggaaattatgtttgtcgagctgaaaaccatgaagattctactgatgtttct
gctacacttgaagttcaaagcaaaccaatttttattcgtaaacctaaagatactatggtt
cttgaaaaagaagatgttacattagaatgtgatgtagaagggaagcccactccacgaatc
atatggttaaaaaatggagatagaataaaacaagacgaatatctccaatttgttaaaggt
acaaaccttaaaatacttggcttaatgacaatggatactggtatgtttcaatgtttagca
tcaaatccagctggaaatattcaagcttcagcttttttaaatgttcttcatgcagactct
ttacttagcaccaactcatccttaaatataaataatgatactatcaactcattatctata
gctgaaaaaccaaaggattcaaagataaatcttccatcagcacccagatcattagaagta
aaatcagtatcaactagatttgcaacattaacttggactaaccctataaaatcaaatgga
gatatcctcacatatacagttttttaccagcaagaaggatctgatagagagagaatgact
aacacgtctttaaccgaaattacaattacgaacttgctaccagacaaacattatttattt
agaataactgctattaatgagtatgggattggagaaagttcacctcgtttaaaagtttta
acaaaaccagaggtaaacttacctggacctcctttgaatgtgacagtgatccctacatct
tcttcctctatatttgtgtcttgggctaaaccagaacaaggagctgaaacaataaaggaa
tacaaattattttatattgaagattattctactgaagaaaaatttgttattaccaaacat
tctgattatgagatcacaaatcttaaaatttttacaaaatataaagtctgggttgttgcg
tataatcaaaatggacaaggtcctagctctttagaagttaatgtgacgacaacatcttca
tcaccatctaaaccaccacaagatgttatggtggaagctgtttctgatacagaaatttct
attaaatgggtaccaccacccaaattgagtcaaaatggagtaataactggctataaaata
aggtatagaaaacgagataaaaagtcttttggagacaccataacaacagctggagatcgt
actagttatcaaatttctaatttagataaaaattcggtataccaagttcgtttatggact
ttaaatactgaaggaattagtccaccaacggattggttaactgttgaaacatttgaaagt
aacctcagggaaaatactgttcctgatccaccagagaattttaaagtgcgagcatattca
aactcattggtagttacatggtcaccacctaaagaaaaagcaattatggtaagaaagtat
acactatcttggggtaaaggcattccagacgtttatgttgaagatttgggtcctaaaact
cgacaatatgaaattaagggcttagaatctaatgctgattatgttttgagtcttgctgct
agtaatgaaatgggtgtcagtccaatagtttatcaaatggctagcacaagggaccataat
attaatacattagaaacaaataatcttattccacctattggattaaaagctaatgttata
tctccaaatgccattgaagtgtcatggactgataattctctccttgattttgattctaat
gttaatgatgaacgtttgtatattattcgttataatgcttatgctcctggtaatgaaaaa
tataaatattcaaataccactgatttgtcatgcattatcaacgatttaaaaccaaataca
cagtatgaatttactgttaaattagtgaaaggccaatttgaaagtgagtggagtatgcta
gtatcaaataataccaaagaagccaaaccagcttctcctcctagagatttaacagctatt
aaaattgatgacaagcctcaaatgataactttaaattggcaaccaccaaaatattcaaat
ggacaaattgttgcttatattgtattgtattctattgatgaaaaaagtcctgactctgat
tgggtgtctgaaactattgaaggtgacttaatgtcgtacactattaaaggactaacgccc
aatacaaactattttttcaaaattcaatcaaaaaattctgtaggttatggtccatttagt
acaactatcaatataaaaacactatcagcaacaaatgtacataacagtgatggaacatct
ttaaaagatggaaaaagtggtatcaacaatactactattttatatatactgattgcttgt
tgtttgcttctgatatcatgtattggcattggaattgttttattgtgttgcaaacaagac
cgacctattaataatagaagtaaaaaaggatatattaaaggctcaactggtaaagccata
aaagcagcacaatctccgaacttaaaaccaccagatttgtggatacatcatgatcagatg
gagttaaaatcaattgaaaaatcttctcaaggttcacttgatacaagttctggttgtggc
caaggtagtaccaacacatatgatggtactgatactcgtgtcacaattcaccatgtacca
cattctaccaattcgttagacaaaagtaactacgtttcttcttatgtaggtaactcatta
atgcaacctttattatcagaagaaagaatgtctacattaaaacgttctaaacctaaacct
gttgttttacctattgatgcatttgattctatttataatgatactatgtcaacattatct
agtcatgaatctcgttctccatatcctagatctcagtatgcaacaacaagagctcatgtt
acagttgatttaacagctggtgccccagaaaacaattatattgtccaagctacaactatt
ccagaaaagtatgaatctataccagtaacatctacatccagtattcaacagcatactggc
tcattaaatacgagtgaaaaaaggcagcaaggacatcctttgaaaagttttagtgtacca
gctcctcctccacagtctgcaccatcaactcctcaacaaaaacatatagttacagtaaga
cctcaaggctcatctagtccatacaagaaacctattacttattcaacagttaatagttca
ccaacaaacacagcattattaagtggtcaaaaaatatggaaaccacaaataaataattct
aattccaacgatcttggaccagaagttgaatccctcagtaaaattcagacatcatatagc
acagaagaattaaatcaagaaatggctaacctagaaggtttaatgaaagatctgagtgca
attactgcatctgaattccaatgctag
DBGET
integrated database retrieval system