Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera): 126901508
Help
Entry
126901508 CDS
T09738
Name
(RefSeq) activating signal cointegrator 1 complex subunit 3
KO
K18663
activating signal cointegrator complex subunit 3 [EC:
5.6.2.4
]
Organism
dvt
Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dvt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
dvt03400
]
126901508
Enzymes [BR:
dvt01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
126901508
DNA repair and recombination proteins [BR:
dvt03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
Direct repair
126901508
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sec63
DEAD
SNRNP200_wHTH
ResIII
Helicase_C
Helicase_PWI
AAA_22
AAA_19
IstB_IS21
UvrD-helicase
Phage_TAC_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126901508
NCBI-ProteinID:
XP_050533942
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2129 aa
AA seq
DB search
MAKAKENLSQHIGQLPKFTRALLIYSNDFIDEMDPCNTWKYNLDVIKERIDEQEKQTQKS
LTFVEICSIINQSQNNIISRNLNLLYEIAKDLSKDDQSEILSSSVLFFFKLLIGESGLLM
KHILELRCMFGKISNQNADQIFKLVKEVEKILDNDNLNKIKTLWENIEETDNHETDHRRE
VQINISEKYFKPRSKWVPPNFGKLPTPDVGLKSVLNSFSMRYNREEKKSSSTVNLDKTWL
LNQIMKTTTPSFGMTNEDYYNSIITALSSQSSDTELQDELFNLLGFKRLDLIEILLKHRN
NIVKQNFSSDERRFAFNAKDIKMDKQPRHMEMITIETEEDKKLRKELRKEEKALQRFNRR
RESDSDDEAIKIVSKTTSAPNVPMFIDPKSCKAPLAEKFPHVYDINSESKVSSCYINGDP
CTIPIGAKRTDHKTYEEVYIPPTRLSQDLTVGKKLVAVKTLDEIGQKAFSGIQSLNRIQS
VVFDAAYNTNENLLVCAPTGAGKTNVALLTIVHQIKQHIQNNEINKSEFKIVYVAPMKAL
ASEMTANFSRRLLSLGITVREFTGDMSLTKAEITSTQILVTTPEKWDVATRKGTGDIALT
SLVKLLIIDEVHLLHGDRGPVLEALVARTLRQVESSQNMIRIVGLSATLPNYKDVARFLR
VNFQKGLFYFDGRFRPVPLIQTFIGVRGSKTVKMQQEMDSVCYDKLHEMVQKGHQVMVFV
HARNATVKTANVFRELATQKNHLSDFLPEDSNRIGVAKKAFERCHSKELSELLNSGFSIH
HAGLLRSDRNLVEKYFAEGAIKVLVCTATLAWGVNLPAHAVIIKGTELYDSKHGTFVDLG
MLDVLQIFGRAGRPQFDTSGHGIIITPHAKLHKYLSLLTNQIPIESCFVQHLVNNLNAEV
VLGTISNVEEAVLWLSYTYLFVRMRINPHVYGILLDEVELDPMLVNKRKEFIINAAMALD
RAQMLRYNERTGDLASTDLGRTASHFYISHDSIEIFNQTMAPFMNLSEILTMIASAKEFE
QLQVRDDEVVELESLSRKYCHVECKGSAVNINGKVNILLQTYLARGRAKGFSLISDLVYI
SQNATRIARALFDMVLRRNNAMLSSKLLEVSQMFEMRQWDFESELRQFSDVLPWEIIDKI
EQRKLTFNQIREMDSKELGILLRNQNIGAAVKKCAMQLPYIEATESIQPITRTILRINLE
LYPEFEWNDKFHGKTSVAFWIWIEDPETDHIYHWEQFLISKRQVIKKEVQKLVFTIPLVE
PLPSQYILHCTSDRWLGTTYTIPLTFQHLILPHSHASVTDLLELHPLPLSALKNQDYQNL
YKFTHFNPIQTQIFHCLYHTDNNVLLGAPTGSGKTIAAEIAMFRVFNEQPEAKVVYIAPL
KALVRERIIDWKVRLEEKLKKSVVELTGDVTPDIKAITNASVIVTTPEKWDGVSRSWQTR
NYVRQVALVVLDEVHLLGEERGPVLEIIISRINFISTHSGQHTRIIALTTALSTAADLAS
WLHIGEMGLYNFRPSVRPVPLEVHISGYAGRNYCPRMATMNKPIYQAIRQHSPTQPVMIF
VSSRRQTRLTALDLIAYLGGEDNPKQWVHKNDYEMDQIIENIRDPNLKLCLAFGLGLHHA
GLQDNDRKIVEELFVNQYIQVLIATSTLAWGVNFPAHFVIVKGTEFYDGKQKRYVDMPIT
DVLQMMGRAGRPQYDNMGIALIMVHDIKKTFYKKFLYEPFPVESSLLNVLPDHINAEIVA
GTIKTKQDAIEYLTWTYLLQRLMKNPEYYGLHSLEESSINDFLSDLVESCIGTLYSSYCV
DIDEDQRNVKPTSLGHIASYYYLQHKTVKIFRERLKGELSLEDLIKVLVDAEEFSLLPVR
HNEDLMNAELDKQCPLNIDGRPFECSHTKTLILLQAHFSHLKMPCTDYITDLKSVLDQSI
RILQAMIDITAEEGYLVLCLKLMQLMQMVIQARWVTDPPVFTLPLVEKHLIPSNILNLLC
LPHLCNVALKSYDQFLNIFLKTQLEPEEINKIYKTVVEMPVVNVQLYIQGYWPDSSEVQK
KLVRNGERMEILGNNEYTLIVETKILNRVIPSKAHAPKFSKPKDIGWFMVLGSIENWELI
ALKRATNNHYRRSSSRLAFSTPSFSGKYI
NT seq
6390 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccaaggctaaagaaaatttatctcaacatattggacaattacccaaatttaccaga
gctcttttaatttattctaatgattttattgatgaaatggatccatgtaatacatggaag
tataacttagatgtaataaaagaacgaatagatgaacaagaaaagcagactcaaaaatct
ttaacatttgttgaaatttgttctattataaatcagtcgcaaaataacattatttcaaga
aatctaaatttgttgtatgaaatagctaaagatctttcaaaagatgatcaatctgaaata
ttaagttcttcagttttatttttttttaaattgttaattggagaatctggattacttatg
aaacatatcttagagcttcgatgtatgtttggaaaaatatcaaatcaaaatgctgatcaa
atatttaagttggtaaaagaagtagaaaaaatattggataatgacaatttaaataaaatt
aagactttatgggaaaatattgaagaaaccgataatcatgaaactgatcatagacgtgaa
gtacaaattaatatctctgaaaaatattttaaaccaagatcaaaatgggtccctcctaat
tttggaaaattaccaacacctgatgttggtttgaaaagtgttttgaattcattttctatg
cgttataatagagaagaaaaaaaaagttctagcacagtaaacttagataaaacatggtta
ttgaatcaaattatgaaaacaacaactccaagttttggaatgacaaatgaagactattac
aatagtattataacagccctttcatctcaaagttctgatactgaacttcaagacgaattg
tttaatttgcttggatttaaacgtcttgatctcatagaaattcttctaaagcataggaat
aacatagtcaagcaaaatttttcttcagatgaaagaagatttgcattcaatgccaaagat
ataaagatggataaacaaccaagacatatggaaatgataactattgaaactgaagaagat
aagaaacttagaaaagaattgagaaaagaagaaaaagcccttcaaagatttaatcgacga
agagaatctgattctgatgatgaagcaattaaaatagtttctaagactactagtgcaccg
aatgtccccatgtttattgatccaaagagttgtaaggcacctttagctgaaaagtttcca
catgtatatgacataaattcagaatcaaaagtatcaagttgttatataaatggagatcct
tgtactattcctattggagctaaaagaactgatcataaaacttatgaagaagtgtacatt
ccacctactaggttgtcacaagatttaacagttggcaaaaaactagttgctgttaaaaca
ttagatgagattggccaaaaagcatttagtggtattcaaagtttaaatagaatacaatct
gttgtttttgatgcagcgtacaatacaaatgaaaatcttttggtatgtgctcccactgga
gctggtaaaacaaatgttgctttattgacaatagtacatcaaattaaacaacatatacaa
aataatgaaattaataaaagtgaattcaagattgtttatgttgctccaatgaaagctcta
gcatctgagatgactgctaacttctctagaagactattaagtttgggtattactgttcgt
gaatttactggtgatatgtctttaactaaagctgaaattactagcactcaaatattagta
acaacacctgagaagtgggatgtagcaactcgcaagggaactggtgatattgctttaact
agtctggttaaattattaattattgatgaagttcatttattacatggtgatcgaggtcca
gtgttagaagcacttgtagcacgtactttacgacaggttgagtcatctcaaaatatgatt
cgtattgttggattatcagctactttaccaaattataaagatgttgctcgatttttaaga
gttaactttcaaaaaggtttattctattttgatggacgttttcgtccagtgcctttgatt
cagacatttattggggttcgaggaagtaagacagttaaaatgcaacaagaaatggattca
gtttgttatgataaattgcatgaaatggttcaaaaaggacatcaagtcatggtgtttgtt
catgcccgtaatgctaccgtaaagacagctaatgtatttagagaacttgcaactcaaaaa
aatcatttatctgattttttgcctgaagattccaaccggataggagtagcaaagaaagca
tttgaacgatgtcattcaaaagaactaagtgaattattgaacagtggattttctattcat
catgcaggcctcttaagatcagataggaatttagttgaaaaatattttgctgagggtgcc
ataaaagtattagtatgtacagctacattagcttggggtgttaatcttcctgctcatgct
gttatcataaaaggtacagagttgtatgactctaaacatggaacatttgtagatctaggt
atgcttgatgttttgcaaatatttggaagagctggtcgtcctcagtttgatacttctgga
catggaattataattactccacatgctaaactacataaatacctttcattactaacaaat
caaataccaattgaaagttgttttgtgcaacatcttgttaacaatttaaatgctgaagta
gttttaggtacaatatctaatgtagaagaagcagtgttatggttaagctatacttatttg
tttgttagaatgcgtataaatccacatgtgtatggtatattactagatgaagtagaattg
gatcctatgttagttaataaaagaaaagaattcatcataaatgcagctatggcattagat
agagctcaaatgttacgttacaacgagagaactggagatctcgcatccactgatctggga
cgaactgccagtcatttttacataagtcatgacagtattgaaatatttaatcagaccatg
gcaccttttatgaacttatcagaaatacttactatgatagcaagtgcaaaagaatttgag
caactacaagttagagatgatgaagtggtagagttagaatcattgagtcgtaaatattgt
catgttgaatgcaaaggatcagcagtgaatattaatggcaaagtaaacattcttttacaa
acttatttagctagaggtagagcaaaaggattttcattaatatcggaccttgtttatatc
tcacaaaatgctacaagaattgcccgggccctgtttgacatggtcttacgtcgcaataat
gccatgttatcatcgaaactgttggaagtcagtcaaatgtttgagatgagacaatgggac
tttgaatctgaattgaggcaattttcagatgttcttccttgggaaattattgataaaata
gaacaaagaaaattaacatttaatcaaattagagaaatggactcaaaagagttaggaatt
ttattaagaaaccaaaatattggtgctgcagtaaaaaaatgtgctatgcagctgccttat
attgaagctacagagagtattcaacctattacaagaaccattttaagaataaatcttgaa
ctttacccagaatttgagtggaatgataaattccatgggaaaacatcagttgcattttgg
atttggatagaagatcctgaaactgatcatatttatcattgggaacaattcttaatttca
aaaagacaagttatcaaaaaagaagttcaaaaattagtttttacaatacctcttgttgaa
ccacttccgtctcaatacattttacactgtacatcagatagatggctgggtactacttac
acaattcccttaacatttcaacatctcatattacctcacagccatgcttcagtaacagac
ttgcttgaacttcatccattgccattatcagctcttaaaaatcaagactaccaaaattta
tacaagtttactcatttcaatccaatacaaactcaaatttttcattgtttgtatcataca
gataataatgtactcttaggagcccctactggatccggtaaaactattgctgcagaaatt
gctatgtttagagttttcaatgaacagcctgaagctaaagtcgtttatattgcaccttta
aaagctcttgtacgagaacgaataattgactggaaagtaagacttgaagaaaagttaaaa
aagtcagttgttgaattaacaggtgatgttacaccagatattaaagcaataactaatgca
tctgtaattgttacaacaccagaaaaatgggatggtgtttcacgaagttggcaaacacga
aattatgttcgacaagttgcattagtggttcttgatgaagttcatttactaggagaagaa
agaggaccagttttagaaataattatatcccgtataaatttcatttcaactcattctggt
cagcatactcgcattattgcattaactactgctttatcaaccgctgctgatctagcttct
tggttacatatcggtgaaatgggtctttacaattttcgtccttctgtacggcctgttcca
cttgaggtgcatattagtggctatgcaggaagaaattattgtcctagaatggcaactatg
aacaagccaatttatcaagctatacgtcaacattctcctactcaacctgttatgattttt
gtatcatcaagaagacaaactagattaactgcacttgatctaatagcatatttaggagga
gaagataaccctaaacaatgggttcataagaatgattatgaaatggatcaaattattgaa
aatatcagagatcctaatttaaaattatgccttgcatttggattaggtcttcatcatgct
ggattacaagataatgatagaaaaattgtagaagaattatttgttaatcaatatattcaa
gttcttattgctacttctactttagcttggggagttaattttccagcacattttgttata
gttaaaggaactgagttttatgatggtaaacaaaaaagatatgttgatatgcctataacc
gatgttcttcaaatgatgggccgtgcaggtagacctcaatatgacaacatgggaattgca
ttaattatggtacacgatataaaaaaaacattttacaagaaattcttgtacgaaccattc
ccagttgaatcatctttgttgaatgtattaccagaccatattaatgctgaaattgtggct
gggacaataaaaacaaagcaagatgcaattgagtatttaacttggacctatctccttcaa
agactaatgaaaaatccagaatattatggattgcatagtttagaagagagttctatcaat
gatttcctttctgacttggttgaaagctgtattggaacactatactcaagttattgtgtt
gatattgatgaggatcagcgtaatgttaaaccaacatctcttggtcatattgcatcatat
tattatttacaacataaaactgtaaaaatattcagagaaagattgaaaggtgaattaagc
ttggaagatttaattaaagttttagttgatgctgaagaatttagtcttttacctgtcagg
cataatgaagatttaatgaatgcggaactagataaacaatgtcctttaaatattgatgga
cgaccatttgagtgttcacacacaaaaactcttatcttgctccaagctcatttttcacat
ttaaaaatgccatgtaccgattatattactgatctaaaatcagttcttgatcaatcaata
cgtatactgcaagctatgattgatattactgcagaggaaggatatttagtattatgcctt
aaattaatgcaacttatgcaaatggttattcaagctcgttgggtgactgatccacctgtt
tttacactacctttagtagaaaagcatttaattccatctaacattttaaatctactttgt
ttaccacatttgtgcaatgttgctcttaagagttatgaccagtttttaaatattttttta
aaaactcaattagaaccagaggagattaataagatttataaaactgttgttgaaatgcct
gttgttaatgttcaattatatatacaaggttattggcctgatagttctgaagttcaaaag
aaattggttagaaatggtgaaagaatggaaatattaggaaacaatgaatatactttaata
gttgaaactaaaattttaaatcgagtgattccatcaaaagctcatgctccaaaattttcc
aaacctaaagatataggttggtttatggttcttggatctatagaaaattgggagttgatt
gcattaaaaagagctactaataatcattacagaagatcatctagtagactagcatttagt
acaccaagcttctcaggtaagtacatttga
DBGET
integrated database retrieval system
