Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera): 126902553
Help
Entry
126902553 CDS
T09738
Name
(RefSeq) pre-mRNA-processing-splicing factor 8
KO
K12856
pre-mRNA-processing factor 8
Organism
dvt
Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera)
Pathway
dvt03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dvt00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
126902553
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
dvt03041
]
126902553
Spliceosome [BR:
dvt03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U5 snRNP specific factors
126902553
Complex C
U5 SnRNP specific factors
126902553
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PROCN
PRP8_domainIV
U6-snRNA_bdg
PRO8NT
U5_2-snRNA_bdg
PROCT
RRM_4
JAB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126902553
NCBI-ProteinID:
XP_050535896
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2379 aa
AA seq
DB search
MSIPPFMLGGNPWAQMIVQQQQQQIAAVQAQAAHAQAAAVHAQIHAQQVAMHQISSAPPN
RIPEPLSEEKLQEKSQKWQQIQSKRFAPKRKFGFVDAQKEDMPPEHIRKIIRDHGDMSSR
KYRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVKVLYHITGAITFVNEIPWVIEPV
YIAQWGTMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNVLDVEPLEAIQIDLDNEE
DVAVAKWFYDHKPLVNTRHVNGSTYRKWNLTLPQMATLYRLANQLLTDLVDDNYFYLFDP
KSFFTAKALNMAIPGGPKFEPLIKDSNPAFVRDEDWNEFNDINKIIIRQPVRTEYRIAFP
YLYNNLPHYVHLSWYHAPNVVYIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRHSVKVNEPVFDEDEE
FELPPEVQPFLQEVPVYTDNTANGIALLWAPRPFNMRSGRCRRAIDVPLVKSWYREHCPP
GQPVKVRVSYQKLLKYFVLNALKHRPPKPQKKRYLFRSFKFTKFFQTTTLDWVEAGLQVC
RQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREILRLTKLI
IDSHVQYRLNNIDAFQLADGLQYVFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFN
TGPVGKGPGCGFWAPGWRVWLFFMRGITPLLERWLGNLLSRQFEGRHSKGVAKTVTKQRV
ESHFDLELRASVMHDIVDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPTPIEN
MILRYVKMKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKD
GPYISPEEAVAIYTTTVHWLESRRFAPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAYSVKSRLN
QSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRTFKEVGIEFMDLYSHLVPVYDVEPLEKI
TDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPSDTEPPPLLVYKWCQGVNNLQDVWDVSEGECNVLL
ESKFEKIYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKSNVIINYKDMNHTNSYGIVRGLQFS
SFIVQYYGLVLDLLVLGLQRASEMAGPPQMPNDFLTFQDVQTEVAHPVRLYCRYTDRVHI
FLRFTAEEAKDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDI
KNRLPRSTTTIQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMSGFECRILPKCRTIHDELTHRDGIWNLQ
NEITKERTAQSFLRVDDESLQRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREA
VVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQ
SDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHDEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAN
AQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRIRTEFKQYQVLKQNPFWWTH
QRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKYKK
LTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIF
RAHLWQKVHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFAAYKW
NVSRPSLLADSKDTMDNTTTQKYWLDVQLRWGDYDSHDVERYARAKFLDYTTDNMSIYPS
PTGVLISIDLAYNLHSAYGNWFPGCKPLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKALQLYSSE
PTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQL
FLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLL
DFPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLI
LILRALHVNTERTKVVLKPDKTTITEPHHIWPTLSDDEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNV
NVASLTQSEIRDIILGMEISAPSAQRQQIAEIEKQTKEQSQLTATTTRTVNKHGDDIITS
TTSNYETQTFSSKTEWRVRAISATNLHLRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNVLKKFVTI
SDLRAQICAYLYGVSPPDNPQVKEIRCLVMPPQWGTHQTVHVPSQLPNNHHYLTDMEPLG
WIHTQPNELPQLSPQDISTHAKIMSDNSSWDGEKTVIITCSFTPGSCSLTAYKLTPSGFE
WGRQNTDKGNNPKGYLPSHYEKVQMLLSDRFLGFFMVPAQGSWNYNFMGVRHDANMKYEL
QLANPKEFYHEIHRPAHFLNFSSLEDGDGVGADREDVYA
NT seq
7140 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctattccaccttttatgttgggtgggaacccatgggctcagatgatagtacaacaa
caacaacagcaaattgctgctgttcaagcacaagctgctcatgctcaagctgctgctgtt
catgctcaaattcatgctcagcaagtggcaatgcatcaaatttcatcagctccacctaat
agaattcctgaaccattaagtgaagaaaaattacaagaaaaatcacaaaaatggcagcaa
attcagtctaaaagattcgcccctaagcgaaaatttggttttgttgatgcacagaaagaa
gacatgccacctgaacatatacgtaaaatcataagggatcatggagatatgagtagtcgt
aaatatcgtcatgataaaagagtttatcttggagctttaaagtatatgccacatgctgtt
ttaaaactgttagaaaacatgcctatgccatgggaacaaatcagagatgtgaaggtattg
tatcatattactggtgctataacatttgtcaatgaaattccatgggtaattgaaccagtt
tatatagctcaatgggggactatgtggattatgatgagaagagaaaaacgtgatagacga
catttcaagcgaatgcgtttccctccttttgatgatgaagaaccaccattagattatgct
gacaatgttttagatgttgaacctttagaggcaatccaaattgatttagataatgaagaa
gatgttgctgttgctaaatggttctatgatcataaacctcttgtaaacacaaggcatgta
aatggttcaacctatcgaaaatggaatttgactttaccacaaatggcaacattataccgt
ttagctaatcaacttttaactgatcttgttgacgacaactatttttatttatttgatcca
aaatcatttttcactgctaaagctttaaatatggctatacctggtggtccaaaatttgag
cctcttataaaagattcaaatcctgcttttgtacgcgatgaagattggaatgagttcaat
gatataaataaaattattatcagacaacctgttcgtactgaatatagaatagcttttccc
tatttgtacaataatcttcctcattatgttcatttgtcttggtatcatgcaccaaatgtt
gtgtatatcaagacagaagatccagatttaccagcattttactttgatcctttaatcaac
cctatatctcataggcattctgtgaaggttaatgaaccagtgtttgatgaagatgaagaa
ttcgaattgccacctgaagttcaaccattcttacaagaagtacctgtgtatacagataac
acagccaatgggatcgctttattatgggccccaagaccttttaatatgagatcaggacgt
tgtagaagagcaattgatgtgcccttggttaaaagttggtatagagaacattgtccacca
ggtcaaccagttaaagtccgtgtaagctatcaaaaattattgaaatactttgtgttgaat
gctttgaaacataggccacctaaacctcaaaagaaaagatatttattccgatcattcaaa
tttactaaatttttccaaacaacaactctggactgggttgaagctggattgcaagtttgt
agacaaggttacaatatgttaaatcttttaatacatcgtaaaaatctcaattacttgcat
ttggattataatttcaacttaaaacctgttaaaactttgacaactaaagaaagaaaaaaa
tcaagatttgggaatgcgtttcatttgtgtcgagaaattttacgattgactaaattaatt
attgattcacatgtgcaatacagattgaacaatattgatgcttttcaattagctgatggt
ttgcagtatgtttttgcacatgttggacaattaacaggaatgtatcgctataagtataag
cttatgagacaaatacgaatgtgtaaagatcttaaacatctaatttactatcgttttaat
actggacctgtgggcaaaggcccaggttgtggattttgggctcctggatggcgagtgtgg
ttattttttatgcgaggtataacaccattactagaacgttggttaggtaatttattatct
agacagtttgaaggaagacattctaaaggtgtcgcaaaaactgttacaaaacaaagagtt
gaaagtcattttgatctagaacttcgtgcttcagttatgcatgacatagttgatatgatg
cctgaaggtatcaaacagaataaagctcgaacaattttacaacatttatctgaagcgtgg
agatgctggaaagcaaatattccatggaaagttcctggattacctactcctattgaaaac
atgattcttcgatatgtaaaaatgaaagctgattggtggactaatactgctcattataat
agagaacgtattcgtagaggtgctactgtagataaaactgtttgtaaaaaaaatttaggg
cgcttaacaagattatatctcaaagcagaacaagaacgtcaacataactatcttaaagat
ggaccatatatttctcctgaagaagctgttgctatttatacaacaactgttcattggttg
gaatctagacgttttgctcctatacctttcccaccactttcatacaagcatgataccaaa
ttattaattttagctttagaacgtttaaaagaagcttacagtgttaaatctcgtttaaat
cagagccaaagagaagaacttggattaatagaacaagcatatgataatcctcatgaagca
ttatctagaataaaacgtcatcttttaactcaaaggacatttaaagaagtaggcatagag
ttcatggacttatactctcatctagtgcctgtttatgatgtagaaccgttagaaaaaatt
acagatgcttatttagatcaatatttatggtatgaagcagataaacggcgtttatttcca
ccatggatcaaaccatcagatactgaacctccacctctgcttgtttacaaatggtgtcaa
ggtgtaaacaatttacaagatgtttgggatgtaagtgaaggggaatgtaatgttttactg
gaatcgaaatttgaaaaaatttatgaaaaaattgacttgaccttacttaataggttactc
agactaatcgttgatcataatattgctgattatatgacggctaaaagcaatgttattatt
aattacaaggatatgaatcatacaaatagttatggtattgttagaggtttacaattttca
tcttttattgttcaatattatgggctcgttttggatttgctggtattgggattacaaaga
gcttctgaaatggctggacctccacaaatgccaaatgacttcttaacatttcaagatgtt
caaactgaagtagctcatcctgttcgcttgtattgtcgatatactgatagagtacatatt
ttcttgagatttactgctgaagaagcaaaagatttaattcaaagatatttgactgaacat
ccagatcctaataatgaaaatattgtaggttacaataataaaaaatgttggcctcgtgat
gctagaatgcgtttaatgaaacatgatgttaatttaggaagagctgttttttgggatatc
aaaaatagattaccacgttctacaactacaatacaatgggaaaacagttttgtaagtgta
tattcaaaggataatcctaatttgttgtttaatatgagtggatttgaatgtcgtatatta
cctaaatgtcgtacaattcatgatgaacttactcatagagatggtatttggaatttacaa
aatgaaataacaaaagaaaggacagcccaatcattcttacgagtagatgatgaatcatta
caaagatttcataatcgtgttagacaaattttaatggccagtggatcaactacttttact
aaaattgttaataaatggaatacagctcttataggattaatgacttatttccgtgaagct
gttgtgaatactcaagaattattagaccttttagtaaaatgtgagaacaaaattcaaact
cgtataaagataggtcttaattccaaaatgccttcaagattccctcctgttgtattttat
acacctaaggaacttggcggtttaggaatgttatctatgggtcatgttttgattccacaa
tctgatttaagatggtctaaacaaactgatgttggaatcactcatttccgttcaggtatg
agtcatgatgaagatcaactaatacctaatttataccgttatattcaaccttgggaatct
gaatttattgattcacaaagagtttgggccgaatatgctttaaaaagacaagaggctaat
gctcaaaacagacgtttaactttggaagatttagaagatagttgggatagaggtattcct
agaataaatactttattccagaaagacagacacactctagcatatgacaaaggttggagg
attcgaactgagtttaaacaatatcaggtacttaagcaaaatccattttggtggactcat
caaagacatgatggtaaattatggaatttaaataattatcgaacagacatgatccaagct
ttaggaggtgttgaaggtatattggagcatacattattcaaaggaacttatttcccaact
tgggaaggtctattttgggaaaaagcatctggatttgaagaatctatgaagtataaaaaa
cttactaatgctcaacgttctggtcttaatcaaattcctaatcgtcgatttactttgtgg
tggtctcctactattaaccgtgcgaatgtttatgttggttttcaagtgcagctagattta
acaggaatatttatgcatggcaaaatacctacattaaaaatttctttgatccaaattttt
agagctcatttatggcaaaaagttcatgaatctattgttatggatctttgtcaagtattt
gatcaagaattggatgcactggaaatagaaactgttcaaaaagaaactattcatcctcgt
aaatcttataaaatgaactcatcttgtgctgatattttattatttgcagcttataaatgg
aatgtctctagaccatcattgttggccgattctaaagacacaatggataatacaacaaca
caaaaatattggctagatgttcaactacgctggggtgattatgattcacatgatgttgaa
cgatatgctcgggcaaaatttttagattatacaactgataatatgtcaatttatccttcg
cccactggtgttctaatttcaattgacttggcatataatttacatagtgcatatggaaat
tggttccccggttgtaaaccattaattcaacaagccatggcaaaaattatgaaagcaaat
ccagctctttatgtattaagagaacgtattcgtaaagctttacagctttattcatctgaa
ccaactgaaccatatttgtcaagtcaaaattatggagaactattttcaaatcaaataatt
tggtttgttgatgataccaatgtatacagagttacaattcataaaacttttgaaggaaat
ttaacaactaaacctattaatggcgcaatatttatttttaatcctcgcactggacagttg
tttttaaaaattattcatacttcagtctgggctggtcaaaaacgtttgggtcaattagca
aaatggaaaactgctgaagaagttgctgctttgatacgttctttacctgttgaagaacaa
ccaaaacaaattattgtgactcgaaaaggaatgttagatcctctcgaggttcatctctta
gattttccaaatattgtgataaaaggttcagaattacagctacctttccaagcatgctta
aaagttgagaaatttggtgacctcattttaaaagctacagagccacaaatggttttattc
aatttatatgatgattggttaaagacaatttcatcctatacagcattttcacgattaatt
ctaatattaagagctttgcatgttaatactgagcgtaccaaagttgttttaaaaccagac
aaaacaactataacagaacctcatcacatttggcctacattaagtgatgatgaatggatt
aaagtggaagttcaattgaaagatctaattttagctgattatggaaaaaaaaataatgtt
aatgtagcttctttaacacaatctgaaattcgtgatattattctgggaatggaaataagc
gctccatcagcacaaagacaacaaattgcagaaatagaaaaacaaacaaaggaacaatca
caattgacagccacgaccacaagaactgtaaacaaacatggagatgacataattacttct
accacttcaaactatgaaacacaaacattcagttcaaaaactgaatggagagttcgtgct
atatctgcaaccaatcttcatttacgtaccaatcatatttatgtatcttctgatgatatt
aaagaaactggttatacatatatacttcctaaaaatgtactaaaaaaatttgttacaata
tctgatttacgagcccagatttgtgcttatctttatggtgttagccctcctgataatcct
caagtaaaagaaattagatgtcttgtaatgccaccacaatggggaacccaccaaacggtt
catgttccctctcaactgcctaataatcatcattatcttacagacatggaaccacttggt
tggatacacacacagcctaatgaattacctcaattatccccacaagatataagtacacat
gctaaaattatgtctgataattcatcatgggatggagaaaaaactgttattattacttgc
agttttacacctggatcttgttcattaacggcctataaattgactcccagtggttttgag
tggggaagacaaaatacagataagggtaataaccctaaaggttacttaccaagtcattat
gaaaaagtacaaatgctattgtcagatagatttcttggtttctttatggttccagcacaa
ggatcatggaattataacttcatgggagtgagacatgatgctaatatgaagtatgaactc
caattggctaacccaaaagaattttaccatgaaattcatagacctgctcattttttaaat
ttttcatcccttgaagacggagatggagtaggtgctgatcgtgaagatgtgtatgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
