Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera): 126903045
Help
Entry
126903045 CDS
T09738
Name
(RefSeq) DENN domain-containing protein Crag isoform X1
KO
K20163
DENN domain-containing protein 4
Organism
dvt
Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dvt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
dvt04131
]
126903045
Membrane trafficking [BR:
dvt04131
]
Protein recycling
Rab GTPases and associated proteins
Other Rab GTPase associated proteins
126903045
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DENN
dDENN
uDENN
PPR_2
DUF2464
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126903045
NCBI-ProteinID:
XP_050536919
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1710 aa
AA seq
DB search
MEERRVVDYFVVVGASDEQSHDDINSTHLKQSLCSDLPPITDLAIVFPSLGEKVPSDFIV
VDTTPSGLIADLNHGSLRSPEVFLCYRRGRDKPPIVDIGIMYDGKERVLKDAQVLKTTVS
GEVANINNSTSSKTFITYRRALPTAPCNILAVSHICVVITSRGETPPHAFCLIHKNLNKG
MVGSDVYLCYKKSVMKPKSITYKPVITNRYPKEDRNYFHLLPSVALFCLPMGATLEAWPN
QASQPKPVFSTFVLTVSDASEKVYGAAITFYEKFSGNLSNEQKELLGLNEHHNELKNGIG
LHSNKSICVLSHWPFFDTFEKFLMFLLNTSLGDKIHIPVERYITHLVDEVPFPSPERPQI
LVQLSMDTQLILTQPEDLPIPRSGAGFHQMIMNLHPDNCLLLLLCALTEQKLLIHSLRPD
VLTAVAEAISSLIFPFKWQCPYIPLCPLSLAEVLHAPLPFLIGVDSRFFDLYEPPTDVTC
VDLDTNTVTLCEDKKYLSIKLLPKKSARVLKYTLEKLYEKLDELQTSFHTSNNKNFGETS
IDKDILMKRKEHELELNIQEAFLRFMGSILKGYRWFLRPITKAPTAGTTDTSSLFDLLGF
LKSRDKSNQKFYSLLTKTQMFIRFIEERSFVSNMDAALEFFDECSEKIDSENSPTRLIEL
DSCGQSERTVFIMPPEMSDMPNMVPYSYKNGFILNSEILKCKDSKNQLKIKNDDHLPIPG
SPMARRTKHEVKSAQKLAKKYSTSPGLWAKFLLGTCYSLWFIHLPSHILQSEDRAASILR
LAYDLLNKFQKNGVQRLTDEVCYRVMMQLCGIYNQPMLAVKLLLVMKRCGLHPNAITYGF
YNRALLESTWPSDLRTHSQLLWNKLRNVVICTALFKQAGLQNRKRRSSTEDEKTSHTSEE
SLLTAEKQSSVSNTPRKLSINVESNYGLRARPISIVKQNSLSPEDDQSWSSQQFESSAGL
LMTTTCSRPSSASSKPNSDSVSVESETDLKRGRSGSLTDEIRLQISPRRHHYHQPLINTS
NDTSSELLKLLKRSKSFGNDAQILKNLNDLKYQTDFKKTNGISKKLVFDNSVKSFDSSLE
NLSEENTCNRFPEAALCTPVLENDPLGALQEPLTPTLCPLVTPISIPRVQSGIELDRSGS
PILFREWGSIHRSATFSDNVGNIDNHMQRSSTMPAHSIKEPEHQQSPIKISLGSAFKIPF
SQYTSSKFSLPRKSDFRLSTNMIENAINNFSPSSFSGKKSNEILMGGLTSLKSAANTVVK
KFDEIKEAISTNNTPIKDYIQCSKDEDKWIDDVDHQFNEPSVRRKISSEISSLAVAQHFD
SWSTNLIELFTDGHKKSGSCNINSGFDTLDFSELSLFQEKLYQRSIRTTELVALEIIMTT
CSKCHNCGCLLFDEEIMSGWVPDDSNLNTKCRLCNKDVVPFLTIDIIDYRSKDVYLNEID
DQNKISNFNLLTDNVKEKGTSKNCYRTDTITVPYLNPLVLRKELESILAAEGDVSLTHYK
FVDEHPIIYWNLVWIFERIDVPSHISGLCLNAASILGDRDITTFHSIWSSCDSSNVLIIN
LWDNPKLYDDIGLPMYSFWSNEETKESCLISALVTDRNTIPKNLMTKVIASIRRNNLTDP
LKKLAFERNKLRGNDLSHSHSLYRDILFLTITAIGRENIDISAFDQEYLIAFENLSENES
KILLKCDHPISIGSQYCRHLFKELELSNYK
NT seq
5133 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagaaaggagagtagttgattattttgtggtagttggtgcttccgatgaacaatcc
catgatgatataaattcgactcatttaaaacaaagtttatgttctgaccttcctcctatt
acagatttagctattgttttcccctctctcggagaaaaagtaccttctgattttattgtc
gtagatacaactccaagtggattaatagctgatcttaatcatggtagtttaagaagtcca
gaagtatttttatgttatcgccgtggacgtgataaacccccaatagtggatattggtata
atgtatgatggcaaagaaagagttttaaaagatgcccaggtattaaaaactacagttagt
ggtgaagttgcaaatattaataattctacatcatcgaaaactttcataacttatagacgt
gctttacctactgcaccatgtaatatattagctgtatctcatatttgtgtagttataact
agtcgaggagaaacaccaccacatgccttttgtttaatacataaaaacttgaataaaggc
atggttgggtcagatgtatacctgtgttacaaaaaatctgttatgaaacctaaatcaatc
acttataaaccagtaatcactaatcggtatccaaaagaagatagaaattattttcatctt
ttaccatcagtagcattattttgtttaccaatgggtgcaacacttgaagcttggccaaat
caggcaagccaaccaaaaccagtattttcaacttttgtattaactgttagtgatgcttct
gaaaaggtttatggagcagctataacattctatgaaaaattcagtggtaatctatcaaat
gaacaaaaagaattgttaggtctcaatgaacatcataatgagttaaaaaatggaattggc
ttacattcaaataaaagtatttgtgtattatctcattggccattttttgatacatttgaa
aaatttctcatgtttttgcttaatacttcgcttggtgataaaatacatatacctgttgaa
cggtatattacacacttagttgatgaagtaccatttccatcacctgagagacctcaaatt
cttgtacaattatcaatggacacacagcttatcttaacacaacctgaagacttaccaata
ccacggagtggagcaggatttcatcaaatgattatgaatttgcacccagataactgtctt
cttcttttattatgtgctttaacagaacagaaacttctaattcattctctaagacctgat
gtacttacagcagtagcagaagccatttcttctttgatatttcctttcaaatggcaatgt
ccatatattcctttgtgtccgttaagtttagctgaagtactacatgctccattaccattt
ttaattggagtagattcaagattttttgatttgtatgagccacctactgatgtaacatgt
gtcgatttagatacaaatactgtgacattatgtgaggataaaaaatacttatctattaaa
ttacttccaaaaaaatcagcaagagttttaaaatacacattagaaaaactttacgaaaaa
cttgatgaactacaaaccagctttcacacttcaaataacaaaaattttggtgaaactagt
attgataaagatatcttaatgaaacgcaaagagcatgaattagaattaaatattcaagaa
gctttccttcgatttatgggatcaatattaaaaggttatcgctggtttttgagaccaatt
acaaaggcaccaacagctggtactacagatacaagttcattatttgatttgttaggtttt
ttaaaatctagagacaaatcaaaccaaaaattttactcacttttaacaaaaactcaaatg
tttattcgttttattgaagaaaggtcttttgtatccaatatggatgctgcgttggaattt
tttgatgaatgttctgaaaaaattgactctgaaaatagtcctaccagacttattgagtta
gactcttgtggtcaaagtgaacgaactgtgtttatcatgcccccagaaatgtcagacatg
ccaaacatggttccatattcttataaaaatggtttcattttaaactcagaaatattaaag
tgcaaagattcaaaaaatcaactaaaaattaaaaatgatgatcatttacctattcctgga
agccctatggcaaggcgcactaaacatgaagtaaaatcagctcaaaaattggcaaaaaaa
tattcaacatctcctggactttgggcaaaatttttacttggaacatgttatagtttatgg
tttatacatttaccaagtcatattttacaatcagaagaccgtgctgcatcaattttacgt
ttagcatatgacttattgaataaatttcaaaaaaatggggttcaacgattaactgatgaa
gtgtgctatagggtaatgatgcaactttgtggcatttacaatcaacctatgttagctgtg
aagcttttacttgttatgaagcgatgtggtttgcatccaaatgcaattacttatggtttt
tataatagagcattattagaatcgacatggccctctgatttaagaacacatagtcaatta
ctttggaataaacttcggaatgttgtgatatgtacagctttatttaaacaagctggatta
caaaacagaaaaagacgaagttctactgaggacgaaaagacatcacatacatctgaagaa
agtttgttaacagctgaaaagcaatcttcagtttcaaatacacctagaaagctatcaata
aatgttgaatcaaattatgggttaagagcacgtccaatcagtatagttaaacaaaattct
ttatctcctgaagatgaccagtcctggagctcacaacaatttgaaagtagtgctggtctt
ttgatgactactacatgctcaagaccaagttcagctagttcaaaaccaaatagtgattct
gtttctgtagaaagtgaaacagatttgaaaagaggccgtagtgggtctttaacagatgaa
attagacttcaaatatcacctagaagacatcattatcatcaaccgttaattaacacatct
aatgatacatcatcagaactactcaaattattaaaacgctcaaaaagttttggtaatgat
gctcaaatactaaaaaatcttaatgatttaaaatatcaaactgattttaaaaaaactaat
ggaatatcaaaaaaattagtctttgataatagtgtaaaatcatttgattcttctttagaa
aatctttcagaagaaaacacttgtaatagatttccagaggcagcactgtgtactccagtg
ttggaaaatgatcctctaggagcattgcaagaaccattaacaccaactctttgtccttta
gtgactcctattagtattcctagagtacagtcaggtatagaacttgaccgcagtggatca
cctatattatttcgcgaatggggaagtattcacagaagtgctacttttagtgataatgta
ggaaatattgacaatcatatgcaaagatcgtccactatgccagctcatagtattaaagaa
ccagaacatcaacaaagtccaattaaaatttcactgggatcagcttttaaaatacctttt
tctcaatatacttcatcaaaattttcattaccacgaaagtctgactttcgattgagtacc
aatatgattgaaaatgcaattaacaacttcagtccttctagtttttctggtaaaaaatca
aatgaaattcttatgggtggattaactagcttaaaaagtgctgcaaatacagttgttaaa
aaatttgatgaaataaaagaagcgatatctacaaataatacaccaataaaagattacatt
caatgctcaaaagatgaggataaatggatagatgatgttgatcatcagtttaatgaacca
agtgttaggcgaaaaatatcaagtgaaatatcttcattagcagttgctcaacattttgat
tcttggagtactaatttaattgaactttttactgatggccacaaaaaaagtggttcttgt
aatataaattcaggttttgacaccttagatttttctgaattaagtctatttcaagaaaaa
ttataccaacgttctattcgtactactgagttagtagctttagaaatcattatgactaca
tgttcaaaatgtcataactgtggctgtttactatttgatgaagaaataatgtctggttgg
gttcctgatgattcaaatttaaatacaaaatgtagattgtgtaataaagatgtggtacct
tttttaactatcgatattattgattatcgatcaaaagatgtttatttaaatgaaattgat
gatcaaaataaaatatcaaattttaatttacttacagataatgttaaagaaaaaggaaca
tcaaaaaattgttacagaacagatacgatcacagttccttatttaaatcctcttgtatta
cgcaaagaacttgaatccattttggctgctgaaggtgatgtatcattaacacattataaa
tttgttgacgagcatcctattatatattggaatttagtttggattttcgaaaggattgat
gtaccatcacacatttcaggcctatgtcttaatgcagctagtatccttggtgatagagat
attacaactttccattcaatttggtcctcctgtgattcttcaaatgtattaattataaat
ctctgggataaccctaaattgtatgatgatattgggctaccaatgtattcattttggtct
aatgaagaaacaaaagagagttgtttgattagtgcattggttacagatcgaaatactatt
ccaaaaaatctaatgacaaaagtaatagctagtattcgtcgaaataatttgactgatcca
ttgaaaaaattagcttttgaaaggaataaattaagaggaaacgatttatcccatagtcat
tcattatatagagatattctatttttaactattactgctattggtcgtgaaaacattgat
attagtgcatttgatcaagaatacttgattgcatttgaaaatttgtcagaaaatgaatct
aagatattattaaaatgtgatcatccaatttcaataggaagtcaatattgtcgtcatctt
tttaaagaactggagctttcaaattataagtga
DBGET
integrated database retrieval system
