Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera): 126905739
Help
Entry
126905739 CDS
T09738
Name
(RefSeq) mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12 isoform X1
KO
K15162
mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12
Organism
dvt
Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dvt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
dvt03021
]
126905739
Transcription machinery [BR:
dvt03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Mediator complex
CDK-module
126905739
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Med12-LCEWAV
Med12
RDD1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126905739
NCBI-ProteinID:
XP_050541696
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2175 aa
AA seq
DB search
MMGFSYEKRPLKRPRLGPPDVYPQEPKQKEDELTTVNVKHGFTTSLTISDEHQHGTARNY
NITASKIGAFFNAIINKKEELNTLLDTGRKRLQINPKDNFWPATARSKTTVEAWFKDLAG
IKPLNILSKKAPNFNKKEEIFMLLCEYNVPLIRATWFIKLSSAYTIAVSEAKIKSKRQLP
DPTLEWTSTLLKFTKEQLIKLQDYYQSTSSSNNSSLHFMTEEQKISLKQWNYCSSLIKYM
YQEGLLERQEVLQWILDLLERYKSSSVSEDGLLKVLCPLALQYCSEFCQSELLSRKLVYF
CSRKLNSMCNSVVDSNPPSSPNSKGTSSISAPSNNSTITNAAAILNDMMACPHHRDILLP
ISCIIQIILLECPTSLVWNHLGGGKLPSILNGSPLDYLPCSPIILPMPQRTNNVSLRKQL
KQFEEIVRLRSQAAEGRWCLDKFQKSSIGAKTMKILTVLDALDRHSFERIDQNNSLDTLY
NKIFSSPNVKDNLNTLPIAVGGITKSSDIDLSKDNRTEYSIDQDQIIVKVLCEWALSSLR
HGEHRGMAVARLLDKRQAEITGRESDSSVENIPSGPNEDKDSVVSTPATLPLFQSLLMHF
LDHDAPILENNHTSRITFTNLVNLFTELIRNDVFSHDAYMCTLISRGDLQSNNGGSQHSS
NSKPTDTPSGAGSTQGPAHIEDDNLFDLKPNVPEHHNRHMDYDDSKIDDDLDKLLQHIKE
EQQNSMDAPDSPKVEPFAGSSIGGLDSNNPSTSTNENMLKGRPSRHLLYATHFPLPLDEE
TTSHDCNQRHVLLYGFGKMRDDARHTIKRISKDICKLFSKKFSIDIAEGGKVKKHSRNEF
NFEATTARVQNLSYFDQHVVTWQCSLTVLESINAFATGNSNYLPVQEHVAFLFDLMELAL
NVNTLLDVCIQILMDIPDVEAQLTTKGSSLVRLYTTSLVLYIVGVLRRYHCCLLLNQEQV
IGAFENLYRVVKHVSNPAECLSVERCVLSHLYDLYLSAAPLLKGRLPGTEPFNTLYIKIR
QTLHSNLQPSTMTQGNWNSSYMSELILSYRRGYKIDSGWYRQLNESQSNRYSLVCNVIIA
VASETDIERLNDLAILSAELTASCSSLASEWLGVLMALCCSSNNPIIFGDVFSHVKMNDI
AVHNSLALFTSILVARHCFSLEDFVVHVALPSLLTVSNEGHGAADTDPEAEASARLTCHL
LLRLFKTTEVPQPSLYSVGASPNPIPNTSSGCSIKQSCDRHLLAAAHNNIRVGPLLAVLK
AIIVVGDATAQRPNQSIKKSPSSQVSTPGGTSKMAGELSISHILGTTDILGGSADHLLME
LRGLGNSDTQTPGLSELAQFVLREICSQEWVLERCLQNPEELCHQDMLLDSMLSSKQAQR
LLHMICYPETASGFDISLDSKTIITNILENSDQWTLRMSWLEMQLMFKQFTTNSPDLNQW
LDTVAKAAIDMFQQNPNTQNKSECLKKTHSMWLLAPLISKLPSAVQGRVLKVAGQVLESG
NMIGLGNTNSGNVTPIATHGVSGGGSSSRSSNKGTPPHPRPAQNLTTVTPTAAILAYHQP
FLSLVLSCLKGQDDQKENLLSSLHNQLSQYLILSKEERLGIQEGCANNKEVNAIQNSLSL
RFSLVGGMFDTIQRNTTLTTDWAVLLVQLVTYSVIDLTNNTKLFSTIIDMLATLIHSTLV
SDSQTEKGEENRKHYQNLMKKLKKEVGEKYSPSISQVRQLLPLGKQQCEIISCEQIGTDG
KGNKISSGMDANDKQGLKVCDKQRVSSWDLLEGHKNPAPLSWSWFSAVRVERKPLWYEEN
HRMLKFHTHSLVKTSSYFLEPLPLPPEDLEPPQEKPCPCVYCNQIKNVGPGINIGPGTGR
PDTPSSVPESPGRGIKRGMKAQGGPSNQRRKKQQQPPPMSPLTPNTQMGPSQIHPQMQGQ
QNQHMAYGGPNGGIYPMQQNTGPNPAQIPQQNPQWGNYGQQSQGGPSFYSQQVPPTQGPG
PGSRFDRPVNTSKQALSHMLRMRLPTNQYMGQTPQQPNMNPNFQPMPRQQFIRRGQHNVP
IQPPPQQQNSNQMYSQQQQPTQMYSNMQQSMNQNYGGYVGQQAGMRPPYMQNQNVPMNPM
GGPQNPTPPYNRPTVPNQQVQNSQYQQQLSQQRIRHIMAMQQQQQQQQQQHLMQRQMQNP
QQQQSHPYGLQPPPY
NT seq
6528 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgggattttcttacgaaaaacgaccattaaaacgaccacgacttggtcctccagat
gtctatccccaagagcctaagcaaaaagaggatgaattaactactgttaatgtaaaacat
ggttttactacatcattgactatatctgatgaacaccaacatggaactgctcgcaattat
aatattacagcttcaaaaattggagctttttttaatgctattatcaataaaaaagaagaa
ttaaacactttgttggatactggaaggaaacgattacaaattaatcctaaggataatttt
tggccagcaactgccagatctaaaactacagttgaagcttggtttaaagatttggctgga
ataaaaccattgaatatactttccaaaaaggcaccaaattttaacaaaaaagaggaaata
tttatgttgttatgtgaatataatgtcccacttattcgagctacatggtttataaaattg
agttcagcctatacaattgctgtgtcagaagcaaaaattaaatcaaaacgtcaactgcca
gatcctacattagaatggaccagtacccttttgaaatttaccaaagaacaattaattaaa
cttcaagattactaccaaagtacatcatcttcaaataacagttccttgcattttatgact
gaagaacaaaaaatttcacttaaacaatggaactattgttcaagtttgatcaaatatatg
tatcaggagggacttttagaacgacaagaagtacttcaatggatattagatttgcttgaa
cgttataaatcatcatcagttagtgaagatggtttgctaaaagttctatgtcctttagct
ttgcagtattgttcagaattttgccaatctgaacttttaagtcgaaaattagtttatttt
tgttcgagaaaattgaattctatgtgtaattcagtagtagattcaaatcctccgtcaagt
cctaattctaaaggaacatctagtataagtgctcctagtaacaattcaaccattaccaat
gctgcagctattttaaatgatatgatggcttgtcctcatcatagggatattttacttcca
ataagttgtattatacaaataattcttttagaatgtcccacatcacttgtttggaatcat
ttgggtggcggaaaactaccatctatattaaatggttcgccattagactatttaccttgt
tctcctataattttacctatgcctcaaagaacaaataatgtttcactaaggaaacaactc
aaacaatttgaagaaattgtaagactaagaagtcaagcagctgaaggcagatggtgttta
gacaaatttcaaaagtcttcaataggagctaaaactatgaaaattttaacagttttggat
gctctagatcgtcatagttttgagcgtattgatcaaaataattctttggatacattatat
aataaaattttttcatcgcccaatgtaaaagataatttaaatactttaccaatagctgtt
ggaggaataacaaaatcttcagatattgatttatcaaaagataaccgcacagaatatagt
atagatcaagatcaaataattgttaaagtgctatgtgagtgggctcttagtagcttaagg
catggtgaacatcgaggaatggcagttgctagattacttgataaaagacaagcagaaata
actggacgagaaagtgattcttctgtagaaaatataccaagtggtcctaatgaagataaa
gattcagttgtttccacacctgctacactgccactatttcaatctcttttaatgcatttt
cttgaccatgatgctccaatattagaaaataatcatacaagccgcataacatttacaaat
ttggtaaatttatttacggaactaataaggaatgatgtgttttcacatgatgcctatatg
tgcactttaatatcaagaggcgatttacaatcaaataatggaggaagtcaacattcaagt
aatagtaaacctacagatactccatcaggtgcaggttcaactcaaggtccagctcatata
gaagatgataacttatttgatttaaaaccaaatgttccagaacatcataatcgacatatg
gactatgatgacagtaaaattgatgatgatttagataaattattgcaacatattaaagaa
gagcaacaaaattcaatggatgctcctgattctccaaaagttgaaccttttgctggttca
tcaattggtgggttagattcaaataatccatcaacaagtactaatgaaaacatgttaaaa
ggtagaccttcacgacatctattatatgcaacacattttccattaccactggatgaagaa
actactagtcatgattgtaaccaaaggcatgttcttttatatggttttggaaaaatgaga
gatgatgctagacatacaattaaacgtataagcaaagatatctgtaaactatttagtaaa
aaatttagcattgatattgctgaaggtggaaaagtaaagaaacattctcgcaatgaattc
aattttgaagcaactactgctagagttcaaaatttgtcttattttgatcaacatgttgtt
acatggcagtgtagcctcacagttcttgaatctattaatgcatttgctactggaaattca
aattatctccctgttcaagaacatgtggcattcttatttgatcttatggagttggcttta
aatgtcaatacacttttagatgtttgcatacagatcttaatggatatacctgatgttgaa
gcacaactaactactaaaggatcatctttagtgcgtttatataccacatcattagttcta
tatattgttggagtattacgtagataccactgttgtttattattgaatcaagagcaagtt
attggagcttttgaaaacctttatagagttgtaaaacatgtttcaaatcctgctgagtgt
ttaagtgttgaaagatgtgttctttcccatttatatgatttatatttatcagcagctcca
cttttaaaaggtcgccttcctggtacagaaccctttaatactctttatattaaaataaga
caaacattgcattcaaatttacaaccttcaactatgacacaaggaaactggaattctagt
tacatgagtgaacttattttatcatatagaagaggatataaaattgattctggatggtac
aggcagctgaatgaatcacaaagtaatcgttatagcttagtgtgcaatgtaataatagca
gttgcatctgaaactgatatagaacgattaaatgatttagctattctcagtgcagaattg
actgcttcttgtagttcacttgcttcagagtggctaggagttcttatggctttatgctgt
tcatcaaataatcctattatatttggagatgttttttcacatgttaaaatgaatgatata
gctgtgcacaactcactagcattatttacatcaattcttgttgcaagacattgtttttct
ctagaagattttgtggtacatgtagctttaccttctttattgactgttagtaatgaaggt
catggagcagctgatacagatcctgaagcagaagcaagtgcaagattgacttgccactta
cttttacgtctttttaaaactacagaagtaccacaacctagtttatactcagttggtgca
tcaccaaatcctataccaaatacaagttctggttgtagtattaaacaaagttgtgataga
cacttattagcggcagctcataataatatcagagttggacctttgttagctgtacttaaa
gctattattgttgttggtgatgcaacagctcagcgccccaatcagtctataaaaaaatca
ccttctagtcaagttagtactcctggaggtactagtaaaatggctggtgaattgtccatc
agtcatattttaggcacaactgatattttagggggatcagctgatcatttactaatggaa
ttaagaggacttggaaattctgacactcaaactccaggtctttcagagttagcacaattt
gtacttagagaaatatgtagtcaagaatgggtattagaacgctgcttacaaaatccagaa
gaactgtgtcatcaagatatgcttttagatagtatgctttcttccaaacaggctcaaaga
ctgctgcatatgatctgttatcctgaaacggcaagtggttttgatatttcattggattca
aagaccatcattacaaatattttagaaaattctgaccaatggactctgagaatgtcttgg
ttagaaatgcaactcatgtttaaacaattcactacaaattcccctgatttaaaccagtgg
cttgatacagttgccaaagctgccattgatatgttccagcaaaatcctaatacccaaaat
aaaagcgagtgtttaaaaaaaacacattcaatgtggttattagcacctcttatttcaaag
ttacctagtgctgtccaaggaagagtgttgaaagtagctggtcaagttctagaaagtgga
aatatgattggacttggaaatacaaattcaggaaatgttacccctatagcaactcatgga
gttagtggaggaggaagtagcagccgaagtagtaataaaggcactccaccacaccctcga
cctgctcaaaatctaactactgttactccaactgctgctattttagcatatcatcagcca
tttttatctttagtacttagctgtttaaaaggacaagatgatcaaaaagaaaatttactt
tcttctctacataatcagttatctcaatatttgattttatctaaagaggaacgcctcgga
attcaagaaggttgtgctaataataaagaagtaaatgccatacaaaactctctttctcta
agatttagtcttgttggaggcatgtttgatacgattcaacgtaatactactctaacaact
gattgggcagttttattagttcaattagttacatattctgttattgatttgactaataat
acgaagttatttagtacaataatcgatatgctagcaacattaatacattcaactcttgta
tcagattctcaaactgaaaaaggagaagaaaatcgtaaacattatcaaaatttaatgaaa
aaattaaaaaaagaggtaggagaaaaatattctccatcaatttcccaagttagacaactt
ctacctttagggaaacaacaatgcgaaattatttcttgcgaacaaattggtactgatggt
aaaggcaataaaatatcatctgggatggatgctaatgataaacaaggtttgaaagtatgt
gataaacagcgtgtaagttcttgggatcttttagaaggtcacaaaaatcctgctcctctt
tcatggtcatggttcagtgctgtacgtgtggaacgtaaaccattatggtatgaagaaaat
catagaatgctcaagttccatacacattcattagttaaaacttcatcatatttcttagaa
cctttaccattaccacctgaagaccttgaacctcctcaagaaaaaccgtgtccttgtgtt
tattgtaaccagattaagaatgtagggcctggtatcaatataggcccaggaacaggaaga
ccagatactccatcttcagtacctgaatctccaggaagaggtataaaacgaggtatgaaa
gctcaaggaggaccttctaatcagcgccgtaaaaaacaacaacaaccgcctcctatgtca
ccattaactccaaatactcaaatggggccaagtcaaattcatccacagatgcagggacaa
caaaatcaacacatggcttatggaggtcctaatggaggaatttatccaatgcagcaaaat
actggcccaaatcctgcccaaattcctcaacaaaatcctcaatggggtaattatggacaa
cagtcacaaggaggaccttctttttattctcagcaagtacctcctactcaaggtccaggt
cctggttcaagatttgatagaccagtaaatacatccaaacaagcactgagccatatgttg
cgaatgagattacctactaatcaatacatgggtcaaactccacaacagcctaatatgaac
cctaattttcaaccaatgccaagacagcaatttattagaagaggtcaacataatgtaccg
atacagcctcctccacaacaacaaaattctaatcaaatgtattcgcaacaacaacaacca
actcaaatgtattctaatatgcaacaaagtatgaatcaaaattatggtggttatgtagga
caacaagcaggaatgagaccaccttatatgcaaaaccaaaatgtacctatgaatccaatg
ggaggccctcaaaatcctactcctccatacaatcgccccactgttcctaaccagcaggta
caaaactctcaatatcaacagcaattgagtcaacagcgtattcgtcatattatggctatg
caacagcagcaacagcaacagcaacagcaacatcttatgcaaagacaaatgcaaaatcct
caacagcaacaaagccatccatatggtttacagccaccaccttactaa
DBGET
integrated database retrieval system