Diabrotica virgifera virgifera (western corn rootworm): 114327520
Help
Entry
114327520 CDS
T09922
Name
(RefSeq) rotatin
KO
K16484
rotatin
Organism
dvv
Diabrotica virgifera virgifera (western corn rootworm)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dvv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
03037 Cilium and associated proteins [BR:
dvv03037
]
114327520
Cilium and associated proteins [BR:
dvv03037
]
Primary cilia and associated proteins
Other primary cilia associated proteins
114327520
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RTTN_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114327520
NCBI-ProteinID:
XP_050499940
LinkDB
All DBs
Position
2:130523498..130770912
Genome browser
AA seq
2185 aa
AA seq
DB search
MGDKFINSNHIEKLGHKIQEIRERALKNIISKLDNGVVFDNDLARCKELLNKLLKWFLLE
PSSQEETVLVLLKRILESEHGKVLIDHIGKEAILNELQQINTYLEPKFTPLLKEIISLVN
SFDDHVVPPLECDIPLSYRSTTSAENDGLTANLGTTATAQEGFLHKESSAEQQTAAGKIT
ESSLTTPYDDRTYRIKDNLDCEAVVLPNIYFEWQPLIESDRHVLNSVESSLLNPPQPSSL
LHSCEFFRDVLLHDFPAEIFLQRPRIILEFFSLLNCGSSRITNSVLSCLCDLTTELQVRI
NHYNDVSLQNFKLKNTIQLDYVSTNRSQSATNRGLDGNEPEIRTKFERPEEIAELQKHQV
STVKYCLFCIDSVFKYLCVKPEITKSTRHRINQVAIKFCLILLEKILELLAMCIEKNIWN
NSPNETSVRILRDLNEIFVKYGTSLEHFRIESVSSEKNLQYRVIYLYLLHNTTNLLQALV
PYSNCASVLPRNLRSALSNSLLDVTFSRLYTDVHNKIFTYVQNFSVANEKEHLRKYEDVK
KVCQGMTATVKFLKEYKNLSYAENIRLASDALASIEFHKDLDFVKVFVDICSEGFSQMAD
DPLTISLVQDIILSLLNHAMIDIRLETYRLCHKTVVTYIGPKLNDTTGIIGSQVLFLLNS
KILVEITCFGLNSDNLEIRKYSEEILTYILKCKLIVSESIWNKVIQALIPSLPIITSQIT
NKSTLGKSLIYLVDPDVAKESLLPIISMIKCNVEILFLDDSLWREEAFSRICWLLSSQDN
VRELLPGFNTLYDTSLTGICKIKNMVDVNKIRRTEHFYQPSSLYQVLEVLNSTNIEPVIK
RSALNQISVMLEDPLLHQIFLDSSGLSLLLNVMKSALTEKDYSDYPDSIIPAMSVLKNIC
FYNASVREELSNNVEIFYYTLRGLLLFFTEERFKQDAIIVIFLLVFKDFIRGSPSRANFS
LPEILISKINLPFTCHSHWTISEYTNNSLRDSITSDRWCLSSIQIQWNAEVFGGFDKLIH
WDEINYENHSMYNFVDILKLNDYDLQCIKNSSIDHCVKHYLKSIQNATSHDVVLESIDNL
TLYVCLHQLACEFNENYNKETFKKHQWENTFLRFLKVLPSSEHDTILLKKILQFLCILIP
YYSSSDSTSWITNFLKKPDQCIFDIFNIDNTSDDDLKIVAQELLKVITLCVKQEQHYLDY
CIPMKDSQSSWLHVIKIIAENLKNSGKQHFYNLAYLDSLLSCLVHLTANLGWSENNPNLY
PTGPLPQMIVALCDLVKAFHSGKGPTAAVSVMGLSITRHVLLVLNHLLAEVKSSKIKGWE
TYFFDNIEDIPLYSFIALWASRDVILRAASVQLFAGFTSSPRAVIEIVHGFGNDTSSIWD
LSLRVLNDYTEANTVRENAAEILANLTSHCTPLGSDKSCDNTNFALKKSSSLTLMNLIDE
HNFYNNFEIILNDLFTTNIPYRKFRNLEKIKLLKNGAESEKSWTSSSDSDINSLVTTTPS
LVKTVCNFLHNLLAIDAVAVSQTVQEKGIAKLIFRALCNPNMSITNTRELSLYVDILDMN
ATICSVLTRLSSNNISCLGTILHTKDCLNLLISLLNPRLYHMDFPQLVYLRNRLWTSVFN
LLSTLVEYGGESEGNLTNRSVEVVNTFSGTITELGNEPFFEAICESISNLGSHDLQNSAL
NMLTGVLRVEAYRNFEYSLLVTEKKVEPSIQSLLDSVRTSRTVLISNNGSARLPKNSKKL
TQDHKLNLLEEVYYEKVIAKPQIDLNDQIEVSIIENDGQSLMSGAEICKILLYLYDICNL
ENTEVFIKKKSIVTKALSTLLCVSKEAKQFALECSMVGVIVKKLRDHHIRLGLESVECLR
RIADKKRLCPLLKELDDLICLLTNFMVDCEPVKLDAASLNLADVVHKLWVWFLVENSMLI
DVLKMICTYTTNCELACQTLPLTSPVAGSGPRKSPGTISLLHAIIALITREMDQISKTHD
RSALEISFNILHNSCQSLECRVLISKSNIFQSISRLHPAITKRQKPWEFVELIWLEFLQT
YTIHPEGQAAVAKIPDVLELIMTLTNSSKMKNRLMASMVLRNVAFYQPNKSRLLSSADFL
NIVQSKLTTGSDEEKNIIVVIIWALAANSQKAKIVLKSIHLDDKLQNVLKHCQLLKSKES
CLSTEDVDRMQYVLQMLRDTNDKIK
NT seq
6558 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagacaaatttattaactcaaatcatatagaaaaactaggacacaaaattcaagaa
atcagagaaagagcccttaagaatattatttcaaaactagacaatggagttgtattcgac
aatgacttggccagatgtaaggaattgcttaataagttgcttaaatggttcttacttgaa
cctagtagtcaagaagaaacggttttagtgttacttaaacgcattttagagtcagaacat
ggaaaagttttaatagatcatataggaaaagaagctatcctcaacgagttacaacaaatt
aacacatatctggaaccaaaatttacaccattattaaaagaaattatcagtctagttaat
agttttgacgaccatgttgtaccccctttggaatgtgatatacctttaagctatagaagt
actacaagtgcagaaaatgatggacttactgcaaatttgggtactacagctactgctcaa
gagggatttttacataaggaatcttctgctgaacaacaaacagcggccggaaaaataaca
gaatctagtcttacaactccatatgatgatcgtacttacagaataaaagacaatttagat
tgtgaagcagtagtcctcccaaacatatatttcgaatggcagccactcatagaatctgac
agacacgttttaaattccgtggaaagttctttgttaaatcccccacaaccttcctcgctt
cttcattcgtgtgaattttttcgagatgtattattacacgattttccagcagaaatattt
cttcagagaccaagaataattttggaatttttttctttgctgaattgtggatcatctaga
attacaaattccgtactttcatgcttatgtgatttgacaacagaattgcaagtacgaatc
aatcattataatgacgtatcattacaaaattttaaattgaagaacactattcaactcgat
tatgtaagtactaatcgcagtcaatctgcaacaaaccgaggtttagatggtaatgaacct
gaaattcgtacaaaatttgaaagaccggaggagattgccgagcttcaaaaacaccaagta
tcaactgtaaaatattgtcttttttgtatagattcggtgttcaaatatttgtgtgttaag
cctgaaattacaaaaagtacaagacatagaattaatcaagtggcaatcaaattttgctta
attctactcgagaagatattggaattactggctatgtgcatagaaaaaaatatttggaat
aatagtccaaatgaaacctctgttaggattttgagggatctcaacgaaatatttgtgaaa
tatggaacttcgttagaacatttcaggattgaatcagtatcatccgagaagaaccttcag
tatagagttatttatctatatttgctgcacaatactacaaacttattacaagctttggtt
ccatattccaattgtgcttcggtcttaccaagaaacctaagaagtgctctttcaaattct
ttgttggatgtcacatttagccgcctctatactgatgttcataacaaaatttttacttat
gttcagaatttttctgtggcaaatgaaaaggaacatttaagaaaatacgaagatgtcaaa
aaagtatgccaaggaatgacagcaaccgttaaattccttaaagagtacaaaaaccttagt
tatgccgaaaacatcaggctcgcctcagatgctctagccagcatagaatttcacaaggat
ttggattttgttaaagtttttgtagatatttgttccgaaggattttctcagatggctgat
gaccctcttacaataagtctagtacaagatattatcttatcattactgaaccacgctatg
atagatattagactagaaacatataggttatgtcataaaacagttgttacttatattggc
cctaaattgaatgataccacaggaattattggatcgcaagttttattcttattaaattcg
aaaattttggtggagataacttgctttgggctaaacagtgacaatttagagatccggaaa
tactctgaggaaattctgacctacatattaaaatgcaaattgatagtatccgaatcaatt
tggaataaagttattcaagctctcataccatccctaccaataataacaagtcaaataacg
aacaaatcgactcttggcaaatctttaatttatttggtagatcctgacgtggcaaaagaa
tccttattgccgataatatctatgatcaaatgtaatgtagaaattttatttttggacgat
tctctatggagagaggaagcattttcgaggatatgttggttgttgtcaagtcaagacaac
gtcagagaactattgcctggattcaatacgctttacgacacatctttaactggtatttgc
aagattaagaacatggtggatgtcaataaaataagaagaacggaacatttttatcaacct
agtagtttataccaagtactagaagttctcaattcgacaaatatagaaccagtgataaaa
agatctgcattgaatcaaataagtgttatgttggaagatccgttgctccatcagatattt
ttagattccagtggtctttctttgttgcttaatgtgatgaaaagtgctcttacggaaaag
gattattcagattatccagattcaatcattccagcgatgtctgttttgaaaaatatatgt
ttttataatgcaagtgtaagagaagaattaagtaataatgtggagatattttattatact
ttgagaggtcttcttttgttttttactgaggagcgctttaaacaagatgctattatagtt
atcttcttattagtttttaaagattttattaggggaagcccatcaagagctaattttagt
cttcctgaaattttaattagcaaaattaaccttccatttacttgtcattctcattggaca
attagtgaatatacaaataacagtttacgagattctattacctccgatagatggtgccta
agttctatacaaattcaatggaatgccgaagtttttggaggttttgataaacttattcac
tgggatgaaattaattatgagaaccattcaatgtataactttgtagatatactgaagctc
aatgattatgatctacaatgtataaagaattcatctattgatcactgcgtaaaacattat
ttgaaatcaatacagaacgccacctctcatgatgttgttttggaatcaattgataactta
acattatatgtatgccttcatcaactcgcatgcgaatttaacgaaaattacaacaaagaa
acatttaaaaaacatcaatgggaaaacacgtttttgagatttttaaaagttcttccatcc
agcgaacatgacaccattttattaaagaaaattctccaattcttatgcattcttatacct
tactattcatcatcagattctacttcgtggataacgaatttcttaaagaaacctgatcaa
tgcatatttgacatattcaatattgataatacgtctgacgatgatctcaaaattgtggct
caagaactgttaaaagttataacattatgtgtcaaacaagaacaacactatttagattac
tgtattccaatgaaagatagtcaaagtagttggttacacgttattaaaattattgcagaa
aacttaaagaatagtggaaaacaacacttttataatctagcttatttggattcattactt
tcgtgtttggtacatttgactgccaatttgggatggagcgaaaataaccccaacttatat
cccacaggacccttgccacagatgattgtggcgctttgtgatttagttaaagcatttcac
tctggtaaaggccccactgcagctgtttcagttatgggactaagtattacgaggcacgtt
ctattagttttgaatcatttgttagctgaagtaaaaagttcaaagattaagggatgggaa
acatatttttttgacaatatcgaagatattcctttgtacagttttattgctctttgggca
agtagagatgtcatattaagagcagcttcagtacaactatttgctggttttacatcgtca
cccagagctgtaattgaaatagttcatggattcggtaacgacacaagttctatttgggat
ttatcgttaagagtacttaatgactataccgaagccaatacagttagagaaaatgctgct
gaaatacttgcaaatcttacgtcacattgtactccactgggctccgacaaatcatgtgat
aacacaaattttgctctaaaaaagagttctagcctcacattaatgaatctcatagatgaa
cataatttttataacaattttgaaattatcctcaatgatctctttacgacgaacattcca
tatagaaaatttaggaatctcgaaaaaattaaattgctcaagaatggtgcagaatccgaa
aaatcttggacgagttcaagtgatagtgatatcaacagtttagttacgactacccctagt
ttagtaaagacagtgtgtaattttttacataaccttttggctattgatgctgttgcagtt
agtcaaacagtgcaagaaaagggcattgcaaagttgattttcagagctttatgtaaccca
aacatgagtataacgaataccagggagctgtctttgtatgtggatatattggatatgaat
gccacaatttgttctgtgttaacacgattatcaagtaacaatatctcttgtctgggaaca
atattgcacacgaaagattgtttgaatttattaatatctctgctaaatccacgattatac
catatggattttcctcaattagtatatttgagaaatagactttggacatctgtatttaat
ttattgagcacactagtggaatatggtggagaatcagagggaaacttgaccaatagatcc
gtagaggtcgttaatacattttctggaacaataactgaattgggaaacgaaccattcttt
gaagctatatgcgagtctatcagcaatttaggatctcacgatcttcaaaattctgcgtta
aatatgttgactggggtcttacgtgtagaagcctatagaaattttgaatattcgctatta
gttacagagaaaaaagttgaaccgtcgattcaatcattgttagattctgttagaacgtca
agaactgtcttaatatccaacaacggtagtgcccgattgcctaaaaactctaaaaaatta
acacaagatcacaaattaaaccttctagaagaggtgtactatgaaaaagttattgcaaaa
ccacaaattgatttaaatgatcaaattgaagttagcataattgaaaacgatggccaaagt
ttgatgtccggtgctgaaatatgcaaaattttattgtatctatacgatatttgtaacttg
gaaaacaccgaagtgtttatcaaaaagaaatcaatagttacaaaggccttgtctacttta
ttatgcgtgtcaaaagaagcaaagcaatttgctttggaatgcagtatggtaggtgtaata
gtaaaaaaactacgagatcatcacatacgattaggattggaatcagttgaatgtttaaga
agaattgccgacaagaaaagattatgtcctttattaaaagaattggacgatttgatatgt
ttgctgacaaattttatggtagattgcgaaccagttaaacttgatgcagcatccctaaat
ttagcagatgttgtgcacaaattgtgggtatggtttttagtagaaaattctatgcttatt
gatgtactaaagatgatttgtacctacacaacaaactgtgaattagcttgtcagacacta
cctttaacaagtcctgtagctggcagtggacctaggaaatctcctggaaccatatcattg
ttgcatgccatcatcgctttgattactcgcgaaatggatcaaataagcaaaacccatgat
cgaagcgctcttgaaatatcatttaatatccttcacaactcttgtcaatccttagaatgt
agggttttgatatcaaagagcaatatattccaaagtatatctcgacttcatccagctatt
actaaacgtcagaaaccatgggaatttgttgaattaatttggttagagtttttacaaacg
tacactatccatccagaaggtcaagctgccgtggcaaaaataccagatgtcttagaactc
attatgacgttgacaaacagttccaagatgaaaaataggttgatggccagtatggtttta
agaaatgtcgccttttatcaaccgaataaatcaagattattaagttcagctgattttctt
aacattgtccaatcgaaacttactacaggatcagatgaagaaaagaatatcatagtcgtc
ataatttgggctttagctgccaatagccaaaaagcgaaaatcgtattgaaatccatacat
ttagatgataaacttcagaatgtgttaaaacattgtcagttacttaaaagcaaagaatct
tgtctaagtactgaagatgtagatcgcatgcagtatgttttacaaatgttaagagatact
aacgataagataaagtga
DBGET
integrated database retrieval system
